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基于连接酶链式反应的EML4-ALK融合基因分型检测
1
作者
钱丽君
胡珊珊
+2 位作者
肖君华
李凯
周宇荀
《东华大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2024年第5期69-77,共9页
针对棘皮动物微管相关蛋白样4-间变性淋巴瘤激酶(EML4-ALK)融合基因变异体V1、V2、V3a、V3b设计引物、探针,优化连接探针长度及其浓度,建立基于连接酶链式反应的qPCR法检测方案,并对该方案的特异性、检出限、抗干扰性进行验证。结果表明...
针对棘皮动物微管相关蛋白样4-间变性淋巴瘤激酶(EML4-ALK)融合基因变异体V1、V2、V3a、V3b设计引物、探针,优化连接探针长度及其浓度,建立基于连接酶链式反应的qPCR法检测方案,并对该方案的特异性、检出限、抗干扰性进行验证。结果表明:基于连接酶链式反应的qPCR法能对EML4-ALK融合基因进行有效分型;连接探针长度在30 nt(nucleotide)时检测灵敏度、特异性最高;连接探针终浓度在0.1~1.0 nmol/L较为合适;设计的引物、探针特异性好,只扩增靶RNA,对其他RNA无扩增;对EML4-ALK融合基因变异体V1、V2的检出限为10 copies/μL,变异体V3a、V3b的检出限为100 copies/μL;在EML4-ALK融合基因RNA标准品检测过程中加入100 ng的肺癌样本RNA作为干扰,检测结果未受到明显干扰。
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关键词
非小细胞肺癌
EML4-ALK融合
基因
连接酶链式反应
基因分型检测
荧光定量PCR
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职称材料
应用Cas9 RNPs进行绵羊FecB基因型检测的可行性研究
被引量:
1
2
作者
刘楠楠
左昕晨
皮文辉
《黑龙江动物繁殖》
2023年第1期20-25,共6页
为了研究Cas9 RNPs用于绵羊FecB基因分型的可行性,试验以FecB基因BB、B+、++型的绵羊个体为试验动物提取基因组DNA。基于Cas9 RNPs的体外DNA定点内切酶活性,用FecB基因靶位点的特异性引物扩增产物作为底物,利用大肠杆菌共表达纯化获得Ca...
为了研究Cas9 RNPs用于绵羊FecB基因分型的可行性,试验以FecB基因BB、B+、++型的绵羊个体为试验动物提取基因组DNA。基于Cas9 RNPs的体外DNA定点内切酶活性,用FecB基因靶位点的特异性引物扩增产物作为底物,利用大肠杆菌共表达纯化获得Cas9 RNPs,对不同FecB基因型目标样本进行酶切检测。结果表明:SDS-PAGE电泳结果显示,在130~180 kD之间有一条与预期大小相符的特异蛋白条带;3种基因型的靶DNA均被切割为185 bp和368 bp两个片段;绵羊FecB++型成纤维细胞Cas9 RNPs电转染的突变检测结果显示,纯化的两个Cas9 RNPs都具有基因组编辑活性。说明本研究获得的Cas9 RNPs在体外和细胞内都具有良好的酶活性,但未能区分绵羊FecB基因型。
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关键词
绵羊
FECB
基因
Cas9
RNPs
基因分型检测
基因
组编辑
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职称材料
30卷8期疑难病案
3
作者
彭存旭
周烨
+1 位作者
陈晨晨
石秀玲
《实用妇产科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第8期640-640,共1页
患者,40岁,因查体发现盆腔包块半年于2013年4月22日入院.患者入院1周前就诊于当地中医院,B超检查示“子宫肌瘤”,直径约8 cm.无腹痛、阴道排液、腰骶部酸痛、肛门坠胀感及月经改变.入院查体:一般情况好,心肺听诊未闻及异常;腹软,无压痛...
