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真菌源水平转移的载脂蛋白D基因影响二斑叶螨的寿命与生殖
被引量:
1
1
作者
陈磊
余心悦
+5 位作者
郭丽雪
陈煜炜
邴孝利
胡琪琪
孙荆涛
洪晓月
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第11期1439-1450,共12页
【目的】载脂蛋白D(apolipoprotein D,ApoD)是一类参与代谢、组织发育、免疫和抗氧化等多项生物功能的胞外蛋白,是抗衰老和延长寿命的重要分子基础。本研究旨在解析ApoD基因在叶螨基因组中的复制与扩张程度及其系统发育,探讨多功能ApoD...
【目的】载脂蛋白D(apolipoprotein D,ApoD)是一类参与代谢、组织发育、免疫和抗氧化等多项生物功能的胞外蛋白,是抗衰老和延长寿命的重要分子基础。本研究旨在解析ApoD基因在叶螨基因组中的复制与扩张程度及其系统发育,探讨多功能ApoD基因对二斑叶螨Tetranychus urticae的寿命和生殖的影响。【方法】联合使用BLASTP,HMMER,TBLASTN和GEMOMA鉴定番茄刺皮瘿螨Aculops lycopersici、截形叶螨Tetranychus truncatus和二斑叶螨基因组中ApoD家族基因;采用最大似然法构建细菌、真菌、植物、哺乳动物、昆虫、瘿螨和叶螨的ApoD系统发育树;依据二斑叶螨在不同发育阶段(卵、若螨、1日龄雌成螨和5日龄雌成螨)和不同寄主植物(菜豆、拟南芥Arabidopsis thaliana、番茄、茄子、棉花和黄瓜)上若螨或成螨的ApoD家族基因表达谱,挑选出ApoDR2,ApoD9,ApoD17和ApoD244个基因,采用dsRNA浸泡法对新羽化的二斑叶螨雌成螨进行ApoDR2,ApoD9,ApoD17和ApoD24的RNAi,并检测10 d内的存活率和单雌日均产卵量。【结果】二斑叶螨基因组中鉴定到68个ApoD基因,近缘种截形叶螨有33个ApoD基因,番茄刺皮瘿螨仅有1个ApoD基因,叶螨科之外的生物普遍拥有1~10个ApoD基因。系统发育分析结果表明,叶螨的ApoD家族主要分为三大簇,分别与昆虫、瘿螨和真菌的脂质转运蛋白基因聚类;叶螨中剧烈扩张的ApoD支系与真菌ApoD基因存在多个特有的一致性位点,且最大似然树显示亲缘关系近。大部分ApoD基因在二斑叶螨若螨和成螨期高水平表达,在二斑叶螨取食不同寄主植物时呈现多样的表达调控模式。与对照相比,沉默ApoDR2和ApoD9对二斑叶螨的适合度无显著影响,沉默ApoD17和ApoD24显著降低了二斑叶螨10 d内存活率和单雌日均产卵量,其中沉默ApoD17对二斑叶螨的存活率和单雌日产卵量影响较大。【结论】推测真菌源水平转移后获得的ApoD基因在叶螨基因组中剧烈扩张,并且对二斑叶螨的寿命和生殖产生了不同程度的影响,但是其在叶螨中的多功能性有待进一步研究。
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关键词
二斑叶螨
载脂蛋白D
水平转移
基因复制与扩张
寿命
生殖
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题名
真菌源水平转移的载脂蛋白D基因影响二斑叶螨的寿命与生殖
被引量:
1
1
作者
陈磊
余心悦
郭丽雪
陈煜炜
邴孝利
胡琪琪
孙荆涛
洪晓月
机构
南京农业大学植物保护学院昆虫学系
出处
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第11期1439-1450,共12页
基金
国家自然科学基金项目(32020103011,32202290)
江苏省自然科学基金项目(BK20221003)。
文摘
【目的】载脂蛋白D(apolipoprotein D,ApoD)是一类参与代谢、组织发育、免疫和抗氧化等多项生物功能的胞外蛋白,是抗衰老和延长寿命的重要分子基础。本研究旨在解析ApoD基因在叶螨基因组中的复制与扩张程度及其系统发育,探讨多功能ApoD基因对二斑叶螨Tetranychus urticae的寿命和生殖的影响。【方法】联合使用BLASTP,HMMER,TBLASTN和GEMOMA鉴定番茄刺皮瘿螨Aculops lycopersici、截形叶螨Tetranychus truncatus和二斑叶螨基因组中ApoD家族基因;采用最大似然法构建细菌、真菌、植物、哺乳动物、昆虫、瘿螨和叶螨的ApoD系统发育树;依据二斑叶螨在不同发育阶段(卵、若螨、1日龄雌成螨和5日龄雌成螨)和不同寄主植物(菜豆、拟南芥Arabidopsis thaliana、番茄、茄子、棉花和黄瓜)上若螨或成螨的ApoD家族基因表达谱,挑选出ApoDR2,ApoD9,ApoD17和ApoD244个基因,采用dsRNA浸泡法对新羽化的二斑叶螨雌成螨进行ApoDR2,ApoD9,ApoD17和ApoD24的RNAi,并检测10 d内的存活率和单雌日均产卵量。【结果】二斑叶螨基因组中鉴定到68个ApoD基因,近缘种截形叶螨有33个ApoD基因,番茄刺皮瘿螨仅有1个ApoD基因,叶螨科之外的生物普遍拥有1~10个ApoD基因。系统发育分析结果表明,叶螨的ApoD家族主要分为三大簇,分别与昆虫、瘿螨和真菌的脂质转运蛋白基因聚类;叶螨中剧烈扩张的ApoD支系与真菌ApoD基因存在多个特有的一致性位点,且最大似然树显示亲缘关系近。大部分ApoD基因在二斑叶螨若螨和成螨期高水平表达,在二斑叶螨取食不同寄主植物时呈现多样的表达调控模式。与对照相比,沉默ApoDR2和ApoD9对二斑叶螨的适合度无显著影响,沉默ApoD17和ApoD24显著降低了二斑叶螨10 d内存活率和单雌日均产卵量,其中沉默ApoD17对二斑叶螨的存活率和单雌日产卵量影响较大。【结论】推测真菌源水平转移后获得的ApoD基因在叶螨基因组中剧烈扩张,并且对二斑叶螨的寿命和生殖产生了不同程度的影响,但是其在叶螨中的多功能性有待进一步研究。
关键词
二斑叶螨
载脂蛋白D
水平转移
基因复制与扩张
寿命
生殖
Keywords
Tetranychus urticae
apolipoprotein D
horizontal transfer
gene duplication and expansion
longevity
reproduction
分类号
Q961 [生物学—昆虫学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
真菌源水平转移的载脂蛋白D基因影响二斑叶螨的寿命与生殖
陈磊
余心悦
郭丽雪
陈煜炜
邴孝利
胡琪琪
孙荆涛
洪晓月
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
1
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