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鸡群中鸡传染性贫血病原与抗体检测及分离株VP1基因序列分析 被引量:2
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作者 冯笑艳 胡明雪 +10 位作者 林雨萌 刘长军 李凯 祁小乐 崔红玉 高立 王素艳 陈运通 王笑梅 张艳萍 高玉龙 《中国家禽》 北大核心 2024年第2期52-58,共7页
为了解鸡群中鸡传染性贫血病毒(CAV)感染及抗体产生情况,从黑龙江省两个无临床症状鸡群(B群和S群)中,分别采集血清通过ELISA方法进行抗体检测,采集抗凝血并分离淋巴细胞,针对基因组保守序列设计引物,通过PCR方法进行病原检测,并对从B群... 为了解鸡群中鸡传染性贫血病毒(CAV)感染及抗体产生情况,从黑龙江省两个无临床症状鸡群(B群和S群)中,分别采集血清通过ELISA方法进行抗体检测,采集抗凝血并分离淋巴细胞,针对基因组保守序列设计引物,通过PCR方法进行病原检测,并对从B群病原阳性鸡分离到的分离株进行VP1基因序列分析。结果显示,B群和S群CAV抗体阳性率分别为62.7%(79/126)和68.2%(88/129),病原阳性率分别为43.0%(49/114)和62.3%(48/77),其中,B群和S群中抗体和病原双阴性的鸡分别为23.7%(27/114)和15.6%(12/77),而抗体和病原双阳性的鸡分别高达28.1%(32/114)和46.8%(36/77);在双阳性鸡中,B群和S群分别有62.5%(20/32)和58.3%(21/36)抗体滴度在1.0×10^(4)及以上,从B群病原阳性鸡全血中分离到一株CAV(HLJ/2022株),分离株HLJ/2022第394位氨基酸为谷氨酰胺,具有强毒的分子特征;两个鸡群的环境拭子CAV阳性率为10.0%(3/30),存在于消毒前的鸡蛋表面、更衣处和鞋底。研究表明,检测鸡群的CAV抗体阳性率在62.7%以上,病原阳性率在43.0%以上,抗体滴度在1.0×104及以上CAV仍可存在,CAV流行株(HLJ/2022)具有强毒分子特征,鸡群环境中存在CAV污染,结果为CIA防控提供重要的参考意见。 展开更多
关键词 鸡传染性贫血病毒 血清学检测 病原学检测 病毒分离鉴定 VP1基因序列分析
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轻量级多用户可验证隐私保护基因序列分析方案
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作者 胡云舒 周俊 +1 位作者 曹珍富 董晓蕾 《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 2024年第10期2448-2466,共19页
随着云计算、大数据等新兴网络服务的蓬勃发展,数据要素在智慧医疗、科学研究等领域中占据重要地位.基因组测序技术通过对病人基因组序列进行处理来判断病人的患病原因和类别,在多个领域有广泛应用.由于存储、计算资源受限,本地用户通... 随着云计算、大数据等新兴网络服务的蓬勃发展,数据要素在智慧医疗、科学研究等领域中占据重要地位.基因组测序技术通过对病人基因组序列进行处理来判断病人的患病原因和类别,在多个领域有广泛应用.由于存储、计算资源受限,本地用户通常需要租用资源丰富但工作在不可信环境下的云服务器来完成复杂的大规模基因组测序处理函数计算任务.为了保护用户数据隐私及验证计算结果的正确性,国内外现有工作通常的做法是利用公钥全同态加密或安全多方计算技术实现数据隐私保护;利用Yao混淆电路或双线性配对技术实现计算结果的正确性验证.由于密码原语的计算开销和通信开销巨大,均不适用于基因序列分析系统中存储、计算资源受限的本地用户的客观性能需求.为了解决上述挑战性问题,提出了一个轻量级多用户可验证隐私保护基因序列分析方案.首先,构造了一种高效的可验证多密钥同态数据封装机制VMK-HDEM,该方案支持在密文域上对L个不同输入实例的打包计算,用户端Sen_(i)'s公钥加密的使用次数复杂度为O(L),即与其数据集的大小无关,大大降低了资源受限的本地用户的计算开销;在可验证性方面,云服务器生成的密文计算结果正确性验证证据大小复杂度为O(deg_(F))(其中deg_(F)代表外包计算函数的阶),与用户数据集大小无关.然后,基于所构造的新型密码原语VMK-HDEM,设计了一个轻量级高效的可验证隐私保护基因序列分析方案LWPPGS,有效保护了用户基因数据集的隐私和基因序列分析结果的隐私,并高效验证其分析结果的正确性.最后,通过形式化的安全性证明和实验仿真结果表明了所构造方案VMK-HDEM和LWPPGS的安全性和实用性. 展开更多
