我国蚊虫体内感染的Wolbachia的wsp基因序列测定与分析 被引量：11

1

作者 宋社吾 赵彤言 +2 位作者 董言德 蒋书楠 陆宝麟 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期571-577,共7页

测定了我国尖音库蚊复合组和白纹伊蚊蚊虫体内感染的Wolbachia株的wsp基因序列。核苷酸和氨基酸的同源性及系统关系分析表明 ,我国尖音库蚊复合组和白纹伊蚊中Wolbachia株的wsp基因序列与Pip组其它株的核苷酸及氨基酸同源性分别为 98%～... 测定了我国尖音库蚊复合组和白纹伊蚊蚊虫体内感染的Wolbachia株的wsp基因序列。核苷酸和氨基酸的同源性及系统关系分析表明 ,我国尖音库蚊复合组和白纹伊蚊中Wolbachia株的wsp基因序列与Pip组其它株的核苷酸及氨基酸同源性分别为 98%～ 10 0 %和 97%～ 10 0 % ,属B大组Wolbachia中的Pip组。 展开更多

关键词 蚊虫 体内感染 WOLBACHIA 基因序列测定 尖音库蚊复合组 白纹伊蚊 昆虫共生微物

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人源性抗HBc单链抗体的筛选、鉴定及基因序列测定

2

作者 汤正好 马会慧 +3 位作者 陈文思 顾琳 李刚 姚集鲁 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期329-333,共5页

目的 :筛选人源性抗乙型肝炎病毒核心蛋白 (HBc)单链抗体 (ScFv)并在体外原核表达、鉴定和基因序列测定 ,为抗HBcScFv的进一步研究奠定基础。方法 :采用噬菌体表面展示技术 ,以乙肝病毒核心抗原为包被抗原 ,从人源性单链噬菌体抗体库中... 目的 :筛选人源性抗乙型肝炎病毒核心蛋白 (HBc)单链抗体 (ScFv)并在体外原核表达、鉴定和基因序列测定 ,为抗HBcScFv的进一步研究奠定基础。方法 :采用噬菌体表面展示技术 ,以乙肝病毒核心抗原为包被抗原 ,从人源性单链噬菌体抗体库中经过 3轮“吸附 -感染 -扩增”的筛选过程 ,获得抗原结合活性较强的人源性抗HBc单链抗体阳性克隆 ,并在大肠杆菌HB2 15 1中进行ScFv可溶性表达 ,对其进行免疫学鉴定和序列测定。结果 :筛选出的ScFv具有抗HBc的特异性 ,并可在大肠杆菌中进行可溶性表达 ;基因序列测定表明 ,该ScFv的重链段基因与人类免疫球蛋白重链可变区相符 ,轻链段基因为人类免疫球蛋白κ轻链可变区。结论 :利用噬菌体抗体库技术 。 展开更多

关键词 人源性抗HBc单链抗体 筛选 鉴定 基因序列测定 乙型肝炎

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可可的全基因序列测定计划将完成

3

作者 黄艳 《世界热带农业信息》 2008年第7期27-27,共1页

关键词 基因序列测定 可可 美国农业部 农业科研 鬼帚病 果腐病 霜霉病 病害

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甘薯羽状斑驳病毒分离物的基因组3′-末端序列测定与分析 被引量：5

4

作者 林林 陈炯 +1 位作者 郑红英 陈剑平 《浙江农业学报》 CSCD 2003年第4期211-214,共4页

采用马铃薯Y病毒属通用引物,从甘薯羽状斑驳病毒(SPFMV)山东济南分离物和浙江杭州分离物基因组3′ 末端扩增到一个含1814个核苷酸的序列,序列号分别为AJ310201和AJ310202。两个序列均包括NIb基因部分序列(nts1 645)、外壳蛋白基因(nts64... 采用马铃薯Y病毒属通用引物,从甘薯羽状斑驳病毒(SPFMV)山东济南分离物和浙江杭州分离物基因组3′ 末端扩增到一个含1814个核苷酸的序列,序列号分别为AJ310201和AJ310202。两个序列均包括NIb基因部分序列(nts1 645)、外壳蛋白基因(nts646 1590)和3′ UTR(nts1594-1814),3′ 末端具有典型的poly(A)尾。外壳蛋白基因核苷酸系统进化树分析和氨基酸分析表明,以前对一些SPFMV分离物的命名有待商榷,一些相关性较强的分离物可分为3个进化主要群体,我国两个分离物属于第二群体。 展开更多

