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实时荧光定量PCR在固氮酶基因检测中的应用
被引量：
2
1
作者
孙傲雪
徐凤花
+3 位作者
刘洋
郭慧娟
曹艳花
张晓霞
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第3期82-85,共4页
实时荧光定量PCR是近年发展起来的一种新的实时定量检测特定核酸技术,它是核酸探针技术、荧光共振能量传递技术和PCR技术的有机结合。与常规PCR相比,它具有特异性更强、能有效解决PCR污染问题、自动化程度高等特点,扩大了PCR的应用范围...
实时荧光定量PCR是近年发展起来的一种新的实时定量检测特定核酸技术,它是核酸探针技术、荧光共振能量传递技术和PCR技术的有机结合。与常规PCR相比,它具有特异性更强、能有效解决PCR污染问题、自动化程度高等特点,扩大了PCR的应用范围。概述实时荧光定量PCR技术在固氮酶(nifH)基因检测中的应用与研究进展,并探讨该技术的发展和应用前景。
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关键词
实时荧光定量PCR
固氮酶
(
nifh
)
基因
检测技术
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职称材料
基于RFLP技术的鹿角杯形珊瑚共附生固氮菌多样性分析
被引量：
1
2
作者
黄小芳
陈蕾
+4 位作者
张燕英
凌娟
龙丽娟
张偲
董俊德
《生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第20期5875-5886,共12页
对三亚湾鹿回头与西沙石岛的常见鹿角杯形珊瑚(Pocillopora damicornis)的固氮酶nif H基因多样性进行了分析,并对其共附生固氮微生物多样性进行了比较。利用Taq I和HaeⅢ两种限制性内切酶分别对三亚湾珊瑚的粘液(SYN)、组织(SYZ)和西沙...
对三亚湾鹿回头与西沙石岛的常见鹿角杯形珊瑚(Pocillopora damicornis)的固氮酶nif H基因多样性进行了分析,并对其共附生固氮微生物多样性进行了比较。利用Taq I和HaeⅢ两种限制性内切酶分别对三亚湾珊瑚的粘液(SYN)、组织(SYZ)和西沙珊瑚组织(XSZ)的阳性克隆子进行聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析,得到了23,25和13个OTUs,文库的覆盖率分别为90.3%,87.5%和94.1%,多样性指数Shannon-Wiener指数(H)分别为2.28,3.02和2.08,Evenness指数(E)分别为0.5,0.65和0.56。研究结果表明:1)3个文库重要组成部分都是绿菌门(Chlorobia)和变形菌门(Proteobacteria)α-亚门、γ-亚门、δ-亚门细菌;2)3个文库绝大部分OTUs的最相似序列来自珊瑚礁、海绵、水体、沉积物等环境中的不可培养细菌,反映鹿角杯形珊瑚组织和粘液可能蕴含着丰富的尚未被培养的固氮菌资源;3)发现了两大重要的类群——分别与绿菌门和脱硫弧菌属(Desulfovibrio)细菌序列最相似的类群,它们通过为珊瑚共生体提供有机氮源参与到珊瑚白化的调节或恢复过程中,在珊瑚共生体营养物质的循环中充当重要角色;4)从多样性指数分析可以看出,SYZ的固氮微生物多样性高于SYN,SYZ的固氮微生物多样性高于XSZ,反映了鹿角杯形珊瑚生活的地理位置不同,固氮菌共附生的生态位不同(如珊瑚粘液、组织等不同部位),都将导致珊瑚共附生固氮菌多样性的差异。
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关键词
鹿角杯形珊瑚
固氮
菌
固氮酶基因nifh
PCR-RFLP
生物多样性
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职称材料
题名
实时荧光定量PCR在固氮酶基因检测中的应用
被引量：
2
1
作者
孙傲雪
徐凤花
刘洋
郭慧娟
曹艳花
张晓霞
机构
东北农业大学资源与环境学院
首都师范大学生命科学学院
中国农业科学院农业资源与农业区划研究所
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第3期82-85,共4页
基金
国家自然科学基金项目(30900001)
