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一种基于聚类和统计分析DNA基因芯片图像处理算法
被引量:
1
1
作者
武拴虎
严洪
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2005年第2期22-25,86,共5页
DNA基因芯片可以同时监控成千上万个基因的表达信息。图像分析是基因芯片试验中一个重要的环节,直接影响到其后续的处理、分析和研究,比如鉴别预测具有不同表达信息的基因功能。基因芯片图像分析包括三个步骤:图像网格化,图像分割以及...
DNA基因芯片可以同时监控成千上万个基因的表达信息。图像分析是基因芯片试验中一个重要的环节,直接影响到其后续的处理、分析和研究,比如鉴别预测具有不同表达信息的基因功能。基因芯片图像分析包括三个步骤:图像网格化,图像分割以及信息抽取。该文主要研究分割和信息抽取问题。首先基于K-Means聚类技术提出了一种新的分割方法;其次基于统计分析文章建议了一种新的背景和前景分割校正方法用于更准确的信息抽取。新方法的优点是对于基因芯片中spot图像没有任何形状限制。实际图像分析结果与目前最流行的基因芯片图像分析软件GenePix对比研究表明该文算法是精确有效的。
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关键词
基因
芯片
图像处理
聚类分析
基因表达信息
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职称材料
题名
一种基于聚类和统计分析DNA基因芯片图像处理算法
被引量:
1
1
作者
武拴虎
严洪
机构
烟台大学计算机学院
香港城市大学电脑工程和资讯科技系
出处
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2005年第2期22-25,86,共5页
基金
香港城市大学交叉学科基金(编号:9010003)
文摘
DNA基因芯片可以同时监控成千上万个基因的表达信息。图像分析是基因芯片试验中一个重要的环节,直接影响到其后续的处理、分析和研究,比如鉴别预测具有不同表达信息的基因功能。基因芯片图像分析包括三个步骤:图像网格化,图像分割以及信息抽取。该文主要研究分割和信息抽取问题。首先基于K-Means聚类技术提出了一种新的分割方法;其次基于统计分析文章建议了一种新的背景和前景分割校正方法用于更准确的信息抽取。新方法的优点是对于基因芯片中spot图像没有任何形状限制。实际图像分析结果与目前最流行的基因芯片图像分析软件GenePix对比研究表明该文算法是精确有效的。
关键词
基因
芯片
图像处理
聚类分析
基因表达信息
Keywords
DNA Microarray,image processing,clustering analysis,Gene expressions
分类号
TP301.6 [自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一种基于聚类和统计分析DNA基因芯片图像处理算法
武拴虎
严洪
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2005
1
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