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入侵植物一年蓬基因组DNA提取方法优化
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作者 王仕文 杨子琼 +5 位作者 魏淑雅 丁彤 顾婉如 陈雨蓓 屈利利 童跃伟 《安徽农学通报》 2024年第13期66-70,共5页
一年蓬为菊科飞蓬属植物,是分布较广、危害较重的一种外来入侵杂草。为优选该植物基因组DNA的提取方法,本研究采取四因素三水平正交试验设计,对一年蓬基因组DNA的十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)提取方法进行优化,并与常规的植物基因组试剂... 一年蓬为菊科飞蓬属植物,是分布较广、危害较重的一种外来入侵杂草。为优选该植物基因组DNA的提取方法,本研究采取四因素三水平正交试验设计,对一年蓬基因组DNA的十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)提取方法进行优化,并与常规的植物基因组试剂盒法进行对比。结果表明,一年蓬基因组DNA较优的提取方法为改良CTAB法,即一年蓬的干燥叶片经CTAB-free去除多糖,并加入β-巯基乙醇防止酚氧化,用氯仿∶异戊醇(24∶1)抽提3次。改良CTAB法提取的一年蓬基因组DNA质量较高,微量分光光度计检测的A_(260)/A_(280)数值接近1.8~2.0,且凝胶电泳DNA条带清晰,无明显拖带。该方法为该植物的遗传多样性和入侵机制等研究提供参考。 展开更多
关键词 菊科 一年蓬 dna提取方法 改良CTAB法 正交试验
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一种简易的昆虫基因组DNA提取方法 被引量:81
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作者 田英芳 黄刚 +1 位作者 郑哲民 魏朝明 《陕西师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 1999年第4期82-84,共3页
报道了一种改进的昆虫基因组DNA 的提取方法.结果表明,该方法可在常温条件下,对多种昆虫及人体组织进行酚/氯仿抽提,DNA 得率较高,OD260/280 的值在1.6~1.9 之间.
关键词 基因组 dna提取 昆虫
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药用植物艾纳香基因组DNA提取方法研究 被引量:15
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作者 庞玉新 王文全 +2 位作者 张影波 刘国道 莫廷辉 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期763-767,791,共6页
以药用植物艾纳香为研究对象,以-20℃保存、4℃保存、室温自然干燥和硅胶干燥四种样品保存方式,并采用SDS法、CTAB法、SDS-CTAB法和改良CTAB法4种不同的基因组DNA提取方法进行了对比试验,以期建立艾纳香的较好的样品保存方法和基因组DN... 以药用植物艾纳香为研究对象,以-20℃保存、4℃保存、室温自然干燥和硅胶干燥四种样品保存方式,并采用SDS法、CTAB法、SDS-CTAB法和改良CTAB法4种不同的基因组DNA提取方法进行了对比试验,以期建立艾纳香的较好的样品保存方法和基因组DNA提取方法。结果表明,-20℃保存是艾纳香的较理想的样品保存方式;改良CTAB法是艾纳香基因组DNA提取较适宜的方法,该方法提取的DNA经紫外检测,其A_(260)/A_(280)为1.8左右,明显优于SDS法(1.1~1.5)、CTAB法(1.2~1.5)和SDS-CTAB法(1.4~1.6),琼脂糖凝胶电泳、酶切检测和PCR扩增也得出了同样的结论。 展开更多
关键词 艾纳香 基因组dna 提取 方法
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美花石斛基因组DNA提取方法的比较 被引量:14
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作者 包英华 白音 +2 位作者 谭庆辉 彭凌 阙生全 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期147-151,共5页