关键词 多密钥全同态数据封装机制 可验证 基因序列分析 隐私保护 高效性
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16S rRNA基因序列分析法鉴定病原细菌 被引量:95
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作者 朱飞舟 陈利玉 陈汉春 《中南大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第10期1035-1041,共7页
目的:运用16S rRNA基因序列分析法鉴定14种细菌,为该方法的临床应用奠定基础。方法:提取细菌DNA,采用通用引物PCR扩增16S rRNA基因片段并测序。将测序结果用Blastn在线软件在Nucleotide数据库中进行序列同源性比对,根据序列同源性鉴定... 目的:运用16S rRNA基因序列分析法鉴定14种细菌,为该方法的临床应用奠定基础。方法:提取细菌DNA,采用通用引物PCR扩增16S rRNA基因片段并测序。将测序结果用Blastn在线软件在Nucleotide数据库中进行序列同源性比对,根据序列同源性鉴定病原细菌。结果:12种细菌可以鉴定到"种",2种细菌可以鉴定到"属"。结论:16SrRNA基因序列分析是一种有效的病原细菌鉴定方法。 展开更多
关键词 16S RRNA 病原细菌 基因序列分析
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中华哲水蚤线粒体DNA COI基因序列分析 被引量:17
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作者 林元烧 方旅平 +1 位作者 曹文清 李少菁 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期90-93,共4页
采用苯酚 氯仿 异戊醇(25∶24∶1)提取、异丙醇沉淀、酒精洗涤、TE缓冲液保存方法提取了采自胶州湾青岛海域的中华哲水蚤基因组DNA;以相应引物经PCR扩增得到线粒体DNA细胞色素氧化酶 I亚基基因(mtCOI)片段;PCR产物采用化学法进行质粒重... 采用苯酚 氯仿 异戊醇(25∶24∶1)提取、异丙醇沉淀、酒精洗涤、TE缓冲液保存方法提取了采自胶州湾青岛海域的中华哲水蚤基因组DNA;以相应引物经PCR扩增得到线粒体DNA细胞色素氧化酶 I亚基基因(mtCOI)片段;PCR产物采用化学法进行质粒重组(载体pGEM T Easy Vector)、热休克转化重组质粒至大肠杆菌感受态细胞(JM109)、氨苄LB培养基扩大培养;测序.结果表明,中华哲水蚤线粒体COI碱基大小为710 bp(国际基因库索引号AY665663),其碱基组成A、C、G、T含量分别为24.23%、19.15%、22.54%和34.08%;G+C含量为41.69%,A+T为58.31%. 展开更多
关键词 中华哲水蚤 碱基 G+C 线粒体DNA 感受态细胞 PCR产物 基因序列分析 含量 醇沉 重组质粒
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禽流感病毒分离株A/Goose/Guangdong/3/96(H5N1)HA基因序列分析 被引量:11
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作者 贾永清 陈化兰 +4 位作者 邓国华 唐秀英 田国斌 于康震 刘保全 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 2000年第1期25-30,共6页
采用RT_PCR技术,以A/Goose/Guangdong/3/96(H5N1)RNA为模板,扩增了1.73kb 的HA 全基因cDNA。将HAcDNA克隆后进行了序列测定,测序结果表明所扩增的1728 个核苷酸片段包含了完整的HA基因的开放阅读框架和上下游引物序列、蛋白质合成的... 采用RT_PCR技术,以A/Goose/Guangdong/3/96(H5N1)RNA为模板,扩增了1.73kb 的HA 全基因cDNA。将HAcDNA克隆后进行了序列测定,测序结果表明所扩增的1728 个核苷酸片段包含了完整的HA基因的开放阅读框架和上下游引物序列、蛋白质合成的起始密码子和终止密码子。