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基于微卫星分子标记的凡纳滨对虾商业苗种遗传多样性分析
被引量:
8
1
作者
方振朋
孟宪红
+6 位作者
李旭鹏
栾生
曹家旺
陈宝龙
孔杰
闫茂仓
胡利华
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2020年第5期101-109,共9页
为研究我国凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)商业苗种的遗传多样性特征,于河北、山东、广东、海南等地采集了6个有代表性的凡纳滨对虾品牌苗种,分别命名为黄骅R、东营M、广州P、广州Z、海南S和海南Z,以8个微卫星标记检测其遗传多样性...
为研究我国凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)商业苗种的遗传多样性特征,于河北、山东、广东、海南等地采集了6个有代表性的凡纳滨对虾品牌苗种,分别命名为黄骅R、东营M、广州P、广州Z、海南S和海南Z,以8个微卫星标记检测其遗传多样性。结果显示,6个品牌的凡纳滨对虾在8个位点呈现不同程度的多态性,其平均等位基因数(Na)、期望杂合度(He)、观测杂合度(Ho)和多态信息含量(PIC)分别为4.5~9.5、0.516~0.733、0.346~0.550和0.472~0.700,各品牌遗传多样性丰富程度从高到低分别为黄骅R>广州Z>广州P>海南Z>东营M>海南S。哈迪–温伯格平衡(HWE)检验显示,4.17%(2/48)的检测结果表现为显著的偏离(0.01<P<0.05),58.33%(28/48)表现为极显著偏离(P<0.01)。分子变异方差分析(AMOVA)发现,12%的变异来自品牌间,24%的变异来自品牌内个体间,其余64%的变异均来自所有品牌个体。UPGMA聚类分析结果显示,6个品牌的凡纳滨对虾聚为2个明显的分支,广州P和广州Z聚为一支,东营M、黄骅R、海南Z和海南S聚为一支。主成分分析(PCA)结果显示,各品牌凡纳滨对虾无法单独进行聚类。本研究初步分析了当前国内养殖凡纳滨对虾的遗传背景,实验结果可为凡纳滨对虾良种选育提供数据支撑。
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关键词
凡纳滨对虾
商业苗种
微卫星
遗传多样性
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职称材料
凡纳滨对虾商业苗种抗WSSV性能比较
被引量:
3
2
作者
董丽君
罗坤
+5 位作者
曹家旺
陈宝龙
栾生
曹宝祥
隋娟
孟宪红
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2019年第1期69-75,共7页
白斑综合征病毒(WSSV)一直是甲壳类生物的高致病性病原。为了解市场上不同凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)商业苗种病原携带情况及其抗WSSV性能,本研究收集了6个品牌的凡纳滨对虾商业苗种(分别简称为海南Z、海南S、广州P、广州Z、黄骅...
白斑综合征病毒(WSSV)一直是甲壳类生物的高致病性病原。为了解市场上不同凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)商业苗种病原携带情况及其抗WSSV性能,本研究收集了6个品牌的凡纳滨对虾商业苗种(分别简称为海南Z、海南S、广州P、广州Z、黄骅R和东营M),先进行包括WSSV在内的8种病原的检测,然后,采用单尾定量口饲感染方式进行抗WSSV性能测试,并比较各组苗种感染WSSV后的平均存活时间、存活率以及累积死亡率的差异。结果显示,6个商业苗种都不携带WSSV,部分苗种检测有潜在虾肝肠胞虫(EHP)和偷死野田村病毒(CMNV)。各苗种感染WSSV后,平均存活时间从长到短依次为海南Z、广州P、黄骅R、海南S、广州Z、东营M。东营M感染WSSV后第4天达到死亡高峰,而海南Z在第6~7天到达死亡高峰,比东营M晚了2~3d。感染实验结束后,海南Z和广州P存活率最高,同为72.5%,而东营M和黄骅R的存活率最低。本研究表明,海南Z和广州P抗WSSV性能最强,研究结果可为凡纳滨对虾抗病新品种的选育提供基础数据。
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关键词
凡纳滨对虾
商业苗种
病原检测
抗WSSV性状
存活率
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职称材料
题名
基于微卫星分子标记的凡纳滨对虾商业苗种遗传多样性分析
被引量:
8
1
作者
方振朋
孟宪红
李旭鹏
栾生
曹家旺
陈宝龙
孔杰
闫茂仓
胡利华
机构
上海海洋大学水产与生命学院
中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室
浙江省近岸水域生物资源开发与保护重点实验室
出处
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2020年第5期101-109,共9页
基金
浙江省近岸水域生物资源开发与保护重点实验室开放基金项目(J2018003)
中国水产科学研究院基本科研业务费(2018GH10)
