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B/C基因型乙肝病毒对ALT不同水平女性乙肝患者性激素水平和生活质量的影响
1
作者 高鹏 刘才周 +1 位作者 李俊峰 姚立琼 《西安交通大学学报(医学版)》 北大核心 2026年第1期125-131,共7页
目的通过分析B/C基因型的乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)在不同丙氨酸氨基转移酶(alanine aminotransferase,ALT)状态下对女性乙型肝炎(乙肝)患者性激素水平、睡眠质量、心理状况和生活质量的影响,为临床诊治提供理论依据。方法... 目的通过分析B/C基因型的乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)在不同丙氨酸氨基转移酶(alanine aminotransferase,ALT)状态下对女性乙型肝炎(乙肝)患者性激素水平、睡眠质量、心理状况和生活质量的影响,为临床诊治提供理论依据。方法选取兰州大学第一医院2021年1月至2023年12月门诊和住院的不同ALT水平的B/C基因型女性慢性乙肝患者256例,按照就诊的时间顺序,分别入组B基因型(B型)、C基因型(C型)的ALT正常组、UNL≤ALT<2UNL组、ALT≥2UNL组。用电化学发光法测量患者血清中的性激素水平,用自制量表调查问卷询问患者的月经情况,用匹兹堡睡眠质量量表询问评价患者的睡眠质量,用焦虑自评量表、抑郁自评量表评价患者抑郁焦虑情况,用SF-36健康量表评价患者的生活质量。对比分析在不同ALT状态下,B/C基因型的HBV对性激素水平、绝经、睡眠质量、心理状况及生活质量的影响。结果B/C基因型HBV在ALT正常组及UNL≤ALT<2UNL组女性乙肝患者性激素水平、绝经、睡眠质量、心理状况及生活质量的影响无明显差异;而在ALT≥2UNL组中,相对于B型患者,C型患者的雌二醇(E2)明显下降[(81.33±8.80)pg/mL vs.(69.81±10.40)pg/mL],睾酮(T)和卵泡生成激素(FSH)均明显增高[(0.34±0.03)ng/mL vs.(0.42±0.06)ng/mL;(48.21±7.38)mIU/mL vs.(55.24±4.09)mIU/mL],绝经率明显增高(53.49%vs.77.27%),各项睡眠指标(PSQI得分11.53±1.11 vs.14.51±1.64)明显增高,抑郁指数(46.69±6.81 vs.61.59±8.12)、焦虑指数(48.53±6.37 vs.60.00±8.26)明显增高以及各项生活质量指标明显下降(总体健康指数75.85±6.56 vs.63.51±7.49),差异有统计学意义(P<0.05)。结论B型和C型HBV对不同ALT水平的女性乙肝患者性激素水平及生活质量的影响有所不同,这将在临床治疗中有一定的指导意义。 展开更多
关键词 乙型肝炎 基因型 性激素 绝经 睡眠质量 心理 生活质量 丙氨酸氨基转移酶(ALT)
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桃单果质量性状基因型鉴定辅助育种的策略研究
2
作者 别航灵 李勇 +3 位作者 陈昌文 方伟超 王力荣 曹珂 《果树学报》 北大核心 2026年第3期481-492,共12页
【目的】建立桃单果质量(旧称单果重)性状分子标记辅助选择体系,提高育种效率。【方法】总结现有的单果质量分子标记,并结合574份种质基因组重测序数据,在只考虑位点间加性作用的情况下,分析中国育成品种的单果质量育种值,结合位点效应... 【目的】建立桃单果质量(旧称单果重)性状分子标记辅助选择体系,提高育种效率。【方法】总结现有的单果质量分子标记,并结合574份种质基因组重测序数据,在只考虑位点间加性作用的情况下,分析中国育成品种的单果质量育种值,结合位点效应值筛选用于改良现有品种的亲本材料。【结果】选择了SNP、Indel等有特定染色体位置的标记,共46个。结合实验室前期的574份桃栽培品种重测序的遗传变异信息、连锁不平衡和偏分离信息,筛得19个效应值呈现显著异质性的标记位点。对3个优良品种(中油蟠7号、中油蟠15号和华光)育种过程中亲本材料的基因型效应解析发现,中油蟠7号和中油蟠15号在选育过程中,亲本材料的育种值略有起伏,但整体呈现持续增大趋势,而华光在育成过程中,单果质量的育种值呈现直线下降趋势。通过分析目前主栽的30个品种,发现预测效应值与真实观测值之间呈极显著正相关。利用所筛标记从地方品种中筛选对主栽品种有改良意义的亲本种质,如长岭早玉露、白花等。【结论】该研究初步建立了包含19个分子标记的桃单果质量性状分子辅助选择体系,利用其基因型效应值进行叠加计算,可实现对桃单果质量表型的早期预测。 展开更多
关键词 桃 单果质量 基因型鉴定 育种值分析 亲本选择
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苏云金芽孢杆菌杀虫蛋白基因型鉴定及对鳞翅目害虫高毒力菌株筛选
