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花生ahFAD2A等位基因表达变异与种子油酸积累关系
被引量：
6
1
作者
黄冰艳
张新友
+5 位作者
苗利娟
高伟
韩锁义
董文召
汤丰收
刘志勇
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第10期1752-1759,共8页
花生ahFAD2A是控制种子油酸、亚油酸含量和油亚比的关键基因。利用ahFAD2A基因特异引物检测远杂9102、豫花9416等52个花生品种的ahFAD2A基因等位变异,并比较其中13个品种的ahFAD2A基因序列。结果表明,花生ahFAD2A基因存在G-A两种单核苷...
花生ahFAD2A是控制种子油酸、亚油酸含量和油亚比的关键基因。利用ahFAD2A基因特异引物检测远杂9102、豫花9416等52个花生品种的ahFAD2A基因等位变异,并比较其中13个品种的ahFAD2A基因序列。结果表明,花生ahFAD2A基因存在G-A两种单核苷酸等位变异(野生型ahFAD2A-wt和突变体ahFAD2A-m)。DNA序列比对结果证实,豫花9416等10个品种(突变体)与远杂9102、延津花籽和开农白2号(野生型)相比,在ahFAD2A基因的448bp处存在核苷酸G-A突变。应用real-timePCR检测ahFAD2A等位基因在种子不同发育时期的表达动态显示,突变体豫花9416等位基因(ahFAD2A-m)在种子发育中期表达量稍高,种子发育后期表达量下降速度较野生型远杂9102(ahFAD2A-wt)更快。进一步测定豫花9416和远杂9102在种子不同发育时期的油酸、亚油酸积累和油亚比动态,发现2个品种间存在明显差异,豫花9416在籽粒发育前期油酸相对含量已超过亚油酸,油亚比大于1并逐渐增加,而远杂9102到籽粒发育中后期油酸相对含量才高于亚油酸,油亚比逐渐接近于1左右。
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关键词
花生
油酸含量
亚油酸含量
ahFAD2A
等位
变异
等位
基因表达变异
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职称材料
二倍体和四倍体泥鳅IGFBP-1基因的表达及其与DNA甲基化的相关性
被引量：
2
2
作者
张曼曼
高泽霞
+3 位作者
冯兵
罗双双
曹文怡
周小云
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期9-16,共8页
为探讨胰岛素样生长因子结合蛋白-1(IGFBP-1)基因在二倍体和四倍体泥鳅之间的表达差异及其与DNA甲基化的相关性,克隆二倍体、四倍体泥鳅的CDS序列和启动子序列,并分别采用qRT-PCR和亚硫酸氢盐测序技术(BSP)分析IGFBP-1在二倍体、四倍体...
为探讨胰岛素样生长因子结合蛋白-1(IGFBP-1)基因在二倍体和四倍体泥鳅之间的表达差异及其与DNA甲基化的相关性,克隆二倍体、四倍体泥鳅的CDS序列和启动子序列,并分别采用qRT-PCR和亚硫酸氢盐测序技术(BSP)分析IGFBP-1在二倍体、四倍体泥鳅中的表达水平及启动子区和第一外显子区的甲基化水平。结果显示,泥鳅的IGFBP-1基因CDS序列长789bp,编码262个氨基酸,二倍体、四倍体泥鳅间有5bp的差异,但氨基酸序列完全相同。在二倍体、四倍体中分别克隆得到2341bp和2331bp的启动子序列,倍性间的序列相似度达99%,启动子序列中包含典型元件TATA-box,以及SP1、CREB、C/EBP、POU2F2、GATA-2/3/4和SRY等转录因子结合位点。泥鳅的IGFBP-1基因主要在肝脏中表达,且四倍体泥鳅肝脏中IGFBP-1的表达水平显著高于二倍体(P<0.01)。四倍体泥鳅IGFBP-1基因启动子及第一外显子区的甲基化水平均比二倍体低,其中四倍体肝脏中的甲基化水平显著低于二倍体(P<0.01)。综合分析研究结果表明,在IGFBP-1基因主要表达的肝脏组织中,其mRNA表达水平与DNA甲基化水平呈负相关,启动子区较高的甲基化可能抑制了二倍体泥鳅IGFBP-1基因的表达。
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关键词
泥鳅
二倍体
四倍体
IGFBP-1
DNA甲基化
生物多倍化
多倍体鱼类
表型
变异
基因表达变异
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职称材料
二倍体和四倍体泥鳅qRT-PCR分析中内参基因优选
被引量：
4
3
作者
罗双双
高泽霞
+3 位作者
冯兵
张曼曼
曹文怡
周小云
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期1-8,共8页
为筛选在泥鳅中稳定表达的内参基因,以确保泥鳅基因表达分析结果的可靠性,选取ACTB、TUBA、EF1A、GAPDH、TUBB和18SrRNA6个常用的内参基因作为候选内参基因,分别用BestKeeper、geNorm、NormFinder、ΔCt和RefFinfer软件分析这6个基因在...
