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MiR-199b-5p过表达在肾小球足细胞中的作用及基因表达特征 被引量:2
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作者 龚向前 鱼敏逸 +4 位作者 陈俊宇 顾欣雨 李善文 张爱青 甘卫华 《皖南医学院学报》 CAS 2018年第6期519-522,共4页
目的:研究miR-199b-5p在足细胞凋亡过程中的功能及miR-199b-5p过表达足细胞中的基因表达谱特征,探讨足细胞凋亡的潜在分子机制。方法:体外培养小鼠足细胞,用lipofectamine 2000分别在小鼠足细胞中瞬时转染miR-199b-5p过表达质粒(miR-199... 目的:研究miR-199b-5p在足细胞凋亡过程中的功能及miR-199b-5p过表达足细胞中的基因表达谱特征,探讨足细胞凋亡的潜在分子机制。方法:体外培养小鼠足细胞,用lipofectamine 2000分别在小鼠足细胞中瞬时转染miR-199b-5p过表达质粒(miR-199b-5p mimics)、miR-199b-5p过表达质粒阴性对照(NC)组。用qRT-PCR检测miR-199b-5p在足细胞中表达水平。用流式细胞仪检测足细胞凋亡的变化。运用高通量测序分析转染miR-199b-5p mimics后足细胞中差异表达基因,并对miR-199b-5p靶基因进行基因功能(GO)富集分析和信号通路(Pathway)富集分析。结果:qRT-PCR结果显示,转染miR-199b-5p mimics足细胞中miR-199b-5p表达水平较对照组升高(P <0. 05)。流式细胞仪检测结果显示,NC组细胞凋亡率(32. 97±1.45)%,转染mimics组细胞凋亡率(25.51±0.94)%较对照组下降(P<0.05)。高通量测序发现,过表达miR-199b-5p足细胞中有106个基因表达较对照组降低大于1.5倍。基因功能富集分析结果显示miR-199b-5p靶基因可能通过NF-κB及TNF等信号通路,调控肌动蛋白骨架稳定性等多个方面抑制足细胞凋亡。结论:过表达miR-199b-5p能抑制足细胞凋亡,可能通过对其靶基因的调控在足细胞损伤的过程中发挥保护作用。 展开更多
关键词 miR-199b-5p 足细胞 基因表达特征 凋亡
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水稻幼苗响应氰化物胁迫的基因表达谱差异分析
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作者 张伏中 蔡青 +2 位作者 宋江燕 胡龙兴 吴根义 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期528-535,共8页
为筛选水稻参与氰化物胁迫响应的关键基因,采用Agilent4×44 K水稻全基因组芯片,分析了氰化钾和铁氰化钾胁迫下水稻幼苗叶片和根系的基因表达特征。结果表明:氰化钾和铁氰化钾处理下,从水稻根系中分别筛选到1841和3037个差异表达基... 为筛选水稻参与氰化物胁迫响应的关键基因,采用Agilent4×44 K水稻全基因组芯片,分析了氰化钾和铁氰化钾胁迫下水稻幼苗叶片和根系的基因表达特征。结果表明:氰化钾和铁氰化钾处理下,从水稻根系中分别筛选到1841和3037个差异表达基因,从水稻叶片中分别筛选到734和1805个差异表达基因;氰化钾处理下,细胞壁代谢和抗逆相关的基因在根中显著上调表达;铁氰化钾处理下,水稻叶中解毒相关基因显著上调表达,说明氰化物能诱导水稻基因差异表达;与细胞解毒作用和抗逆相关的基因、与细胞壁和次生代谢途径相关的基因以及转录因子类基因的表达均显著上调,表明2种氰化物处理下水稻根系和叶片均可能通过调节其体内的一些代谢途径和一些酶的催化活性来应对氰化物的胁迫,积极诱导与防御相关的基因,并通过主动吸收和转运等代谢过程将氰化物代谢解毒,以降低对植物的伤害。 展开更多
关键词 水稻 氰化物 胁迫 基因表达特征 差异分析
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哲罗鲑胰岛素样生长因子Ⅱ cDNA的克隆与组织表达分析 被引量:1
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作者 吴秀梅 徐黎明 +6 位作者 王晓玉 纪锋 赵景壮 刘淼 曹永生 卢彤岩 尹家胜 《大连海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期604-609,共6页
为了研究胰岛素样生长因子-Ⅱ(insulin-like growth factors-Ⅱ,IGF-Ⅱ)在哲罗鲑Hucho taimen生长繁殖过程中所起的作用,根据Gen Bank收录的大西洋鲑IGF-Ⅱ基因开放阅读框序列(NCBI登录号:NM_001123647)设计用于哲罗鲑IGF-Ⅱ开放阅读框... 为了研究胰岛素样生长因子-Ⅱ(insulin-like growth factors-Ⅱ,IGF-Ⅱ)在哲罗鲑Hucho taimen生长繁殖过程中所起的作用,根据Gen Bank收录的大西洋鲑IGF-Ⅱ基因开放阅读框序列(NCBI登录号:NM_001123647)设计用于哲罗鲑IGF-Ⅱ开放阅读框扩增的引物,以哲罗鲑肝脏总RNA反转录成的cDNA为模板,利用PCR方法克隆获得哲罗鲑IGF-Ⅱ基因的开放阅读框。生物信息学分析结果显示,哲罗鲑IGF-Ⅱ基因的长度为645 bp,编码含有214个氨基酸残基的蛋白,该蛋白的相对分子质量为24554,等电点为9.92;哲罗鲑IGF-Ⅱ前肽由信号肽、B、C、A、D、E肽6部分构成;同源性比对和系统进化分析结果显示,哲罗鲑IGF-Ⅱ与鲑科鱼类IGF-Ⅱ核苷酸序列同源性最高,聚为一支,其中与大西洋鲑的IGF-Ⅱ同源性最高(98.6%),该基因在进化过程中有着高度保守的进化特性;用荧光定量PCR技术检测2龄哲罗鲑IGF-Ⅱ基因在不同组织中的表达,结果显示,该基因在肝脏中表达量最高,在心脏、鳃、脾、后肠、头肾、胃中的表达量次之,而在前肠和脑中的表达量最低。 展开更多
关键词 哲罗鲑 胰岛素样生长因子-Ⅱ 基因表达特征
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植物络合素合酶及其基因研究进展 被引量:3
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作者 梅磊 朱晔 +2 位作者 肖钦之 陈进红 祝水金 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期530-538,共9页
植物络合素(phytochelatin, PC)能与重金属产生络合反应,在植物解除重金属毒害过程中起关键作用,其在生物体内的合成受植物络合素合酶(phytochelatin synthase, PCS)控制。深入研究植物络合素合酶对理解植物对抗重金属胁迫的机制,以及... 植物络合素(phytochelatin, PC)能与重金属产生络合反应,在植物解除重金属毒害过程中起关键作用,其在生物体内的合成受植物络合素合酶(phytochelatin synthase, PCS)控制。深入研究植物络合素合酶对理解植物对抗重金属胁迫的机制,以及运用基因工程手段创造工程植物来修复重金属污染环境具有重要意义。本文从PCS的双功能酶特性、基因表达和酶学特征、物种分布和亲缘关系、催化活性中心及激活模式5个方面作简要评述。PCS的主要功能为催化合成植物络合素,同时具有肽酶的副功能;PCS基因的表达是组成型的,在少数物种中,其表达也受Cd^(2+)等重金属离子诱导,而酶的活性受部分金属离子调控,其中以Cd^(2+)效果最为明显。PCS分布广泛,不是植物所独有的,在酵母、线虫等物种中同时存在,然而该酶在植物中同源性较高,在其他物种中较低,暗示其在植物对环境适应过程中具有某些重要作用。PCS的催化中心位于N-基端,其中与藻青菌中Cys70、His183和Asp201相对应的3个氨基酸在所有物种中为严格保守;PCS的重金属活化被认为与其含半胱氨酸有关,包含重金属直接接触活化和形成间接中间物活化2种假说。最后对PCS的多功能性、基因表达特性、酶激活机制及此基因的利用进行了展望,旨在为与PCS相关的研究提供参考。 展开更多