核苷酸序列比较分析结果表明:A/Goose/Guangdong/3/96(H5N1) 与A/Goose/Guangdong/1/96(H5N1)有11 个核苷酸差异,同源率99.4% ;与A/HongKong/156/97(H5N1) 有25 个核苷酸差异,同源率98.6 % ;与A/Chicken/HongKong/258/97 (H5N1) 有30 个核苷酸差异,同源率98.3% ;它们的氨基酸序列同源率依次分别为99 .2 % 、98.6% 和98.1% 。受体结合位点的氨基酸序列完全一致;HA裂解位点氨基酸序列也完全一致,各有5 个碱性氨基酸插入。这说明上述4 个流感病毒分离株可能来自同一个祖先,具有相同的毒力和相似的生物学特性。 展开更多
关键词 禽流感病毒 HA 基因序列分析
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猪捷申病毒HB株的分离与全基因序列分析 被引量:11
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作者 张晓杰 刘业兵 +1 位作者 汤德元 朱向博 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期937-942,共6页
为分析河北省某规模化猪场猪捷申病毒(PTV)的遗传变异和进化关系,作者成功分离到PTV HB株,对其进行了毒力测定和动物回归试验,设计引物进行了全基因序列测定,并与国内外42株PTV全基因序列进行了同源性比较。结果表明猪捷申病毒HB株病毒... 为分析河北省某规模化猪场猪捷申病毒(PTV)的遗传变异和进化关系,作者成功分离到PTV HB株,对其进行了毒力测定和动物回归试验,设计引物进行了全基因序列测定,并与国内外42株PTV全基因序列进行了同源性比较。结果表明猪捷申病毒HB株病毒滴度为10-6.4 TCID50.mL-1,健康仔猪接毒28d后均出现明显猪捷申病症状,该毒株全基因组序列长度为7 090bp。系统进化树分析表明,猪捷申病毒HB株(JQ664746)属于PTV-8型血清型,和国内分离的PTV-jilin/2003株(GQ293092)同源性最高,从而为进一步研究该毒株的遗传变异提供参考。 展开更多
关键词 猪捷申病毒HB株 病毒分离 基因序列分析
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两株鸭源禽呼肠孤病毒S3基因序列分析 被引量:8
7
作者 许秀梅 苏敬良 +3 位作者 黄瑜 傅光华 程龙飞 赵继勋 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2008年第1期12-14,共3页
关键词 基因序列分析 禽呼肠孤病毒 S3 鸭源 呼肠孤病毒科 病毒粒子 节段 ARV
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基于丙型肝炎病毒NS5B基因序列分析的基因分型 被引量:8
8
作者 张继明 尹有宽 +4 位作者 谢怡 卢清 张清波 邬祥惠 翁心华 《中国抗感染化疗杂志》 2003年第5期287-290,共4页
目的 :建立基于丙型肝炎病毒 (HCV)NS5B基因序列分析的基因分型方法 ,对上海地区慢性丙型肝炎进行基因分型。方法 :用HCVRNA实时荧光定量检测试剂盒对慢性丙型肝炎患者血清标本的HCVRNA水平进行定量分析。用逆转录 聚合酶链反应 (RT P... 目的 :建立基于丙型肝炎病毒 (HCV)NS5B基因序列分析的基因分型方法 ,对上海地区慢性丙型肝炎进行基因分型。方法 :用HCVRNA实时荧光定量检测试剂盒对慢性丙型肝炎患者血清标本的HCVRNA水平进行定量分析。用逆转录 聚合酶链反应 (RT PCR)和套式 PCR扩增HCVRNA阳性的 4 1份标本的部分HCVNS5B区基因 ,PCR产物经回收、纯化后直接进行测序分析。从GenBank中下载 2 5份不同基因型的HCV原型序列 ,用NS5B区 2 2 2bp的基因片段构建系统进化树 ,对临床标本相应的HCVNS5B区序列进行分析。结果 :基于HCVNS5B基因序列的系统进化树分析 ,可成功地对本组 4 1份标本进行基因分型。分型结果显示 ,1b型占 85 .4 % (35 / 4 1) ,2a型占 12 .2 0 % (5 / 4 1) ,3a型占 2 .4 4 % (1/ 4 1)。结论 :基于HCVNS5B区基因序列的系统进化树分析是一种可靠和方便的HCV基因分型方法。上海地区的HCV基因型以 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 基因 系统进化树分析 NS5B基因 基因序列分析 基因分型