为筛选在泥鳅中稳定表达的内参基因,以确保泥鳅基因表达分析结果的可靠性,选取ACTB、TUBA、EF1A、GAPDH、TUBB和18SrRNA6个常用的内参基因作为候选内参基因,分别用BestKeeper、geNorm、NormFinder、ΔCt和RefFinfer软件分析这6个基因在二倍体和四倍体泥鳅胚胎发育阶段、成鱼组织间以及倍性间表达的稳定性。结果显示,在胚胎发育各阶段,TUBB和TUBA的表达最稳定,可作为胚胎发育阶段qRT-PCR分析的内参基因;其中,TUBB在泥鳅倍性间的表达差异不显著,因此,可作为泥鳅胚胎发育中跨倍性qRT-PCR研究的内参基因。在成鱼各组织中,ACTB和18SrRNA的表达最稳定,可用作组织间qRT-PCR分析的内参基因;其中,18SrRNA在倍性间的组织表达差异不显著,因此,可作为泥鳅组织间跨倍性qRT-PCR的内参基因。
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关键词
泥鳅
二倍体
四倍体
多倍体鱼类
表型
变异
基因表达变异
QRT-PCR
内参
基因
稳定
表达
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职称材料
题名
花生ahFAD2A等位基因表达变异与种子油酸积累关系
被引量：
6
1
作者
黄冰艳
张新友
苗利娟
高伟
韩锁义
董文召
汤丰收
刘志勇
机构
中国农业大学农学与生物技术学院
河南省农业科学院经济作物研究所/农业部黄淮海油料作物重点实验室/河南省油料作物遗传改良重点实验室
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第10期1752-1759,共8页
基金
国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(2011CB109304)
国家现代农业产业技术体系建设项目(CARS-14)
+1 种基金
河南省科技创新人才计划项目(104200510003)
河南省科技攻关重点项目(092102110044)资助
文摘
花生ahFAD2A是控制种子油酸、亚油酸含量和油亚比的关键基因。利用ahFAD2A基因特异引物检测远杂9102、豫花9416等52个花生品种的ahFAD2A基因等位变异,并比较其中13个品种的ahFAD2A基因序列。结果表明,花生ahFAD2A基因存在G-A两种单核苷酸等位变异(野生型ahFAD2A-wt和突变体ahFAD2A-m)。DNA序列比对结果证实,豫花9416等10个品种(突变体)与远杂9102、延津花籽和开农白2号(野生型)相比,在ahFAD2A基因的448bp处存在核苷酸G-A突变。应用real-timePCR检测ahFAD2A等位基因在种子不同发育时期的表达动态显示,突变体豫花9416等位基因(ahFAD2A-m)在种子发育中期表达量稍高,种子发育后期表达量下降速度较野生型远杂9102(ahFAD2A-wt)更快。进一步测定豫花9416和远杂9102在种子不同发育时期的油酸、亚油酸积累和油亚比动态,发现2个品种间存在明显差异,豫花9416在籽粒发育前期油酸相对含量已超过亚油酸,油亚比大于1并逐渐增加,而远杂9102到籽粒发育中后期油酸相对含量才高于亚油酸,油亚比逐渐接近于1左右。
关键词
花生
油酸含量
亚油酸含量
ahFAD2A
等位
变异
等位
基因表达变异
Keywords
Arachis hypogaea L.