关键词 植物络合素合酶 双功能酶 亲缘关系 基因表达特征 活化机制
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mRNA Expression of Chemokine Receptors on Peripheral Blood Mononuclear Cells and Correlation with Clinical Features in Systemic Lupus Erythematosus Patients 被引量:2
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作者 Yu-mei Li Zhi-qiang Chen +4 位作者 Xu Yao Ai-zhen Yang An-sheng Li Dong-ming Liu Juan-qin Gong 《Chinese Medical Sciences Journal》 CAS CSCD 2010年第3期162-168,共7页
Objective To investigate the expressions of chemokine receptors and interleukin (IL) receptors on the peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from systemic lupus erythematosus (SLE) patients and their correla... Objective To investigate the expressions of chemokine receptors and interleukin (IL) receptors on the peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from systemic lupus erythematosus (SLE) patients and their correlations with clinical features as well as SLE disease activity index (SLEDAI). Methods The mRNA expressions of chemokine receptors and IL receptors on PBMCs of 93 SLE patients and 30 healthy controls were detected by reverse transcription-polymerase chain reaction, including CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR8, CXCR3, CXCR5, CX3CR1, XCR1, IL-4R, and IL-10R. The clinical features of SLE patients were recorded. The correlations of chemokine receptors and IL receptors mRNA expressions with clinical features as well as SLEDAI were assayed using linear regression analysis. Results The level of CCR5 mRNA in SLE patients (including active and inactive SLE) was signifi- cantly higher than that in healthy controls (P〈0.05), and there was no significant difference between active and inactive patients in this respect (P〉0.05). CX3CR1 mRNA expression significantly increased from healthy control to inactive SLE to active SLE in sequence. The others (except for CCR8, CXCR3, and IL-1 OR) in active SLE patients weresignificantly higher than those in both inactive SLE patients and healthy controls (all P〈0.05). There were positive correlations between SLEDAI and CCR2 (r=0.424, t=4.313, P〈0.001), CCR3 (r=0.518, t=5.410, P〈0.001), CCR4 (r=0.376, t=3.851, P〈0.001), CCR6 (r=0.457, t=4.513,P〈0.001), CXCR5 (r=0.455, t=4.629, P〈0.001), CX3CR1 (r=0.44-5, t=4.523, P〈0.001), as well as XCRI (r=0.540, t=5.445, P〈0.001). And CCR5 mRNA expression level was positively correlated with IL-4R mRNA (r=0.313, t=2.353, P〈0.05). The patients with myositis and cutaneous vasculitis simultaneously showed lower levels of CCR5 and CX3CRI, and CCR5 expression was negatively correlated with the scores of SLEDAI in SLE cases accompanied by photosensitivity (r=0.426, t=- 2.155, P〈0.05). Conclusion Increased expressions of CCR5 and CX3CRI on PBMCs may be indicators in clinical survey for SLE. 展开更多
关键词 systemic lupus erythematosus chemokine receptors peripheral bloodmononuclear cell
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