+1 种基金
山东省农业良种工程(2017LZN011)
泰山学者良种工程项目和现代农业产业技术体系专项资金(CARS-48)共同资助。
文摘
为研究我国凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)商业苗种的遗传多样性特征,于河北、山东、广东、海南等地采集了6个有代表性的凡纳滨对虾品牌苗种,分别命名为黄骅R、东营M、广州P、广州Z、海南S和海南Z,以8个微卫星标记检测其遗传多样性。结果显示,6个品牌的凡纳滨对虾在8个位点呈现不同程度的多态性,其平均等位基因数(Na)、期望杂合度(He)、观测杂合度(Ho)和多态信息含量(PIC)分别为4.5~9.5、0.516~0.733、0.346~0.550和0.472~0.700,各品牌遗传多样性丰富程度从高到低分别为黄骅R>广州Z>广州P>海南Z>东营M>海南S。哈迪–温伯格平衡(HWE)检验显示,4.17%(2/48)的检测结果表现为显著的偏离(0.01<P<0.05),58.33%(28/48)表现为极显著偏离(P<0.01)。分子变异方差分析(AMOVA)发现,12%的变异来自品牌间,24%的变异来自品牌内个体间,其余64%的变异均来自所有品牌个体。UPGMA聚类分析结果显示,6个品牌的凡纳滨对虾聚为2个明显的分支,广州P和广州Z聚为一支,东营M、黄骅R、海南Z和海南S聚为一支。主成分分析(PCA)结果显示,各品牌凡纳滨对虾无法单独进行聚类。本研究初步分析了当前国内养殖凡纳滨对虾的遗传背景,实验结果可为凡纳滨对虾良种选育提供数据支撑。
关键词
凡纳滨对虾
商业苗种
微卫星
遗传多样性
Keywords
Pacific white shrimp Litopenaeus vannamei
Commercial seedling
Microsatellite
Genetic diversity
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
凡纳滨对虾商业苗种抗WSSV性能比较
被引量:
3
2
作者
董丽君
罗坤
曹家旺
陈宝龙
栾生
曹宝祥
隋娟
孟宪红
机构
农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所
青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室
上海海洋大学水产与生命学院
出处
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2019年第1期69-75,共7页
基金
中国水产科学研究院基本科研业务费(2016GH06)
国家自然科学基金(31372523)
+1 种基金
泰山学者良种工程项目
现代农业产业技术体系专项资金(CARS-48)共同资助~~
文摘
白斑综合征病毒(WSSV)一直是甲壳类生物的高致病性病原。为了解市场上不同凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)商业苗种病原携带情况及其抗WSSV性能,本研究收集了6个品牌的凡纳滨对虾商业苗种(分别简称为海南Z、海南S、广州P、广州Z、黄骅R和东营M),先进行包括WSSV在内的8种病原的检测,然后,采用单尾定量口饲感染方式进行抗WSSV性能测试,并比较各组苗种感染WSSV后的平均存活时间、存活率以及累积死亡率的差异。结果显示,6个商业苗种都不携带WSSV,部分苗种检测有潜在虾肝肠胞虫(EHP)和偷死野田村病毒(CMNV)。各苗种感染WSSV后,平均存活时间从长到短依次为海南Z、广州P、黄骅R、海南S、广州Z、东营M。东营M感染WSSV后第4天达到死亡高峰,而海南Z在第6~7天到达死亡高峰,比东营M晚了2~3d。感染实验结束后,海南Z和广州P存活率最高,同为72.5%,而东营M和黄骅R的存活率最低。本研究表明,海南Z和广州P抗WSSV性能最强,研究结果可为凡纳滨对虾抗病新品种的选育提供基础数据。
关键词
凡纳滨对虾
商业苗种
病原检测
抗WSSV性状
存活率
Keywords
Pacific white shrimp Litopenaeus vannamei
Commercial larvae
Pathogen detection
WSSV-resistant traits
Survival rate
分类号
S945.1 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
作者
出处
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被引量
操作
1
基于微卫星分子标记的凡纳滨对虾商业苗种遗传多样性分析
方振朋
孟宪红
李旭鹏
栾生
曹家旺
陈宝龙
孔杰
闫茂仓
胡利华
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2020
8
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职称材料
2
凡纳滨对虾商业苗种抗WSSV性能比较
董丽君
罗坤
曹家旺
陈宝龙
栾生
曹宝祥
隋娟
孟宪红
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2019
3
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