3
作者 丰硕 黄国强 +3 位作者 程佳旭 曹伟平 贾海民 宋健 《华北农学报》 北大核心 2026年第1期184-193,共10页
苏云金芽孢杆菌(Bt)能够产生多种杀虫蛋白,是重要的生防资源。为了发掘对鳞翅目害虫高毒力的Bt菌株,缓解害虫抗性压力并扩大资源储备,以河北地区土壤样品中分离的109株Bt菌株为研究对象,通过油镜观察伴孢晶体形状,利用40对通用引物(包括... 苏云金芽孢杆菌(Bt)能够产生多种杀虫蛋白,是重要的生防资源。为了发掘对鳞翅目害虫高毒力的Bt菌株,缓解害虫抗性压力并扩大资源储备,以河北地区土壤样品中分离的109株Bt菌株为研究对象,通过油镜观察伴孢晶体形状,利用40对通用引物(包括cry、cyt、vip 3种基因型)PCR鉴定所有菌株的基因型。以小菜蛾、斜纹夜蛾等5种鳞翅目害虫为靶标,筛选高杀虫活性菌株,并利用SDS-PAGE分析其晶体蛋白。结果表明,伴孢晶体形状主要是圆球形(90株),少部分为菱形(19株)。杀虫蛋白基因型检出率为93.6%,主要包括29种不同的cry基因型、1种cyt基因型以及3种vip基因型,91株具有至少2种杀虫蛋白基因型的组合,其中26株含有6种以上,多为cry+vip型。室内生测发现19株对小菜蛾等多种鳞翅目害虫的高毒力菌株,主要表达130,65 ku的蛋白,包含杀鳞翅目的cry1类、cry2类、cry15类等基因型,与PCR鉴定结果一致。获得了对鳞翅目害虫广谱、高毒力的Bt菌株,并初步明确了其杀虫基因,对新型Bt产品的开发具有重要意义。 展开更多
关键词 苏云金芽孢杆菌 基因型 鳞翅目害虫 杀虫活性
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高油大豆品种营养品质的基因型与环境互作分析
4
作者 吴子佶 林琴 +5 位作者 孙亚伟 李阳阳 毛劲 李培武 许琳 阎哲 《大豆科学》 北大核心 2026年第1期47-61,共15页
为系统性解析大豆营养品质的基因型-环境互作效应及其多组分之间的互作特点,选取10个油分含量较高的大豆品种,于2023年(江苏徐州)和2024年(浙江建德和浙江杭州)开展两年三地田间试验,测定蛋白质、粗脂肪、脂肪酸及氨基酸含量,结合GGE双... 为系统性解析大豆营养品质的基因型-环境互作效应及其多组分之间的互作特点,选取10个油分含量较高的大豆品种,于2023年(江苏徐州)和2024年(浙江建德和浙江杭州)开展两年三地田间试验,测定蛋白质、粗脂肪、脂肪酸及氨基酸含量,结合GGE双标图、相关性网络和主成分分析解析品质性状的基因型-环境互作效应及多组分关联特点。结果表明:蛋白质、粗脂肪和氨基酸各组分含量变异系数较小,表现出良好的跨环境稳定性;脂肪酸各组分含量的环境稳定性相对较差。在所有测试地区中,浙江建德种植的大豆品种综合品质最优,其蛋白质、粗脂肪、必需氨基酸及不饱和脂肪酸的平均含量均为3个试验点中最高。相关性分析表明,在高油大豆品种中,蛋白质含量与粗脂肪含量呈负相关,而与所有氨基酸呈正相关,氨基酸各组分之间均存在一定正相关;粗脂肪与除半胱氨酸外的所有氨基酸均存在一定负相关;棕榈酸和硬脂酸含量显著正相关,油酸和亚油酸含量之间极显著负相关。通过GGE分析证明,邯豆23的蛋白质和必需氨基酸含量较高且稳定性强,在浙江建德和浙江杭州均表现出最优适应性。结合主成分分析评价结果显示,邯豆23的营养品质评分最高,表明其营养品质在所有测试品种中最为优异。本研究基于大豆蛋白质、粗脂肪、氨基酸和脂肪酸含量等品质性状的基因型-环境互作分析、相关性分析和主成分分析,成功构建了一套多维度的大豆品质综合评价体系,为高品质大豆品种的筛选和选育提供了数据支撑。 展开更多
关键词 高油大豆 营养品质 基因型-环境互作 GGE双标图 主成分分析 营养评价
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黄淮麦区小麦种质资源抗黄花叶病鉴定及基因型分析
5
作者 沈庆花 刘胜利 +12 位作者 陈宏宇 王宇博 刘振 许豪 郑继周 石东风 李巧云 董纯豪 唐建卫 高艳 孙炳剑 殷贵鸿 黄振朴 《麦类作物学报》 北大核心 2026年第1期14-21,共8页
小麦黄花叶病是当前危害中国小麦生产的主要土传病毒病之一,该病由小麦黄花叶病毒(wheat yellow mosaic virus,WYMV)引起,以土传禾谷多黏菌(Polymyxa graminis)为介体进行传播,目前在中国黄淮麦区发病呈现逐年加重趋势且难以防控。为了... 小麦黄花叶病是当前危害中国小麦生产的主要土传病毒病之一,该病由小麦黄花叶病毒(wheat yellow mosaic virus,WYMV)引起,以土传禾谷多黏菌(Polymyxa graminis)为介体进行传播,目前在中国黄淮麦区发病呈现逐年加重趋势且难以防控。为了筛选出优异的抗黄花叶病种质和基因资源,对黄淮麦区158个小麦品种(系)进行了2年度共计3个环境的黄花叶病田间抗性鉴定,并利用主效抗病基因的分子标记进行基因型检测。结果表明,3个环境中田间反应型均为免疫、高抗和中抗小麦黄花叶病的小麦品种(系)分别有26个、35个和10个,占比分别为16.5%、22.2%和6.3%;均为中感和高感的品种(系)有72个和15个,占比分别为45.5%和9.5%。经分子标记检测,单独携带QYm.nau-2D、Ym2和QYm.njau-5A.1抗性基因/QTL位点的品种(系)分别有39个、48个和3个,占比分别为24.7%、30.4%和1.9%;单独携带QYm.nau-2D和QYm.njau-5A.1及聚合QYm.nau-2D与Ym2的小麦品种(系)具有较好的抗病性。综合田间抗性表型和基因型检测结果,豫农907、豫农908、周麦30等61个免疫或高抗黄花叶病小麦品种(系)可用于小麦抗黄花叶病遗传育种、新基因的挖掘和品种(系)布局。 展开更多
