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乳酸菌基因组规模代谢建模研究与在食品体系中的应用进展
被引量：
1
1
作者
刘子豪
倪皓洁
+3 位作者
李文璐
王凤忠
王彦波
曾黉
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2024年第24期348-356,共9页
乳酸菌具有改善食品风味、提高营养价值等重要作用,被广泛应用于食品发酵领域。基因组规模代谢模型是研究微生物代谢的重要工具,可以模拟生物体内代谢网络、准确描述基因型-表型关系,目前已成功应用于乳酸菌代谢调控等研究中。本文系统...
乳酸菌具有改善食品风味、提高营养价值等重要作用,被广泛应用于食品发酵领域。基因组规模代谢模型是研究微生物代谢的重要工具,可以模拟生物体内代谢网络、准确描述基因型-表型关系,目前已成功应用于乳酸菌代谢调控等研究中。本文系统回顾了近20年以来构建的乳酸菌基因组规模代谢模型,并重点综述了现有模型在食品体系中的应用情况。本文在分析现有模型存在的主要挑战与局限性的同时,结合目前新技术、新思想对其未来发展方向进行展望,旨在为未来如何更加有效、准确地将乳酸菌基因组规模代谢模型有机地应用在食品工业,辅助食品微生物群落智慧设计提供参考。
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关键词
乳酸菌
基因组规模代谢模型
代谢
模拟
食品工业
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职称材料
乳酸菌全基因组测序的应用进展
被引量：
7
2
作者
张彦位
杨玲
+6 位作者
路江浩
严超
仵红岩
李玲
刘明月
齐世华
何方
《食品工业科技》
CAS
北大核心
2022年第15期444-450,共7页
乳酸菌在自然界中广泛存在,具有丰富的物种多样性,在食品、饲料和医药等领域广泛应用,目前市场上绝大多数的益生菌都是乳酸菌。近年来,全基因组测序技术蓬勃发展,大大促进了乳酸菌资源的开发与应用。基于乳酸菌的全基因组信息可以系统...
乳酸菌在自然界中广泛存在,具有丰富的物种多样性,在食品、饲料和医药等领域广泛应用,目前市场上绝大多数的益生菌都是乳酸菌。近年来,全基因组测序技术蓬勃发展,大大促进了乳酸菌资源的开发与应用。基于乳酸菌的全基因组信息可以系统且全面地了解菌株的代谢特征、潜在的益生功能与应用方向,可以更加准确地探究乳酸菌的遗传、进化和分类。乳酸菌安全性评价程序要求在基因组水平检索是否存在耐药、毒力和致病性相关基因,并判定相关基因是否可水平转移。应用全基因组测序技术,比较不同代次菌株基因组中基因序列和结构差异,可高效、完整地判定乳酸菌在产业化应用过程中的遗传性和稳定性。在全基因组信息基础上,重构基因组规模代谢网络模型,可模拟并预测菌体细胞在特定环境下的行为,能系统地指导菌株的代谢工程策略。本文对全基因组测序技术在乳酸菌代谢特性、遗传进化、安全性和稳定性方面的应用现状进行了综述,旨在为乳酸菌基因组学研究提供理论支持。
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关键词
乳酸菌
基因组
学
安全性
稳定性
基因组
规模
代谢
网络
模型
(GSMM)
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职称材料
题名
乳酸菌基因组规模代谢建模研究与在食品体系中的应用进展
被引量：
1
1
作者
刘子豪
倪皓洁
李文璐
王凤忠
王彦波
曾黉
机构
北京工商大学食品与健康学院
中国农业科学院农产品加工研究所
出处
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2024年第24期348-356,共9页
基金
农业农村部农产品质量安全收贮运管控重点实验室开放课题项目(S2023KFKT-06)。
文摘
乳酸菌具有改善食品风味、提高营养价值等重要作用,被广泛应用于食品发酵领域。基因组规模代谢模型是研究微生物代谢的重要工具,可以模拟生物体内代谢网络、准确描述基因型-表型关系,目前已成功应用于乳酸菌代谢调控等研究中。本文系统回顾了近20年以来构建的乳酸菌基因组规模代谢模型,并重点综述了现有模型在食品体系中的应用情况。本文在分析现有模型存在的主要挑战与局限性的同时,结合目前新技术、新思想对其未来发展方向进行展望,旨在为未来如何更加有效、准确地将乳酸菌基因组规模代谢模型有机地应用在食品工业,辅助食品微生物群落智慧设计提供参考。
关键词
乳酸菌
基因组规模代谢模型
代谢
模拟
食品工业
Keywords
lactic acid bacteria
genome-scale metabolic model
metabolic simulation
food industry
分类号
TS201.3 [轻工技术与工程—食品科学]
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职称材料
题名
乳酸菌全基因组测序的应用进展
被引量：
7
2
作者
张彦位
杨玲
路江浩
严超
仵红岩
李玲
刘明月
齐世华
何方
机构
河北一然生物科技股份有限公司
四川大学华西公共卫生学院
出处
《食品工业科技》
CAS
北大核心
2022年第15期444-450,共7页
基金
河北省科技厅农业高质量发展关键共性技术攻关专项(21322804D)。
文摘
乳酸菌在自然界中广泛存在,具有丰富的物种多样性,在食品、饲料和医药等领域广泛应用,目前市场上绝大多数的益生菌都是乳酸菌。近年来,全基因组测序技术蓬勃发展,大大促进了乳酸菌资源的开发与应用。基于乳酸菌的全基因组信息可以系统且全面地了解菌株的代谢特征、潜在的益生功能与应用方向,可以更加准确地探究乳酸菌的遗传、进化和分类。乳酸菌安全性评价程序要求在基因组水平检索是否存在耐药、毒力和致病性相关基因,并判定相关基因是否可水平转移。应用全基因组测序技术,比较不同代次菌株基因组中基因序列和结构差异,可高效、完整地判定乳酸菌在产业化应用过程中的遗传性和稳定性。在全基因组信息基础上,重构基因组规模代谢网络模型,可模拟并预测菌体细胞在特定环境下的行为,能系统地指导菌株的代谢工程策略。本文对全基因组测序技术在乳酸菌代谢特性、遗传进化、安全性和稳定性方面的应用现状进行了综述,旨在为乳酸菌基因组学研究提供理论支持。
关键词
乳酸菌
基因组
学
安全性
稳定性
基因组
规模
代谢
网络
模型
(GSMM)
Keywords
lactic acid bacteria
genomics
safety
stability
genome-scale metabolic network model(GSMM)
分类号
TS201.3 [轻工技术与工程—食品科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
乳酸菌基因组规模代谢建模研究与在食品体系中的应用进展
刘子豪
倪皓洁
李文璐
王凤忠
王彦波
曾黉
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2024
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
乳酸菌全基因组测序的应用进展
张彦位
杨玲
路江浩
严超
仵红岩
李玲
刘明月
齐世华
何方
《食品工业科技》
CAS
北大核心
2022
7
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