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洱海流域油菜-水稻轮作农田土壤细菌多样性特征
被引量：
2
1
作者
伏成秀
李铭刚
+8 位作者
吴翔
付斌
张庆
施竹凤
倪明
胡万里
杨明英
朱红业
杨佩文
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2020年第9期1898-1904,共7页
【目的】解析洱海流域油菜-水稻轮作农田土壤细菌多样性特征,探讨水旱轮作对土壤微生物多样性的影响。【方法】运用微生物核糖体RNA基因靶向测序技术和荧光定量PCR技术,研究了连续7Y油菜-水稻种植后土壤细菌种群结构的组成、丰度和碳氮...
【目的】解析洱海流域油菜-水稻轮作农田土壤细菌多样性特征,探讨水旱轮作对土壤微生物多样性的影响。【方法】运用微生物核糖体RNA基因靶向测序技术和荧光定量PCR技术,研究了连续7Y油菜-水稻种植后土壤细菌种群结构的组成、丰度和碳氮转化功能基因丰度变化特征,结合Perason相关性分析,解析细菌种群结构与土壤碳氮素之间的关系。【结果】土壤有机质(OM)和全氮(TN)与细菌种群中的变形菌门(Proteobacteria)和酸杆菌门(Acidobacteria)的种群相对丰度呈显著负相关关系,与绿弯菌门(Chloroflexi)和放线菌门(Actinobacteria)的种群相对丰度呈显著正相关关系。在油菜和水稻种植季,不同处理间Clean tags数量、OTUs丰度及α多样性指数差异性不显著(P≥5),门分类水平上的优势细菌种群相对丰度差异性不显著(P≥5)。土壤碳氮转化功能基因qPCR统计分析结果表明,处理间固碳基因cbbL-R和氨氧化基因amoA的拷贝数差异性不显著,有机碳源物料配施化肥显著提高固氮基因nifH和氨氧化基因amoA拷贝数(P<0.05)。【结论】油菜和水稻种植季土壤细菌种群结构组成和碳氮转化功能基因丰度呈相似变化趋势,水旱轮作对土壤细菌种群多样性的影响不显著,其稳定性可能与土壤本底较高的碳氮素储量有关。
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关键词
油菜-水稻轮作
土壤细菌种群结构
高通量测序
碳氮转化功能基因
qPCR定量分析
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职称材料
基于高通量测序的穿心莲连作根际土壤细菌群落多样性分析
被引量：
10
2
作者
周界
李明
+4 位作者
徐友阳
洪彪
段书蕾
张慧晔
邹江林
《华南农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第3期55-63,共9页
【目的】研究穿心莲Andrographis paniculata连作对土壤细菌多样性及种群结构的影响。【方法】通过16S rRNA基因高通量测序对连作组(连作5年穿心莲的根际土壤)和对照组(连作5年穿心莲周边相同土质的未耕作自然土壤)样品进行测序分析,比...
【目的】研究穿心莲Andrographis paniculata连作对土壤细菌多样性及种群结构的影响。【方法】通过16S rRNA基因高通量测序对连作组(连作5年穿心莲的根际土壤)和对照组(连作5年穿心莲周边相同土质的未耕作自然土壤)样品进行测序分析,比较2组土壤细菌的丰富度、多样性和群落结构差异。【结果】α多样性指数分析结果显示,连作组土壤中细菌丰富度指数Chao1指数、Observed species指数显著低于对照组(P<0.05),连作组土壤中的多样性指数Shannon指数和Simpson指数均低于对照组,但差异不显著。主坐标分析及分子方差分析进行组间群落结构差异显著性分析结果显示,穿心莲连作显著改变了土壤细菌群落结构(P<0.05)。从2个处理组土壤样品中共检测到2 769个可操作分类单元,分属于47门885属,穿心莲连作明显改变了土壤细菌在门和属水平上的结构分布。在门分类水平上,酸杆菌门Acidobacteria、变形菌门Proteobacteria、拟杆菌门Bacteroidetes和Patescibacteria等11个细菌门是2个处理组的主要细菌类群,连作组土壤中变形菌门和酸杆菌门的相对丰度较对照组分别增加了21.97%和46.33%(P<0.05),而Patescibacteria较对照组减少了68.99%(P<0.05);在属分类水平上,有10个优势菌属的相对丰度变化显著(P<0.05),其中连作组土壤中有益生防细菌黄杆菌属Flavobacterium和Haliangium的相对丰度较对照组分别减少了78.40%和54.55%,而植物病原细菌伯克氏菌属Burkholderia-Caballeronia-Paraburkholderia的相对丰度较对照组增加了804.17%。【结论】穿心莲5年连作降低了土壤细菌丰富度和多样性水平,使土壤微生态系统稳定性降低,同时有益菌相对丰度显著降低,而病原菌相对丰度显著增加造成细菌群落结构改变。上述变化打破了原有的土壤微生态平衡,可能是穿心莲连作障碍的重要原因之一。
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关键词
穿心莲
连作障碍
土壤细菌种群结构
高通量测序
相对丰度
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职称材料
题名
洱海流域油菜-水稻轮作农田土壤细菌多样性特征
被引量：
2
1
作者
伏成秀
李铭刚
吴翔
付斌
张庆
施竹凤
倪明
胡万里
杨明英
朱红业
杨佩文
机构
云南省农业科学院农业环境资源研究所
云南大学
四川省农业科学院土壤肥料研究所
出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2020年第9期1898-1904,共7页
基金
国家自然科学基金(31660600,31760019)
