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大豆四粒荚数QTL分析及位点交互群体验证
被引量：
1
1
作者
李灿东
蒋洪蔚
+6 位作者
郭泰
王志新
郑伟
张振宇
赵海红
王囡囡
陈庆山
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期44-50,共7页
为定位年际间稳定、群体间通用的大豆四粒荚QTL,以2013-2016年表型数据为基础,利用RIL群体结合SLAF-seq高密度遗传图谱对大豆四粒荚数进行QTL分析,利用含目标区间的导入系个体对QTL进行表型验证。结果表明:RILs群体大豆四粒荚QTL分析共...
为定位年际间稳定、群体间通用的大豆四粒荚QTL,以2013-2016年表型数据为基础,利用RIL群体结合SLAF-seq高密度遗传图谱对大豆四粒荚数进行QTL分析,利用含目标区间的导入系个体对QTL进行表型验证。结果表明:RILs群体大豆四粒荚QTL分析共获得8个QTL,其中在Gm06染色体上检测到4个位置相近的QTLs,加性效应为正值,区间大小0.62Mb,在Gm16染色体上检测到4个位置相同的QTL,加性效应为负值,区间大小1.04Mb,这些QTL是不同年际间稳定存在的位点。共有5个导入系个体含有Gm06染色体目标区间,这些个体在不同年际间的四粒荚表型值均显著高于轮回亲本,共有7个导入系个体含有Gm16染色体目标区间,这些个体在不同年际间的四粒荚数表型值均显著低于轮回亲本,表明目标区间的导入对导入系四粒荚数表型具有相应的增效或减效作用,从而在全基因组导入系群体中验证了QTL的准确性与通用性。研究结果为大豆四粒荚数候选基因挖掘及分子辅助育种提供理论依据。
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关键词
大豆
四粒荚数
QTL定位
交互群体验证
在线阅读
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职称材料
大豆高密度遗传图谱的构建及产量相关性状QTL定位
被引量：
3
2
作者
王博
董莹莹
+8 位作者
付雪
刘赫禹
张翔超
刘冀
史飞飞
赵雪
韩英鹏
李文滨
滕卫丽
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期1228-1238,共11页
大豆是重要的粮油作物,而我国大豆主要依靠进口,提高大豆产量对保障国家粮油安全意义重大。为定位大豆产量相关性状,本研究以产量差异显著的东农42和东农50作为杂交亲本,构建了包含168个家系的重组自交系(recombination inbred lines,RI...
大豆是重要的粮油作物,而我国大豆主要依靠进口,提高大豆产量对保障国家粮油安全意义重大。为定位大豆产量相关性状,本研究以产量差异显著的东农42和东农50作为杂交亲本,构建了包含168个家系的重组自交系(recombination inbred lines,RILs)群体,对其进行全基因组重测序,构建高密度遗传图谱,并利用R/qtl软件的复合区间作图法(composite interval mapping,CIM)结合两年六点的大豆产量相关性状表型数据,进行QTL定位。结果表明:利用测序获得的660316个SNP标记构建了一张分布在20个连锁群的包含6227个bin标记的大豆高密度遗传图谱,总图距和平均图距分别为2739.15 cM,0.44 cM。在12个染色体上定位到22个大豆产量相关性状QTL,四粒荚数、单株荚数、单株粒重和百粒重性状定位到的QTL分别为5、4、5和8个。在3号和19号染色体上各有一段基因组区域在两年间重复定位,涉及6个主效QTL,分别为qNFSP-19-1(22.976%)、qNFSP-19-2(11.977%)、qNFSP 19-3(17.203%)、qHSW-3-1(11.346%)、qHSW-3-2(11.346%)和qHSW-3-3(11.175%),加性效应值均为负值。在3、7、11、12和20号染色体上新定位到7个产量相关性状QTL,其中表型贡献率最高的为qHSW-3-3(14.276%),包含具有重复定位区间的qHSW-3-2和qHSW-3-3。与前人定位的结果相比,更多QTL极大地缩短了定位区间,表明本文报道的高密度遗传图谱更准确,可以为大豆产量相关性状的精细定位、候选基因的挖掘及分子标记辅助育种奠定基础。
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关键词
大豆
高密度遗传图谱
四粒荚数
单株
荚
数
单株
粒
重
百
粒
重
QTL
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职称材料
题名
大豆四粒荚数QTL分析及位点交互群体验证
被引量：
1
1
作者
李灿东
蒋洪蔚
郭泰
王志新
郑伟
张振宇
赵海红
王囡囡
陈庆山
机构
黑龙江省农业科学院佳木斯分院
东北农业大学
吉林省农业科学院
出处