文摘
实时荧光定量PCR是近年发展起来的一种新的实时定量检测特定核酸技术,它是核酸探针技术、荧光共振能量传递技术和PCR技术的有机结合。与常规PCR相比,它具有特异性更强、能有效解决PCR污染问题、自动化程度高等特点,扩大了PCR的应用范围。概述实时荧光定量PCR技术在固氮酶(nifH)基因检测中的应用与研究进展,并探讨该技术的发展和应用前景。
关键词
实时荧光定量PCR
固氮酶
(
nifh
)
基因
检测技术
Keywords
Real-time fluorescent quantitative PCR Nitrogenase（
nifh
）gene Measurement technique
分类号
R450 [医药卫生—治疗学]
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职称材料
题名
基于RFLP技术的鹿角杯形珊瑚共附生固氮菌多样性分析
被引量：
1
2
作者
黄小芳
陈蕾
张燕英
凌娟
龙丽娟
张偲
董俊德
机构
中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室
中国科学院南海海洋研究所海南热带海洋生物实验站
中国科学院大学
出处
《生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第20期5875-5886,共12页
基金
国家自然科学基金项目(41276113
41276114
+6 种基金
41006069)
国家高技术研究发展计划项目(2012AA092104
2013AA092901
2013AA092902)
中国科学院战略性先导科技专项A(XDA11020202)
三亚市院地科技合作项目(2013YD74)
国家海洋局近岸海域生态环境重点实验室开放基金(201304)
文摘
对三亚湾鹿回头与西沙石岛的常见鹿角杯形珊瑚(Pocillopora damicornis)的固氮酶nif H基因多样性进行了分析,并对其共附生固氮微生物多样性进行了比较。利用Taq I和HaeⅢ两种限制性内切酶分别对三亚湾珊瑚的粘液(SYN)、组织(SYZ)和西沙珊瑚组织(XSZ)的阳性克隆子进行聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析,得到了23,25和13个OTUs,文库的覆盖率分别为90.3%,87.5%和94.1%,多样性指数Shannon-Wiener指数(H)分别为2.28,3.02和2.08,Evenness指数(E)分别为0.5,0.65和0.56。研究结果表明:1)3个文库重要组成部分都是绿菌门(Chlorobia)和变形菌门(Proteobacteria)α-亚门、γ-亚门、δ-亚门细菌;2)3个文库绝大部分OTUs的最相似序列来自珊瑚礁、海绵、水体、沉积物等环境中的不可培养细菌,反映鹿角杯形珊瑚组织和粘液可能蕴含着丰富的尚未被培养的固氮菌资源;3)发现了两大重要的类群——分别与绿菌门和脱硫弧菌属(Desulfovibrio)细菌序列最相似的类群,它们通过为珊瑚共生体提供有机氮源参与到珊瑚白化的调节或恢复过程中,在珊瑚共生体营养物质的循环中充当重要角色;4)从多样性指数分析可以看出,SYZ的固氮微生物多样性高于SYN,SYZ的固氮微生物多样性高于XSZ,反映了鹿角杯形珊瑚生活的地理位置不同,固氮菌共附生的生态位不同(如珊瑚粘液、组织等不同部位),都将导致珊瑚共附生固氮菌多样性的差异。
关键词
鹿角杯形珊瑚
固氮
菌
固氮酶基因nifh
PCR-RFLP
生物多样性
Keywords
Pocillopora damicornis
nitrogen-fixing bacteria
nif H
PCR-RFLP
biodiversity
分类号
Q938 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
实时荧光定量PCR在固氮酶基因检测中的应用
孙傲雪
徐凤花
刘洋
郭慧娟
曹艳花
张晓霞
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于RFLP技术的鹿角杯形珊瑚共附生固氮菌多样性分析
黄小芳
陈蕾
张燕英
凌娟
龙丽娟
张偲
董俊德
《生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
1
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