农业农村部西南山地农业环境重点实验室开放基金(AESMA-OPP-2019001)。
文摘
【目的】解析洱海流域油菜-水稻轮作农田土壤细菌多样性特征,探讨水旱轮作对土壤微生物多样性的影响。【方法】运用微生物核糖体RNA基因靶向测序技术和荧光定量PCR技术,研究了连续7Y油菜-水稻种植后土壤细菌种群结构的组成、丰度和碳氮转化功能基因丰度变化特征,结合Perason相关性分析,解析细菌种群结构与土壤碳氮素之间的关系。【结果】土壤有机质(OM)和全氮(TN)与细菌种群中的变形菌门(Proteobacteria)和酸杆菌门(Acidobacteria)的种群相对丰度呈显著负相关关系,与绿弯菌门(Chloroflexi)和放线菌门(Actinobacteria)的种群相对丰度呈显著正相关关系。在油菜和水稻种植季,不同处理间Clean tags数量、OTUs丰度及α多样性指数差异性不显著(P≥5),门分类水平上的优势细菌种群相对丰度差异性不显著(P≥5)。土壤碳氮转化功能基因qPCR统计分析结果表明,处理间固碳基因cbbL-R和氨氧化基因amoA的拷贝数差异性不显著,有机碳源物料配施化肥显著提高固氮基因nifH和氨氧化基因amoA拷贝数(P<0.05)。【结论】油菜和水稻种植季土壤细菌种群结构组成和碳氮转化功能基因丰度呈相似变化趋势,水旱轮作对土壤细菌种群多样性的影响不显著,其稳定性可能与土壤本底较高的碳氮素储量有关。
关键词
油菜-水稻轮作
土壤细菌种群结构
高通量测序
碳氮转化功能基因
qPCR定量分析
Keywords
Rape-rice rotation
Soil microbial population
High-throughput sequencing
Carbon and nitrogen conversion function gene
qPCR quantitative analysis
分类号
S147.2 [农业科学—肥料学]
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职称材料
题名
基于高通量测序的穿心莲连作根际土壤细菌群落多样性分析
被引量：
10
2
作者
周界
李明
徐友阳
洪彪
段书蕾
张慧晔
邹江林
机构
广东药科大学中药学院
国家中医药管理局岭南药材生产与开发重点研究室
广州白云山和记黄埔中药有限公司
出处
《华南农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第3期55-63,共9页
基金
广东省科技计划(2016A020226050)
广东省重点领域研发计划(2020B020221002)。
文摘
【目的】研究穿心莲Andrographis paniculata连作对土壤细菌多样性及种群结构的影响。【方法】通过16S rRNA基因高通量测序对连作组(连作5年穿心莲的根际土壤)和对照组(连作5年穿心莲周边相同土质的未耕作自然土壤)样品进行测序分析,比较2组土壤细菌的丰富度、多样性和群落结构差异。【结果】α多样性指数分析结果显示,连作组土壤中细菌丰富度指数Chao1指数、Observed species指数显著低于对照组(P<0.05),连作组土壤中的多样性指数Shannon指数和Simpson指数均低于对照组,但差异不显著。主坐标分析及分子方差分析进行组间群落结构差异显著性分析结果显示,穿心莲连作显著改变了土壤细菌群落结构(P<0.05)。从2个处理组土壤样品中共检测到2 769个可操作分类单元,分属于47门885属,穿心莲连作明显改变了土壤细菌在门和属水平上的结构分布。在门分类水平上,酸杆菌门Acidobacteria、变形菌门Proteobacteria、拟杆菌门Bacteroidetes和Patescibacteria等11个细菌门是2个处理组的主要细菌类群,连作组土壤中变形菌门和酸杆菌门的相对丰度较对照组分别增加了21.97%和46.33%(P<0.05),而Patescibacteria较对照组减少了68.99%(P<0.05);在属分类水平上,有10个优势菌属的相对丰度变化显著(P<0.05),其中连作组土壤中有益生防细菌黄杆菌属Flavobacterium和Haliangium的相对丰度较对照组分别减少了78.40%和54.55%,而植物病原细菌伯克氏菌属Burkholderia-Caballeronia-Paraburkholderia的相对丰度较对照组增加了804.17%。【结论】穿心莲5年连作降低了土壤细菌丰富度和多样性水平,使土壤微生态系统稳定性降低,同时有益菌相对丰度显著降低,而病原菌相对丰度显著增加造成细菌群落结构改变。上述变化打破了原有的土壤微生态平衡,可能是穿心莲连作障碍的重要原因之一。
关键词
穿心莲
连作障碍
土壤细菌种群结构
高通量测序
相对丰度
Keywords
Andrographis paniculata
continuous cropping obstacle
soil bacterial community structure
high-throughput sequencing
relative abundance
分类号
R282.2 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
洱海流域油菜-水稻轮作农田土壤细菌多样性特征
伏成秀
李铭刚
吴翔
付斌
张庆
施竹凤
倪明
胡万里
杨明英
朱红业
杨佩文
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2020
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于高通量测序的穿心莲连作根际土壤细菌群落多样性分析
周界
李明
徐友阳
洪彪
段书蕾
张慧晔
邹江林
《华南农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
10
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