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代表活性污泥中苯酚降解菌群的ERIC-PCR产物片段的多态性
被引量：
12
1
作者
高平平
王健
+1 位作者
席玉英
赵立平
《生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第6期1095-1100,共6页
对可能代表活性污泥中两个时期的主要苯酚降解菌群的 ERIC- PCR指纹图谱中的两条 2 .1 kb的条带 ( P1和 P8)中的 DNA片段进行克隆、转化 ,得到 1 93个转化子。 H inf I物理图谱分析得到 35种酶切类型 ,将两端各进行 1次测序后 ,同源性大...
对可能代表活性污泥中两个时期的主要苯酚降解菌群的 ERIC- PCR指纹图谱中的两条 2 .1 kb的条带 ( P1和 P8)中的 DNA片段进行克隆、转化 ,得到 1 93个转化子。 H inf I物理图谱分析得到 35种酶切类型 ,将两端各进行 1次测序后 ,同源性大于 90 %的克隆归为一类 ,共得到 1 0种序列类型。对各类型的代表克隆进行了全长测序 ,5种类型为 P1条带所有 ,3种类型为 P8所有 ,二者共享的类型为 2种 ,丰度最高的片段为 S3,P1条带中 76.3%的转化子和 P8条带中 66.7%转化子属该类型。对所得序列进行检索分析 ,它们与 Gen Bank中已知基因序列均无显著同源性。用 S3特异性引物对活性污泥样品及其它在 LB、d CGY、MP和 FWM培养基上的回收菌进行扩增 ,除 LB上的回收菌没有显示目的条带外 ,活性污泥和其回收菌中均检测到带有该基因组片段的菌种的存在。
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关键词
群落结构
ERIC-PCR指纹图
特征性条带
基因组片段测序
活性污泥
苯酚降解菌群
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职称材料
题名
代表活性污泥中苯酚降解菌群的ERIC-PCR产物片段的多态性
被引量：
12
1
作者
高平平
王健
席玉英
赵立平
机构
山西大学生物技术研究所
山西大学环境与资源学院
上海交通大学生命科学技术学院
出处
《生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第6期1095-1100,共6页
基金
国家"863"高科技研究发展计划资助项目( No.SZ-0 3 -0 1 -0 4
2 0 0 1 AA2 1 41 3 1 )~~
文摘
对可能代表活性污泥中两个时期的主要苯酚降解菌群的 ERIC- PCR指纹图谱中的两条 2 .1 kb的条带 ( P1和 P8)中的 DNA片段进行克隆、转化 ,得到 1 93个转化子。 H inf I物理图谱分析得到 35种酶切类型 ,将两端各进行 1次测序后 ,同源性大于 90 %的克隆归为一类 ,共得到 1 0种序列类型。对各类型的代表克隆进行了全长测序 ,5种类型为 P1条带所有 ,3种类型为 P8所有 ,二者共享的类型为 2种 ,丰度最高的片段为 S3,P1条带中 76.3%的转化子和 P8条带中 66.7%转化子属该类型。对所得序列进行检索分析 ,它们与 Gen Bank中已知基因序列均无显著同源性。用 S3特异性引物对活性污泥样品及其它在 LB、d CGY、MP和 FWM培养基上的回收菌进行扩增 ,除 LB上的回收菌没有显示目的条带外 ,活性污泥和其回收菌中均检测到带有该基因组片段的菌种的存在。
关键词
群落结构
ERIC-PCR指纹图
特征性条带
基因组片段测序
活性污泥
苯酚降解菌群
Keywords
ERIC PCR community fingerprinting
signature band
genomic fragment sequencing
分类号
X172 [环境科学与工程—环境科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
代表活性污泥中苯酚降解菌群的ERIC-PCR产物片段的多态性
高平平
王健
席玉英
赵立平
《生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2003
12
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