关键词 小麦黄花叶病 抗病性评价 分子标记 基因型
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2024年北京市结核分枝杆菌基因型与耐药性研究
6
作者 缪鸿豪 张洁 +10 位作者 庞梦迪 任怡宣 邓阳 易俊莉 樊瑞芳 陈双双 陈昊 于兰 李洁 李传友 杨新宇 《中国防痨杂志》 北大核心 2026年第4期477-484,共8页
目的:探讨2024年北京市管理肺结核患者结核分枝杆菌临床分离株基因型、表型耐药特征及两者间相关性,为本地区结核病防控提供科学依据。方法:从北京市结核病防治服务体系中收集2024年1—12月期间符合纳入标准的923例管理肺结核患者的结... 目的:探讨2024年北京市管理肺结核患者结核分枝杆菌临床分离株基因型、表型耐药特征及两者间相关性,为本地区结核病防控提供科学依据。方法:从北京市结核病防治服务体系中收集2024年1—12月期间符合纳入标准的923例管理肺结核患者的结核分枝杆菌临床分离株及其流行病学资料。使用PCR法进行所有菌株的菌种鉴定,通过RD105缺失基因检测法鉴定北京基因型和非北京基因型菌株,并根据NTF区完整性区分古老型和现代型北京基因型。采用分枝杆菌散布重复单元—15位点数目可变串联重复序列(MIRU-VNTR 15)进行基因分型,通过分辨指数(HGI)和总分辨指数(HGDI)评估各VNTR位点及整个分型体系的多态性及分辨力,同时观察基因型成簇情况,并使用最低抑菌浓度法进行4种一线及4种A组抗结核药物的药物敏感性试验。结果:923株菌株菌种鉴定及基因分型结果显示,结核分枝杆菌922株和非洲分枝杆菌1株;其中,结核分枝杆菌中北京基因型占90.89%(838/922),且以现代型为主[85.20%(714/838)]。MIRU-VNTR分型显示,HGDI值为0.998,其中QUB11b(HGI=0.722)和QUB26(HGI=0.639)两个位点表现出高多态性,是区分菌株的关键位点。230株结核分枝杆菌成簇菌株均为北京基因型,成簇率为24.95%(230/922),98.26%(226/230)为北京现代型;共形成63个簇,最大簇包含29株菌株,均为北京现代型。耐药检测显示,异烟肼的耐药率最高[12.26%(113/922)],乙胺丁醇最低[0.22%(2/922)];北京基因型对异烟肼和左氧氟沙星的耐药率[分别为12.89%(108/838)和9.79%(82/838)]均明显高于非北京型[分别为5.95%(5/84)和2.38%(2/84)],现代型对异烟肼和利福平的耐药率[分别为11.76%(84/714)和5.18%(37/714)]均明显低于古老型[分别为19.35%(24/124)和11.29%(14/124)],差异均有统计学意义(χ^(2)=3.415,P=0.039;χ^(2)=5.055,P=0.012;χ^(2)=5.421,P=0.018;χ^(2)=6.897,P=0.011)。结论:现代型北京基因型具有较高的遗传多样性和传播活性,是北京市结核分枝杆菌优势流行株和近期传播的主要基因型,且以异烟肼耐药问题最为突出,故需加强对现代型北京基因型菌株,特别是耐药菌株的分子监测与传播链追踪。 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 基因型 串联重复序列 结核 抗多种药物性
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GABRG2及SCN1A双基因变异致遗传性癫痫伴热性惊厥附加症1例及其家系基因型-表型研究
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作者 李跃林 李仁可 +7 位作者 熊玉蓉 潘书静 张佳丽 雷文婷 石永媛 杨丽娟 周朝彬 田茂强 《临床儿科杂志》 北大核心 2026年第1期51-55,共5页
