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细菌性条斑病菌JH01诱导水稻抗病均一化差减文库的构建
被引量：
1
1
作者
凌丹燕
路梅
《安徽农业科学》
CAS
2016年第2期188-191,共4页
[目的]构建细菌性条班病菌诱导下的水稻抗病均一化差减eDNA文库，对获得的差异表达ESTs进行生物信息学及抗病相关基因的表达分析。[方法]以水稻IR26（Tester）和两优培九（Driver）幼苗5～6叶期叶片为材料，采用双链特异性核酸酶（DSN...
[目的]构建细菌性条班病菌诱导下的水稻抗病均一化差减eDNA文库，对获得的差异表达ESTs进行生物信息学及抗病相关基因的表达分析。[方法]以水稻IR26（Tester）和两优培九（Driver）幼苗5～6叶期叶片为材料，采用双链特异性核酸酶（DSN）介导的均一化消减杂交技术，构建细菌性条斑病菌JH01诱导的水稻抗病相关基因差减eDNA文库，以pLB-F和pLB-R为引物，通过菌液PCR扩增对差减文库的质量进行检测。【结果】eDNA文库的插入片段分布在0．5～2．0kb，平均大小约为1．0kb．重组率达95％。序列测定分析发现，随机挑取的504个克隆中有98条差异表达基因；经BLAST比对和GO注释发现，59条序列具有同源基因，分别参与信号转导、能量代谢、过敏性坏死反应、防卫反应等；另外39条序列无相似基因，有待进一步研究。通过实时荧光定量PCR发现，从该文库中分离得到的OsNDPK4参与细菌性条斑病菌JH01诱导的水稻防卫反应。[结论]水稻受细菌性条斑病菌侵染的eDNA文库质量较好，为研究条斑病菌致病性因子与水稻互作机制奠定基础.
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关键词
细菌性条斑病
水稻
双链特异性核酸酶(DSN)
均一化差减杂交
荧光定量PCR
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职称材料
题名
细菌性条斑病菌JH01诱导水稻抗病均一化差减文库的构建
被引量：
1
1
作者
凌丹燕
路梅
机构
浙江师范大学化学与生命科学学院
出处
《安徽农业科学》
CAS
2016年第2期188-191,共4页
基金
浙江省自然科学基金项目(Y3110194)
文摘
[目的]构建细菌性条班病菌诱导下的水稻抗病均一化差减eDNA文库，对获得的差异表达ESTs进行生物信息学及抗病相关基因的表达分析。[方法]以水稻IR26（Tester）和两优培九（Driver）幼苗5～6叶期叶片为材料，采用双链特异性核酸酶（DSN）介导的均一化消减杂交技术，构建细菌性条斑病菌JH01诱导的水稻抗病相关基因差减eDNA文库，以pLB-F和pLB-R为引物，通过菌液PCR扩增对差减文库的质量进行检测。【结果】eDNA文库的插入片段分布在0．5～2．0kb，平均大小约为1．0kb．重组率达95％。序列测定分析发现，随机挑取的504个克隆中有98条差异表达基因；经BLAST比对和GO注释发现，59条序列具有同源基因，分别参与信号转导、能量代谢、过敏性坏死反应、防卫反应等；另外39条序列无相似基因，有待进一步研究。通过实时荧光定量PCR发现，从该文库中分离得到的OsNDPK4参与细菌性条斑病菌JH01诱导的水稻防卫反应。[结论]水稻受细菌性条斑病菌侵染的eDNA文库质量较好，为研究条斑病菌致病性因子与水稻互作机制奠定基础.
关键词
细菌性条斑病
水稻
双链特异性核酸酶(DSN)
均一化差减杂交
荧光定量PCR
Keywords
Bacterial leaf streak
Rice
Duplex-specific nnclease （DSN）
Normalized subtractive hybridization
Real-tine fluorescence quantitative PCR
分类号
S432.1 [农业科学—植物病理学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
细菌性条斑病菌JH01诱导水稻抗病均一化差减文库的构建
凌丹燕
路梅
《安徽农业科学》
CAS
2016
1
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