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同源重组修复通路基因遗传变异与结直肠癌易感性的关联研究被引量：3: 1; 作者禚昌龙陈维艳 +6 位作者龙琦夏宜馨王灵巧杨桓曹佳周紫垣张爱华《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第18期1769-1775,共7页; 目的探讨我国人群同源重组修复(homologous recombination repair,HRR)通路关键基因的单核苷酸多态性与结直肠癌(colorectal cancer,CRC)易感性关联。方法以生物信息学分析结合文献筛选同源重组修复通路关键基因;采用基于通路分析的病例... 展开更多; 关键词结直肠癌同源重组修复基因单核苷酸多态性; 在线阅读下载PDF 职称材料

利用CRISPR/Cas9系统检测同源片段长度对重组效率的影响被引量：1: 2; 作者孙菱康月茜 +6 位作者唐弘卢楠徐蕾杨婕庄稀尧王瑜伟杨春《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期121-126,共6页; 目的:在大肠埃希菌中利用CRISPR/Cas9系统对插入失活的m Cherry红色荧光报告基因进行靶向切割并重组,以研究同源片段长度对重组修复效率的影响。方法:通过Golden Gate克隆方法构建Cas9表达质粒p KD46-Cas,转化至大肠埃希菌DH5α中,阿拉... 展开更多; 关键词 CRISPR/Cas9 同源重组修复:基因编辑技术; 在线阅读下载PDF 职称材料

透明颤菌vgb基因整合型大肠杆菌的培养特性被引量：1: 3; 作者陈新爱徐志南 +1 位作者王芳岑沛霖《浙江大学学报（工学版）》 EI CAS CSCD 北大核心 2003年第1期124-128,共5页; 透明颤菌血红蛋白(VHb)是一种氧调节、氧结合蛋白,其基因vgb的表达在转录水平上受氧调控.大肠杆菌E.coliBV是采用基因同源重组方法将vgb基因整合到基因工程常用宿主菌E.coliBL21中构建得到的.研究了不同价态的铁离子对同源重组菌的生长... 展开更多; 关键词透明颤菌 VGB基因基因同源重组血红蛋白大肠杆菌基因表达基因工程微生物培养; 在线阅读下载PDF 职称材料

46例前列腺癌患者的组织DNA及血液ctDNA测序分析被引量：2: 4; 作者唐堂唐朋 +5 位作者谭信韬冉强彭松刘秋礼徐静江军《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第17期1658-1666,F0003,共10页; 目的探讨前列腺癌患者组织DNA与血液ctDNA检出的突变情况,分析基因突变与临床特点和治疗的相关性。方法采用探针杂交捕获和Illumina高通量测序为基础的靶向二代测序技术检测本院泌尿外科46例病理诊断明确的前列腺癌患者的前列腺组织标本... 展开更多; 关键词前列腺癌二代测序全外显子测序基因突变同源重组基因; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名同源重组修复通路基因遗传变异与结直肠癌易感性的关联研究被引量：3: 1; 作者禚昌龙陈维艳龙琦夏宜馨王灵巧杨桓曹佳周紫垣张爱华; 机构贵州医科大学公共卫生学院陆军军医大学(第三军医大学)军事预防医学系军事环境卫生学教研室陆军军医大学(第三军医大学)军事预防医学系毒理学研究所; 出处《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第18期1769-1775,共7页; 基金国家自然科学基金面上项目(81273156,30771841)~~; 文摘目的探讨我国人群同源重组修复(homologous recombination repair,HRR)通路关键基因的单核苷酸多态性与结直肠癌(colorectal cancer,CRC)易感性关联。方法以生物信息学分析结合文献筛选同源重组修复通路关键基因;采用基于通路分析的病例-对照研究设计,共纳入2001年1月至2004年6月于陆军军医大学3所附属医院普通外科经病理诊断的413例新发CRC病例与1 671例非肿瘤患者对照。以ILLUMINA人类基因组芯片对筛选出的基因上下游50 kb区域内的TagSNPs分型,采用logistic回归模型计算SNPs与CRC的关联。