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结直肠腺癌发病相关基因的识别:基于汇总数据的孟德尔随机化法
1
作者
白耀文
黑志军
+5 位作者
杨海龙
尹少军
马锋超
胡军红
张志永
夏坤锟
《郑州大学学报(医学版)》
北大核心
2025年第3期348-352,共5页
目的:基于汇总数据的孟德尔随机化(SMR)法识别结直肠腺癌(COAD)发病相关基因。方法:结合GWAS数据、来自不同研究的表达量性状基因座(eQTL)和DNA甲基化性状基因座(mQTL)数据采用SMR法识别COAD发病相关基因,通过单细胞RNA测序分析验证;整...
目的:基于汇总数据的孟德尔随机化(SMR)法识别结直肠腺癌(COAD)发病相关基因。方法:结合GWAS数据、来自不同研究的表达量性状基因座(eQTL)和DNA甲基化性状基因座(mQTL)数据采用SMR法识别COAD发病相关基因,通过单细胞RNA测序分析验证;整合多组学证据结果,明确关键基因和次要基因。结果:SMR分析筛选出6个与COAD发病风险显著相关的基因,包括ATF1、COLCA2、COLCA1、C11orf53,以及LINC01270(RP11-290F20.1)和LINC01271(RP11-290F20.2)。单细胞RNA测序分析证实COLCA1、COLCA2、C11orf53和LINC01270(RP11-290F20.1)的效应。ATF1被认定为关键基因,COLCA1、COLCA2、C11orf53、LINC01270(RP11-290F20.1)和LINC01271(RP11-290F20.2)被认定为次要基因。结论:识别出COAD发病相关基因。
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关键词
结直肠腺癌
基于汇总数据的孟德尔随机化法
候选基因识别
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题名
结直肠腺癌发病相关基因的识别:基于汇总数据的孟德尔随机化法
1
作者
白耀文
黑志军
杨海龙
尹少军
马锋超
胡军红
张志永
夏坤锟
机构
郑州大学第一附属医院结直肠肛门外科
出处
《郑州大学学报(医学版)》
北大核心
2025年第3期348-352,共5页
基金
河南省医学科技攻关计划省部共建项目(SBGJ202103060)
河南省高层次人才培养项目[豫科(2024)12号]。
文摘
目的:基于汇总数据的孟德尔随机化(SMR)法识别结直肠腺癌(COAD)发病相关基因。方法:结合GWAS数据、来自不同研究的表达量性状基因座(eQTL)和DNA甲基化性状基因座(mQTL)数据采用SMR法识别COAD发病相关基因,通过单细胞RNA测序分析验证;整合多组学证据结果,明确关键基因和次要基因。结果:SMR分析筛选出6个与COAD发病风险显著相关的基因,包括ATF1、COLCA2、COLCA1、C11orf53,以及LINC01270(RP11-290F20.1)和LINC01271(RP11-290F20.2)。单细胞RNA测序分析证实COLCA1、COLCA2、C11orf53和LINC01270(RP11-290F20.1)的效应。ATF1被认定为关键基因,COLCA1、COLCA2、C11orf53、LINC01270(RP11-290F20.1)和LINC01271(RP11-290F20.2)被认定为次要基因。结论:识别出COAD发病相关基因。
关键词
结直肠腺癌
基于汇总数据的孟德尔随机化法
候选基因识别
Keywords
colorectal adenocarcinoma
summary-data-based Mendelian randomization
candidate gene identification
分类号
R735.3 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
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被引量
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1
结直肠腺癌发病相关基因的识别:基于汇总数据的孟德尔随机化法
白耀文
黑志军
杨海龙
尹少军
马锋超
胡军红
张志永
夏坤锟
《郑州大学学报(医学版)》
北大核心
2025
0
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