目的 探讨GABRG2及SCN1A双基因变异对遗传性癫痫伴热性惊厥附加症(GEFS+)表型的影响。方法 收集1例因“反复抽搐”于2023年5月就诊于儿内科的3岁女童及其三代家系成员的临床资料,通过全外显子组测序(WES)及Sanger测序验证该家系基因变异... 目的 探讨GABRG2及SCN1A双基因变异对遗传性癫痫伴热性惊厥附加症(GEFS+)表型的影响。方法 收集1例因“反复抽搐”于2023年5月就诊于儿内科的3岁女童及其三代家系成员的临床资料,通过全外显子组测序(WES)及Sanger测序验证该家系基因变异,结合文献分析基因型-表型关联。结果 该家系6例成员中,3例SCN1A(c.5621G>A)突变患者表现为热性惊厥(FS)或晚发药物反应性癫痫;2例GABRG2(c.373C>T)突变患者表现为FS或外显不全;GABRG2及SCN1A双变异的先证者表现为早发耐药性癫痫及惊厥持续状态。文献已报道携带上述单位点突变的2例患者也表现为FS。蛋白质相互作用分析显示,SCN1A与GABRG2可能通过共表达协同调控神经元兴奋性。结论 SCN1A与GABRG2双基因变异可能通过基因修饰效应和功能叠加而加重癫痫表型,提示当临床家系表型差异大时,需警惕基因双变异的功能叠加及修饰效应,及时基因检测有助于精准诊疗及遗传咨询。 展开更多
关键词 GEFS+ 基因型-表型关联 GABRG2基因 SCN1A基因 双基因变异
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基因型对辣椒花药培养效果的影响
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作者 王嘉玲 冯心怡 +5 位作者 丁子健 李文跃 杨光彬 李雪峰 杨博智 周书栋 《湖南农业科学》 2026年第2期30-35,共6页
研究以48份不同基因型辣椒栽培种为材料开展花药胚状体诱导及组培苗再生试验,以期筛选高花药培养力辣椒材料,并观察其胚状体的形态发生过程。结果表明:48份不同基因型辣椒材料的花药膨大率、花药褐化率、胚状体诱导率和组培苗再生率变... 研究以48份不同基因型辣椒栽培种为材料开展花药胚状体诱导及组培苗再生试验,以期筛选高花药培养力辣椒材料,并观察其胚状体的形态发生过程。结果表明:48份不同基因型辣椒材料的花药膨大率、花药褐化率、胚状体诱导率和组培苗再生率变异系数分别为70.63%、28.60%、101.27%、87.86%;其中,花药膨大率与褐化率显著正相关,与胚状体诱导率、组培苗再生率极显著正相关;花药褐化率分别与胚状体诱导率、组培苗再生率极显著正相关,胚状体诱导率与组培苗再生率极显著正相关。试验筛选到1份高花药培养力基因型22Y19,其胚状体诱导率达20.14%,组培苗再生率达42.25%,其胚状体发育经历了球形胚、心形胚、鱼雷形胚和子叶形胚4个典型阶段,并最终发育成完整的植株。该材料不仅可作为桥梁亲本用于提升低诱导率基因型的花药培养效率,也可作为关键试验材料用于深入解析胚状体发育的分子调控机制。 展开更多
关键词 辣椒 花药培养 基因型 胚状体 单倍体
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大数据驱动的畜禽表型-基因型关联研究进展
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作者 王欣如 《畜禽业》 2026年第2期17-21,共5页
随着基因组学、表型组学和大数据技术的迅速发展,畜禽表型-基因型关联研究进入了新阶段。借助高通量测序、传感器、影像及人工智能工具,可以对畜禽生产性能、健康水平和行为特征等多维表型进行动态记录,并与基因组信息深度整合,从而识... 随着基因组学、表型组学和大数据技术的迅速发展,畜禽表型-基因型关联研究进入了新阶段。借助高通量测序、传感器、影像及人工智能工具,可以对畜禽生产性能、健康水平和行为特征等多维表型进行动态记录,并与基因组信息深度整合,从而识别关键性状的遗传标记并提升育种效率。近年来,全基因组关联研究、表型组宽关联研究、选择信号分析与结构变异研究不断推动相关位点的鉴定;QTLdb、Corr DB等数据库的建设与应用,使得数据整合与共享更加高效;系统遗传学网络分析、机器学习和基因组预测模型的引入,则为复杂性状的关联推断与功能注释提供了有效工具;跨物种比较与功能验证进一步揭示了表型-基因型联系的生物学机制。研究结论表明:大数据驱动下的畜禽遗传改良取得了显著突破,不仅显著提升了繁育决策的精准度,也为多组学解析复杂性状提供了新思路。 展开更多
关键词 大数据 表型-基因型关联 畜禽育种 多组学整合 人工智能
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旱地与补灌条件下不同基因型小麦耐旱性评价 被引量：2
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作者 孙宪印 吕广德 +9 位作者 亓晓蕾 徐加利 孙盈盈 米勇 牟秋焕 尹逊栋 张继波 王瑞霞 钱兆国 高明刚 《干旱地区农业研究》 北大核心 2025年第1期13-20,共8页