患者,40岁,因查体发现盆腔包块半年于2013年4月22日入院.患者入院1周前就诊于当地中医院,B超检查示“子宫肌瘤”,直径约8 cm.无腹痛、阴道排液、腰骶部酸痛、肛门坠胀感及月经改变.入院查体:一般情况好,心肺听诊未闻及异常;腹软,无压痛,未触及包块.妇科检查:外阴发育正常,阴道通畅,分泌物不多;宫颈肥大,光滑,子宫体如孕3个月大小,形态不规则,轻压痛;双侧附件区未及明显异常.经阴道超声检查:左侧壁低回声团块,大小7.8 cm×7.5 cm×7.2 cm,子宫肌瘤可考虑.液基细胞学检查(TCT):未发现宫颈上皮内瘤变及恶性病变.HPV基因分型检测均阴性.于2013年4月24日在我科行“腹腔镜子宫肌瘤剥除术”,术中见子宫如3个月妊娠大小,形态异常,宫体左前壁有直径约8 cm结节突起,双侧附件外观正常.手术顺利.术后病理检查示:(子宫)平滑肌瘤,富于细胞.患者术后恢复良好,于2013年4月28日拆线出院.
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关键词
疑难病案
子宫肌瘤剥除术
液基细胞学检查
经阴道超声检查
宫颈上皮内瘤变
入院查体
基因分型检测
术后病理检查
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职称材料
前沿
4
《中国农村科技》
2015年第5期12-13,共2页
华智牵手LGC建世界水稻分子育种平台农民日报讯为大幅提高水稻育种效率,华智水稻生物技术有限公司与英国LGC集团(简称艾吉析)3月25日在伦敦达成一项重要的战略合作。华智将应用艾吉析的创新基因分型检测技术和自动化设备,建立世界领...
华智牵手LGC建世界水稻分子育种平台农民日报讯为大幅提高水稻育种效率,华智水稻生物技术有限公司与英国LGC集团(简称艾吉析)3月25日在伦敦达成一项重要的战略合作。华智将应用艾吉析的创新基因分型检测技术和自动化设备,建立世界领先的水稻分子育种平台,推动相关新技术在杂交水稻和常规水稻育种中的常规化与实用化。
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关键词
水稻育种
基因分型检测
农民日报
自动化设备
无人机系统
猪流行性腹泻
猪传染性胃肠炎
深加工产品
消化道传染病
活疫苗
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职称材料
题名
基于连接酶链式反应的EML4-ALK融合基因分型检测
1
作者
钱丽君
胡珊珊
肖君华
李凯
周宇荀
机构
东华大学生物与医学工程学院
出处
《东华大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2024年第5期69-77,共9页
基金
科技部重大研发计划(2018YFA0801101)
中央高校基本科研业务费专项资金资助(2232023A-04)。
文摘
针对棘皮动物微管相关蛋白样4-间变性淋巴瘤激酶(EML4-ALK)融合基因变异体V1、V2、V3a、V3b设计引物、探针,优化连接探针长度及其浓度,建立基于连接酶链式反应的qPCR法检测方案,并对该方案的特异性、检出限、抗干扰性进行验证。结果表明:基于连接酶链式反应的qPCR法能对EML4-ALK融合基因进行有效分型;连接探针长度在30 nt(nucleotide)时检测灵敏度、特异性最高;连接探针终浓度在0.1~1.0 nmol/L较为合适;设计的引物、探针特异性好,只扩增靶RNA,对其他RNA无扩增;对EML4-ALK融合基因变异体V1、V2的检出限为10 copies/μL,变异体V3a、V3b的检出限为100 copies/μL;在EML4-ALK融合基因RNA标准品检测过程中加入100 ng的肺癌样本RNA作为干扰,检测结果未受到明显干扰。
关键词
非小细胞肺癌
EML4-ALK融合
基因
连接酶链式反应
基因分型检测
荧光定量PCR
Keywords
non-small cell lung cancer
EML4-ALK fusion gene
ligase chain reaction
genotyping detection
fluorescence quantitative PCR
分类号
Q33 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
应用Cas9 RNPs进行绵羊FecB基因型检测的可行性研究
被引量:
1
2
作者
刘楠楠
左昕晨
皮文辉
机构
石河子大学动物科技学院
出处
《黑龙江动物繁殖》
2023年第1期20-25,共6页
基金
石河子大学高层次人才科研启动经费项目(RCZK2021B34)。
