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两个棉花HyPRP基因的分子鉴定与初步表达分析 被引量:4
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作者 许文亮 黄耿青 +3 位作者 王秀兰 邰付菊 汪虹 李学宝 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第7期1146-1153,共8页
从棉花胚珠和纤维cDNA文库中分离了2个编码杂合的富含脯氨酸的细胞壁蛋白(hybrid proline-rich protein,HyPRP)基因,命名为GhHyPRP1和GhHyPRP2,其编码蛋白分别含有327和137个氨基酸。蛋白质结构分析表明,二者都含有:N-端信号肽区、富含... 从棉花胚珠和纤维cDNA文库中分离了2个编码杂合的富含脯氨酸的细胞壁蛋白(hybrid proline-rich protein,HyPRP)基因,命名为GhHyPRP1和GhHyPRP2,其编码蛋白分别含有327和137个氨基酸。蛋白质结构分析表明,二者都含有:N-端信号肽区、富含脯氨酸结构域、C-端含有特定排列顺序和数目的半胱氨酸结构域。根据蛋白质结构域组成特点及与其他多结构域的富含脯氨酸蛋白质序列的同源性比较分析,将GhHyPRP1归为HyPRP A类蛋白质,将GhHyPRP2归为HyPRP B类蛋白质。RT-PCR分析显示GhHyPRP1在幼苗下胚轴中大量表达,而GhHyPRP2在胚珠中优势表达,暗示这2个基因可能分别在棉花不同组织发育中具有一定的生物学功能。 展开更多
关键词 棉花(Gossypium hirsutum) 杂合脯氨酸蛋白质(HyPRP) 基因与蛋白质结构 基因表达
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三个编码富含甘氨酸异构体的基因在棉花不同组织的差异表达 被引量:1
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作者 黄耿青 许文亮 +2 位作者 王秀兰 杜曼丽 李学宝 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期344-350,共7页
从棉花cDNA文库中分离了3个编码富含甘氨酸蛋白(glycine-rich proteins,GRPs)的基因,分别命名为GhGRP1、GhGRP2、GhGRP3.推断的编码蛋白质的氨基酸序列都富含甘氨酸,甘氨酸含量超过40%.而且GhGRP1和GhGRP2蛋白质序列同源性高达99%,仅在... 从棉花cDNA文库中分离了3个编码富含甘氨酸蛋白(glycine-rich proteins,GRPs)的基因,分别命名为GhGRP1、GhGRP2、GhGRP3.推断的编码蛋白质的氨基酸序列都富含甘氨酸,甘氨酸含量超过40%.而且GhGRP1和GhGRP2蛋白质序列同源性高达99%,仅在C末端有1个氨基酸残基(Arg/Pro)的差别.这3个蛋白在富含甘氨酸区相互显示较高的同源性,GhGRP1与GhGRP2达到100%,而GhGRP2与GhGRP3达到45·1%,但它们与基因数据库中其它蛋白质的同源性很低.根据结构域的组织特点,将GhGRP1和GhGRP2归为C端富含半胱氨酸结构域(C-cysteine-rich)类GRP,将GhGRP3归为N端有信号肽的GRP.GhGRP1和GhGRP2都含有12个GGX(此处X代表P/W/F)重复,GhGRP3含有22个GGX(此处X代表A/F/V/L/T/P)重复.此外,它们还含有不同数量GX,GGGX等的重复.实时RT-PCR分析表明,GhGRP1在花药中优势表达.GhGRP2在10dpa(day post anthesis)胚珠中表达最强,10dpa纤维和下胚轴次之,而在花药、根和花瓣中表达量相对较低.GhGRP3在花药,根和下胚轴中表达量较高,而在子叶,花瓣、纤维和胚珠中表达较低.上述结果表明,GhPRP基因家族的不同成员可能分别在棉花不同组织细胞的发育过程中发挥作用. 展开更多
关键词 棉花 富含甘氨酸蛋白 基因与蛋白质结构 差异表达
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3个棉纤维优势表达的CHS基因的分子鉴定与表达分析
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作者 宁华 李扬 +1 位作者 龚思颖 李学宝 《华中师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期272-278,共7页
从棉花纤维cDNA文库中分离了3个新的基因.对其编码的蛋白质结构特点的分析表明:这3个基因属于苯基苯乙烯酮合酶(chalcone synthase,CHS)类基因(分别命名为GhCHS2,GhCHS3和GhCHS4).在核苷酸水平上,GhCHS2与GhCHS3的cDNA序列同源性达到73%... 从棉花纤维cDNA文库中分离了3个新的基因.对其编码的蛋白质结构特点的分析表明:这3个基因属于苯基苯乙烯酮合酶(chalcone synthase,CHS)类基因(分别命名为GhCHS2,GhCHS3和GhCHS4).在核苷酸水平上,GhCHS2与GhCHS3的cDNA序列同源性达到73%,GhCHS3与GhCHS4的cDNA序列同源性达到67%,而GhCHS2与GhCHS4的cDNA序列同源性达到63%.在蛋白质水平上,GhCHS2与GhCHS3达到85%同源性,GhCHS2与GhCHS4达到60%同源性,而GhCHS3与GhCHS4同源性达到58%.荧光定量RT-PCR分析表明:GhCHS2、GhCHS3和GhCHS4都在棉纤维中优势表达,而在其他组织中表达量较低.结果表明它们可能在棉花纤维发育过程中起作用. 展开更多
关键词 棉花 苯基苯乙烯酮合酶(CHS) 基因与蛋白质结构 基因表达
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