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题名表达谱基因芯片及其在植物研究中的作用
被引量：1
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作者
万群
吴洁
宋明
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机构
四川省农业科学院生物技术育种工程中心
西南农业大学园艺系
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出处
《四川农业科技》
2004年第4期5-6,共2页
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关键词
表达谱基因芯片
基因表达谱
基因芯片
植物研究
检测
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分类号
Q819
[生物学—生物工程]
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题名卵巢癌干细胞基因表达谱共有特征分析
被引量：2
- 2
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作者
鞠宝辉
田菁
黄宇婷
陈春燕
冯慧
郝权
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机构
天津医科大学附属肿瘤医院天津市肿瘤防治重点实验室
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出处
《山东医药》
CAS
2013年第24期1-5,I0001,共6页
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基金
国家自然科学基金资助项目(30901742)
天津市应用基础及前沿技术研究计划重点项目(11JCZDJC27900)
+1 种基金
天津市应用基础及前沿技术研究计划青年基金项目(13JCQNJC10700)
天津市卫生局基金项目(2011KZ80)
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文摘
目的分析卵巢癌干细胞共有的差异基因表达特征。方法将NCBI GEO数据库中获取的细胞系及患者来源的卵巢癌干细胞与各非干性癌细胞的全基因组表达谱进行整合比对分析,运用GeneSifter软件解析出卵巢癌干细胞共有差异表达基因,并对其共同涉及的生物学特性及信号通路进行富集分析。结果卵巢癌IGROV1细胞系和进展期患者腹水来源的干性侧群细胞相比各非干性侧群细胞,以及OVCAR3细胞系来源的多细胞球相比其他非干性卵巢癌细胞的差异表达基因数分别为1 347、509、6 495个;其中,NAB1、JAK1、PIK3R1、TMOD1和S100A6等为共同上调的关键基因,而PROS1、GREB1、KLF9、CRABP2、GADD45B、Notch1、LATS2和SLFN11等为共同下调基因(差异>1.5倍;P均<0.05)。这些差异表达基因显著富集于表观遗传修饰、细胞周期调控、跨膜信号转导及化学排斥蛋白通道活性等分子功能,共同参与了细胞干性维持、细胞增殖调控、细胞分化程度降低及迁徙能力增高、细胞耐受及抗性增强等生物学进程,以及与卵巢癌发生、发展密切相关的ECM、ErbB和Hedgehog等信号通路。结论各卵巢癌干细胞中存在共有的干性差异表达基因、共同富集的生物学特性及特异信号调控网络。
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关键词
卵巢癌
肿瘤干细胞
基因芯片表达谱
富集分析
生物学进程
信号通路
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Keywords
ovarian carcinoma
neoplastic stem cells
gene expression profiles
enrichment analysis
biological process
signaling pathway
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分类号
R737.33
[医药卫生—肿瘤]
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题名恩诺沙星对大肠杆菌全基因组表达谱的影响
被引量：7
- 3
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作者
白华
齐静
朱小玲
王庆艳
杜加法
刘玉庆
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机构
山东省动物疫病防治与繁育重点实验室
山东省农业科学院畜牧兽医研究所
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出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第10期1537-1544,共8页
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基金
国家自然科学基金(30770044)
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文摘
为探索恩诺沙星(Enrofloxacin)压力下大肠杆菌(Escherichia coli,E.coli)生理状态的变化,从而为进一步研究细菌对药物压力的应答机制提供参考,作者将E.coli接种于加入恩诺沙星(浓度为1/2 MIC)的液体LB中,绘制生长曲线,分别以光镜和电镜进行形态学观察,取5 h培养菌,进行表达谱差异分析。结果显示,加入恩诺沙星后细菌生长速度明显降低(P<0.01),菌体形态呈长丝状,基因芯片检测发现519个差异点,其中239个上调,而280个下调,表达变化3倍以上的基因66个,其中34个上调,32个下调,主要涉及SOS应答、细胞分裂、压力应答、物质合成、新陈代谢、转录调控等生物学功能。上述结果表明,在恩诺沙星压力下,细菌启动SOS应答,细胞分裂被抑制,细菌生理机制发生了复杂的变化。
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关键词
恩诺沙星
表达谱基因芯片
大肠杆菌
细菌形态
转录分析
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Keywords
enrofloxacin
expression profiles microarray
Escherichia coli
morphology of bacteria
transcription analysis
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分类号
S859.79
[农业科学—临床兽医学]
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