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基于基因功能表达谱的疾病分类：抗基因缺失的稳健性被引量：3: 1; 作者郭政张田文 +1 位作者王琦李霞《高技术通讯》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期78-81,共4页; 利用基因表达谱数据,按 Gene Ontology基因功能分类体系,将基因模块化地组织到具有显著生物学意义的低维差异表达功能模块单元中,构造新的指标用于分类疾病样本,从而提出了基于功能表达谱的分析新途径.新算法可稳健地抗基因检测缺失,抗... 展开更多; 关键词基因功能稳健性疾病基因缺失 Ontology 基因检测生物学意义基因表达谱分类体系功能模块差异表达检测误差基因数目特征维数树分类器样本分类仿真分析分类方法谱数据地组织模块化新算法数据集淋巴瘤; 在线阅读下载PDF 职称材料

安佳欣胶囊对抑郁症模型大鼠基因功能类表达影响的初步研究被引量：12: 2; 作者钟国才李强 +7 位作者柯尊洪吕莹丽郝晓峰李崇前杨达王海敏王栋郭政《中国神经精神疾病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期82-87,共6页; 目的研究安佳欣胶囊对抑郁症模型大鼠基因功能类表达的影响。方法分析抑郁症大鼠模型组和安佳欣胶囊组各8例样本的基因表达谱数据,筛选差异表达基因。利用基因功能分类体系Gene Ontology中的生物学过程子树和细胞组分子树,寻找和分析显... 展开更多; 关键词安佳欣胶囊抑郁症基因表达谱 GENE ONTOLOGY 基因功能; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于功能模块的基因表达谱聚类分析被引量：1: 3; 作者郭政张田文 +1 位作者王琦王海芸《同济大学学报（自然科学版）》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第2期264-269,共6页; 按GENE ONTOLOGY基因功能分类体系,将基因模块化地组织成具有显著生物意义的低维功能模块单元,并将其作为新的分析指标用于分类微阵列疾病样本,从而提出了基于功能表达谱的聚类分析新途径.采用NC I60数据集,通过功能表达谱对组织样本进... 展开更多; 关键词基因表达谱功能表达谱基因功能分类体系聚类; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于多基因组合选择模型的结肠癌特征基因选取被引量：1: 4; 作者马超《统计与信息论坛》 CSSCI 2012年第6期78-82,共5页; 通过基因的Bhattacharyya距离指标过滤掉大部分无关基因,然后探索性的提出了一种建立多基因组合选择模型的统计方法。从候选特征基因中选取了8个可能的结肠癌特征基因集合,判别分析的结果证明了该方法的可行性。; 关键词基因表达谱生物信息学多基因组合选择模型结肠癌; 在线阅读下载PDF 职称材料

分析基因表达谱数据的新方法(英文): 5; 作者潘海燕朱军韩丹夫《浙江大学学报（农业与生命科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期492-494,共3页; 关键词基因表达谱数据基因功能分子标记生物化学技术; 在线阅读下载PDF 职称材料

基因的多效性与中医理论的气化作用考辨: 6; 作者林乔王米渠吴斌《中医药学刊》 CAS 2004年第8期1416-1418,共3页; 从已有的报道中总结出 :任一个体的基因组里 ,疾病基因谱的表达总受体质、年龄 (即基因相互作用 )与环境条件 (含病源生物 )而异 ,并影响着某些基因的多效性方向 ,从而相同的基因谱可控制不同的表型 ,而这些多效性基因效应定向的过程与... 展开更多; 关键词阴阳基因组基因气化基因功能组合(基因谱); 在线阅读下载PDF 职称材料

利用SSR标记筛选水稻富γ-氨基丁酸后代材料: 7; 作者王康恺赵娜 +8 位作者马嘉欣王迎超田玲杨治伟洪缘缘田蕾张银霞杨淑琴李培富《江苏农业科学》 2020年第8期78-84,共7页; 以高粱稻-1和宁农黑粳的杂交F 2代和F 4代为试验材料,在实验室前期已获得的稻米籽粒中控制γ-氨基丁酸(γ-aminobutyric acid,GABA)含量的3个数量性状基因座(quantitative trait locus,QTL)位点基础上,进一步利用简单重复序列(simple se... 展开更多; 关键词水稻 Γ-氨基丁酸高效液相色谱糙米籽粒基因型组合 SSR标记; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于基因功能表达谱的疾病分类：抗基因缺失的稳健性被引量：3: 1; 作者郭政张田文王琦李霞; 机构哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院; 出处《高技术通讯》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期78-81,共4页; 基金国家自然科学基金，国家高技术研究发展计划(863计划); 文摘利用基因表达谱数据,按 Gene Ontology基因功能分类体系,将基因模块化地组织到具有显著生物学意义的低维差异表达功能模块单元中,构造新的指标用于分类疾病样本,从而提出了基于功能表达谱的分析新途径.