采用CTAB法、尿素法、高盐低pH法、SDS法和陈大明法等5种方法提取美花石斛(Dendrobium loddigesii Rolfe)基因组总DNA,通过电泳、紫外光谱分析和RAPD-PCR扩增等检测手段,比较分析了DNA质量。DNA条带显示改良CTAB法和改良尿素法较好。
关键词 美花石斛 基因组dna dna提取方法
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柿属植物基因组DNA提取方法比较 被引量:21
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作者 梁玉琴 李芳东 +2 位作者 傅建敏 乌云塔娜 吴硕 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期170-173,共4页
针对柿属植物叶片富含单宁,常规CTAB法提取DNA质量低等问题,为了获得符合柿属植物SSR-PCR扩增要求的DNA,分别采用改良CTAB法和植物基因组DNA提取试剂盒两种方法,提取柿属植物DNA,结果显示:两种方法均可得到满足SSR-PCR扩增要求的DNA;试... 针对柿属植物叶片富含单宁,常规CTAB法提取DNA质量低等问题,为了获得符合柿属植物SSR-PCR扩增要求的DNA,分别采用改良CTAB法和植物基因组DNA提取试剂盒两种方法,提取柿属植物DNA,结果显示:两种方法均可得到满足SSR-PCR扩增要求的DNA;试剂盒较改良CTAB法提取的DNA质量高、杂质少,DNA得率略低,但其操作步骤简单,耗时短,毒害小,因其费用较改良CTAB法高,各实验室可根据自身条件选择适宜方法提取柿属植物DNA。 展开更多
关键词 柿属植物 dna提取 改良CTAB法 基因组dna提取试剂盒
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一种简便实用的玉米干种子基因组DNA提取方法 被引量:14
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作者 魏琦超 畅丽萍 +2 位作者 周岩 宫俊丽 王慧娟 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期165-167,共3页
利用改良的CTAB法提取玉米干种子基因组DNA,DNA样品经紫外光谱吸收、琼脂糖凝胶电泳、PCR和酶切检测,表明获得的DNA样品纯度较好、无明显降解,DNA质量可满足下游分子生物学实验要求,证实该方法是提取玉米基因组DNA的一种有效方法。
关键词 玉米 干种子 基因组dna 提取
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一种有效的蚜虫基因组DNA提取方法 被引量:15
7
作者 杨子祥 冯颖 陈晓鸣 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2005年第5期641-642,F0003,共3页
Aphid is a group of small insects in the Homoptera.There are approximately 4 000 aphid species all over the world.Many of them attack important agricultural crops and therefore have economic importance.However,some sp... Aphid is a group of small insects in the Homoptera.There are approximately 4 000 aphid species all over the world.Many of them attack important agricultural crops and therefore have economic importance.However,some species such as Chinese gallnut aphids are beneficial for human beings.Most aphids display complex life cycles with alternation of sexual and asexual generations