关键词 甘薯羽状斑驳病毒 分子鉴定 基因序列测定

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斜带石斑鱼神经坏死病毒基因组RNA1和RNA2序列测定及分析 被引量：9

5

作者 陈晓艳 翁少萍 +3 位作者 吕玲 黄剑南 殷志新 何建国 《中山大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期73-77,共5页

根据GenBank数据库公布的鱼类神经坏死病毒(nervousnecrosisvirus,NNV)同源序列设计了7对特异性引物,采用RT＿PCR方法扩增出目的片断,将PCR产物测序和分析。斜带石斑鱼Epinepheluscoioides神经坏死病毒(orange＿spottedNNV,OGNNV)基因... 根据GenBank数据库公布的鱼类神经坏死病毒(nervousnecrosisvirus,NNV)同源序列设计了7对特异性引物,采用RT＿PCR方法扩增出目的片断,将PCR产物测序和分析。斜带石斑鱼Epinepheluscoioides神经坏死病毒(orange＿spottedNNV,OGNNV)基因组由两个片断(RNA1和RNA2)组成,RNA1由3103个核苷酸组成,含有一个开放阅读框,编码982个氨基酸;RNA2由1433个核苷酸组成,含有一个开放阅读框,编码338个氨基酸。OGNNV基因组与新加坡GGNNV(greasygrouperNNV)的基因组有高度的相似性。分析病毒的RNA2序列发现:OGNNV与DGNNV(dragongrouperNNV)、RGNNV(redspottedNNV)和GGNNV的亲缘关系很近,并且具有相同的中和位点;分析病毒的RNA1序列,发现在OGNNV的RNA1序列中同样可以找到依赖RNA的RNA聚合酶的6个模序(motif)。根据同源性比较和系统进化分析,OGNNV属于RGNNV血清型的成员。 展开更多

关键词 斜带石斑鱼Epinephelus coioides神经坏死病毒 基因组序列测定与分析 β诺达病毒

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狂犬病毒GSQY-Dog-China-2013株全基因组序列测定和遗传进化分析

6

作者 邢广旭 姜中毅 +2 位作者 焦文强 王方雨 张改平 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2023年第1期8-13,共6页

为了全面分析我国狂犬病病毒遗传进化情况,本试验使用反转录PCR(RT-PCR)方法将狂犬病病毒GSQY-Dog-China-2013分为10个片段进行扩增,回收目的片段并与pMD20-T simple载体连接,转化JM109感受态细胞,挑取阳性克隆进行测序;使用DNASTAR软... 为了全面分析我国狂犬病病毒遗传进化情况,本试验使用反转录PCR(RT-PCR)方法将狂犬病病毒GSQY-Dog-China-2013分为10个片段进行扩增,回收目的片段并与pMD20-T simple载体连接,转化JM109感受态细胞,挑取阳性克隆进行测序;使用DNASTAR软件中的Edit Seq通过拼接相邻片段之间的重叠序列获得GSQY-Dog-China-2013全基因组序列,构建系统进化树进行遗传进化分析。结果显示,GSQY-Dog-China-2013全长11924核苷酸(nt),包含5个开放阅读框,分别编码核蛋白(N)、磷蛋白(P)、基质蛋白(M)、糖蛋白(G)和转录大蛋白(L);基于全基因组序列的进化树分析显示,GSQY-Dog-China-2013株和国内分离株形成一个分支,在国内分离株中与SXYL15株和SXBJ15株形成一个分支,亲缘关系最接近,提示GSQY-Dog-China-2013可能源自我国陕西省。本试验系甘肃省首次报道狂犬病病毒全基因组序列,进一步丰富了我国狂犬病病毒遗传进化数据,为狂犬病全面防治以及疫苗研发提供了数据支持。 展开更多

关键词 狂犬病病毒 GSQY-Dog-China-2013 全基因组序列测定 遗传进化分析

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关中奶山羊源D型产气荚膜梭菌全基因组序列测定及其分子特征分析 被引量：3

7

作者 吴克 冯航 +1 位作者 王娟 杨增岐 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期3967-3974,共8页

