胃癌组织hMLH1和hMSH2基因启动子区甲基化状态研究 被引量：5

1

作者 房殿春 罗元辉 刘为纹 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第9期1010-1011,共2页

目的　探讨hMLH1和hMSH2基因启动子区的甲基化状态与微卫星DNA不稳的关系。方法　采用甲基化特异性PCR方法检测hMLH1和hMSH2基因启动子区的甲基化状态 ,采用PCR为基础的方法检测微卫星DNA不稳。结果　正常胃粘膜未见hMLH1和hMSH2基因启... 目的　探讨hMLH1和hMSH2基因启动子区的甲基化状态与微卫星DNA不稳的关系。方法　采用甲基化特异性PCR方法检测hMLH1和hMSH2基因启动子区的甲基化状态 ,采用PCR为基础的方法检测微卫星DNA不稳。结果　正常胃粘膜未见hMLH1和hMSH2基因启动子区的高甲基化。 6 8例胃癌中检出hMLH1高甲基化 11例 ,占 16 .2 % ,而且均为去甲基化和高甲基化并存 ,未见有hMSH2高甲基化者。将MSI分为高频率MSI(MSI H ,≥ 2个位点 ) 8例、低频率MSI(MSI L ,仅为 1个位点 ) 9例和MSI阴性(MSS) 5 1例 3组 ,结果MSI H组hMLH1高甲基化的检出率显著高于MSI L和MSS组 (P <0 .0 1)。结论　hMLH1高甲基化可能参与了MSI病理途径 ,而hMSH2甲基化状态可能与MSI途径无关。 展开更多

关键词 胃癌 HMLH1 HMSH2 基因启动子区甲基化 微卫星不稳

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急性白血病LRP15基因启动子区甲基化及其表达分析 被引量：3

2

作者 赵瑜 窦丽萍 +3 位作者 王全顺 卢学春 楼方定 于力 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2007年第1期39-41,共3页

为了探讨LRP15基因在急性白血病(AL)患者中的表达情况及其与启动子区CpG岛甲基化的关系,采用甲基化特异PCR(MSP)方法检测AL患者LRP15基因启动子区甲基化状态,并用RT-PCR方法检测该基因在这些患者中的表达情况。结果发现,LRP15基因在缓... 为了探讨LRP15基因在急性白血病(AL)患者中的表达情况及其与启动子区CpG岛甲基化的关系,采用甲基化特异PCR(MSP)方法检测AL患者LRP15基因启动子区甲基化状态,并用RT-PCR方法检测该基因在这些患者中的表达情况。结果发现,LRP15基因在缓解与非缓解状态白血病患者中的表达分别为47.6%和16.7%,其启动子区甲基化比例分别为38.1%和72.2%。LRP15基因的表达与其启动子区甲基化之间无相关(P=0.0087)。结论:AL患者LRP15基因启动子区的甲基化不完全是导致LRP15基因表达沉默的原因。 展开更多

关键词 LRP15基因 急性白血病 启动子区甲基化

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乳腺癌BRCA1-mRNA表达及启动子区甲基化状态与临床病理特征的相关性 被引量：3

3

作者 李晓锋 汪园园 刘希 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2018年第24期4089-4092,共4页

目的探究乳腺癌易感基因1-mRNA(BRCA1-mRNA)水平及启动子区甲基化状态与乳腺癌患者临床病理特征的相关性。方法选取2016年2月至2018年2月于西安交大一附院确诊为乳腺癌的350例患者为实验组,另选取同期行体检的50例健康女性为对照组,分... 目的探究乳腺癌易感基因1-mRNA(BRCA1-mRNA)水平及启动子区甲基化状态与乳腺癌患者临床病理特征的相关性。方法选取2016年2月至2018年2月于西安交大一附院确诊为乳腺癌的350例患者为实验组,另选取同期行体检的50例健康女性为对照组,分别检测两组受检者的BRCA1-mRNA水平、启动子区甲基化状态,分析BRCA1-mRNA水平与启动子区甲基化状态相关性。结果实验组BRCA1-mRNA水平低于对照组,启动子区甲基化阳性状态比率显著高于对照组(P <0.05);实验组患者BRCA1-mRNA水平、启动子区甲基化状态与其年龄、TNM分期无相关性,前者与肿瘤大小存在相关性(P <0.05);后者与组织学分级存在相关性(P <0.05)。结论乳腺癌患者BRCA1-mRNA水平与肿瘤大小有关,启动子区甲基化状态与其组织学分级有关,可以作为判断乳腺癌肿瘤状态的实验室指标。 展开更多