and host plant alternation.Molecular genetic markers have good stabilities,high variability and mostly are free from environmental influences.So they were very suitable for aphid research and could tackle some problems which the traditional taxonomical methods could not solve.The paper introduced a simple and effective method that could extract genomic DNA from a single aphid individual and could be used for the research of molecular genetic marker such as RAPD,RFLP and DNA sequence determination. 展开更多
关键词 蚜虫 基因组dna 提取方法
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4种不同广玉兰基因组DNA提取方法的比较 被引量:12
8
作者 陈永华 相阳 +4 位作者 张冬林 李志辉 陈亮明 彭婧 马倩 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期45-48,共4页
采用常规CTAB法、常规SDS法、改良CTAB法、改良SDS法4种方法对广玉兰(Magnolia grandiflora)叶片基因组DNA的提取进行比较,并进行ISSR-PCR检测,结果表明:改良的CTAB法提取的基因组DNA效果比常规CTAB法、常规和改良SDS法都好,提取DNA的... 采用常规CTAB法、常规SDS法、改良CTAB法、改良SDS法4种方法对广玉兰(Magnolia grandiflora)叶片基因组DNA的提取进行比较,并进行ISSR-PCR检测,结果表明:改良的CTAB法提取的基因组DNA效果比常规CTAB法、常规和改良SDS法都好,提取DNA的浓度和纯度高,无蛋白质和RNA等杂质影响,并且可以很好的应用于ISSR分子标记分析,ISSR-PCR反应体系中模板DNA的最佳浓度是30 ng/20μL. 展开更多
关键词 生物工程与技术 广玉兰 基因组dna提取 方法
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平菇基因组DNA提取方法的研究 被引量:10
9
作者 闫燕 许文涛 +5 位作者 苏春元 罗云波 王一南 谷新晰 戴蕴青 田洪涛 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期190-193,共4页
以实验室自行培育的平菇为实验材料,分别使用CTAB法、SDS-CTAB法以及高盐酶解法提取平菇基因组DNA,并通过紫外分光光度计、限制性酶切及PCR检测来衡量基因组质量。结果表明,使用CTAB法很难得到高质量的基因组DNA,OD260/280仅为1.5左右,... 以实验室自行培育的平菇为实验材料,分别使用CTAB法、SDS-CTAB法以及高盐酶解法提取平菇基因组DNA,并通过紫外分光光度计、限制性酶切及PCR检测来衡量基因组质量。结果表明,使用CTAB法很难得到高质量的基因组DNA,OD260/280仅为1.5左右,而且伴有较多的杂质,电泳条带拖尾严重;使用EcoRI限制性酶对其进行酶切分析,效率较低,同时PCR检测不能得到有效扩增;而使用优化后的SDS-CTAB法及高盐酶解法提取平菇DNA,能够获得质量高、纯度好的基因组DNA,OD260/280基本保持在1.8~2.0之间,电泳条带较为清晰均一,使用EcoRI限制性酶对其进行酶切分析,酶切效果较好,并且DNA质量能够满足PCR检测的模板要求。说明SDS-CTAB法以及高盐酶解法提取的平菇DNA能够满足分子水平操作的要求,两者相比,前者成本较低,后者产率较高。 展开更多
关键词 平菇 基因组dna 提取方法
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一种木本果树基因组DNA提取方法研究 被引量:142
10
作者 陈大明 张上隆 金勇丰 《浙江农业大学学报》 CSCD 北大核心 1997年第6期621-624,共4页