文摘
为了研究Cas9 RNPs用于绵羊FecB基因分型的可行性,试验以FecB基因BB、B+、++型的绵羊个体为试验动物提取基因组DNA。基于Cas9 RNPs的体外DNA定点内切酶活性,用FecB基因靶位点的特异性引物扩增产物作为底物,利用大肠杆菌共表达纯化获得Cas9 RNPs,对不同FecB基因型目标样本进行酶切检测。结果表明:SDS-PAGE电泳结果显示,在130~180 kD之间有一条与预期大小相符的特异蛋白条带;3种基因型的靶DNA均被切割为185 bp和368 bp两个片段;绵羊FecB++型成纤维细胞Cas9 RNPs电转染的突变检测结果显示,纯化的两个Cas9 RNPs都具有基因组编辑活性。说明本研究获得的Cas9 RNPs在体外和细胞内都具有良好的酶活性,但未能区分绵羊FecB基因型。
关键词
绵羊
FECB
基因
Cas9
RNPs
基因分型检测
基因
组编辑
Keywords
sheep
FecB gene
Cas9 RNPs
genotyping
genome editing
分类号
S826.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
30卷8期疑难病案
3
作者
彭存旭
周烨
陈晨晨
石秀玲
机构
济宁医学院附属医院
出处
《实用妇产科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第8期640-640,共1页
文摘
患者,40岁,因查体发现盆腔包块半年于2013年4月22日入院.患者入院1周前就诊于当地中医院,B超检查示“子宫肌瘤”,直径约8 cm.无腹痛、阴道排液、腰骶部酸痛、肛门坠胀感及月经改变.入院查体:一般情况好,心肺听诊未闻及异常;腹软,无压痛,未触及包块.妇科检查:外阴发育正常,阴道通畅,分泌物不多;宫颈肥大,光滑,子宫体如孕3个月大小,形态不规则,轻压痛;双侧附件区未及明显异常.经阴道超声检查:左侧壁低回声团块,大小7.8 cm×7.5 cm×7.2 cm,子宫肌瘤可考虑.液基细胞学检查(TCT):未发现宫颈上皮内瘤变及恶性病变.HPV基因分型检测均阴性.于2013年4月24日在我科行“腹腔镜子宫肌瘤剥除术”,术中见子宫如3个月妊娠大小,形态异常,宫体左前壁有直径约8 cm结节突起,双侧附件外观正常.手术顺利.术后病理检查示:(子宫)平滑肌瘤,富于细胞.患者术后恢复良好,于2013年4月28日拆线出院.
关键词
疑难病案
子宫肌瘤剥除术
液基细胞学检查
经阴道超声检查
宫颈上皮内瘤变
入院查体
基因分型检测
术后病理检查
分类号
R714 [医药卫生—妇产科学]
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职称材料
题名
前沿
4
出处
《中国农村科技》
2015年第5期12-13,共2页
文摘
华智牵手LGC建世界水稻分子育种平台农民日报讯为大幅提高水稻育种效率,华智水稻生物技术有限公司与英国LGC集团(简称艾吉析)3月25日在伦敦达成一项重要的战略合作。华智将应用艾吉析的创新基因分型检测技术和自动化设备,建立世界领先的水稻分子育种平台,推动相关新技术在杂交水稻和常规水稻育种中的常规化与实用化。
关键词
水稻育种
基因分型检测
农民日报
自动化设备
无人机系统
猪流行性腹泻
猪传染性胃肠炎
深加工产品
消化道传染病
活疫苗
分类号
S511 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于连接酶链式反应的EML4-ALK融合基因分型检测
钱丽君
胡珊珊
肖君华
李凯
周宇荀
《东华大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2024
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
应用Cas9 RNPs进行绵羊FecB基因型检测的可行性研究
刘楠楠
左昕晨
皮文辉
《黑龙江动物繁殖》
2023
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
30卷8期疑难病案
彭存旭
周烨
陈晨晨
石秀玲
《实用妇产科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
前沿
《中国农村科技》
2015
0
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职称材料
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