关键词 乳腺癌 BRCA1-mRNA 启动子区甲基化 病理特征 易感基因

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帕金森病患者时钟基因启动子区甲基化分析 被引量：1

4

作者 林庆玲 蔡彦宁 +3 位作者 丁晖 顾朱勤 马敬红 陈彪 《首都医科大学学报》 CAS 北大核心 2011年第6期767-770,共4页

目的分析帕金森病(Parkinson's disease,PD)患者和正常老年对照组时钟基因启动子区甲基化水平,探讨帕金森病患者时钟基因异常表达的机制。方法采用甲基化特异性PCR(MSP)法,检测206例帕金森病患者和181例正常老年对照者的7种时钟基... 目的分析帕金森病(Parkinson's disease,PD)患者和正常老年对照组时钟基因启动子区甲基化水平,探讨帕金森病患者时钟基因异常表达的机制。方法采用甲基化特异性PCR(MSP)法,检测206例帕金森病患者和181例正常老年对照者的7种时钟基因启动子甲基化水平。结果 7种时钟基因中,cry1和npas2启动子区存在明显甲基化。另5种时钟基因启动子(per1、per2、cry2、clock、bmal1)未发现明显甲基化。PD患者中npas2甲基化频率明显下降。结论 PD患者时钟基因的异常表达可能与时钟基因启动子区甲基化的改变有关。 展开更多

关键词 帕金森病 启动子区甲基化 时钟基因

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蒙古族结核病患者CYP2E1基因多态性及其启动子区甲基化水平与抗结核药物致肝损伤的关系 被引量：3

5

作者 胡宝翠 郝金奇 +5 位作者 施瑞清 侯瑞丽 余艳琴 张冬 邓乐乐 韦丽琴 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2020年第6期598-603,共6页

目的抗结核药物致肝损伤(ADIH)的发生与CYP2E1基因多态性及甲基化水平是否相关的研究甚少。文中旨在探讨蒙古族结核病患者CYP2E1基因多态性及启动子区甲基化水平与ADIH的关系。方法选取2015年11月至2018年6月于内蒙古通辽市结核病防治... 目的抗结核药物致肝损伤(ADIH)的发生与CYP2E1基因多态性及甲基化水平是否相关的研究甚少。文中旨在探讨蒙古族结核病患者CYP2E1基因多态性及启动子区甲基化水平与ADIH的关系。方法选取2015年11月至2018年6月于内蒙古通辽市结核病防治所标准化治疗的135例蒙古族结核病患者。根据ADIH判定标准选取发生肝损伤的蒙古族结核病患者为ADIH组(n=45),按照1∶2比例匹配未发生肝损伤的蒙古族结核病患者为对照组(n=90)。进行DNA提取,聚合酶链反应(PCR)扩增CYP2E1基因,确定CYP2E1 rs2031920基因型,分析CYP2E1基因多态性及启动子区甲基化水平与ADIH之间的关系。结果CYP2E1 rs2031920基因型、C1和C2基因频率在ADIH组和对照组中分布差异无统计学意义(P>0.05)。ADIH组CYP2E1基因启动子区总体甲基化水平较对照组明显降低[(0.711±0.085)vs(0.759±0.062)],差异有统计学意义(P<0.05)。Logistic回归显示CYP2E1基因启动子区总体甲基化水平是ADIH发生的影响因素(P<0.005),甲基化水平每升高0.1个单位,ADIH发生风险降低0.388倍,其OR(95%CI)值为0.388(0.204~0.739)。结论蒙古族ADIH患者的CYP2E1基因启动子区总体甲基化水平降低,但CYP2E1基因多态性与ADIH的发生无关,提示CYP2E1基因甲基化可应用于结核病患者ADIH的预防和治疗。 展开更多