研究了一种可有效排除细胞内多酚类等杂质污染的简便、快捷、经济的果树基因组DNA提取方法.其改良策略是:在细胞核被裂解前去除细胞质中的多酚类等杂质,防止多酚类物质被氧化,从而排除多酚类等杂质的干扰.利用这一方法提取的柑... 研究了一种可有效排除细胞内多酚类等杂质污染的简便、快捷、经济的果树基因组DNA提取方法.其改良策略是:在细胞核被裂解前去除细胞质中的多酚类等杂质,防止多酚类物质被氧化,从而排除多酚类等杂质的干扰.利用这一方法提取的柑桔、枇杷、梨、苹果、湖北海棠、桃、樱桃等7种果树基因组DNA均能被限制性内切酶完全消化,获得理想的Southern杂交结果,也可作为PCR模板应用,成功地进行特异性基因扩增和RAPD. 展开更多
关键词 木本果树 果树 基因组 dna制备 提取 多酚类杂质
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6种链霉菌基因组DNA提取方法比较 被引量:13
11
作者 刘炳辉 曹远银 +3 位作者 闫建芳 齐小辉 程浩 刘秋 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2008年第10期86-89,共4页
采用优化SDS、SDS、优化CTAB、CTAB、液氮研磨、微波法分别提取委内瑞拉链霉菌基因组DNA,比较6种方法的差异,选出最佳提取方法分别提取S.fradiae,S.venezuelae,S.ambofa-ciens,S.glaucescens,S.coelicolor基因组DNA,并利用16S rDNA的通... 采用优化SDS、SDS、优化CTAB、CTAB、液氮研磨、微波法分别提取委内瑞拉链霉菌基因组DNA,比较6种方法的差异,选出最佳提取方法分别提取S.fradiae,S.venezuelae,S.ambofa-ciens,S.glaucescens,S.coelicolor基因组DNA,并利用16S rDNA的通用引物扩增相应的目的基因。结果表明:6种方法制备的基因组DNA以优化SDS法和微波法为上选,后者的纯度高但量很少。优化SDS法是6种提取方法中最可靠的DNA提取方法,DNA量大,纯度高,可靠,可作为PCR反应的模板进行16S rDNA基因有效扩增。 展开更多
关键词 放线菌 基因组dna提取 PCR 16S Rdna
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乙醇保存的动物标本基因组DNA提取方法的比较 被引量:28
12
作者 张德华 周开亚 孙红英 《生物学杂志》 CAS CSCD 2004年第6期46-48,共3页
为提高从乙醇长期保存的动物标本中提取大分子DNA的质量,用5种不同方法对动物组织进行预处理实验,然后采用SDS/蛋白酶K裂解,酚-氯仿抽提和乙醇沉淀提取总DNA,通过0.8%琼脂糖凝胶对模板进行电泳和PCR产物作鉴定,经比较,用0.9%NaCl法、PB... 为提高从乙醇长期保存的动物标本中提取大分子DNA的质量,用5种不同方法对动物组织进行预处理实验,然后采用SDS/蛋白酶K裂解,酚-氯仿抽提和乙醇沉淀提取总DNA,通过0.8%琼脂糖凝胶对模板进行电泳和PCR产物作鉴定,经比较,用0.9%NaCl法、PBS法和混合液法进行预处理,消除乙醇对Taq酶的影响以及蛋白质和核酸交联问题,为提取动物基因组DNA的3种更理想方法。 展开更多
关键词 基因组dna dna提取 动物组织
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高质量毕赤酵母基因组DNA提取方法比较 被引量:14
13
作者 唐天乐 高炳淼 +1 位作者 长孙东亭 罗素兰 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期196-199,共4页
旨在比较5种毕赤酵母基因组DNA的提取法,以便获得简便高效的提取高质量酵母基因组DNA的优化方法。分别使用蜗牛酶破壁法,超声波破碎法,液氮研磨法,Lyticase破壁法,试剂盒法提取毕赤酵母基因组DNA,然后进行DNA电泳检测以及紫外分光光度... 旨在比较5种毕赤酵母基因组DNA的提取法,以便获得简便高效的提取高质量酵母基因组DNA的优化方法。分别使用蜗牛酶破壁法,超声波破碎法,液氮研磨法,Lyticase破壁法,试剂盒法提取毕赤酵母基因组DNA,然后进行DNA电泳检测以及紫外分光光度计测定DNA浓度和纯度。结果显示,5种方法均能提取出酵母基因组DNA,而酶法所提取的酵母基因组DNA质量最好。由此证实,蜗牛酶法成本低、效果好,是理想的提取高质量酵母基因组DNA的方法,完全满足后续试验要求。 展开更多
