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K39型肺炎克雷伯菌噬菌体IME330的生物学特性及基因组特性分析
1
作者
魏晋攀
王灿
赵磊
《安徽医科大学学报》
北大核心
2025年第9期1631-1637,共7页
目的从医院未经处理的污水中分离一株靶向K39型肺炎克雷伯菌裂解性噬菌体,并系统分析其生物学特性及基因组学信息。方法以基于荚膜多糖基因序列鉴定的K39型肺炎克雷伯菌Kp 1000为宿主菌,采用双层琼脂平板法进行噬菌体的分离与纯化。通...
目的从医院未经处理的污水中分离一株靶向K39型肺炎克雷伯菌裂解性噬菌体,并系统分析其生物学特性及基因组学信息。方法以基于荚膜多糖基因序列鉴定的K39型肺炎克雷伯菌Kp 1000为宿主菌,采用双层琼脂平板法进行噬菌体的分离与纯化。通过负染法结合透射电子显微镜观察噬菌体的形态特征,利用噬斑法评估其裂菌谱。进一步测定噬菌体的最佳感染复数(MOI),完成一步生长曲线、温度及酸碱等耐受性实验,评估其生物学特性。最后,提取噬菌体DNA,利用Illumina HiSeq2000测序平台进行全基因组测序,并对测序结果进行注释与分析。结果成功分离到一株特异性靶向K39型肺炎克雷伯菌的裂解性噬菌体,命名为IME330。透射电镜显示,该噬菌体头部直径为(75±1)nm,尾长为(185±1)nm。裂菌谱分析表明,IME330能裂解K39型肺炎克雷伯菌,显示出较窄的宿主范围和高度特异性。其最佳感染复数(MOI)为0.1,裂解量达168 PFU/cell。理化特性实验表明,IME330对高温及酸碱环境(pH 4~10)具有较强的耐受性。基因组分析显示,IME330基因组全长144245 bp,分子量为46463 MDa,G+C含量为44.8%,共编码320个开放阅读框。结论IME330被鉴定为一株新型裂解性肺炎克雷伯菌噬菌体,隶属于有尾噬菌体目。该噬菌体对温度、酸碱等理化因素具有较强耐受性,且表现出高效的裂解能力,但其裂菌谱较窄,宿主特异性较高。
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关键词
肺炎克雷伯菌
噬菌体
生物学
特性
基因组特性分析
透射电镜
一步生长曲线
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题名
K39型肺炎克雷伯菌噬菌体IME330的生物学特性及基因组特性分析
1
作者
魏晋攀
王灿
赵磊
机构
安徽医科大学附属阜阳医院呼吸内科
出处
《安徽医科大学学报》
北大核心
2025年第9期1631-1637,共7页
基金
安徽省自然科学基金青年项目(编号:2108085QH310)
安徽省转化医学研究院科研基金项目(编号:2023zhyx-C100)。
文摘
目的从医院未经处理的污水中分离一株靶向K39型肺炎克雷伯菌裂解性噬菌体,并系统分析其生物学特性及基因组学信息。方法以基于荚膜多糖基因序列鉴定的K39型肺炎克雷伯菌Kp 1000为宿主菌,采用双层琼脂平板法进行噬菌体的分离与纯化。通过负染法结合透射电子显微镜观察噬菌体的形态特征,利用噬斑法评估其裂菌谱。进一步测定噬菌体的最佳感染复数(MOI),完成一步生长曲线、温度及酸碱等耐受性实验,评估其生物学特性。最后,提取噬菌体DNA,利用Illumina HiSeq2000测序平台进行全基因组测序,并对测序结果进行注释与分析。结果成功分离到一株特异性靶向K39型肺炎克雷伯菌的裂解性噬菌体,命名为IME330。透射电镜显示,该噬菌体头部直径为(75±1)nm,尾长为(185±1)nm。裂菌谱分析表明,IME330能裂解K39型肺炎克雷伯菌,显示出较窄的宿主范围和高度特异性。其最佳感染复数(MOI)为0.1,裂解量达168 PFU/cell。理化特性实验表明,IME330对高温及酸碱环境(pH 4~10)具有较强的耐受性。基因组分析显示,IME330基因组全长144245 bp,分子量为46463 MDa,G+C含量为44.8%,共编码320个开放阅读框。结论IME330被鉴定为一株新型裂解性肺炎克雷伯菌噬菌体,隶属于有尾噬菌体目。该噬菌体对温度、酸碱等理化因素具有较强耐受性,且表现出高效的裂解能力,但其裂菌谱较窄,宿主特异性较高。
关键词
肺炎克雷伯菌
噬菌体
生物学
特性
基因组特性分析
透射电镜
一步生长曲线
Keywords
K.pneumoniae
phage
biological characteristics
analysis of genomic characteristics
transmission electron microscopy
one-step growth curve
分类号
R459.9 [医药卫生—治疗学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
K39型肺炎克雷伯菌噬菌体IME330的生物学特性及基因组特性分析
魏晋攀
王灿
赵磊
《安徽医科大学学报》
北大核心
2025
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