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我国多斑按蚊复合体mtDNA-COⅡ基因序列分析及系统发育关系研究(双翅目:蚊科) 被引量:6
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作者 李石柱 马雅军 郑哲民 《陕西师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期84-88,共5页
测定并比较分析了我国多斑按蚊复合体5成员种(多斑按蚊、威氏按蚊、伪威氏按蚊、达罗毗按蚊及塞沃按蚊)mtDNA COⅡ的基因序列,并依据该分子特征构建了其系统发育关系.结果显示,多斑按蚊复合体5成员种的COⅡ基因序列长度均为684bp,GC含... 测定并比较分析了我国多斑按蚊复合体5成员种(多斑按蚊、威氏按蚊、伪威氏按蚊、达罗毗按蚊及塞沃按蚊)mtDNA COⅡ的基因序列,并依据该分子特征构建了其系统发育关系.结果显示,多斑按蚊复合体5成员种的COⅡ基因序列长度均为684bp,GC含量范围为24.85%~26.02%;其中多斑按蚊、威氏按蚊和达罗毗按蚊种内差异极小,为0.15%~0.58%;而种间序列差异较大,为3.66%~9.63%.以中华按蚊为外群,分析多斑按蚊复合体5成员种的系统发育关系显示,威氏按蚊和达罗毗按蚊亲缘关系最近,伪威氏按蚊与其它4种的亲缘关系较远. 展开更多
关键词 中国 多斑按蚊 复合体 mtDNA-COⅡ 基因序列分析 系统发育关系 双翅目 蚊科 亲缘关系
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墨吉对虾Penaeus merguiensis线粒体16SrRNA基因序列分析 被引量:14
10
作者 庆宁 林岳光 《华南师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2002年第3期63-67,共5页
比较墨吉对虾 6个群体的线粒体 16SrRNA基因约 4 5 7个碱基对的DNA序列 .结果表明这 6个群体间的遗传距离 (D)在 0 - 0 .0 0 85之间 .未发现广东的
关键词 基因序列分析 墨吉对虾 线粒体16SrRNA基因 RNA序列 遗传变异 遗传距离 亲缘关系
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基因序列分析软件Hmmpfam的可扩展并行性能优化 被引量:4
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作者 陈军 赵文辉 +1 位作者 莫则尧 李晓梅 《软件学报》 EI CSCD 北大核心 2004年第2期170-178,共9页
基于MPI(message passing interface)平台实现了HMMER软件包核心程序之一Hmmpfam的大规模并行计算.该版本针对原PVM(parallel virtual machine)并行版本在并行规模扩大后,master易成为通信瓶颈的问题,对通信结构进行了优化,提出了一种... 基于MPI(message passing interface)平台实现了HMMER软件包核心程序之一Hmmpfam的大规模并行计算.该版本针对原PVM(parallel virtual machine)并行版本在并行规模扩大后,master易成为通信瓶颈的问题,对通信结构进行了优化,提出了一种新的三层通信结构,在序列和HMM模型的两个层次上实现了并行化,并分别提供了有效的负载平衡策略,同时优化了I/O性能,在700多台处理机上达到95%的效率. 展开更多
关键词 并行计算 基因序列分析 HMMER
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2007-2008年同一地点H9N2亚型禽流感病毒连续分离毒株HA基因序列分析 被引量:5
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作者 张毅 尹燕博 +4 位作者 韩丽敏 张巧燕 王新 王建琳 崔尚金 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2009年第5期18-20,共3页
关键词 H9N2亚型禽流感病毒 分离毒株 基因序列分析 HA 地点 发病鸡群 病原鉴定 禽流感疫情
