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基于功能模块的基因表达谱聚类分析
被引量：
1
1
作者
郭政
张田文
+1 位作者
王琦
王海芸
《同济大学学报（自然科学版）》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2006年第2期264-269,共6页
按GENE ONTOLOGY基因功能分类体系,将基因模块化地组织成具有显著生物意义的低维功能模块单元,并将其作为新的分析指标用于分类微阵列疾病样本,从而提出了基于功能表达谱的聚类分析新途径.采用NC I60数据集,通过功能表达谱对组织样本进...
按GENE ONTOLOGY基因功能分类体系,将基因模块化地组织成具有显著生物意义的低维功能模块单元,并将其作为新的分析指标用于分类微阵列疾病样本,从而提出了基于功能表达谱的聚类分析新途径.采用NC I60数据集,通过功能表达谱对组织样本进行聚类分析.结果显示,新算法不但得到高准确度的样本分型结果,而且能够直接从功能水平上给出相应的生物学解释.同时,用基于功能表达谱对组织样本进行聚类分析可以显著降低特征维数,有效地处理高检测误差与基因表达变异问题.
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关键词
基因
表达谱
功能
表达谱
基因功能分类体系
聚类
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职称材料
题名
基于功能模块的基因表达谱聚类分析
被引量：
1
1
作者
郭政
张田文
王琦
王海芸
机构
哈尔滨医科大学生物信息学系
哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院
出处
《同济大学学报（自然科学版）》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2006年第2期264-269,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(30370798
30170515
+2 种基金
30370388)
国家"八六三"高技术研究发展计划资助项目(2003AA2Z2051
2002AA2Z2052)
文摘
按GENE ONTOLOGY基因功能分类体系,将基因模块化地组织成具有显著生物意义的低维功能模块单元,并将其作为新的分析指标用于分类微阵列疾病样本,从而提出了基于功能表达谱的聚类分析新途径.采用NC I60数据集,通过功能表达谱对组织样本进行聚类分析.结果显示,新算法不但得到高准确度的样本分型结果,而且能够直接从功能水平上给出相应的生物学解释.同时,用基于功能表达谱对组织样本进行聚类分析可以显著降低特征维数,有效地处理高检测误差与基因表达变异问题.
关键词
基因
表达谱
功能
表达谱
基因功能分类体系
聚类
Keywords
gene expression profile
gene functional profile
Gene Ontology
clustering
分类号
Q344.13 [生物学—遗传学]
TP391.4 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于功能模块的基因表达谱聚类分析
郭政
张田文
王琦
王海芸
《同济大学学报（自然科学版）》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2006
1
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参考文献
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