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山西省枣树上啤酒花矮化类病毒的检测及序列分析 被引量:3
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作者 张本利 李世访 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期39-42,62,共5页
[目的] 从枣树样品中分离鉴定啤酒花矮化类病毒(HSVd)。[方法] 从山西省农业科学院果树研究所国家枣种质资源圃采集70份枣树叶片样品,提取小分子RNA后通过Northern杂交、RTPCR进行检测,并对阳性样品中的类病毒进行克隆测序,... [目的] 从枣树样品中分离鉴定啤酒花矮化类病毒(HSVd)。[方法] 从山西省农业科学院果树研究所国家枣种质资源圃采集70份枣树叶片样品,提取小分子RNA后通过Northern杂交、RTPCR进行检测,并对阳性样品中的类病毒进行克隆测序,利用生物学软件对所得序列进行分析。 [结果] 70份枣树样品中有1份样品感染HSVd,克隆测序后,共获得13条HSVd序列,它们与GenBank上首次报道的HSVd序列相似性为92.6%~92.8% 。[结论] 本研究首次在国内报道了枣树上分离得到的HSVd序列,HSVd枣树分离物与已报道的HSVd分离物差异较大。 展开更多
关键词 枣树 啤酒花矮化类病毒 分子检测 序列分析
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柑橘3种病毒类病原多重RT-PCR检测技术的建立及应用
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作者 袁琳凯 马崇欢 +5 位作者 李丁山 陈志炜 江宵烽 丁新伦 张洁 吴祖建 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期339-344,共6页
【目的】建立柑橘黄化脉明病毒(citrus yellow vein clearing virus,CYVCV)、柑橘衰退病毒(citrus tristeza virus,CTV)和啤酒花矮化类病毒(hop stunt viroid,HSVd)的多重RT-PCR检测体系。【方法】设计多重RT-PCR引物,分析其特异性,确... 【目的】建立柑橘黄化脉明病毒(citrus yellow vein clearing virus,CYVCV)、柑橘衰退病毒(citrus tristeza virus,CTV)和啤酒花矮化类病毒(hop stunt viroid,HSVd)的多重RT-PCR检测体系。【方法】设计多重RT-PCR引物,分析其特异性,确定其最佳浓度比、最适退火温度及灵敏度,在此基础上对福建地区的柑橘样品进行检测。【结果】确定了CYVCV-F/R、CTV-F/R和HSVd-F/R等3对引物的最佳浓度比例为1∶1∶2,最适退火温度为52.9℃,灵敏度结果显示该体系可检测模板稀释到10^(-2)的阳性样品。应用该体系对采自福建部分地区的157份柑橘样品进行检测,结果发现,CYVCV、CTV和HSVd的检出率分别为47.1%、56.7%和22.9%。【结论】成功建立了柑橘CYVCV、CTV和HSVd病原的多重RT-PCR检测方法,为该类病害的检测提供准确、快速的检测方法。 展开更多
关键词 柑橘黄脉明病毒 柑橘衰退病毒 啤酒花矮化类病毒 多重RT-PCR
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柑桔木质陷孔病类病毒贵州分离物的分子鉴定
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作者 王雪峰 唐科志 +3 位作者 李中安 周彦 兰建强 周常勇 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期181-184,共4页
从采自贵州感染了啤酒花矮化类病毒(Hopstunt viroid,HSVd)的柑桔植株中抽提总核酸,通过一对鉴别引物,经RT-PCR扩增初步筛选出柑桔木质陷孔病类病毒(Citrus cachexia viroid,CCaVd)。扩增该类病毒的全长核苷酸片段,通过克隆和测序,结果... 从采自贵州感染了啤酒花矮化类病毒(Hopstunt viroid,HSVd)的柑桔植株中抽提总核酸,通过一对鉴别引物,经RT-PCR扩增初步筛选出柑桔木质陷孔病类病毒(Citrus cachexia viroid,CCaVd)。扩增该类病毒的全长核苷酸片段,通过克隆和测序,结果发现,该片段全长298 bp,与GenBank中报道的木质陷孔病类病毒分离物同源性达到96%以上。这是中国发生的木质陷孔病类病毒的分子生物学特征的首次报道。 展开更多
关键词 柑桔木质陷孔病病毒 啤酒花矮化类病毒 RT—PCR 分子生物学特征
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HSVd靶向性ds-sRNA对感病番茄miRNA表达影响的分析
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作者 李经纬 唐文琨 +2 位作者 严溢 王娅 张万萍 《核农学报》 CAS 北大核心 2025年第2期262-274,共13页
序列与类病毒基因组一致的外源ds-sRNA可在短时间内沉默类病毒基因组,miRNAs广泛参与基因表达调控,在这一生物过程中发挥重要作用。为了挖掘参与外源ds-sRNA沉默类病毒基因组的核心miRNAs,通过对感染啤酒花矮化类病毒(HSVd)的番茄植株... 序列与类病毒基因组一致的外源ds-sRNA可在短时间内沉默类病毒基因组,miRNAs广泛参与基因表达调控,在这一生物过程中发挥重要作用。为了挖掘参与外源ds-sRNA沉默类病毒基因组的核心miRNAs,通过对感染啤酒花矮化类病毒(HSVd)的番茄植株外源施用靶向基因组不同分区的dssRNA,并在施用后不同时间段测定类病毒全基因组滴度,确定靶向HSVd中央保守区的ds-sRNA施用36 h对HSVd沉默效率最佳。基于最佳处理,对样本进行miRNA-seq、降解组测序以及关键miRNAs的实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证。结果表明,与ddH2O处理对照相比,miRNA-seq中检出参与调控植物抗性的sly-MIR10528-p3和参与调控基因沉默的ptc-miR162a_R+1的表达量变化显著,qRT-PCR检出目标miRNA表达趋势与测序数据一致;降解组检测中,sly-MIR10528-p3和ptc-miR162a_R+1的表达趋势与miRNA-seq检测结果基本一致,另外检出参与调控病毒防御的sly-miR162、调控非生物胁迫抗性的vvi-miR3630-3p_L-2R-1_1ss21AT和参与调控基因沉默的bna-MIR169c-p3_2ss12GC17TG的表达量变化显著。本次检测共获得52个显著差异表达的新miRNA信息。本研究结果可为番茄抗病育种和分子药物开发提供新的理论基础和技术支持。 展开更多
关键词 番茄 啤酒花矮化类病毒 靶向性ds-sRNA miRNA-seq 降解组测序
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甜樱桃斑果病研究进展及其防治 被引量:3
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作者 刘庆忠 《落叶果树》 2017年第5期1-4,共4页
类病毒是一类单链、闭合环状低分子量的致病性RNA,大小为246~463bp,无蛋白质外壳包裹,是目前发现的最小病原物。类病毒侵染性强,可导致被侵染的细胞或组织发生异常,侵染后造成类似病毒感染的矮化、斑驳、叶变形、裂皮、斑果和坏死等症... 类病毒是一类单链、闭合环状低分子量的致病性RNA,大小为246~463bp,无蛋白质外壳包裹,是目前发现的最小病原物。类病毒侵染性强,可导致被侵染的细胞或组织发生异常,侵染后造成类似病毒感染的矮化、斑驳、叶变形、裂皮、斑果和坏死等症状。从类病毒的危害症状、检测及鉴定、致病机理、传播及防治等方面介绍了引起甜樱桃斑果病的啤酒花矮化类病毒。 展开更多
关键词 啤酒花矮化类病毒 甜樱桃 斑果病 鉴定 症状 防治
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