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珠三角地区鸭坦布苏病毒的全基因序列测定与分析
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作者 张克山 陈芳艳 +5 位作者 刘金 蔡丝丝 刘湘红 张靖鹏 陈瑞爱 王林川 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期13-19,共7页
【目的】了解2010年以来分离于珠三角地区鸭坦布苏病毒病（Duck Tembusu virus，DTMUV）GDNS2010．1、GDNS2010．2、GDZQ2012、GDPY2013株的分子特征．【方法】参考GenBank收藏的DTMUVJS804株，共设计合成11对特异性引物，扩增了4株病... 【目的】了解2010年以来分离于珠三角地区鸭坦布苏病毒病（Duck Tembusu virus，DTMUV）GDNS2010．1、GDNS2010．2、GDZQ2012、GDPY2013株的分子特征．【方法】参考GenBank收藏的DTMUVJS804株，共设计合成11对特异性引物，扩增了4株病毒的全基因序列片段．【结果和结论】4株病毒全长约为10990bp，无Ploy（A）尾结构，仅含有1个大的ORF，共编码3426个氨基酸，5′非编码区（5′UTR）各含有94hp．在3′非编码区（3′UTR），GDNS2010．1、GDNS2010．2毒株在103395～103411bp处缺失10个碱基．联合前期试验已测定的2株病毒序列（GDHZ2012．1、GDHZ2012．2），用DNAstar和MEGA6．0序列分析软件将6株病毒同GenBank收藏的国内的其他坦布苏病毒株比对，发现核酸序列相似性在98％以上，与Ntaya病毒和Sitiawan病毒相似性较大，相似性都在73％左右；与西尼罗河病毒、日本乙型脑炎病毒、黄热病毒等相似性皆低于63％．6株病毒囊膜蛋白E核酸序列相似性为97．5％～99．9％，推导氨基酸序列相似性在97％以上，其中同一地区分离的毒株相似性最高，达99．9％；在囊膜蛋白E154位存在一潜在的糖基化位点Asn-Try-Ser，在E蛋白结构域Ⅱ第E289位，极性带正电荷的Lys变为极性带负电荷的Glu，推测这一位点可能为病毒的毒力位点． 展开更多
关键词 鸭坦布苏病毒 克隆测序 全基因组序列 囊膜蛋白毒力位点 鸭黄病毒
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