为在干旱胁迫条件下从不同小麦品系中筛选耐旱性强且具有高产稳产特性的基因型,采用随机区组设计,于2022—2023年在泰安市农业科学院马庄试验农场开展田间试验,以14个不同基因型小麦品系为材料,设置自然干旱和补灌条件2个处理,以旱地与... 为在干旱胁迫条件下从不同小麦品系中筛选耐旱性强且具有高产稳产特性的基因型,采用随机区组设计,于2022—2023年在泰安市农业科学院马庄试验农场开展田间试验,以14个不同基因型小麦品系为材料,设置自然干旱和补灌条件2个处理,以旱地与补灌条件下产量为基础,采用平均产量(MP)、几何平均产量(GMP)、抗旱系数(DRC)、抗旱指数(DRI)和干旱耐受指数(STI)共5个抗旱性指标对不同品系进行比较和抗旱性分级。结果表明,对比不同品系的干旱指标数值的大小与位次变化,V7、V14、V2和V12基因型排名靠前,具有高产、稳产特点。同时STI、GMP、MP指标与旱地产量和补灌产量均呈极显著正相关关系且表现出较好的产量一致性;主成分分析和聚类分析结果均进一步明确了这些基因型的耐旱及高产稳产特性。综上,在干旱与补灌条件下,STI、GMP、MP和DRI指标可用于耐旱高产基因型的鉴别和分级,综合利用5种抗旱指标筛选出耐旱高产品系分别为V7、V14、V2和V12,各品系抗旱性级别分别为1、2、2级和1级。 展开更多
关键词 小麦 基因型 干旱胁迫 主成分分析 聚类分析 耐旱性指标
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施氮量对粳型香稻香味、食味品质的影响及优质优味香稻基因型筛选
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作者 殷春渊 黄金华 +8 位作者 刘贺梅 徐鹏亮 孙建权 胡秀明 王和乐 张金霞 张倩倩 张凯博 王书玉 《江苏农业科学》 北大核心 2025年第21期110-116,共7页
为明确不同氮肥对香稻香味、食味品质的影响,筛选优质优味水稻基因型,以近几年沿黄地区培育的16个优良香稻新品种(品系)为试验材料,设置4种氮肥水平(0、180、225、270 kg/hm^(2),分别用N0、N1、N2、N3处理表示),测定不同基因型香稻中香... 为明确不同氮肥对香稻香味、食味品质的影响,筛选优质优味水稻基因型,以近几年沿黄地区培育的16个优良香稻新品种(品系)为试验材料,设置4种氮肥水平(0、180、225、270 kg/hm^(2),分别用N0、N1、N2、N3处理表示),测定不同基因型香稻中香味物质2-乙酰基-1-吡咯啉(2-AP)含量、食味值、稻米加工和外观品质及产量。结果表明,在不同基因型香稻中,糙米香味物质2-AP含量除个别基因型外基本表现为随施氮量的增加而增加,并且在N3处理下有下降的趋势,即大部分表现为N2处理最高,最高值为0.055μg/g,平均为0.032μg/g,分别比N0、N1、N3处理高100.8%、108.2%、5.7%。食味值表现为不施氮肥处理较高,最高食味值达85分,最低为76分,平均为81.25分,远高于其他3个施氮处理。供试香稻品种的加工品质在不同基因型及氮肥处理间的差异相对较小;外观品质在不同基因型及处理间的差异较大,最大变异系数达85.762%。香稻产量表现为随施氮量的增加而增加或先增加后降低的趋势,不同基因型间的差异不一致,不同施氮水平的平均产量为8.91 t/hm^(2),基本属中产水平。根据香味、食味、整精米率和垩白度筛选出了浓香、食味值高、整精米率、低垩白(即好闻好吃好看)和浓香、食味值高、整精米率高、垩白(即好闻好吃不好看)2种类型的水稻基因型。不施氮、中氮处理分别提高了稻米的食味、香味,中产、好闻、好吃、好看和中产、好闻、好吃、不好看这2类香稻基因型可作为优质优味香稻新品种选育的重要种质资源。在优质米培育和栽培实践中,在中产水平即可实现优质优味的协同,一味追求产量、香味、食味、外观四者协同提高仍有一定难度。 展开更多
关键词 香稻 香味 食味 基因型 氮素 产量
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小粒花生基因型与环境互作效应及高产稳产适应性分析
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作者 沈希华 张少聪 +6 位作者 邢晓宁 王海莉 王艳 芦连勇 吕娇艳 华福平 王芳 《花生学报》 北大核心 2025年第4期374-381,共8页
产量是花生育种和生产中追求的最重要的目标。本研究通过分析2018-2019年河南省花生联合体小粒组花生品种区域试验数据,对小粒花生品种荚果产量形成相关性状的相关性进行了探究,发现百仁质量、百果质量、单株饱果数、单株生产力、结果... 产量是花生育种和生产中追求的最重要的目标。本研究通过分析2018-2019年河南省花生联合体小粒组花生品种区域试验数据,对小粒花生品种荚果产量形成相关性状的相关性进行了探究,发现百仁质量、百果质量、单株饱果数、单株生产力、结果枝数、分枝数是影响小粒花生荚果产量的关键性状。通过GGE模型对参试品种的丰产性、稳产性和适应性进行可视化分析,发现安花5号虽有高产的年份,但稳产性仍待改进,在洛阳、商丘、信阳、驻马店等环境相似区域较为适播;安花6号的丰产性、稳产性俱佳,两年综合排名靠前。相较于对照品种远杂9102,安花5号和安花6号具有明显的产量优势和推广优势,在河南省及类似生态区具有较高推广价值。 展开更多