关键词 蒙古族 抗结核药物致肝损伤 CYP2E1基因多态性 CYP2E1基因启动子区甲基化水平

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RNF180启动子区甲基化在前列腺癌中的作用机制 被引量：2

6

作者 王海光 姜华茂 +3 位作者 左知润 龙湟哲 袁观远 贾凡振 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期561-565,共5页

目的通过检测RNF180启动子区甲基化改变来阐明前列腺癌发生和演进过程中RNF180表达的意义。方法分别采用Western blotting、RT-PCR、甲基化特异性PCR(MSP)及亚硫酸氢盐测序(BSP)法检测人前列腺癌细胞系(PC3、LNCap和DU145)与人正常前列... 目的通过检测RNF180启动子区甲基化改变来阐明前列腺癌发生和演进过程中RNF180表达的意义。方法分别采用Western blotting、RT-PCR、甲基化特异性PCR(MSP)及亚硫酸氢盐测序(BSP)法检测人前列腺癌细胞系(PC3、LNCap和DU145)与人正常前列腺上皮细胞(RWPE-1)中RNF180的表达情况;采用免疫组化法检测人前列腺癌组织芯片上前列腺癌及癌旁组织中RNF180蛋白的表达。结果前列腺癌细胞中RNF180基因的m RNA及蛋白的表达量明显低于正常前列腺上皮细胞(P<0.05),而前列腺癌细胞中RNF180启动子区的甲基化水平却明显高于正常前列腺上皮细胞;RNF180蛋白在前列腺癌组织中的表达量明显低于相应的癌旁组织。结论 RNF180启动子区在前列腺癌细胞中呈高度非完全性甲基化状态,这也可能是RNF180在癌细胞和癌组织中表达下降或沉默的原因之一。 展开更多

关键词 前列腺癌 RNF180 启动子区甲基化

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EC9706细胞和人食管鳞状细胞癌组织中MAL基因启动子区的甲基化状态

7

作者 刘伯新 郭长青 +1 位作者 王曼华 王明荣 《郑州大学学报（医学版）》 CAS 北大核心 2013年第4期440-443,共4页

目的:探讨人食管鳞状细胞癌(食管鳞癌)MAL基因启动子区的甲基化状态。方法:利用亚硫酸氢盐测序法检测人食管鳞癌细胞系EC9706中MAL基因启动子区CpG位点甲基化的发生情况。根据测序结果选用甲基化敏感性限制性内切酶酶切结合PCR技术进一... 目的:探讨人食管鳞状细胞癌(食管鳞癌)MAL基因启动子区的甲基化状态。方法:利用亚硫酸氢盐测序法检测人食管鳞癌细胞系EC9706中MAL基因启动子区CpG位点甲基化的发生情况。根据测序结果选用甲基化敏感性限制性内切酶酶切结合PCR技术进一步检测26例食管鳞癌组织及配对癌旁正常组织MAL基因启动子区的甲基化情况。结果:EC9706细胞中MAL基因启动子区检测出42个胞嘧啶位点的甲基化,占所有CpG位点的73.7%(42/57)。食管鳞癌组织中MAL基因的甲基化率为53.8%(14/26),远远高于配对癌旁正常组织的7.7%(2/26)(χ2=10.924,P<0.001)。不同临床病理特征食管鳞癌组织中MAL基因启动子区甲基化率差异均无统计学意义(P>0.05)。结论:MAL基因启动子区的甲基化可能是食管鳞癌发生的机制之一。 展开更多

关键词 食管鳞状细胞癌 EC9706细胞 MAL基因 启动子区甲基化

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人Sox10基因启动子区高甲基化的预测和验证 被引量：1

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作者 李文英 余鸿 +1 位作者 陈兴书 肖岚 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第20期2168-2171,共4页

