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从时间序列基因芯片数据中挖掘跨事务关联规则被引量：1: 1; 作者彭斌李辉智易东《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期396-398,共3页; 目的探讨从时间序列基因芯片数据中发掘基因之间的作用关系。方法采用跨事务关联规则挖掘技术及Gene Ontology标注库对时间序列基因芯片数据进行分析处理。结果根据6个不同发育时间段的基因芯片表达数据,采用2倍法从10080个探针中筛选出... 展开更多; 关键词跨事务关联规则时间序列基因芯片数据数据挖掘; 在线阅读下载PDF 职称材料

降维近似支持向量机基因芯片数据分类器: 2; 作者王立鹏袁占亭周智芳《重庆大学学报（自然科学版）》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第12期102-108,共7页; 基因芯片技术的出现改变了生物医学研究的前景,其产生的海量数据是限制其发展的瓶颈问题。论文针对基因芯片数据量大、样本数低和基因维数高的特点,提出了一种对基因芯片数据进行分类的降维近似支持向量机DRPSVM基因芯片数据分类器。DRP... 展开更多; 关键词生物信息学基因芯片数据近似支持向量机降维分类器二次规划; 在线阅读下载PDF 职称材料

从基因芯片数据快速有效地挖掘共调控基因: 3; 作者赵倩尚学群《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2010年第9期33-37,共5页; 针对基因芯片数据高噪音、列(基因)数比行(实验条件)数多几个数量级的特殊性,为了进一步提高从基因芯片数据挖掘共调控基因的时间效率和挖掘结果的有效性,首先根据所有两两基因对之间的Pearson相关系数对原始完整数据集进行分组,然后使... 展开更多; 关键词基因芯片数据共调控基因 Pearson相关系数闭合频繁模式; 在线阅读下载PDF 职称材料

家蚕普通气味结合蛋白基因的表达及分子进化研究被引量：7: 4; 作者张升祥徐世清 +3 位作者王更先周晓玲王桂花崔为正《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期610-618,共9页; 昆虫的普通气味结合蛋白(general odorant binding protein,GOBP)是气味结合蛋白(odorant binding protein,OBP)家族中的重要成员,与昆虫感受低特异性气味分子刺激相关,在觅食、求偶等生理行为过程中发挥重要的作用。基于家蚕5龄第3天... 展开更多; 关键词家蚕普通气味结合蛋白基因表达分子进化基因芯片数据; 在线阅读下载PDF 职称材料

应用关联规则挖掘构建人小脑发育的基因表达关联网络被引量：2: 5; 作者彭斌杨忠 +1 位作者李辉智易东《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2007年第2期117-119,123,共4页; 目的构建小脑发育过程中基因之间的表达调控关联网络。方法应用关联规则(Association Rules)挖掘技术和GO(Gene Ontology)数据库对人胎儿小脑发育的基因芯片数据进行分析处理。结果根据胎儿6个不同发育时间段的基因芯片数据从10080个基... 展开更多; 关键词关联规则基因芯片数据关联网络小脑发育; 在线阅读下载PDF 职称材料

