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回交自交系(BIL)群体4对主基因加多基因混合遗传模型分离分析方法的建立
被引量:
11
1
作者
王金社
赵团结
盖钧镒
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期198-206,共9页
主基因加多基因混合遗传模型是用于分析数量性状表型数据的统计分析方法,该方法便于育种工作者利用杂种分离世代的数据对育种性状的遗传组成初步判断,制定相应的育种策略,也可用于校验QTL定位所揭示的数量性状的性状遗传组成。回交自交...
主基因加多基因混合遗传模型是用于分析数量性状表型数据的统计分析方法,该方法便于育种工作者利用杂种分离世代的数据对育种性状的遗传组成初步判断,制定相应的育种策略,也可用于校验QTL定位所揭示的数量性状的性状遗传组成。回交自交系(BIL)群体是永久性群体,可以进行有重复的比较试验,适用于受环境影响较大的复杂性状的遗传研究。本研究以BIL群体为对象构建了4对主基因、主基因加多基因分离分析方法的遗传模型,包括2类11个遗传模型。利用基于IECM(iterative expectation conditional maximization)算法的极大似然分析方法估算各个混合遗传模型中的分布参数,用AIC值和一组适合性测验结果选取最优模型,并从入选模型的分布参数通过最小二乘法估计遗传参数。由1个模拟的随机区组试验对模型进行验证,模拟群体中遗传参数的估计值与设定值之间具有很好的一致性。利用本文建立的模型重新分析大豆回交自交系群体(Essex×ZDD2315)及其亲本对胞囊线虫(Hetero-dera glycines Ichinohe)1号生理小种的抗性数据后发现4对主基因模型优于原报道的3对主基因模型,说明本方法的有效性和正确性。
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关键词
回交
自交
家系
群体
(
bil
)
主基因加多基因混合遗传
分离分析
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职称材料
回交自交系群体数量性状遗传体系的分离分析方法
被引量:
12
2
作者
何小红
盖钧镒
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第2期210-216,共7页
将植物数量性状的主基因-多基因遗传体系检测的分离分析方法拓展到回交自交系群体。建立了包括无遗传控制、只有多基因控制、1—3对主基因控制和1—3对主基因+多基因控制遗传模型下的混合分布函数,并由ML和ECM算法估计分布参数。以最...
将植物数量性状的主基因-多基因遗传体系检测的分离分析方法拓展到回交自交系群体。建立了包括无遗传控制、只有多基因控制、1—3对主基因控制和1—3对主基因+多基因控制遗传模型下的混合分布函数,并由ML和ECM算法估计分布参数。以最大熵(最小AIC)准则和适合性测验选择最优最适遗传模型,进而利用所估计的分布参数估算遗传参数。在方法推演基础上通过1个模拟数据例题说明其应用。
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关键词
数量性状
回交
自交
系(
bil
)
群体
主基因+多基因混合遗传
分离分析
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职称材料
题名
回交自交系(BIL)群体4对主基因加多基因混合遗传模型分离分析方法的建立
被引量:
11
1
作者
王金社
赵团结
盖钧镒
机构
南京农业大学大豆研究所/国家大豆改良中心/农业部大豆生物学与遗传育种重点实验室(综合)/作物遗传与种质创新国家重点实验室
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期198-206,共9页
基金
国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(2009CB1184
2010CB1259
+7 种基金
2011CB1093)
国家高新技术研究发展计划(863计划)项目(2011AA10A105
2012AA101106)
国家自然科学基金资助项目(31071442
32671266)
农业部公益性行业专项(200803060)
江苏省优势学科建设工程专项
国家重点实验室自主课题项目资助
文摘
主基因加多基因混合遗传模型是用于分析数量性状表型数据的统计分析方法,该方法便于育种工作者利用杂种分离世代的数据对育种性状的遗传组成初步判断,制定相应的育种策略,也可用于校验QTL定位所揭示的数量性状的性状遗传组成。回交自交系(BIL)群体是永久性群体,可以进行有重复的比较试验,适用于受环境影响较大的复杂性状的遗传研究。本研究以BIL群体为对象构建了4对主基因、主基因加多基因分离分析方法的遗传模型,包括2类11个遗传模型。利用基于IECM(iterative expectation conditional maximization)算法的极大似然分析方法估算各个混合遗传模型中的分布参数,用AIC值和一组适合性测验结果选取最优模型,并从入选模型的分布参数通过最小二乘法估计遗传参数。由1个模拟的随机区组试验对模型进行验证,模拟群体中遗传参数的估计值与设定值之间具有很好的一致性。利用本文建立的模型重新分析大豆回交自交系群体(Essex×ZDD2315)及其亲本对胞囊线虫(Hetero-dera glycines Ichinohe)1号生理小种的抗性数据后发现4对主基因模型优于原报道的3对主基因模型,说明本方法的有效性和正确性。
关键词
回交
自交
家系
群体
(
bil
)
主基因加多基因混合遗传
分离分析
Keywords
Backcross Inbred Lines (
bil
) population
Major gene plus polygenes mixed inheritance
Segregation analysis
分类号
S334 [农业科学—作物遗传育种]
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职称材料
题名
回交自交系群体数量性状遗传体系的分离分析方法
被引量:
12
2
作者
何小红
盖钧镒
机构
南京农业大学大豆研究所/国家大豆改良中心/南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第2期210-216,共7页
基金
国家自然科学基金(30492050)
高校博士点基金(20020307028)
长江学者和创新团队发展计划资助
文摘
将植物数量性状的主基因-多基因遗传体系检测的分离分析方法拓展到回交自交系群体。建立了包括无遗传控制、只有多基因控制、1—3对主基因控制和1—3对主基因+多基因控制遗传模型下的混合分布函数,并由ML和ECM算法估计分布参数。以最大熵(最小AIC)准则和适合性测验选择最优最适遗传模型,进而利用所估计的分布参数估算遗传参数。在方法推演基础上通过1个模拟数据例题说明其应用。
关键词
数量性状
回交
自交
系(
bil
)
群体
主基因+多基因混合遗传
分离分析
Keywords
Quantitative trait
bil
population
Major gene plus polygene mixed inheritance
Segregation analysis
分类号
S334 [农业科学—作物遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
回交自交系(BIL)群体4对主基因加多基因混合遗传模型分离分析方法的建立
王金社
赵团结
盖钧镒
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
11
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
回交自交系群体数量性状遗传体系的分离分析方法
何小红
盖钧镒
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006
12
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职称材料
已选择
0
条
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参考文献
引证文献
统计分析
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