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弗氏柠檬酸杆菌噬菌体NM4.3生物学特性及全基因组分析
1
作者
陈煜裕
刘畅
+2 位作者
魏永谦
刘春
姜敬哲
《南方水产科学》
北大核心
2025年第4期35-43,共9页
弗氏柠檬酸杆菌(Citrobacter freundii)是近年来牛蛙(Rana catesbeiana)养殖中新出现的高致病性病原菌,其多重耐药性增加了防控难度。从牛蛙养殖尾水中分离出1株裂解弗氏柠檬酸杆菌的噬菌体NM4.3,通过全基因组测序、生物学特性和系统发...
弗氏柠檬酸杆菌(Citrobacter freundii)是近年来牛蛙(Rana catesbeiana)养殖中新出现的高致病性病原菌,其多重耐药性增加了防控难度。从牛蛙养殖尾水中分离出1株裂解弗氏柠檬酸杆菌的噬菌体NM4.3,通过全基因组测序、生物学特性和系统发育分析,评估其潜在应用价值。结果显示,NM4.3为圆环dsDNA噬菌体,基因组大小为174351 bp,GC含量为38.74%,编码310个开放阅读框(ORF),包含病毒粒子结构、宿主裂解及DNA代谢相关功能基因,还额外编码13个tRNA。生物学特性结果表明,NM4.3潜伏期短(10 min),裂解效率高(爆发量76 PFU·细胞−1),在60℃和pH 3~12处理1 h后仍可维持一定活性。基于基因组的核酸序列和保守基因末端酶大亚基(Ter-L)的氨基酸序列分析,鉴定NM4.3属于Straboviridae、Tevenvirinae、Moonvirus,与已知成员的平均核苷酸一致性(ANI)低于95%,定义为该属下的一个新种。基因组注释发现其长尾纤维蛋白存在变异,这可能是影响宿主特异性的因素。
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关键词
弗氏柠檬酸杆菌
噬菌体
生物学特性
基因组测序及分析
系统发育
分析
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题名
弗氏柠檬酸杆菌噬菌体NM4.3生物学特性及全基因组分析
1
作者
陈煜裕
刘畅
魏永谦
刘春
姜敬哲
机构
仲恺农业工程学院动物科技学院
中国水产科学研究院南海水产研究所/农业农村部南海渔业资源开发利用重点实验室
出处
《南方水产科学》
北大核心
2025年第4期35-43,共9页
基金
广东省重点领域研发计划项目(2022B0202110001)
中国水产科学研究院南海水产研究所中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助(2022TS05)
中国水产科学研究院科技创新团队中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助(2023TD44)。
文摘
弗氏柠檬酸杆菌(Citrobacter freundii)是近年来牛蛙(Rana catesbeiana)养殖中新出现的高致病性病原菌,其多重耐药性增加了防控难度。从牛蛙养殖尾水中分离出1株裂解弗氏柠檬酸杆菌的噬菌体NM4.3,通过全基因组测序、生物学特性和系统发育分析,评估其潜在应用价值。结果显示,NM4.3为圆环dsDNA噬菌体,基因组大小为174351 bp,GC含量为38.74%,编码310个开放阅读框(ORF),包含病毒粒子结构、宿主裂解及DNA代谢相关功能基因,还额外编码13个tRNA。生物学特性结果表明,NM4.3潜伏期短(10 min),裂解效率高(爆发量76 PFU·细胞−1),在60℃和pH 3~12处理1 h后仍可维持一定活性。基于基因组的核酸序列和保守基因末端酶大亚基(Ter-L)的氨基酸序列分析,鉴定NM4.3属于Straboviridae、Tevenvirinae、Moonvirus,与已知成员的平均核苷酸一致性(ANI)低于95%,定义为该属下的一个新种。基因组注释发现其长尾纤维蛋白存在变异,这可能是影响宿主特异性的因素。
关键词
弗氏柠檬酸杆菌
噬菌体
生物学特性
基因组测序及分析
系统发育
分析
Keywords
Citrobacter freundii
Phage
Biological characteristics
Genome sequencing and analysis
Phylogenetic analysis
分类号
Q939.48 [生物学—微生物学]
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作者
出处
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被引量
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1
弗氏柠檬酸杆菌噬菌体NM4.3生物学特性及全基因组分析
陈煜裕
刘畅
魏永谦
刘春
姜敬哲
《南方水产科学》
北大核心
2025
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