结果筛选出17个HRR通路中的关键基因;在17个基因及上下游50 kb区域内的2 207个SNP中有16个位点与结直肠癌风险关联显著,其中RAD52基因3’-UTR的rs11226位点携带A等位基因者的CRC风险相对携带G者增加约1.4倍(OR=1.42,95%CI=1.22~1.66,P=6.67×10-6);CRTC3-AS1基因内含子区rs75893366位点携带G等位基因者的CRC风险仅为携带A者的0.4倍(OR=0.43,95%CI=0.25~0.74,P=1.81×10-3)。但仅rs11226位点经bonferroni校正后在男性和女性中均具有显著性。结论同源重组修复通路中17个关键基因的单核苷酸多态性与结直肠癌患病风险显著关联,提示同源重组修复通路基因的遗传变异可能影响结直肠癌的遗传易感性。; 关键词结直肠癌同源重组修复基因单核苷酸多态性; Keywords colorectal cancer homologous recombination repair single nucleotide polymorphisms; 分类号 R735.34 [医药卫生—肿瘤]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名利用CRISPR/Cas9系统检测同源片段长度对重组效率的影响被引量：1: 2; 作者孙菱康月茜唐弘卢楠徐蕾杨婕庄稀尧王瑜伟杨春; 机构重庆医科大学分子医学与肿瘤研究中心病原生物学实验室重庆市中医院检验科; 出处《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期121-126,共6页; 基金重庆市教委科学技术研究资助项目(编号:KJ1500203) 重庆市卫计委西医资助项目(编号:2015MSXM081) 重庆市科委基础科学与前沿技术研究资助项目(编号:cstc2016jcyj A0277); 文摘目的:在大肠埃希菌中利用CRISPR/Cas9系统对插入失活的m Cherry红色荧光报告基因进行靶向切割并重组,以研究同源片段长度对重组修复效率的影响。方法:通过Golden Gate克隆方法构建Cas9表达质粒p KD46-Cas,转化至大肠埃希菌DH5α中,阿拉伯糖诱导表达Cas9蛋白,Western blot检测蛋白表达。用同样的方法,将一段随机靶标序列引入p Tac-m Cherry-3guid质粒中,造成插入失活,同时在插入序列两侧分别预留0、40、80、120 bp的m Cherry编码区overlap序列,构建出含不同长度同源片段的插入失活m Cherry荧光报告质粒p Q0、p Q40、p Q80、p Q120,并将其分别转化到表达Cas9蛋白的大肠埃希菌DH5α中,对应的细菌平板分别为p Q0组、p Q40组、p Q80组及p Q120组,每组各9个平板,对每个平板的红、白色菌落进行计数,分别计算出红色菌落数/菌落总数的比值,即为重组修复效率。结果:PCR及测序证实p KD46-Cas质粒及插入失活的m Cherry荧光报告载体p Q0、p Q40、p Q80、p Q120构建成功,Western blot鉴定p KD46-Cas在大肠埃希菌DH5α中表达Cas9蛋白;红色菌落计数显示p Q0组为0,其余3组均出现红色菌落,4组重组修复效率的差异有统计学意义(P<0.05),重组修复效率与同源片段长度呈正相关(r=0.792,P<0.01)。结论:成功建立了基于m Cherry红色荧光报告基因和Cas9的同源重组效率检测系统;研究表明不包含同源片段的质粒无法进行有效的重组,当同源片段在0~120 bp时其长度对重组效率有影响。此系统为深入研究原核生物的同源重组提供了一个新的技术平台。; 关键词 CRISPR/Cas9 同源重组修复:基因编辑技术; Keywords CRISPR/Cas9 homologous recombination gene edition; 分类号 Q78 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名透明颤菌vgb基因整合型大肠杆菌的培养特性被引量：1: 3; 作者陈新爱徐志南王芳岑沛霖; 机构浙江大学生命科学学院浙江大学生物工程研究所; 出处《浙江大学学报（工学版）》 EI CAS CSCD 北大核心 2003年第1期124-128,共5页; 文摘透明颤菌血红蛋白(VHb)是一种氧调节、氧结合蛋白,其基因vgb的表达在转录水平上受氧调控.大肠杆菌E.coliBV是采用基因同源重组方法将vgb基因整合到基因工程常用宿主菌E.coliBL21中构建得到的.研究了不同价态的铁离子对同源重组菌的生长特性及VHb合成的影响,研究表明,0.2mmol/L的二价铁离子具有促进VHb表达从而刺激菌体细胞生长的作用.