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嗜麦芽寡氧单胞菌临床株与环境株的16S rRNA基因序列及系统发育分析
1
作者
罗玮
毕春霞
+3 位作者
闫志勇
辛晓妮
苏维奇
朱元祺
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2011年第16期2904-2906,共3页
目的:比较嗜麦芽寡氧单胞菌临床株与环境株16S rRNA基因序列,构建系统发育树,分析其进化关系。方法:对选取的3株嗜麦芽寡养单胞菌临床株和1株环境株的16S rRNA基因进行PCR扩增并测序。将上述及从GenBank中挑选出的其他32株不同来源的嗜...
目的:比较嗜麦芽寡氧单胞菌临床株与环境株16S rRNA基因序列,构建系统发育树,分析其进化关系。方法:对选取的3株嗜麦芽寡养单胞菌临床株和1株环境株的16S rRNA基因进行PCR扩增并测序。将上述及从GenBank中挑选出的其他32株不同来源的嗜麦芽寡养单胞菌的16S rRNA基因序列进行对比分析,并绘制系统发育树。结果:系统发育分析表明大部分菌株可根据来源分为3个簇,序列分析显示某些高度可变区可能存在可区分临床株与环境株的关键序列。结论:嗜麦芽寡养单胞菌基因型及表现型具有多样性;大部分嗜麦芽寡氧单胞菌临床株与环境株可根据16S rRNA基因序列进行鉴别。
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关键词
嗜麦芽寡氧单胞菌
16S
RRNA基因
系统发育分析
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题名
嗜麦芽寡氧单胞菌临床株与环境株的16S rRNA基因序列及系统发育分析
1
作者
罗玮
毕春霞
闫志勇
辛晓妮
苏维奇
朱元祺
机构
青岛大学医学院微生物学教研室
青岛市市立医院检验科
青岛大学医学院附属医院检验科
出处
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2011年第16期2904-2906,共3页
基金
山东省科技公关(编号:2007GG3WZ05009)
青岛市科技计划基础研究项目(编号:09-1-3-65-jch)
文摘
目的:比较嗜麦芽寡氧单胞菌临床株与环境株16S rRNA基因序列,构建系统发育树,分析其进化关系。方法:对选取的3株嗜麦芽寡养单胞菌临床株和1株环境株的16S rRNA基因进行PCR扩增并测序。将上述及从GenBank中挑选出的其他32株不同来源的嗜麦芽寡养单胞菌的16S rRNA基因序列进行对比分析,并绘制系统发育树。结果:系统发育分析表明大部分菌株可根据来源分为3个簇,序列分析显示某些高度可变区可能存在可区分临床株与环境株的关键序列。结论:嗜麦芽寡养单胞菌基因型及表现型具有多样性;大部分嗜麦芽寡氧单胞菌临床株与环境株可根据16S rRNA基因序列进行鉴别。
关键词
嗜麦芽寡氧单胞菌
16S
RRNA基因
系统发育分析
Keywords
Stenotrophomonas maltophilia
16S ribosomal RNA gene
Phylogenetic analysis
分类号
R378 [医药卫生—病原生物学]
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题名
作者
出处
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被引量
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1
嗜麦芽寡氧单胞菌临床株与环境株的16S rRNA基因序列及系统发育分析
罗玮
毕春霞
闫志勇
辛晓妮
苏维奇
朱元祺
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2011
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