关键词 花生 产量组成 基因型与环境互作 品种
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一株G10P[11]型牛轮状病毒的分离鉴定及基因型分析
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作者 刘健 白艺兰 +11 位作者 桂亚萍 杨显超 徐锋 沈海潇 向蒙 唐聪圣 葛杰 卢军 翁永刚 金耀忠 王建 黄士新 《中国预防兽医学报》 北大核心 2025年第9期979-983,共5页
为了解上海地区牛轮状病毒(BRV)流行株的基因型特征,丰富我国BRV流行病学数据,本研究将上海地区牛场5份犊牛腹泻样品接种恒河猴胚肾细胞MA-104细胞,盲传5代后观察细胞病变(CPE)并收集出现病变的细胞上清,经蚀斑纯化后检测病毒TCID50,采... 为了解上海地区牛轮状病毒(BRV)流行株的基因型特征,丰富我国BRV流行病学数据,本研究将上海地区牛场5份犊牛腹泻样品接种恒河猴胚肾细胞MA-104细胞,盲传5代后观察细胞病变(CPE)并收集出现病变的细胞上清,经蚀斑纯化后检测病毒TCID50,采用RT-PCR方法、间接免疫荧光试验(IFA)和电镜观察鉴定病毒;利用RT-PCR扩增分离株VP4、VP6和VP7基因、测序后采用Lasergene7.0软件分析三者基因序列的同源性和分型,采用MEGA6.0软件构建分离株VP4、VP6和VP7基因的进化树,分析其遗传进化关系。结果显示,盲传5代后其中1份样品出现CPE,经蚀斑纯化后测得病毒效价为106.4TCID50/0.1 mL,分离株经RT-PCR、IFA和电镜观察证实为BRV,命名为SHH2023001株。扩增分离株VP4、VP6和VP7基因,测序分析结果显示上述基因分别与美国牛源BRV B223株(96.7%)、阿根廷牡蛎源BsAs株(96.9%)和印度牛源Hg2株(90.1%)的同源性最高,表明本研究分离的BRV SHH2023001株基因型为G10P[11]I2型;遗传进化树显示,分离株VP4基因与BRV B223株同处于P[11]分支,VP6基因与BRV疫苗株Rota Teq-WI79-9同处于I2分支,VP7基因与BRV Hg-2株同处于G10分支。本研究于上海地区首次分离到一株多宿主来源基因重配的A群G10P[11]型BRV,为BRV感染的防控和疫苗的研究提供物质基础。 展开更多
关键词 牛A群轮状病毒 分离鉴定 基因型分析 进化分析
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珠蛋白生成障碍性贫血筛查结果及罕见基因型分析
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作者 王桂香 余杨 +1 位作者 何幸 刘小花 《中国实验血液学杂志》 北大核心 2025年第6期1714-1719,共6页
目的:分析成都市新都区珠蛋白生成障碍性贫血的基因类型及分布情况,为该区地中海贫血的防治提供参考依据。方法:选取2021年6月至2024年4月在成都市新都区人民医院进行地中海贫血基因筛查的3 679例受试者作为研究对象,使用血液分析仪检... 目的:分析成都市新都区珠蛋白生成障碍性贫血的基因类型及分布情况,为该区地中海贫血的防治提供参考依据。方法:选取2021年6月至2024年4月在成都市新都区人民医院进行地中海贫血基因筛查的3 679例受试者作为研究对象,使用血液分析仪检测得到血液相关参数、毛细管电泳法进行血红蛋白成分分析,采用PCR+导流杂交法进行常规地中海贫血基因检测,对血液学特征与常规地贫基因结果不符的样本,进一步用基因测序技术确定基因型,并对检测的结果进行分析。结果:3 679例样本中检测出540例地贫基因携带者,总检出率为14.68%,其中α-地贫329例,共8种基因型,基因型频数前3位依次为--^(SEA)/αα(45.29%,149/329)、-α^(3.7)/αα(38.91%,128/329)、-α^(4.2)/αα(6.08%,20/329);β-地贫197例,共10种基因型,基因型频数前3位依次为β^(CD41-42(-TCTT))/β^(N)(29.95%,59/197)、β^(CD17(A>T))/β^(N)(27.92%,55/197)、β^(IVSII-654(C>T))/β^(N)(24.87%,49/197);αβ复合型地贫14例,共12种基因型,以-α^(3.7)/αα,β^(IVSII-654(C>T))/β^(N)、-α^(3.7)/αα,β^(CD41-42(-TCTT))/β^(N)为主;1例少见地中海贫血基因型(--^(SEA)/HKαα)。另外,还发现3例罕见异常血红蛋白突变型和1例未报到的异常血红蛋白突变型(HBA1:c.300+13C>G位点杂合突变)。结论:本地区人群地中海贫血基因检出率较高,基因型复杂。在基因诊断时,应注意多技术结合检测,避免漏检罕见基因型。 展开更多
关键词 珠蛋白生成障碍性贫血 基因检测 异常血红蛋白 基因型