关键词 毕赤酵母 高质量基因组dna 提取方法优化
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小麦TILLING突变体检测中基因组DNA提取方法的优化 被引量:8
14
作者 徐艳 徐继法 +4 位作者 陈磊 赵吉强 FU Zeyu JAMESON Paula E 宋建成 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期185-191,共7页
为了优化小麦高通量TILLING突变体扫描所需基因组DNA提取的方法,对利用SDS法、改良SDS法、CTAB法、改良CTAB法、AxyPrep DNA提取试剂盒、Qiagen DNeasy Plant Mini Kit试剂盒以及再生Qiagen硅胶柱方法提取的小麦基因组DNA进行了系统比... 为了优化小麦高通量TILLING突变体扫描所需基因组DNA提取的方法,对利用SDS法、改良SDS法、CTAB法、改良CTAB法、AxyPrep DNA提取试剂盒、Qiagen DNeasy Plant Mini Kit试剂盒以及再生Qiagen硅胶柱方法提取的小麦基因组DNA进行了系统比较。结果表明,尽管7种方法所提取DNA的纯度及琼脂糖凝胶电泳检测结果均良好,但再生Qiagen硅胶柱方法、CTAB法和改良SDS法的DNA浓度显著高于其他方法。根据小麦细胞分裂素氧化酶基因1(TaCKX1)的DNA序列设计引物,以新鲜DNA样品用于PCR扩增大于1 000bp的片段时,后4种方法扩增效果优于前3种方法;DNA在-20℃下保存100d后重新进行PCR扩增时,则只有Qiagen试剂盒和再生Qiagen硅胶柱2种方法提取的DNA能扩增出大于1 000bp的片段。采用本实验室与新西兰坎特伯雷大学合作建立的再生硅胶柱与自配提取液提取小麦基因组DNA,既保证了DNA的高质量,又降低了使用试剂盒的成本,为小麦TILLING库的构建及其他相关试验提供了一种经济有效的DNA提取方法。 展开更多
关键词 小麦 TILLING 基因组dna 提取方法
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一种高效快速的鱼类标本基因组DNA提取方法 被引量:17
15
作者 乐小亮 章群 +1 位作者 赵爽 范凤娟 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期202-204,共3页
以95%酒精保存的黄鳝(M onopterus albus)和斑鳢(Channa maculates)标本为材料,采用先沉降DNA再去除杂质的方法从鱼类标本中提取基因组DNA。基因组DNA的琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度法检测以及PCR扩增结果显示,本方法提取的鱼类基因组... 以95%酒精保存的黄鳝(M onopterus albus)和斑鳢(Channa maculates)标本为材料,采用先沉降DNA再去除杂质的方法从鱼类标本中提取基因组DNA。基因组DNA的琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度法检测以及PCR扩增结果显示,本方法提取的鱼类基因组DNA的电泳主带清晰明亮;A260/A280值在1.7830-2.0144之间;PCR扩增产物条带清晰明亮,且单一整齐没有拖带,表明本方法可从酒精保存的鱼类标本中提取比较纯净的DNA,能够满足一般分子生物学试验需要。与传统苯酚/氯仿法相比,本方法操作简单快速,避免了苯酚等物质对后续实验的影响,可作为一种常规动物组织DNA提取方法。 展开更多
关键词 鱼类 动物组织 基因组dna提取
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稻蝗属基因组DNA提取方法 被引量:18
16
作者 刘波 郑哲民 +1 位作者 张迎春 刘缠民 《陕西师大学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 1999年第3期97-99,共3页
运用一种改进的方法对稻蝗属新鲜标本、酒精浸泡标本及干标本进行基因组 D N A 提取.样品经检测,谱带基本呈线形,无拖尾, O D(260/280 nm )值667% 在16~18 之间.