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河南地区猪戊型肝炎病毒的检测及基因序列分析 被引量:3
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作者 张小霞 许锋 +1 位作者 梁振普 乔冠华 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期302-306,共5页
对从河南省郑州、洛阳、新乡、焦作、周口等5地市采集的133份血清样品进行戊型肝炎病毒(Hepatitis EVirus,HEV)IgG抗体分析;通过反转录聚合酶链式反应的方法(RT-PCR)对从郑州、中牟、新郑、济源、濮阳等5个地市采集的200份粪便样品进行H... 对从河南省郑州、洛阳、新乡、焦作、周口等5地市采集的133份血清样品进行戊型肝炎病毒(Hepatitis EVirus,HEV)IgG抗体分析;通过反转录聚合酶链式反应的方法(RT-PCR)对从郑州、中牟、新郑、济源、濮阳等5个地市采集的200份粪便样品进行HEV RNA检测.检测结果表明,79.70%的血清为HEV抗体阳性;7.5%的粪便样品为HEV RNA阳性.通过序列分析证明,3个测序的HEV河南分离株均为基因Ⅳ型.为了进一步研究河南HEV的特点,克隆得到筛选的地理株JY40病毒株基因组3’端826 bp的DNA片段,序列分析结果显示该片段与湖北株相应序列的同源性最高. 展开更多
关键词 戊型肝炎病毒 检测 基因序列分析
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对枝蜈蚣藻的修订研究——基于形态特征和基因序列分析 被引量:5
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作者 刘芳 田伊林 王宏伟 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期1273-1281,共9页
通过形态观察结合rbc L和COⅠ基因序列分析的方法,对采自广东省汕头市、浙江省温州市和辽宁省大连市的对枝蜈蚣藻Grateloupia didymecladia Li et Ding的11个标本进行了重新鉴定。结果表明:(1)藻体单生或丛生,红褐色或深红色,质地黏滑... 通过形态观察结合rbc L和COⅠ基因序列分析的方法,对采自广东省汕头市、浙江省温州市和辽宁省大连市的对枝蜈蚣藻Grateloupia didymecladia Li et Ding的11个标本进行了重新鉴定。结果表明:(1)藻体单生或丛生,红褐色或深红色,质地黏滑、肉质、衰老时软骨质,成熟藻体直立,高15—50 cm,主枝明显,扁平,宽3—15 mm,厚约1 mm,末端渐尖,1—3回羽状分枝。小枝对生或互生,生长在主枝上或主枝边缘,基部缢缩,长短不一,最长可达15 cm;配子体为雌雄异体,果胞枝生殖枝丛和辅助细胞生殖枝丛均为Grateloupia型,果胞枝生殖枝丛主枝由5个细胞组成,辅助细胞生殖枝丛主枝由4个细胞组成(5cpb-4auxb型);四分孢子囊由四分孢子体的内皮层细胞产生,呈十字形分裂。以上特征均与亚栉状蜈蚣藻G.subpectinata Holmes一致。(2)基于rbc L基因序列构建的系统树显示,11个样本之间无碱基差异,形成独立的进化支,与产于韩国和日本的亚栉状蜈蚣藻G.subpectinata Holmes碱基差异分别为1 bp(0.08%)和2 bp(0.17%),属于种内差异;基于COⅠ基因序列构建的系统树显示,11个样本之间无碱基差异,形成独立的进化支,与韩国产的亚栉状蜈蚣藻碱基差异为1 bp(0.18%),属于种内差异。根据形态、结构及基因序列分析,确定对枝蜈蚣藻与亚栉状蜈蚣藻为同一种,根据优先法则,将对枝蜈蚣藻G.didymecladia Li et Ding作为亚栉状蜈蚣藻G.subpectinata Holmes的同物异名。亚栉状蜈蚣藻为中国新记录种。 展开更多
关键词 红藻门 海膜科 对枝蜈蚣藻 亚栉状蜈蚣藻 形态特征 基因序列分析
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几个中国大麦属物种叶绿体psbL和psbJ基因序列分析 被引量:2
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作者 魏育明 颜泽洪 +3 位作者 吴卫 郭红 张志清 郑有良 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 2005年第1期15-19,25,共6页