在0.1L/h低通气量条件下,E.coliBV分别进行间歇培养和流加培养,低溶氧刺激VHb在短时间内迅速大量合成,改善了细胞内氧的传递性能,使生长期分别延长到25h和45h,生物量(DCW)分别达到9.6g/L和26g/L.; 关键词透明颤菌 VGB基因基因同源重组血红蛋白大肠杆菌基因表达基因工程微生物培养; Keywords Vitreoscilla hemoglobin(VHb) vgb gene integrated E.coli BV; 分类号 Q782 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名46例前列腺癌患者的组织DNA及血液ctDNA测序分析被引量：2: 4; 作者唐堂唐朋谭信韬冉强彭松刘秋礼徐静江军; 机构陆军军医大学(第三军医大学)大坪医院泌尿外科; 出处《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第17期1658-1666,F0003,共10页; 基金国家自然科学基金青年科学基金项目(81802558) 陆军军医大学科研项目(2017XYY07)。; 文摘目的探讨前列腺癌患者组织DNA与血液ctDNA检出的突变情况,分析基因突变与临床特点和治疗的相关性。方法采用探针杂交捕获和Illumina高通量测序为基础的靶向二代测序技术检测本院泌尿外科46例病理诊断明确的前列腺癌患者的前列腺组织标本(n=31)以及外周血液标本(n=32)循环肿瘤细胞DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)的突变情况,检测范围包括1021个基因的全外显子区域及部分内含子区域中的4种突变类型(点突变、小片段的插入缺失、拷贝数变异和目前已知的融合基因)。结果在31例患者的前列腺组织标本中最常被检出的突变基因为TP53(29%,9/31),其次为CDK12(22.6%,7/31)、FOXA1(22.6%,7/31)与JAK1(16.1%,5/31)。在32例外周血ctDNA标本中检测出的常见突变基因为AR(34.3%,11/32)、APC(25%,8/32)、CDK12(18.8%,6/32)、DNMT3a(18.8%,6/32)与TP53(18.8%,6/32)。TMPRSS2-ERG融合基因在所有检测患者中检出率为13%(6/46)。其中1例患者同时存在TMPRSS2-ERG、VEGFA-TMPRSS2及ERG-VEGFA融合突变。46例患者中同源重组相关基因的体细胞突变检出率为21.7%,携带有胚系同源重组基因突变患者占8.7%。且携带(无论胚系或体细胞)同源重组基因突变患者的发病年龄更低、Gleason评分更高、转移灶数量更多,特别是携带胚系突变的患者更显著。结论血液ctDNA和传统的组织DNA样本均可检出基因突变;血液ctDNA检测可动态监控前列腺癌基因频谱在治疗过程中的变化,有助于及时调整治疗方案。; 关键词前列腺癌二代测序全外显子测序基因突变同源重组基因; Keywords prostate cancer second generation sequencing whole exon sequencing gene mutations homologous recombinant genes; 分类号 R394.3 [医药卫生—医学遗传学] R730.43 [医药卫生—肿瘤]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	同源重组修复通路基因遗传变异与结直肠癌易感性的关联研究	禚昌龙陈维艳龙琦夏宜馨王灵巧杨桓曹佳周紫垣张爱华	《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心	2019	3	在线阅读下载PDF 职称材料
2	利用CRISPR/Cas9系统检测同源片段长度对重组效率的影响	孙菱康月茜唐弘卢楠徐蕾杨婕庄稀尧王瑜伟杨春	《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心	2018	1	在线阅读下载PDF 职称材料
3	透明颤菌vgb基因整合型大肠杆菌的培养特性	陈新爱徐志南王芳岑沛霖	《浙江大学学报（工学版）》 EI CAS CSCD 北大核心	2003	1	在线阅读下载PDF 职称材料
4	46例前列腺癌患者的组织DNA及血液ctDNA测序分析	唐堂唐朋谭信韬冉强彭松刘秋礼徐静江军	《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心	2021	2	在线阅读下载PDF 职称材料