关键词 基因组 dna提取 稻蝗属 提取
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桃基因组DNA提取方法及部位的比较研究 被引量:10
17
作者 郭金英 范崇辉 +3 位作者 王力荣 朱更瑞 方伟超 李红娟 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期205-207,共3页
通过对桃基因组DNA几种提取方法所得的DNA质量分析,表明分步离心法是最为理想的提取方法,能满足RAPD及其他分子生物学研究的需要。用此方法提取桃不同部位基因组DNA,结果分析表明,从嫩叶和幼嫩果实提取DNA产率较高。
关键词 dna 提取方法 分步离心法 基因组 部位 比较研究 生物学 嫩叶 幼嫩果实
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菊芋基因组DNA提取方法的比较 被引量:11
18
作者 赵孟良 韩睿 +1 位作者 马胜超 李莉 《中国蔬菜》 北大核心 2012年第07X期41-44,共4页
采用改良CTAB法、改进的高盐SDS法及两种植物基因组DNA提取试剂盒法等4种方法提取菊芋基因组DNA,并进行电泳分析、质量检测及ISSR引物扩增检测。结果表明,改良CTAB法优于其他3种方法,提取的DNA质量较好、纯度较高,能够满足ISSR-PCR扩增... 采用改良CTAB法、改进的高盐SDS法及两种植物基因组DNA提取试剂盒法等4种方法提取菊芋基因组DNA,并进行电泳分析、质量检测及ISSR引物扩增检测。结果表明,改良CTAB法优于其他3种方法,提取的DNA质量较好、纯度较高,能够满足ISSR-PCR扩增要求。 展开更多
关键词 菊芋 基因组dna 提取方法
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8种水稻基因组DNA提取方法的比较 被引量:11
19
作者 朱世杨 罗天宽 +3 位作者 张小玲 陈海英 唐征 刘庆 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第5期1929-1931,共3页
[目的]寻找操作简便、耗时短、成本低的水稻基因组DNA提取方法。[方法]分别以水稻幼嫩黄化叶片和老叶片为材料,用8种方法提取其中的DNA,测定所提DNA的浓度和纯度,并对其进行PCR扩增和电泳检测,比较各方法的提取效果。[结果]8种方法提取... [目的]寻找操作简便、耗时短、成本低的水稻基因组DNA提取方法。[方法]分别以水稻幼嫩黄化叶片和老叶片为材料,用8种方法提取其中的DNA,测定所提DNA的浓度和纯度,并对其进行PCR扩增和电泳检测,比较各方法的提取效果。[结果]8种方法提取的DNA浓度分别为35.15、30.80、67.30、26.15、23.55、8.95、48.05、54.26μg/ml,方法③提取的DNA浓度最大,但PCR扩增效果较差;改进的SDS法(方法⑦、⑧)提取的DNA纯度较高,PCR扩增产物电泳条带较亮,但这2种方法操作程序复杂,成本较高,提取每份样品的成本分别为14、31元,远高于其他提取方法。[结论]除方法③外,其余5种简化方法均能得到较高质量的水稻基因组DNA,且提取成本远低于传统SDS法。 展开更多
关键词 水稻 基因组dna 提取
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鱼类血液基因组DNA提取方法优化 被引量:9
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作者 刘哲 康鹏天 +2 位作者 柴文琼 王太 刘晓敏 《水生态学杂志》 北大核心 2009年第6期102-106,共5页
以冷水性虹鳟鱼抗凝冷冻全血为材料,分别采用氯仿-醋酸钾法、RGDE(Rapid genomic DNA extraction)法、改进的RGDE法、传统酚-氯仿法、试剂盒法提取基因组DNA,琼脂糖凝胶电泳检测显示改进的RGDE法可以获得较高质量的鱼类基因组DNA。进... 以冷水性虹鳟鱼抗凝冷冻全血为材料,分别采用氯仿-醋酸钾法、RGDE(Rapid genomic DNA extraction)法、改进的RGDE法、传统酚-氯仿法、试剂盒法提取基因组DNA,琼脂糖凝胶电泳检测显示改进的RGDE法可以获得较高质量的鱼类基因组DNA。进一步将改进的RGDE法提取血液基因组DNA的效果与传统酚-氯仿法提取血液、肌肉基因组DNA及试剂盒法提取血液基因组DNA的效果通过紫外分光光度计测定浓度和纯度进行比较。结果表明,改进RGDE法提取的基因组DNA平均浓度为1050ng/μL,极显著高于用试剂盒从血液中提取的DNA浓度,显著高于酚-氯仿法从血液和肌肉中提取的DNA浓度,DNA产量为1575μg/mL,A260/A280比值1.65-1.97。采用改进的RGDE法提取DNA,全过程只需2h,具有速度快、成本低、无污染、无需特殊设备的明显优点,而且随机扩增的结果稳定,电泳条带清晰。 展开更多
关键词 鱼类 基因组dna 提取方法 优化
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