对8份来源于中国和2份来自国外的不同大麦属物种或亚种叶绿体基因组psbL-psbJ区进行了序列测定。结果表明,10份大麦属材料的psbL-psbJ区序列长度均为365bp,且无变异位点。同时,将大麦属psbL-psbJ区序列与已报道的黑麦(Secalecereale L.... 对8份来源于中国和2份来自国外的不同大麦属物种或亚种叶绿体基因组psbL-psbJ区进行了序列测定。结果表明,10份大麦属材料的psbL-psbJ区序列长度均为365bp,且无变异位点。同时,将大麦属psbL-psbJ区序列与已报道的黑麦(Secalecereale L.)、小麦(Triticumaestivum L.)、水稻(Oryza sativa L.)和玉米(Zea mays L.)的相同序列比较,发现所有物种的psbL基因序列长度均为117bp,且无核酸变异位点;psbJ基因序列长度均为123bp,共检测到6个核酸变异位点。除水稻外,所有物种psbL和psbJ基因间区长度均为125bp,水稻psbL和psbJ基因间区为126bp。在psbL和psbJ基因间区,除水稻具有1个插入位点外,还发现8个核酸变异位点。psbL-psbJ区揭示的大麦属物种、黑麦、小麦、水稻和玉米的遗传分化距离变化范围为0.0055-0.0426。以玉米为外类群,采用邻接法进行系统发育关系分析发现,同属于小麦族的大麦属植物、黑麦和小麦间亲缘关系较近,而水稻与玉米则相对较近。 展开更多
关键词 大麦属 基因序列分析 物种 中国 叶绿体基因 序列长度 序列测定 序列比较 插入位点 遗传分化 关系分析 系统发育 亲缘关系 水稻 变异 玉米 黑麦 核酸 外类群 小麦族 植物
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云南临沧地区蜱种分子生物学鉴定及埃立克体基因序列分析 被引量:1
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作者 亚红祥 张云智 王静林 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期793-797,共5页
目的了解云南临沧地区蜱虫种类及其自然感染埃立克体的情况。方法采集耕牛体表寄生的蜱虫,经形态学鉴定和分组后,从蜱虫中提取DNA,应用PCR扩增蜱虫COI基因以及埃立克体16S rRNA和groEL基因,并测序分析。结果共采集到蜱虫42只,其中微小牛... 目的了解云南临沧地区蜱虫种类及其自然感染埃立克体的情况。方法采集耕牛体表寄生的蜱虫,经形态学鉴定和分组后,从蜱虫中提取DNA,应用PCR扩增蜱虫COI基因以及埃立克体16S rRNA和groEL基因,并测序分析。结果共采集到蜱虫42只,其中微小牛蜱38只占90.48%、血蜱4只占9.52%。将每种蜱的2只为1组,在21组样本中,检出COI片断21份(检出率100%);在相同的4组样本中均检出埃立克体16S rRNA片断和groEL片断4份(检出率19.05%)。基因序列分析,检出的COI片断序列中有2份与澳大利亚pava血蜱(JX573136)的同源性最高(89.3%),其余19份序列与马来西亚微小牛蜱B3的同源性最高(99.5%);检出的4份16S rRNA片断序列完全一致,与美国查菲埃立克体Arkansas和埃文埃立克体Aa2FT349及中国北京查菲埃立克体BY-YQ-HME-O18株的同源性均为100%;检出的4份groEL片断序列也完全一致,与日本埃立克体Yonaguni206株的同源性最高均为93.9%。结论经分子检测证实云南临沧地区耕牛体表微小牛蜱中存在一种类似日本Yonaguni206株的埃立克体感染,耕牛体表还可能寄生一种新的血蜱。 展开更多
关键词 埃立克体 蜱虫 PCR检测 基因序列分析 云南临沧
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绵羊PRND基因序列分析 被引量:1
17
作者 霍桂桃 赵德明 +1 位作者 尹晓敏 周向梅 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2008年第4期8-10,共3页
关键词 基因序列分析 PrP^c 绵羊 PRION 序列同源性 DPL 哺乳动物 二级结构
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鸡传染性支气管炎病毒分离株与疫苗株抗原相关性和S1基因序列分析 被引量:1