新算法可稳健地抗基因检测缺失,抗基因表达变异,抗检测误差,并可以显著地降低分类特征维数(参与疾病分类的基因数目).采用淋巴瘤数据集,比较了基于功能表达谱和常规的基因表达谱的决策树分类器.结果显示,基于功能表达谱可以得到高准确度的疾病样本分类结果,能够直接从功能水平上给出相应的生物学解释.通过仿真分析,进一步显示了基于功能表达谱的分类方法具有抗基因检测缺失的稳健性.; 关键词基因功能稳健性疾病基因缺失 Ontology 基因检测生物学意义基因表达谱分类体系功能模块差异表达检测误差基因数目特征维数树分类器样本分类仿真分析分类方法谱数据地组织模块化新算法数据集淋巴瘤; 分类号 Q78 [生物学—分子生物学] O212.1 [理学—概率论与数理统计]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名安佳欣胶囊对抑郁症模型大鼠基因功能类表达影响的初步研究被引量：12: 2; 作者钟国才李强柯尊洪吕莹丽郝晓峰李崇前杨达王海敏王栋郭政; 机构哈尔滨医科大学生物信息学系成都康弘集团博士后工作站; 出处《中国神经精神疾病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期82-87,共6页; 基金国家自然科学基金资助项目(编号:30170515 30370388 +8 种基金 30370798 30570424 30571034) 2002AA2Z2052) 哈医大211工程"十五"建设项目资助; 文摘目的研究安佳欣胶囊对抑郁症模型大鼠基因功能类表达的影响。方法分析抑郁症大鼠模型组和安佳欣胶囊组各8例样本的基因表达谱数据,筛选差异表达基因。利用基因功能分类体系Gene Ontology中的生物学过程子树和细胞组分子树,寻找和分析显著聚集差异表达基因的复合功能类,从分子水平和基因功能模块水平探索安佳欣胶囊对抑郁症模型大鼠基因表达谱的影响。结果筛选出330个差异表达基因,并进一步识别了8个差异表达基因功能模块,主要涉及糖代谢、蛋白转运、谷氨酰胺代谢、凋亡诱导和神经发生。通过文献证实进一步发现了差异功能模块中7个可能与抑郁症发病相关的基因(Pfkm、Gpx1、Stx1a、Ninj2、Plp、Evl、Nrn1)在两组动物中差异表达。结论安佳欣胶囊可能增加抑郁症模型大鼠的单胺递质合成和释放,改善神经保护和神经发生功能,这些改变可能与安佳欣胶囊的抗抑郁作用有关。; 关键词安佳欣胶囊抑郁症基因表达谱 GENE ONTOLOGY 基因功能; Keywords ANJIAXIN capsule depression gene expression profile Gene Ontology gene function; 分类号 R285.5 [医药卫生—中药学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于功能模块的基因表达谱聚类分析被引量：1: 3; 作者郭政张田文王琦王海芸; 机构哈尔滨医科大学生物信息学系哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院; 出处《同济大学学报（自然科学版）》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第2期264-269,共6页; 基金国家自然科学基金资助项目(30370798 30170515 +2 种基金 30370388) 2002AA2Z2052); 文摘按GENE ONTOLOGY基因功能分类体系,将基因模块化地组织成具有显著生物意义的低维功能模块单元,并将其作为新的分析指标用于分类微阵列疾病样本,从而提出了基于功能表达谱的聚类分析新途径.采用NC I60数据集,通过功能表达谱对组织样本进行聚类分析.结果显示,新算法不但得到高准确度的样本分型结果,而且能够直接从功能水平上给出相应的生物学解释.同时,用基于功能表达谱对组织样本进行聚类分析可以显著降低特征维数,有效地处理高检测误差与基因表达变异问题.; 关键词基因表达谱功能表达谱基因功能分类体系聚类; Keywords gene expression profile gene functional profile Gene Ontology clustering; 分类号 Q344.13 [生物学—遗传学] TP391.4 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于多基因组合选择模型的结肠癌特征基因选取被引量：1: 4; 作者马超; 机构南京大学公共卫生管理与医疗保障政策研究中心; 出处《统计与信息论坛》 CSSCI 2012年第6期78-82,共5页; 文摘通过基因的Bhattacharyya距离指标过滤掉大部分无关基因,然后探索性的提出了一种建立多基因组合选择模型的统计方法。从候选特征基因中选取了8个可能的结肠癌特征基因集合,判别分析的结果证明了该方法的可行性。