本研究自陕西省富平县某规模化关中奶山羊养殖场腹泻奶山羊肛门拭子中分离到5株产气荚膜梭菌,命名为21-D-1~21-D-5。毒素基因检测表明,其均为携带etx的D型产气荚膜梭菌,且21-D-5携带食源性致病毒素基因cpe。全基因组序列测定显示,5株D... 本研究自陕西省富平县某规模化关中奶山羊养殖场腹泻奶山羊肛门拭子中分离到5株产气荚膜梭菌,命名为21-D-1~21-D-5。毒素基因检测表明,其均为携带etx的D型产气荚膜梭菌,且21-D-5携带食源性致病毒素基因cpe。全基因组序列测定显示,5株D型产气荚膜梭菌基因组大小、GC含量和基因数量稳定;单核苷酸多态性(SNPs)分析显示,21-D-1和21-D-2以及21-D-3和21-D-4之间的SNPs差异极低(<25),表明其大概率属于相同的产气荚膜梭菌菌株。分离的D型产气荚膜梭菌基因组中共检测到15种毒素基因,其中,毒素基因etx在分离的D型菌株中高度保守、基因环境相似,且在菌株21-D-5中毒素基因cpe位于etx下游。此外,包括噁唑烷酮类耐药基因optrA在内的9种耐药基因也在分离株中被检测到,并且erm(A)、optrA和fexA具有共同传播的可能性。本研究为国内首次对D型产气荚膜梭菌进行全基因组序列测定分析,结果对产气荚膜梭菌疾病的防治和基因组的进一步研究具有参考价值。 展开更多

关键词 关中奶山羊 D型产气荚膜梭菌 全基因组序列测定分析

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基因Ⅶ型新城疫病毒蛋鸡分离株的生物学特性及全基因组序列分析

8

作者 蔡丝丝 崔智豪 +3 位作者 刘玲 陈亮 陈瑞爱 王林川 《中国家禽》 北大核心 2015年第9期21-26,共6页

对广东某蛋鸡场新城疫病毒分离株(命名GD0526)进行生物学特性研究及全基因组序列分析,结果显示该分离株具血凝活性,能被特异性新城疫病毒标准阳性血清所抑制,动物回归试验出现新城疫典型症状。该毒株MDT为43.38h、ICPI为1.73、IVPI为2.3... 对广东某蛋鸡场新城疫病毒分离株(命名GD0526)进行生物学特性研究及全基因组序列分析,结果显示该分离株具血凝活性,能被特异性新城疫病毒标准阳性血清所抑制,动物回归试验出现新城疫典型症状。该毒株MDT为43.38h、ICPI为1.73、IVPI为2.37,F基因裂解位点为112R-R-Q-K-R-F117,符合强毒株特征。抗体增长规律和免疫交叉保护试验说明该毒株免疫原性较好,能产生较高水平的抗体,对试验鸡提供很好的保护。全基因组克隆和测序分析表明该毒株全基因组长15192bp,属基因Ⅶd型,与Shangdong-02-2010株核苷酸序列具有很高的同源性,而与LaSota株的相似性较低。 展开更多

关键词 新城疫病毒 型 全基因组序列测定

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鸭坦布苏病毒分离鉴定及全基因组序列分析 被引量：7

9

作者 王宾宾 闫大为 +6 位作者 倪欣涛 李雪松 滕巧泱 杨健美 陈鸿军 刘芹防 李泽君 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2017年第6期8-14,共7页

本文采集2015年浙江省2个鸭养殖场中疑似鸭坦布苏病毒(Duck Tembusu virus,DTMUV)感染的雌麻鸭卵巢病料,经组织研磨处理,DF-1细胞纯化,成功分离了2株鸭坦布苏病毒(DTMUV),分别命名为ZJ201501和ZJ201504。利用9对两两相互重叠的PCR引物,... 本文采集2015年浙江省2个鸭养殖场中疑似鸭坦布苏病毒(Duck Tembusu virus,DTMUV)感染的雌麻鸭卵巢病料,经组织研磨处理,DF-1细胞纯化,成功分离了2株鸭坦布苏病毒(DTMUV),分别命名为ZJ201501和ZJ201504。利用9对两两相互重叠的PCR引物,对这2株病毒的全基因进行分段PCR扩增,经序列测定和拼接,得到病毒的全基因组序列。核苷酸序列和E蛋白氨基酸序列比对分析发现:ZJ201501和ZJ201504的核苷酸同源性高达99.9%,全长氨基酸仅有2个位点差异;与选取的19株DTMUV参考序列相比,在核苷酸水平和E蛋白氨基酸水平上,其同源性分别大于97.1%和98.4%,而ZJ201501和ZJ201504与早期分离的DTMUV FX2010遗传距离最远,这表明DTMUV在鸭群中发生了一定的变异。本研究为进一步了解DTMUV的遗传进化提供了理论依据。 展开更多