青光眼高眼压环境导致星形胶质细胞差异基因表达的生物信息学分析被引量：1: 6; 作者李挚雯钱秀清《医用生物力学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第S01期310-310,共1页; 目的研究青光眼高眼压作用下的基因表达反应及信号通路预测。方法在GEO数据库中搜索有关人青光眼以及正常人眼在高眼压作用下星形胶质细胞的基因芯片数据;利用R语言中的li mma包分别对数据进行差异基因的筛选;对差异基因进行DAVID功能... 展开更多; 关键词星形胶质细胞差异基因功能富集分析基因芯片数据高眼压青光眼信号通路 R语言; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名从时间序列基因芯片数据中挖掘跨事务关联规则被引量：1: 1; 作者彭斌李辉智易东; 机构第三军医大学军事预防医学院卫生统计学教研室西南政法大学刑侦学院; 出处《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期396-398,共3页; 基金国家自然科学基金(60371034)~~; 文摘目的探讨从时间序列基因芯片数据中发掘基因之间的作用关系。方法采用跨事务关联规则挖掘技术及Gene Ontology标注库对时间序列基因芯片数据进行分析处理。结果根据6个不同发育时间段的基因芯片表达数据,采用2倍法从10080个探针中筛选出119个差异表达基因参与规则挖掘,产生的规则达1300多条,筛选保留J-Measure值最大的10条关联规则并构建基因关联网络图。结论跨事务关联规则能够描述时序基因之间的作用关系,根据关联规则可以对基因的表达状态进行预测。; 关键词跨事务关联规则时间序列基因芯片数据数据挖掘; Keywords inter-transaction association rules time series microarray data data mining; 分类号 R195.1 [医药卫生—卫生统计学] R318.04 [医药卫生—生物医学工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名降维近似支持向量机基因芯片数据分类器: 2; 作者王立鹏袁占亭周智芳; 机构兰州理工大学电气工程与信息工程学院兰州理工大学石油化工学院; 出处《重庆大学学报（自然科学版）》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第12期102-108,共7页; 基金国家十一五科技支撑资助项目(2006BAF01A21) 甘肃自然科学基金资助项目(3ZS062-B25-037); 文摘基因芯片技术的出现改变了生物医学研究的前景,其产生的海量数据是限制其发展的瓶颈问题。论文针对基因芯片数据量大、样本数低和基因维数高的特点,提出了一种对基因芯片数据进行分类的降维近似支持向量机DRPSVM基因芯片数据分类器。DRPSVM采用降维的二次规划算法,使得该算法的时间复杂度和空间复杂度比传统的PSVM算法均有降低。通过在CAMDA2000、colon 1dataset和colon 2dataset等基因芯片数据集上的与BP、Nearest、RBF、SVM分类器的分类性能比较,DRPSVM在数据样本少、数据维数急剧升高时,分类性能稳定、存在唯一的最优解、训练时间快,适合基因芯片数据分类的应用环境。; 关键词生物信息学基因芯片数据近似支持向量机降维分类器二次规划; Keywords bioinformatics microarray data proximal support vector machines dimensionality reduction classifier quadratic programming; 分类号 Q811.4 [生物学—生物工程] Q789 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名从基因芯片数据快速有效地挖掘共调控基因: 3; 作者赵倩尚学群; 机构西北工业大学计算机学院; 出处《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2010年第9期33-37,共5页; 基金陕西省自然科学基金(No.2007F27)~~; 文摘针对基因芯片数据高噪音、列(基因)数比行(实验条件)数多几个数量级的特殊性,为了进一步提高从基因芯片数据挖掘共调控基因的时间效率和挖掘结果的有效性,首先根据所有两两基因对之间的Pearson相关系数对原始完整数据集进行分组,然后使用列(基因)枚举方法对各组数据分别进行闭合频繁模式挖掘,并对活化和抑制共调控关系的挖掘分别进行处理。实验结果证明:算法快速有效地挖掘出了两种共调控基因。; 关键词基因芯片数据共调控基因 Pearson相关系数闭合频繁模式; Keywords microarray data co-regulated genes Pearson correlation coefficient closed frequent pattern; 分类号 TP311 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名家蚕普通气味结合蛋白基因的表达及分子进化研究被引量：7: 4; 作者张升祥徐世清王更先周晓玲王桂花崔为正; 机构山东农业大学林学院苏州大学基础医学与生物科学学院邯郸学院生物科学系; 出处《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期610-618,共9页; 基金现代农业产业技术体系建设专项(蚕桑); 文摘昆虫的普通气味结合蛋白(general odorant binding protein,GOBP)是气味结合蛋白(odorant binding protein,OBP)家族中的重要成员,与昆虫感受低特异性气味分子刺激相关,在觅食、求偶等生理行为过程中发挥重要的作用。