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口蹄疫病毒G-01株基因组编码区的序列分析
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作者 索青利 赵明秋 +2 位作者 陈金顶 陈立军 黄忠强 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期95-99,共5页
参考GenBank中注册的O型口蹄疫病毒(FMDV)全基因序列,分段设计了9对引物,应用RT-PCR方法对G-01株的基因组编码区序列进行了克隆和序列测定,获得了该毒株基因组编码区的核苷酸序列(6966 bp)并推导出其编码的氨基酸序列(2322 aa).... 参考GenBank中注册的O型口蹄疫病毒(FMDV)全基因序列,分段设计了9对引物,应用RT-PCR方法对G-01株的基因组编码区序列进行了克隆和序列测定,获得了该毒株基因组编码区的核苷酸序列(6966 bp)并推导出其编码的氨基酸序列(2322 aa).将获得的G-01株基因组编码区的核苷酸序列与参考的14株FMDV基因序列进行比较,结果表明,本毒株的3A蛋白的92~101位缺失10 aa,VP1基因的133~160位的关键位点没有变化,该毒株与以HKN/2002株为代表的7株O型毒株的同源性较高,与HKN/2002株遗传关系最近,而与另外7株O型毒株同源性较低,其遗传关系也较远.由此推断G-01与HKN/2002株属于遗传关系较近的毒株,这2株病毒有着相同的进化起源. 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 基因组编码 序列分析
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禽流感病毒基因组编码的蛋白及功能 被引量:1
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作者 王彦辉 郑明学 《国外畜牧学(猪与禽)》 2007年第2期62-65,共4页
禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)基因组由8条单股负链RNA组成,编码10种蛋白,8种结构蛋白和2种非结构蛋白,文章对AIV基因组编码的蛋白及其功能进行了概述,可为AIV预防和治疗技术的研究提供参考。
关键词 禽流感病毒 蛋白结构 功能 基因组编码
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基于全基因组编码区序列的烟草花叶病毒分子进化分析 被引量:3
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作者 刘天波 周志成 +2 位作者 彭曙光 曾维爱 唐前君 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期87-92,107,共7页
为揭示烟草花叶病毒分子进化特征,从GenBank中下载已报道的烟草花叶病毒全基因组编码区序列,进行重组、系统发育、遗传变异、种群结构和基因漂流等分析。结果表明:突变和负选择作用是驱动烟草花叶病毒进化的主要作用力,种群结构稳定,处... 为揭示烟草花叶病毒分子进化特征,从GenBank中下载已报道的烟草花叶病毒全基因组编码区序列,进行重组、系统发育、遗传变异、种群结构和基因漂流等分析。结果表明:突变和负选择作用是驱动烟草花叶病毒进化的主要作用力,种群结构稳定,处于扩张趋势中,基因变异程度低,重组在烟草花叶病毒分子进化中作用不明显。烟草花叶病毒不同分离物形成3个有一定地理相关性的种群ChinaⅠ、ChinaⅡ和Europe。欧洲分离物核苷酸序列多样性比中国的差异大,Europe和ChinaⅠ种群可能受到遗传漂变影响,Europe与ChinaⅡ、ChinaⅠ与ChinaⅡ之间存在发生基因交流的渠道。 展开更多
关键词 烟草花叶病毒 基因组编码序列 系统发育 分子进化
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我国登革4型病毒广州株基因组非编码区序列测定及分析
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作者 王鹏程 秦鄂德 +4 位作者 耿丽卿 于曼 赵卫 陈水平 苑锡同 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2001年第4期6-9,共4页
目的 测定和分析我国登革 4型病毒广州 (D4-B5 )株基因组非编码区 (NCR)序列 ,为探讨其结构特征与功能的关系提供依据。方法 从登革 4型病毒感染的乳鼠脑中提取总RNA ,采用RACE法扩增病毒基因组 5’和 3’端片段 ,分别将其克隆至pGEM... 目的 测定和分析我国登革 4型病毒广州 (D4-B5 )株基因组非编码区 (NCR)序列 ,为探讨其结构特征与功能的关系提供依据。方法 从登革 4型病毒感染的乳鼠脑中提取总RNA ,采用RACE法扩增病毒基因组 5’和 3’端片段 ,分别将其克隆至pGEM -T载体 ,挑取阳性克隆进行序列测定 ;利用RNAdraw软件对非编码区二级结构进行预测。结果与结论 我国登革 4型病毒广州株基因组 5′和 3′非编码区长度分别为 10 1nt和 40 3nt,具有黄病毒共有的保守序列和二级结构。与登革4型病毒多米尼加分离株比较显示 ,5′NCR第 5 7和 36位核苷酸的改变对其二级结构有显著的影响 ;3′NCR多处核苷酸差异导致两者预测的二级结构差别较大 ,但均能形成相同的保守结构 ,它们可能对病毒基因组RNA的复制。 展开更多
关键词 登革4型病毒 基因组编码 序列测定 分析
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禽呼肠孤病毒的分子特征和复制周期 被引量:1
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作者 吴艳萍 《中国畜牧业》 2024年第2期45-46,共2页