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期44-50,共7页
基金
黑龙江省自然科学基金优秀青年基金(YQ2019C021)
国家自然科学基金青年科学基金(31801389)。
文摘
为定位年际间稳定、群体间通用的大豆四粒荚QTL,以2013-2016年表型数据为基础,利用RIL群体结合SLAF-seq高密度遗传图谱对大豆四粒荚数进行QTL分析,利用含目标区间的导入系个体对QTL进行表型验证。结果表明:RILs群体大豆四粒荚QTL分析共获得8个QTL,其中在Gm06染色体上检测到4个位置相近的QTLs,加性效应为正值,区间大小0.62Mb,在Gm16染色体上检测到4个位置相同的QTL,加性效应为负值,区间大小1.04Mb,这些QTL是不同年际间稳定存在的位点。共有5个导入系个体含有Gm06染色体目标区间,这些个体在不同年际间的四粒荚表型值均显著高于轮回亲本,共有7个导入系个体含有Gm16染色体目标区间,这些个体在不同年际间的四粒荚数表型值均显著低于轮回亲本,表明目标区间的导入对导入系四粒荚数表型具有相应的增效或减效作用,从而在全基因组导入系群体中验证了QTL的准确性与通用性。研究结果为大豆四粒荚数候选基因挖掘及分子辅助育种提供理论依据。
关键词
大豆
四粒荚数
QTL定位
交互群体验证
Keywords
soybean
the number of four-seed-pod
QTL identification
interactive group validation
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
大豆高密度遗传图谱的构建及产量相关性状QTL定位
被引量：
3
2
作者
王博
董莹莹
付雪
刘赫禹
张翔超
刘冀
史飞飞
赵雪
韩英鹏
李文滨
滕卫丽
机构
东北农业大学大豆研究所
出处
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期1228-1238,共11页
基金
黑龙江省“百千万”工程科技重大专项(2019ZX16B01-1)
现代农业产业技术体系建设专项(CARS-04-PS04)
国家自然科学基金(31471517)。
文摘
大豆是重要的粮油作物,而我国大豆主要依靠进口,提高大豆产量对保障国家粮油安全意义重大。为定位大豆产量相关性状,本研究以产量差异显著的东农42和东农50作为杂交亲本,构建了包含168个家系的重组自交系(recombination inbred lines,RILs)群体,对其进行全基因组重测序,构建高密度遗传图谱,并利用R/qtl软件的复合区间作图法(composite interval mapping,CIM)结合两年六点的大豆产量相关性状表型数据,进行QTL定位。结果表明:利用测序获得的660316个SNP标记构建了一张分布在20个连锁群的包含6227个bin标记的大豆高密度遗传图谱,总图距和平均图距分别为2739.15 cM,0.44 cM。在12个染色体上定位到22个大豆产量相关性状QTL,四粒荚数、单株荚数、单株粒重和百粒重性状定位到的QTL分别为5、4、5和8个。在3号和19号染色体上各有一段基因组区域在两年间重复定位,涉及6个主效QTL,分别为qNFSP-19-1(22.976%)、qNFSP-19-2(11.977%)、qNFSP 19-3(17.203%)、qHSW-3-1(11.346%)、qHSW-3-2(11.346%)和qHSW-3-3(11.175%),加性效应值均为负值。在3、7、11、12和20号染色体上新定位到7个产量相关性状QTL,其中表型贡献率最高的为qHSW-3-3(14.276%),包含具有重复定位区间的qHSW-3-2和qHSW-3-3。与前人定位的结果相比,更多QTL极大地缩短了定位区间,表明本文报道的高密度遗传图谱更准确,可以为大豆产量相关性状的精细定位、候选基因的挖掘及分子标记辅助育种奠定基础。
关键词
大豆
高密度遗传图谱
四粒荚数
单株
荚
数
单株
粒
重
百
粒
重
QTL
Keywords
soybean
high density genetic map
number of four-seed-pod
pods per plant
seed weight per plant
100-seed weight
QTL
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大豆四粒荚数QTL分析及位点交互群体验证
李灿东
蒋洪蔚
郭泰
王志新
郑伟
张振宇
赵海红
王囡囡
陈庆山
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
大豆高密度遗传图谱的构建及产量相关性状QTL定位
王博
董莹莹
付雪
刘赫禹
张翔超
刘冀
史飞飞
赵雪
韩英鹏
李文滨
滕卫丽
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
3
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