基于家蚕5龄第3天幼虫的基因芯片和蛹期、成虫期的RT-PCR表达谱分析发现,家蚕的GOBP1蛋白基因(gobp1)主要在幼虫的头部及蛹和成虫的触角中表达,在幼虫的睾丸以及成虫的胸足、体壁、脂肪体等非感受器官中也有表达,而GOBP2蛋白基因(gobp2)的表达谱和gobp1相比明显较窄。该结果表明家蚕gobp1以感受气味分子刺激的功能为主,同时还可能具有其他尚未被发现的生理功能;而家蚕gobp2可能具有对气味感受更高、更专一的功能特点。对家蚕及其他12种鳞翅目昆虫的GOBP蛋白序列比对发现,各物种间的GOBP蛋白序列相似性很高,蛋白二级结构元件也高度相似,具有的昆虫OBP典型结构中的半胱氨酸(C)位点非常保守。基于非同义突变与同义突变比值(Ka/Ks)的分子进化分析显示,13种鳞翅目昆虫的GOBP蛋白基因仅有棉铃虫gobp1在分化中受到正向选择作用,揭示不同昆虫的GOBP蛋白基因可能具有相似的生理功能。; 关键词家蚕普通气味结合蛋白基因表达分子进化基因芯片数据; Keywords Bombyx mori General odorant binding protein Gene expression Molecular evolution Microarray; 分类号 S881.2 [农业科学—特种经济动物饲养] Q78 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名应用关联规则挖掘构建人小脑发育的基因表达关联网络被引量：2: 5; 作者彭斌杨忠李辉智易东; 机构第三军医大学卫生统计教研室第三军医大学神经生物教研室西南政法大学刑侦学院; 出处《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2007年第2期117-119,123,共4页; 基金国家自然基金资助课题(编号:60371034); 文摘目的构建小脑发育过程中基因之间的表达调控关联网络。方法应用关联规则(Association Rules)挖掘技术和GO(Gene Ontology)数据库对人胎儿小脑发育的基因芯片数据进行分析处理。结果根据胎儿6个不同发育时间段的基因芯片数据从10080个基因(或EST片段)中筛选出110个表达变异较大的基因作为输入,得到形如LHSRHS的关联规则5000多条;从中选择10个功能已知且在关联规则中出现频率较高的基因作为构建关联网络的基因。根据包含这10个基因的关联规则,构建出两张基因表达关联网络图。结论利用关联规则挖掘技术构建的小脑发育基因表达关联网络在一定程度上能够描述小脑发育过程中基因之间的关联关系。; 关键词关联规则基因芯片数据关联网络小脑发育; Keywords Association rules Microarray data Associated networks Cerebella development; 分类号 R741 [医药卫生—神经病学与精神病学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名青光眼高眼压环境导致星形胶质细胞差异基因表达的生物信息学分析被引量：1: 6; 作者李挚雯钱秀清; 机构首都医科大学生物医学工程学院; 出处《医用生物力学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第S01期310-310,共1页; 基金国家自然科学基金项目,12072210; 文摘目的研究青光眼高眼压作用下的基因表达反应及信号通路预测。方法在GEO数据库中搜索有关人青光眼以及正常人眼在高眼压作用下星形胶质细胞的基因芯片数据;利用R语言中的li mma包分别对数据进行差异基因的筛选;对差异基因进行DAVID功能富集分析;比较筛选出的差异基因以及信号通路,选择两组及以上共同出现的差异基因及通路,从而确定青光眼力学敏感蛋白表达的变化,以及相关的信号通路。; 关键词星形胶质细胞差异基因功能富集分析基因芯片数据高眼压青光眼信号通路 R语言; 分类号 R775 [医药卫生—眼科] Q811.4 [生物学—生物工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	从时间序列基因芯片数据中挖掘跨事务关联规则	彭斌李辉智易东	《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心	2008	1	在线阅读下载PDF 职称材料
2	降维近似支持向量机基因芯片数据分类器	王立鹏袁占亭周智芳	《重庆大学学报（自然科学版）》 EI CAS CSCD 北大核心	2011	0	在线阅读下载PDF 职称材料
3	从基因芯片数据快速有效地挖掘共调控基因	赵倩尚学群	《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心	2010	0	在线阅读下载PDF 职称材料
4	家蚕普通气味结合蛋白基因的表达及分子进化研究	张升祥徐世清王更先周晓玲王桂花崔为正	《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心	2010	7	在线阅读下载PDF 职称材料
5	应用关联规则挖掘构建人小脑发育的基因表达关联网络	彭斌杨忠李辉智易东	《中国卫生统计》 CSCD 北大核心	2007	2	在线阅读下载PDF 职称材料
6	青光眼高眼压环境导致星形胶质细胞差异基因表达的生物信息学分析	李挚雯钱秀清	《医用生物力学》 CAS CSCD 北大核心	2021	1	在线阅读下载PDF 职称材料