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杀伤细胞免疫球蛋白样受体基因型和单倍型与干眼病的关系
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作者 刘云霞 王群 +3 位作者 黄靖 杨梁政 彭洁 任桂芳 《中国免疫学杂志》 北大核心 2025年第5期1197-1201,共5页
目的:探讨汉族人群中杀伤细胞免疫球蛋白样受体(KIR)基因型和单倍体型与干眼病(DED)的相关性。方法:应用序列特异性引物聚合酶链反应(PCR-SSP)对106例DED患者和220例健康者进行KIR基因型分析。结果:在DED患者和健康人群中共发现23种KIR... 目的:探讨汉族人群中杀伤细胞免疫球蛋白样受体(KIR)基因型和单倍体型与干眼病(DED)的相关性。方法:应用序列特异性引物聚合酶链反应(PCR-SSP)对106例DED患者和220例健康者进行KIR基因型分析。结果:在DED患者和健康人群中共发现23种KIR基因型,其中新发现的KIR基因型有10种。与对照组相比,DED患者组KIR基因型G和单倍型4频率显著增加(P=0.025,P=0.004),而单倍型2频率显著下降(P=0.016)。DED患者KIR基因型B/B的频率也显著高于对照组(P=0.027)。KIR单倍型A和B具有独特的着丝粒(Cen)和端粒(Tel)基因基序,DED患者Cen-B/B基因型频率也高于对照组(P=0.037)。结论:在汉族人群中,KIR基因型和单倍体型与DED之间可能存在关联。 展开更多
关键词 杀伤细胞免疫球蛋白样受体 基因型 单倍型 干眼病
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基于基因型主效应及其与环境互作效应双标图评价两系杂交中稻新品种襄两优827的丰产性、稳产性和适应性
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作者 赵沙沙 田永宏 +4 位作者 陈波 房振兵 潘高峰 潘秀才 孙强 《中南农业科技》 2025年第10期12-17,共6页
为科学评价两系杂交中稻新品种襄两优827的生产潜力,利用基因型主效应及其与环境互作效应(GGE)双标图分析了其2020—2021年湖北省中稻区域试验数据,评估了该品种的丰产性、稳产性及适应性。结果表明,襄两优827丰产性突出,2年平均产量分... 为科学评价两系杂交中稻新品种襄两优827的生产潜力,利用基因型主效应及其与环境互作效应(GGE)双标图分析了其2020—2021年湖北省中稻区域试验数据,评估了该品种的丰产性、稳产性及适应性。结果表明,襄两优827丰产性突出,2年平均产量分别达10164.43 kg/hm^(2)和9945.20 kg/hm^(2);稳产性良好,综合表现优于对照品种丰两优四号;适宜种植区域分析表明,该品种适应性较广,2020年最适宜在天门市禾福地区种植,2021年适宜在宜昌、襄阳、沙洋等6个试点构成的区域种植。襄两优827是丰产稳产性好、适应性广的优良杂交中稻新品种,适宜在湖北省除西南稻瘟病常发山区外的区域推广种植。 展开更多
关键词 杂交中稻 襄两优827 基因型主效应及其与环境互作效应(GGE)双标图 丰产性 稳产性 适应性
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基于GenBank分析1995—2023年间亚洲地区及俄罗斯诺如病毒基因型别分布和变迁 被引量：4
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作者 姜慧敏 陈燕 +5 位作者 李利利 孙晓曼 薛垂召 李金松 裴银辉 段招军 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第5期515-521,共7页
目的对GenBank中1995—2023年间的24144条亚洲地区及俄罗斯人诺如病毒序列进行分析,以便了解亚洲地区及俄罗斯诺如病毒基因型别在时间和空间上的变迁特征。方法以FASTA格式从GenBank下载1995—2023年亚洲地区及俄罗斯人诺如病毒序列,使... 目的对GenBank中1995—2023年间的24144条亚洲地区及俄罗斯人诺如病毒序列进行分析,以便了解亚洲地区及俄罗斯诺如病毒基因型别在时间和空间上的变迁特征。方法以FASTA格式从GenBank下载1995—2023年亚洲地区及俄罗斯人诺如病毒序列,使用Excel、R语言、Graphpad Prism分析并作图。结果从2004年开始向GenBank提交的诺如病毒序列数逐年增加,并在2015年达到峰值,其中中国和日本提交序列数占全部诺如病毒序列的62.3%;这些序列共有31种衣壳基因型(C型),GI占9%、GII占90%,49种聚合酶基因型(P型)和68种CP组合的型别;4460条重组序列中41%属于3种重组株:GII.2[P16]、GII.4[P31]和GII.4[P16]。结论通过上述分析有助于了解亚洲地区及俄罗斯诺如病毒型别分布特征和随时间变迁过程,为疫苗设计和评价等提供支撑。 展开更多