禽呼肠孤病毒是Orthoreovirus属5种病毒之一,该属还包括非致融哺乳动物呼肠孤病毒、致融哺乳动物呼肠孤病毒和狒狒呼肠孤,以及从爬行动物中分离的致融病毒。禽呼肠孤病毒和哺乳动物呼肠孤病毒是Orthoreovirus属的两个主要类群,尽管它们... 禽呼肠孤病毒是Orthoreovirus属5种病毒之一,该属还包括非致融哺乳动物呼肠孤病毒、致融哺乳动物呼肠孤病毒和狒狒呼肠孤,以及从爬行动物中分离的致融病毒。禽呼肠孤病毒和哺乳动物呼肠孤病毒是Orthoreovirus属的两个主要类群,尽管它们有许多共同的分子特征和物理化学特征,但它们在宿主范围、致病性和基因组编码能力以及各种生物学和血清学特性方面有所不同。 展开更多
关键词 禽呼肠孤病毒 分子特征 哺乳动物呼肠孤病毒 血清学特性 物理化学特征 复制周期 宿主范围 基因组编码
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蛋白质组学主要实验技术的研究进展 被引量:1
6
作者 蔡冬冬 王秀荣 +5 位作者 石霖 武嘉男 陶乐蒙 王馥梅 包红梅 陈化兰 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第7期680-683,共4页
关键词 蛋白质组学 实验技术 人类基因组计划 基因组时代 相对稳定性 基因组编码 生命现象 基因数量
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血清蛋白质组学在肝细胞癌的应用进展 被引量:1
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作者 侯振江 《临床肝胆病杂志》 CAS 2009年第6期471-473,共3页
关键词 血清蛋白质组学 肝细胞癌 蛋白质鉴定技术 蛋白质表达谱 细胞水平 基因组编码 蛋白质分离 肿瘤标志物
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甲型流感病毒宿主范围决定因素的研究进展 被引量:5
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作者 张晓芮 汤思淇 +9 位作者 朱大帷 李海玲 冯亚莉 徐艺娜 苏超凡 冷昊钰 王永涛 张月美 太晓春 张莹 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期869-876,共8页
流感是由流感病毒所引起的一类急性呼吸道疾病。流感病毒分为4种类型:A(甲)、B(乙)、C(丙)和D(丁)。其中甲型流感病毒(Influenza A virus,IAV)的宿主范围极广,除了家禽、鸟类以外,IAV还能感染马、猪、海豹、水貂、老虎、犬、猫等哺乳动... 流感是由流感病毒所引起的一类急性呼吸道疾病。流感病毒分为4种类型:A(甲)、B(乙)、C(丙)和D(丁)。其中甲型流感病毒(Influenza A virus,IAV)的宿主范围极广,除了家禽、鸟类以外,IAV还能感染马、猪、海豹、水貂、老虎、犬、猫等哺乳动物以及人类[1]。IAV基因组编码10种必需蛋白,分别为聚合酶碱性蛋白2(PB2)、聚合酶碱性蛋白1(PB1)、聚合酶酸性蛋白(PA)、血凝素(HA)、核蛋白(NP)、神经氨酸酶(NA)、基质蛋白(M1)、膜蛋白(M2)、非结构蛋白1(NS1)以及非结构蛋白2(NS2),此外其还编码多种附件蛋白,包括PB1-F2蛋白、PA-X蛋白等。 展开更多
关键词 甲型流感病毒 急性呼吸道疾病 基质蛋白 宿主范围 聚合酶 碱性蛋白 非结构蛋白2 基因组编码
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猪细小病毒病的研究进展 被引量:4
9
作者 黄秋月 王传文 《山东畜牧兽医》 2003年第4期41-43,共3页
关键词 细小病毒病 PPV病原特性 病毒结构 病毒基因组 基因组编码 组织嗜性 致病性
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藏猪流行性腹泻病毒感染诊断
10
作者 徐林 张朝辉 +1 位作者 汤承 张斌 《四川畜牧兽医》 2021年第10期50-51,共2页
猪流行性腹泻病毒(PEDV)可引发猪只严重腹泻。PEDV基因组编码的刺突Spike(S)蛋白在感染宿主的过程中具有重要作用,分析S基因可了解PEDV毒株分子特征。藏猪主要生活在青藏高原,腹泻是严重危害藏猪仔猪的常见疾病。1实验材料和方法1.1材料... 猪流行性腹泻病毒(PEDV)可引发猪只严重腹泻。PEDV基因组编码的刺突Spike(S)蛋白在感染宿主的过程中具有重要作用,分析S基因可了解PEDV毒株分子特征。藏猪主要生活在青藏高原,腹泻是严重危害藏猪仔猪的常见疾病。1实验材料和方法1.1材料1.1.1病料某规模化藏猪场病猪的新鲜粪便样本。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 藏猪 分子特征 PEDV 粪便样本 感染宿主 基因组编码 材料和方法
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我国在双生病毒致病机制研究领域取得新进展
11
《蔬菜》 2015年第11期72-,共1页
中国农业科学院植保所作物有害生物功能基因组研究创新团队在双生病毒功能基因组和致病机制方面取得新的研究进展,发现了双生病毒基因组编码的一个新基因AC5,并揭示了该基因在病毒致病过程中的功能以及抑制植物转录水平和转录后水平基... 中国农业科学院植保所作物有害生物功能基因组研究创新团队在双生病毒功能基因组和致病机制方面取得新的研究进展,发现了双生病毒基因组编码的一个新基因AC5,并揭示了该基因在病毒致病过程中的功能以及抑制植物转录水平和转录后水平基因沉默的新机制。 展开更多
关键词 双生病毒 功能基因组 基因沉默 创新团队 中国农业科学院 致病过程 植保所 基因组编码 研究成果
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