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基因表达谱微阵列网络数据库在肿瘤研究中的应用 被引量:1
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作者 刘曦 刘卓琦 罗达亚 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期260-266,共7页
基因表达谱微阵列数据库是一类可提供存储、查询、下载分析的在线网络数据库,在肿瘤相关领域的研究中提供了大量的数据来源。由于微阵列分析对于无生物/医学信息学专业背景的研究人员仍然有较多困难,致使该数据库的使用尚未普及。本文... 基因表达谱微阵列数据库是一类可提供存储、查询、下载分析的在线网络数据库,在肿瘤相关领域的研究中提供了大量的数据来源。由于微阵列分析对于无生物/医学信息学专业背景的研究人员仍然有较多困难,致使该数据库的使用尚未普及。本文从数据查询、下载分析和使用方法等方面对常用基因表达谱微阵列数据库进行概述,并对现阶段基因表达微阵列数据库的应用策略进行总结,旨在帮助该领域研究的初学工作者了解数据库的基本知识并推动其在科研工作中的应用。 展开更多
关键词 基因表达谱微阵列 网络数据库 肿瘤
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伴癌与非伴癌胃高级别上皮内瘤变全基因表达谱的比较 被引量:5
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作者 俎明 徐雪 +6 位作者 周炜洵 费贵军 吴晰 姚方 李媛 程书钧 陆星华 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期23-29,共7页
目的比较伴癌患者的胃高级别上皮内瘤变(HGIN)与非伴癌患者的胃HGIN组织全基因表达谱的差异。方法收集北京协和医院2010年3月至2013年5月间行放大染色胃镜检查的21例患者的标本,胃镜活检组织病理均为HGIN。21例患者均行内镜黏膜下剥离术... 目的比较伴癌患者的胃高级别上皮内瘤变(HGIN)与非伴癌患者的胃HGIN组织全基因表达谱的差异。方法收集北京协和医院2010年3月至2013年5月间行放大染色胃镜检查的21例患者的标本,胃镜活检组织病理均为HGIN。21例患者均行内镜黏膜下剥离术,病理示10例为HGIN,11例为HGIN伴部分癌变。采用4×44K人全基因表达谱芯片,用非配对t检验和Benjamini-Hochberg假发现率(FDR)校正筛选差异基因,采用Gene Spring GX 12.6进行基因本体(GO)富集分析。结果伴癌HGIN与非伴癌HGIN组织的全基因表达谱比较,共有差异基因470个(P<0.05,倍数变化>2),其中表达上调的基因180个,表达下调的基因290个。上调基因GO富集主要与三酰甘油合成、甘油酯合成、中性脂质合成、甘油醚代谢、有机醚代谢及甘油酯类代谢有关。结论脂质代谢改变可能是胃癌发生的早期事件。 展开更多
关键词 胃高级别上皮内瘤变 胃癌 基因表达谱微阵列
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