关键词 鸭坦布苏病毒 分离鉴定 全基因组序列测定 进化树

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宠物鸟H3N8亚型流感病毒HA基因的特征性分析 被引量：4

10

作者 张云 刘明 +5 位作者 倪健强 华荣虹 于康震 曲连东 Richar Webby Robert GWebster 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期420-424,共5页

来自香港和世界各地的10株宠物鸟H3N8流感病毒的HA基因进行了全基因序列测定,用DNASTAR和Tree View软件进行序列编辑,序列翻译,进化树绘制和分子演化分析。结果表明来自不同国家和地区的H3N8流感病毒的HA基因都非常相似,都形成一个独立... 来自香港和世界各地的10株宠物鸟H3N8流感病毒的HA基因进行了全基因序列测定,用DNASTAR和Tree View软件进行序列编辑,序列翻译,进化树绘制和分子演化分析。结果表明来自不同国家和地区的H3N8流感病毒的HA基因都非常相似,都形成一个独立的分支,属于欧亚亚系,同源率为95 9%～100%;香港2001年宠物鸟的毒株之间的同源率最高,分别为99 2%～100%。HA基因与A/Equine/Jilin/89(H3N8)的同源性为最高,在92 9%～93 6%之间。氨基酸分析表明只有A/Parakeet/Netherland/33/01的HA基因在97～99受体结合位点处有一个额外潜在的糖基化位点NKT;因此可见宠物鸟H3N8流感病毒的HA基因高度保守,HA基因均来自共同的祖先。 展开更多

关键词 HA基因 宠物鸟 位点 流感病毒 毒株 同源性 基因序列测定 亚型 受体结合 糖基化

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人KiSS-1基因克隆及其真核表达载体的构建 被引量：1

11

作者 王春晖 乔宠 戴显伟 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期218-219,共2页

目的:克隆转移抑制基因KiSS1的不含信号肽的表达序列,构建人KiSS1基因的真核表达载体。方法:从人正常胰腺组织中提取总RNA,经RT PCR得到KiSS1基因开放阅读框cDNA序列,并将其克隆到真核表达载体pcDNA3中,构建真核表达质粒pcDNA3/KiSS1。... 目的:克隆转移抑制基因KiSS1的不含信号肽的表达序列,构建人KiSS1基因的真核表达载体。方法:从人正常胰腺组织中提取总RNA,经RT PCR得到KiSS1基因开放阅读框cDNA序列,并将其克隆到真核表达载体pcDNA3中,构建真核表达质粒pcDNA3/KiSS1。结果:经PCR、酶切鉴定和基因序列测定,证实重组入载体pcDNA3的片段为目的基因开放阅读框的核苷酸序列。结论:重组质粒pcDNA3/KiSS1的成功构建,为该基因相应蛋白质的表达和其抗体的制备研究提供基础。 展开更多

关键词 真核表达载体 基因克隆 KISS-1基因 pcDNA3 开放阅读框 转移抑制基因 正常胰腺组织 cDNA序列 RT-PCR 真核表达质粒 基因序列测定 核苷酸序列 表达序列 总RNA 酶切鉴定 目的基因 重组质粒 信号肽 蛋白质 栽体

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鲇源迟钝爱德华氏菌分离鉴定与药物敏感性研究

12

作者 徐小雅 关丽 唐治宇 《科学养鱼》 2025年第6期55-56,共2页

2024年,辽宁省某淡水养殖场突发鲇死亡现象,其临床症状主要表现为肛门红肿,腹部膨大、鳍基充血;剖检后发现其肝、胆、脾肾肿大,肝脏、肾脏出血伴明显坏死灶,肠道无容物且内壁充血,并伴有腹水。本研究从发病鲇中分离出一株优势菌,通过对... 2024年,辽宁省某淡水养殖场突发鲇死亡现象,其临床症状主要表现为肛门红肿,腹部膨大、鳍基充血;剖检后发现其肝、胆、脾肾肿大,肝脏、肾脏出血伴明显坏死灶,肠道无容物且内壁充血,并伴有腹水。本研究从发病鲇中分离出一株优势菌,通过对菌落形态观察、生理生化鉴定、基因序列测定等手段,鉴定其为迟钝爱德华氏菌,并进行常用渔用抗菌药物耐药性检测以及中草药体外抑菌试验,以期对该病菌的防治提供参考。 展开更多

