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题名猪星状病毒的流行病学调查及遗传进化分析
被引量：5
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作者
李本强
陶洁
程靖华
石迎
乔长涛
刘惠莉
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机构
上海市农业科学院畜牧兽医研究所/上海市农业遗传育种重点实验室
上海市种猪工程技术中心
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出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第10期1046-1050,1073,共6页
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基金
上海市科技兴农项目[沪农科创字(2019)第3-2号]。
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文摘
为了解上海地区猪群中猪星状病毒(PAstV)的流行现状及其遗传特性,本研究于2016年~2020年间在上海不同地区10个猪场共采集了1416份仔猪腹泻粪便样品,利用RT-PCR方法及生物信息学技术进行检测与分析。结果显示,PAstV的总阳性率为26.2%,PAstV与其他腹泻病病原的混合感染情况较复杂,二重感染率占比达56.93%,主要以PAstV/猪嵴病毒(PKoV)为主(20.07%);三重感染率占比29.41%,以PAstV/PKoV/猪流行性腹泻病毒(PEDV)(10.09%)感染模式为主;四重感染率为11.4%,以PAstV/牛病毒性腹泻病毒(BVDV)/猪札幌病毒(PoSaV)/猪萨佩罗病毒(PSV)(13.51%)感染为主。猪群中PAstV的流行与气温差有很大关系,在季节交替时节流行率较高,特别是秋冬交替时节。选取其中2个PAstV阳性样品(JS-PAstV和CM-PAstV)进行全基因组序列的测定和分析,结果显示两者的全基因组同源性不高,仅为73.8%。全基因组进化分析显示,CM-PAstV分别与挪威、日本、美国的PAstV 3型的亲缘性较近;而JS-PAstV与匈牙利的PAstV 3型的亲缘性最近。对ORF2基因进行病毒重组分析,显示JS-PAstV和CM-PAstV的ORF2基因均与人星状病毒之间存在重组现象。提示,上海地区猪群中存在PAstV 3型的流行,且遗传距离较远,但存在与人星状病毒重组的风险,需进一步监测关注。本研究数据丰富了国内PAstV的流行病学资料,可为该病的风险防控提供科学数据。
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关键词
猪星状病毒
混合感染
季节性
遗传进化分析
基因序列重组
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Keywords
PAstV
co-infection
seasonality
phylogenetic analysis
virus recombinant
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分类号
S852.65
[农业科学—基础兽医学]
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