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周期性缺氧应激对花鲈肠道菌群结构的影响
被引量:
10
1
作者
孙永旭
董宏标
+5 位作者
王文豪
曹明
段亚飞
李华
刘青松
张家松
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第4期46-52,共7页
该研究基于Illumina MiSeq 高通量测序技术,对周期性缺氧应激下花鲈(Lateolabrax maculatus)肠道菌群结构的变化进行分析,为研究其幼鱼肠道菌群对环境缺氧的适应机制提供参考依据。结果显示,周期性缺氧导致花鲈肠道菌群多样性和丰富度...
该研究基于Illumina MiSeq 高通量测序技术,对周期性缺氧应激下花鲈(Lateolabrax maculatus)肠道菌群结构的变化进行分析,为研究其幼鱼肠道菌群对环境缺氧的适应机制提供参考依据。结果显示,周期性缺氧导致花鲈肠道菌群多样性和丰富度显著增加(P<0.05),群落结构复杂化,缺氧组和常氧组群落组成存在较大差异。缺氧组肠道菌群分类操作单元相比常氧组显著增加(P<0.05),其特有操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU)数达1 003 个。门分类水平上,变形菌门、厚壁菌门和拟杆菌门为2 组肠道菌群的主要组成菌门。与常氧组相比,缺氧组变形菌门相对丰度显著降低(P<0.05),而拟杆菌门相对丰度显著升高(P<0.05);纲水平上,缺氧组α变形菌纲和芽孢杆菌纲相对丰度显著降低(P<0.05),梭菌纲、γ变形菌纲和拟杆菌纲相对丰度显著升高(P<0.05)。此外,周期性缺氧应激还引起花鲈肠道内厌氧绳菌科、毛螺菌科、瘤胃菌科等厌氧或兼性厌氧菌和绿硫菌科等光合产氧菌类相对丰度升高。
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关键词
花鲈
肠道菌群
周期性缺氧
ILLUMINA
MiSeq高通量测序
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职称材料
题名
周期性缺氧应激对花鲈肠道菌群结构的影响
被引量:
10
1
作者
孙永旭
董宏标
王文豪
曹明
段亚飞
李华
刘青松
张家松
机构
中国水产科学研究院南海水产研究所
上海海洋大学水产与生命学院
广东省渔业种质保护中心
中国水产科学研究院南海水产研究所深圳试验基地
出处
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第4期46-52,共7页
基金
中国水产科学研究院南海水产研究所中央级公益性科研院所基本业务费专项资金资助(2017YB15,2016TS07)
农业农村部南海渔业资源开发利用重点实验室开放基金(FREU2018-02)
+1 种基金
中国-东盟海上合作基金项目“中国-东盟现代海洋渔业技术合作及产业化开发示范”
深圳市“十三五”海洋经济创新发展示范项目(3817#)
文摘
该研究基于Illumina MiSeq 高通量测序技术,对周期性缺氧应激下花鲈(Lateolabrax maculatus)肠道菌群结构的变化进行分析,为研究其幼鱼肠道菌群对环境缺氧的适应机制提供参考依据。结果显示,周期性缺氧导致花鲈肠道菌群多样性和丰富度显著增加(P<0.05),群落结构复杂化,缺氧组和常氧组群落组成存在较大差异。缺氧组肠道菌群分类操作单元相比常氧组显著增加(P<0.05),其特有操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU)数达1 003 个。门分类水平上,变形菌门、厚壁菌门和拟杆菌门为2 组肠道菌群的主要组成菌门。与常氧组相比,缺氧组变形菌门相对丰度显著降低(P<0.05),而拟杆菌门相对丰度显著升高(P<0.05);纲水平上,缺氧组α变形菌纲和芽孢杆菌纲相对丰度显著降低(P<0.05),梭菌纲、γ变形菌纲和拟杆菌纲相对丰度显著升高(P<0.05)。此外,周期性缺氧应激还引起花鲈肠道内厌氧绳菌科、毛螺菌科、瘤胃菌科等厌氧或兼性厌氧菌和绿硫菌科等光合产氧菌类相对丰度升高。
关键词
花鲈
肠道菌群
周期性缺氧
ILLUMINA
MiSeq高通量测序
Keywords
Lateolabrax maculatus
intestinal microflora
periodic hypoxia
Illumina MiSeq high throughput sequencing
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
周期性缺氧应激对花鲈肠道菌群结构的影响
孙永旭
董宏标
王文豪
曹明
段亚飞
李华
刘青松
张家松
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2019
10
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