关键词 诺如病毒 胃肠炎 基因型
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我国猪群中多杀性巴氏杆菌的基因型分析 被引量：20
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作者 彭忠 梁婉 +5 位作者 艾伟诚 王斐 华琳 汤细彪 陈焕春 吴斌 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期1064-1072,共9页
本研究旨在了解我国猪群中流行的多杀性巴氏杆菌(Pm)的主要基因型。利用荚膜基因分型、脂多糖(LPS)基因分型、多位点序列分型(MLST)对2013年12月—2017年12月4年间来源于我国各地区规模化猪场患有疑似呼吸系统疾病的病死猪肺、鼻拭子、... 本研究旨在了解我国猪群中流行的多杀性巴氏杆菌(Pm)的主要基因型。利用荚膜基因分型、脂多糖(LPS)基因分型、多位点序列分型(MLST)对2013年12月—2017年12月4年间来源于我国各地区规模化猪场患有疑似呼吸系统疾病的病死猪肺、鼻拭子、气管、肝等样品中分离鉴定的Pm进行基因型分析,并对23种主要毒力基因进行检测。结果表明,当前在我国猪群中流行的Pm的荚膜基因型为A(48.85%)、D(42.75%)、F(2.67%),优势基因型为A和D;LPS基因型为L3(25.00%)和L6(75.00%)型,优势基因型为L6;MLST基因型为ST3(21.25%)、ST10(27.50%)、ST11(42.50%)、ST12(2.50%)、ST16(2.50%)、ST74(1.25%)及ST75(2.50%),优势基因型为ST3、ST10和ST11。如果将荚膜基因型、LPS基因型和MLST基因型组合起来看,当前在我国猪群中流行的Pm的主要基因型为荚膜:脂多糖:MLST基因型A:L3:ST3(20.00%)、A:L6:ST10(26.25%)及D:L6:ST11(42.50%)。毒力基因检测的结果发现部分毒力基因的分布表现出一定的"基因型偏好性"。结果提示,D:L6:ST11是我国猪群中流行的多杀性巴氏杆菌的主要基因型,可能与我国猪群中由多杀性巴氏杆菌导致的呼吸道疾病密切相关。 展开更多
关键词 猪多杀性巴氏杆菌 荚膜基因型 脂多糖基因型 MLST基因型 毒力基因
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林木基因型-环境互作算法研究进展与思考 被引量：3
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作者 葛晓宁 许新桥 +8 位作者 张怀清 张京 杨杰 崔泽宇 傅汝饶 梁金洁 邹添华 王林龙 刘洋 《林业科学》 北大核心 2025年第3期1-15,共15页
随着全球气候变化,传统的林木育种方式面临挑战,难以满足快速气候适应与资源优化配置的迫切需求。林木基因型(G)与环境(E)之间的复杂互作关系是林木生长发育研究的核心,阐明G×E互作机制以提高林木育种效率和精准度成为研究的重点... 随着全球气候变化,传统的林木育种方式面临挑战,难以满足快速气候适应与资源优化配置的迫切需求。林木基因型(G)与环境(E)之间的复杂互作关系是林木生长发育研究的核心,阐明G×E互作机制以提高林木育种效率和精准度成为研究的重点。本文围绕林木基因型-环境互作算法的相关研究进展,解析基因型与环境互作对表型特性塑造的机制,包括基因组与表型特征形成的关联机制、环境因子对表型的影响等;探讨多源异构数据融合在解析互作机制和育种中的应用,涵盖数据挖掘技术、融合策略和实时数据处理;阐述基因型与环境互作算法在林木育种中的演变与应用,包括历史演变、在性状预测和分析中的应用等;介绍林木基因型与环境互作算法研发体系,涉及数据获取、融合、算法设计和模型优化。最后,提出林木基因型-环境互作未来研究的方向,结合可解释人工智能、数据融合、育种验证和气候适应性预测,为林木育种提供更精准的预测工具和决策支持,尤其在应对气候变化挑战时,推动林木的生态适应性与生产力提升。 展开更多
关键词 基因型-环境互作 林木育种 数据融合 机器学习 深度学习
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植物磷营养效率的基因型差异及其遗传控制 被引量：6
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作者 孔令旗 李振声 李继云 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 1996年第S1期6-10,共5页
关键词 植物磷营养 基因型差异 磷营养效率 植物基因型 磷高效 高效基因型 含磷量 营养元素 根系分泌物 石灰性土壤
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