; 关键词基因表达谱生物信息学多基因组合选择模型结肠癌; Keywords DNA microarray Bioinformatics polygenic combination selection model colon cancer; 分类号 Q16 [生物学—普通生物学] TP181 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名分析基因表达谱数据的新方法(英文): 5; 作者潘海燕朱军韩丹夫; 机构浙江大学生物信息研究所浙江大学数学系; 出处《浙江大学学报（农业与生命科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期492-494,共3页; 基金 National Technology Research and Development Program (86 3) of China (2 0 0 2 AA2 340 31) .; 关键词基因表达谱数据基因功能分子标记生物化学技术; 分类号 Q75 [生物学—分子生物学] Q503 [生物学—生物化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基因的多效性与中医理论的气化作用考辨: 6; 作者林乔王米渠吴斌; 机构成都中医药大学中医遗传学研究室; 出处《中医药学刊》 CAS 2004年第8期1416-1418,共3页; 基金应用基因芯片研究肾阳虚证的基因表达谱(30171126) 虚寒证的基因组研究及数学分析(90209013); 文摘从已有的报道中总结出 :任一个体的基因组里 ,疾病基因谱的表达总受体质、年龄 (即基因相互作用 )与环境条件 (含病源生物 )而异 ,并影响着某些基因的多效性方向 ,从而相同的基因谱可控制不同的表型 ,而这些多效性基因效应定向的过程与中医所谓的气化一词的含义相似。任一病理的气化基因组合 ,虽然是变化的 ,但在不同的病理阶段总可以表现出寒热、虚实、表里、阴阳等 4类八纲之中的 1项以上的属性证候 ;同时分别均有其对应的气化基因组合控制它们的表征。; 关键词阴阳基因组基因气化基因功能组合(基因谱); Keywords YinYang genome gene effectuating profile; 分类号 R-05 [医药卫生]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名利用SSR标记筛选水稻富γ-氨基丁酸后代材料: 7; 作者王康恺赵娜马嘉欣王迎超田玲杨治伟洪缘缘田蕾张银霞杨淑琴李培富; 机构宁夏优势特色作物现代分子育种重点实验室宁夏大学农学院; 出处《江苏农业科学》 2020年第8期78-84,共7页; 基金国家自然科学基金(项目编号:31360324、31760374、31401361) 宁夏农业育种专项课题(编号:2018NYYZ0302)。; 文摘以高粱稻-1和宁农黑粳的杂交F 2代和F 4代为试验材料,在实验室前期已获得的稻米籽粒中控制γ-氨基丁酸(γ-aminobutyric acid,GABA)含量的3个数量性状基因座(quantitative trait locus,QTL)位点基础上,进一步利用简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)标记对其进行基因型检测,获得了不同基因组合类型,在此基础上利用高效液相色谱法,测定各基因组合类型籽粒中GABA含量,探讨GABA含量与其类型间的关系。结果表明,在F 2代和F 4代的所有组合类型中,代表高含量纯合基因组合类型(BBA组合)中GABA含量的检测结果均值最高,代表低含量纯合基因组合类型(AAB组合)中GABA含量的检测结果均值最低,其检测结果与基因型表现一致。显著性分析表明,GABA含量与不同基因组合类型之间存在极显著相关性。同时还表明,相比F 2代,F 4代的BBA组合中GABA的平均含量增高,AAB组合中GABA的平均含量降低,且变异程度均有降低,特别是低含量纯合基因组合类型材料的符合度从53%上升到75%,其结果表明,低含量纯合基因组合类型材料有趋于稳定的趋势。试验结果可应用于利用分子标记辅助选择富γ-氨基丁酸杂交后代材料的研究中。; 关键词水稻 Γ-氨基丁酸高效液相色谱糙米籽粒基因型组合 SSR标记; 分类号 S511.032 [农业科学—作物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	基于基因功能表达谱的疾病分类：抗基因缺失的稳健性	郭政张田文王琦李霞	《高技术通讯》 CAS CSCD 北大核心	2005	3	在线阅读下载PDF 职称材料
2	安佳欣胶囊对抑郁症模型大鼠基因功能类表达影响的初步研究	钟国才李强柯尊洪吕莹丽郝晓峰李崇前杨达王海敏王栋郭政	《中国神经精神疾病杂志》 CAS CSCD 北大核心	2007	12	在线阅读下载PDF 职称材料
3	基于功能模块的基因表达谱聚类分析	郭政张田文王琦王海芸	《同济大学学报（自然科学版）》 EI CAS CSCD 北大核心	2006	1	在线阅读下载PDF 职称材料
4	基于多基因组合选择模型的结肠癌特征基因选取	马超	《统计与信息论坛》 CSSCI	2012	1	在线阅读下载PDF 职称材料
5	分析基因表达谱数据的新方法(英文)	潘海燕朱军韩丹夫	《浙江大学学报（农业与生命科学版）》 CAS CSCD 北大核心	2004	0	在线阅读下载PDF 职称材料
6	基因的多效性与中医理论的气化作用考辨	林乔王米渠吴斌	《中医药学刊》 CAS	2004	0	在线阅读下载PDF 职称材料
7	利用SSR标记筛选水稻富γ-氨基丁酸后代材料	王康恺赵娜马嘉欣王迎超田玲杨治伟洪缘缘田蕾张银霞杨淑琴李培富	《江苏农业科学》	2020	0	在线阅读下载PDF 职称材料