Oleic acid content
Linoleic acid content
ahFAD2A
Allelic variation
Allelic expression variation
分类号
S565.2 [农业科学—作物学]
在线阅读
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职称材料
题名
二倍体和四倍体泥鳅IGFBP-1基因的表达及其与DNA甲基化的相关性
被引量：
2
2
作者
张曼曼
高泽霞
冯兵
罗双双
曹文怡
周小云
机构
华中农业大学水产学院/农业动物遗传育种与繁育教育部重点实验室
出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期9-16,共8页
基金
国家重点研发计划“蓝色粮仓科技创新”重点专项(2018YFD0900205)
文摘
为探讨胰岛素样生长因子结合蛋白-1(IGFBP-1)基因在二倍体和四倍体泥鳅之间的表达差异及其与DNA甲基化的相关性,克隆二倍体、四倍体泥鳅的CDS序列和启动子序列,并分别采用qRT-PCR和亚硫酸氢盐测序技术(BSP)分析IGFBP-1在二倍体、四倍体泥鳅中的表达水平及启动子区和第一外显子区的甲基化水平。结果显示,泥鳅的IGFBP-1基因CDS序列长789bp,编码262个氨基酸,二倍体、四倍体泥鳅间有5bp的差异,但氨基酸序列完全相同。在二倍体、四倍体中分别克隆得到2341bp和2331bp的启动子序列,倍性间的序列相似度达99%,启动子序列中包含典型元件TATA-box,以及SP1、CREB、C/EBP、POU2F2、GATA-2/3/4和SRY等转录因子结合位点。泥鳅的IGFBP-1基因主要在肝脏中表达,且四倍体泥鳅肝脏中IGFBP-1的表达水平显著高于二倍体(P<0.01)。四倍体泥鳅IGFBP-1基因启动子及第一外显子区的甲基化水平均比二倍体低,其中四倍体肝脏中的甲基化水平显著低于二倍体(P<0.01)。综合分析研究结果表明,在IGFBP-1基因主要表达的肝脏组织中,其mRNA表达水平与DNA甲基化水平呈负相关,启动子区较高的甲基化可能抑制了二倍体泥鳅IGFBP-1基因的表达。
关键词
泥鳅
二倍体
四倍体
IGFBP-1
DNA甲基化
生物多倍化
多倍体鱼类
表型
变异
基因表达变异
Keywords
Misgurnus anguillicaudatus
diploid
tetraploid
insulin-like growth factors binding protein-1( IGFBP-1)
DNA methylation
biopolyploid
polyploid fish
phenotypic variation
gene expression variation
分类号
Q959.468 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
二倍体和四倍体泥鳅qRT-PCR分析中内参基因优选
被引量：
4
3
作者
罗双双
高泽霞
冯兵
张曼曼
曹文怡
周小云
机构
华中农业大学水产学院/农业动物遗传育种与繁育教育部重点实验室
出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期1-8,共8页
基金
国家重点研发计划“蓝色粮仓科技创新”重点专项(2018YFD0900205)
文摘
为筛选在泥鳅中稳定表达的内参基因,以确保泥鳅基因表达分析结果的可靠性,选取ACTB、TUBA、EF1A、GAPDH、TUBB和18SrRNA6个常用的内参基因作为候选内参基因,分别用BestKeeper、geNorm、NormFinder、ΔCt和RefFinfer软件分析这6个基因在二倍体和四倍体泥鳅胚胎发育阶段、成鱼组织间以及倍性间表达的稳定性。结果显示,在胚胎发育各阶段,TUBB和TUBA的表达最稳定,可作为胚胎发育阶段qRT-PCR分析的内参基因;其中,TUBB在泥鳅倍性间的表达差异不显著,因此,可作为泥鳅胚胎发育中跨倍性qRT-PCR研究的内参基因。在成鱼各组织中,ACTB和18SrRNA的表达最稳定,可用作组织间qRT-PCR分析的内参基因;其中,18SrRNA在倍性间的组织表达差异不显著,因此,可作为泥鳅组织间跨倍性qRT-PCR的内参基因。
关键词
泥鳅
二倍体
四倍体
多倍体鱼类
表型
变异
基因表达变异
QRT-PCR
内参
基因
稳定
表达
Keywords
Misgurnus anguillicaudatus
diploid
tetraploid
polyploid fish
phenotypic variation
gene expression variation
qRT-PCR
internal control genes
stable expression
分类号
Q959.468 [生物学—动物学]
在线阅读
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
花生ahFAD2A等位基因表达变异与种子油酸积累关系
黄冰艳
张新友
苗利娟
高伟
韩锁义
董文召
汤丰收
刘志勇
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
6
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职称材料
2
二倍体和四倍体泥鳅IGFBP-1基因的表达及其与DNA甲基化的相关性
张曼曼
高泽霞
冯兵
罗双双
曹文怡
周小云
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
二倍体和四倍体泥鳅qRT-PCR分析中内参基因优选
罗双双
高泽霞
冯兵
张曼曼
曹文怡
周小云
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
4
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职称材料
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