关键词 基因序列测定 抗菌药物 药物敏感性

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龈下菌斑及冠状动脉粥样硬化斑块中牙龈卟啉单胞菌的同源性检测 被引量：8

13

作者 刘佳 钟良军 +3 位作者 张源明 梁平 徐隽 倪佳 《实用口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期827-830,共4页

目的:检测牙周袋内牙周致病菌牙龈卟啉单胞菌(P.g)与冠状动脉粥样硬化斑块中牙龈卟啉单胞菌的同源性,探讨慢性牙周炎发生发展与冠心病的相关性。方法:选取15例患有冠状动脉粥样硬化型心脏病伴有慢性牙周炎的患者,分别收集其龈下菌斑样... 目的:检测牙周袋内牙周致病菌牙龈卟啉单胞菌(P.g)与冠状动脉粥样硬化斑块中牙龈卟啉单胞菌的同源性,探讨慢性牙周炎发生发展与冠心病的相关性。方法:选取15例患有冠状动脉粥样硬化型心脏病伴有慢性牙周炎的患者,分别收集其龈下菌斑样本和冠状动脉粥样硬化斑块样本,提取细菌DNA,PCR检测样本中的P.g16S rDNA基因,扩增产物行基因序列的测定。结果:龈下菌斑中的P.g16S rDNA基因与冠状动脉粥样硬化斑块中的P.g16S rDNA基因具有高度同源性。结论:牙周致病菌与冠心病发生发展密切相关,慢性牙周炎是冠心病的危险因素之一,为冠心病及慢性牙周炎的防治提供了依据。 展开更多

关键词 牙龈卟啉单胞菌 聚合酶链反应 基因序列测定 冠心病

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从风湿热患者咽喉中分离出A组β溶血性链球菌1株 被引量：1

14

作者 黄建林 余步云 古洁若 《实用医学杂志》 CAS 2006年第9期1058-1058,共1页

关键词 Β溶血性链球菌 限制性片段长度多态性 风湿热 血清学分型 基因序列测定 分子生物学技术 脉冲场凝胶电泳 emm基因 离出 咽喉

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小鹅瘟病毒与H9N2离流感病毒混合感染的诊治

15

作者 王红利 《河南畜牧兽医（综合版）》 2018年第3期45-46,共2页

近年来，随着养鹅数量及规模的增加，鹅养殖密度的增大，多种鹅传染病不断发生，尤其是对养鹅业影响严重的小鹅瘟和禽流感，近几年的发生呈上升趋势。笔者通过对发病鹅群临床症状及病变的观察，同时结合实验室检测，PCR扩增和目的基因... 近年来，随着养鹅数量及规模的增加，鹅养殖密度的增大，多种鹅传染病不断发生，尤其是对养鹅业影响严重的小鹅瘟和禽流感，近几年的发生呈上升趋势。笔者通过对发病鹅群临床症状及病变的观察，同时结合实验室检测，PCR扩增和目的基因序列测定. 展开更多

关键词 小鹅瘟病毒 混合感染 流感病毒 H9N2 诊治 基因序列测定 实验室检测 PCR扩增

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《海洋与湖沼》2010年第3期导读

16

《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期111-113,共3页

中国沿海7个长蛸（Octopusvariabilis）群体COI基因的遗传变异研究采用线粒体DNA细胞色素氧化酶亚基I（C01）基因序列测定技术分析了中国沿海重要经济头足类长蛸7个野生群体的种群遗传结构及其变异。结果表明，我国长蛸资源存在相对丰... 中国沿海7个长蛸（Octopusvariabilis）群体COI基因的遗传变异研究采用线粒体DNA细胞色素氧化酶亚基I（C01）基因序列测定技术分析了中国沿海重要经济头足类长蛸7个野生群体的种群遗传结构及其变异。结果表明，我国长蛸资源存在相对丰富的遗传多样性， 展开更多

关键词 细胞色素氧化酶 导读 湖沼 海洋 种群遗传结构 基因序列测定 线粒体DNA 野生群体

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炎性肝肿瘤细胞中常见体细胞框架缺失激活gp130

17

作者 王一阳 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期576-576,共1页

关键词 肝肿瘤细胞 炎性蛋白 激活过程 GP130 体细胞 基因序列测定 细胞介素-6 信号通路

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