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作者 任海松 张秀美 +4 位作者 崔言顺 许传田 杨少华 李建亮 胡北侠 《山东农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2012年第1期74-78,共5页
本实验挑选8株近年来山东省IBV分离株与疫苗株H120和491,利用SPF鸡分别制备了高免阳性血清,进行鸡胚交叉中和试验,计算其抗原相关系数,鉴定其血清型,并结合S1基因序列分析,研究其血清型和基因型之间的关系。结果显示:SDWF0608、SDLY0612... 本实验挑选8株近年来山东省IBV分离株与疫苗株H120和491,利用SPF鸡分别制备了高免阳性血清,进行鸡胚交叉中和试验,计算其抗原相关系数,鉴定其血清型,并结合S1基因序列分析,研究其血清型和基因型之间的关系。结果显示:SDWF0608、SDLY0612、SDLY0701与疫苗株H120同属Mass血清型的不同亚型,其它5个分离株与H120和491不属于同一个血清型。结合S1基因序列分析发现,S1基因序列分析与血清中和结果二者不具有明显的相关性,8个分离株分属三个基因群,其中SDTA06111与H120等同属一个基因群,但血清中和实验显示它们不属于一个血清型;CK/CH/SD09/005与一个参考株独自构成一个基因群,其S1基因变异程度较大,并且能够与两个疫苗株发生交叉中和实验,但不属于一个血清型,它可能是一个基因重组后病毒。 展开更多
关键词 鸡传染性支气管炎 S1基因序列分析 血清中和实验 抗原相关系数(R)
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三株H9N2亚型禽流感病毒HA和NA基因序列分析 被引量:3
19
作者 葛兆宏 《中国家禽》 北大核心 2010年第3期63-65,共3页
禽流感(Avian influenza,AI)是由A型流感病毒引起的一种严重危害禽类健康的传染性疾病。低致病性的H9N2亚型禽流感病毒(AIV)近几年来在国内一些地区发生,不仅造成蛋鸡产蛋下降,也可能诱发青年鸡发生呼吸道感染,从而造成很高的... 禽流感(Avian influenza,AI)是由A型流感病毒引起的一种严重危害禽类健康的传染性疾病。低致病性的H9N2亚型禽流感病毒(AIV)近几年来在国内一些地区发生,不仅造成蛋鸡产蛋下降,也可能诱发青年鸡发生呼吸道感染,从而造成很高的死亡率.AIV存在着广泛的抗原漂移和抗原转变现象,其抗原变异频率很高。本研究采用RT—PCR方法测定了江苏地区某养鸡场2006-2008年分离的3株H9N2亚型AIV血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因,对其变异情况进行了探讨。 展开更多
关键词 H9N2亚型禽流感病毒 基因序列分析 鸡产蛋下降 NA HA A型流感病毒 抗原漂移 变异频率
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辽宁省玉米矮花叶病毒外壳蛋白基因序列分析及株系鉴定
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作者 姜华 高小蓉 +2 位作者 安利佳 刘维志 陆敏 《沈阳农业大学学报》 CAS CSCD 2000年第5期498-502,共5页
对辽宁地区近年发生的玉米矮花叶病毒株系进行了鉴定。电镜下病毒粒子形态呈线条状 ,大小为 (420~750)nm×(13~15)nm ,超薄切片中有风轮状内含体。以病毒RNA为模板 ,按已知的玉米矮花叶病毒外壳蛋白 (CP)基因核苷酸序列合成引物 ... 对辽宁地区近年发生的玉米矮花叶病毒株系进行了鉴定。电镜下病毒粒子形态呈线条状 ,大小为 (420~750)nm×(13~15)nm ,超薄切片中有风轮状内含体。以病毒RNA为模板 ,按已知的玉米矮花叶病毒外壳蛋白 (CP)基因核苷酸序列合成引物 ,逆转录合成cDNA ,以此为模板进行PCR ,扩增出了1kb左右的CP基因片段 ,将这一片段插入到载体pUC19中转化E.coliDH5a菌株 ,得到了CP基因克隆。cDNA序列分析表明 ,和中国已报道的玉米矮花叶病毒B株系 (MDMV -B)外壳蛋白基因序列同源率达98.4% ,氨基酸序列同源率99.4%。由此认为引起辽宁地区玉米矮花叶病的毒原为MDMV 。 展开更多
关键词 玉米矮花叶病毒 毒原鉴定 电镜观察 CP基因序列分析
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