目的运用生物信息学方法预测人Sox10基因启动子区甲基化情况并进行实验验证。方法从GenBank获取人Sox10基因序列,利用Methyprimer 11.0软件、Li lab、CpG Island Searcher预测其启动子区CpG岛。进一步运用甲基化特异性PCR(methylation s... 目的运用生物信息学方法预测人Sox10基因启动子区甲基化情况并进行实验验证。方法从GenBank获取人Sox10基因序列,利用Methyprimer 11.0软件、Li lab、CpG Island Searcher预测其启动子区CpG岛。进一步运用甲基化特异性PCR(methylation specific PCR,MSP)和重亚硫酸盐测序(bisulfite sequencing PCR,BSP)方法检测人Sox10基因启动子区CpG岛在多形性胶质母细胞瘤和瘤周组织中的甲基化情况。结果经过生物信息学分析发现,人Sox10基因启动子区存在2个CpG岛,分别为165(1 241～1 405)bp和105(1 478～1 582)bp。针对这两个CpG岛设计引物行MSP和BSP实验,研究发现,在人多形性胶质母细胞瘤和瘤周组织中Sox10基因启动子区CpG岛均出现部分甲基化,其中在多形性胶质母细胞瘤中的甲基化率为90.5%,在瘤周组织中的甲基化率为28.5%。结论本研究证实了人Sox10基因启动子区CpG岛在多形性胶质母细胞瘤中出现高甲基化,提示其表达下调可能受甲基化调节。 展开更多

关键词 人Sox10基因启动子区甲基化 生物信息学分析 MSP BSP 人多形性胶质母细胞瘤

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胃癌中P16,Survivin和Rb基因甲基化状态 被引量：7

9

作者 国丽 黄超 +4 位作者 叶美 徐淑媛 季步欣 王玉红 纪全江 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2016年第14期2380-2382,共3页

目的:研究胃癌中P16、Survivin和Rb基因启动子区甲基化状态的改变。方法:收集106例胃癌患者和18例健康成人体检者的外周血标本,提取全血DNA,甲基化特异PCR(MSP)方法检测P16、Survivin和Rb基因启动子区甲基化表达情况,统计学方法分析实... 目的:研究胃癌中P16、Survivin和Rb基因启动子区甲基化状态的改变。方法:收集106例胃癌患者和18例健康成人体检者的外周血标本,提取全血DNA,甲基化特异PCR(MSP)方法检测P16、Survivin和Rb基因启动子区甲基化表达情况,统计学方法分析实验数据。结果:106例病例组中p16基因启动子区甲基化率为72.6%(77例甲基化阳性)对照组甲基化仅为1例,病例组p16基因启动子区甲基化率明显高于对照组;病例组Survivin基因启动子区甲基化率6%(7例甲基化阳性)对照组甲基化率0;病例组Rb基因启动子区甲基化率为17.9%(19例甲基化阳性)对照组甲基化仅为1例。统计学分析P(p16)=5.097E-08,P(Survivin)=0.262,P(Rb)=0.187。结论:胃癌中p16基因启动子区甲基化状态可能对胃癌的发生、发展起到一定的作用,通过进一步研究可将p16基因启动子区的甲基化作为胃癌早期筛选指标。Survivin和Rb基因启动子区甲基化状态的改变,病例组和对照组的差异无显著性,对胃癌发生、发展的关系是否存在其他机制,有待进一步的研究。 展开更多

关键词 胃肿瘤 启动子区甲基化 P16、Survivin和Rb基因 MSP

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质谱技术在DNA甲基化研究中的应用 被引量：1

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作者 黄新凤 叶金波 刘建军 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期112-120,共9页

DNA甲基化是最重要的表观遗传修饰之一,主要发生在哺乳动物基因组Cp G核苷酸序列中的胞嘧啶C-5位点,并与机体生长发育、转座子沉默、X染色体失活及许多疾病的发生相关。但对DNA甲基化的形成、维持和重构的分子机制的认识是有限的,需要... DNA甲基化是最重要的表观遗传修饰之一,主要发生在哺乳动物基因组Cp G核苷酸序列中的胞嘧啶C-5位点,并与机体生长发育、转座子沉默、X染色体失活及许多疾病的发生相关。但对DNA甲基化的形成、维持和重构的分子机制的认识是有限的,需要从基因组水平寻找最优的DNA甲基化定性和定量分析方法,而质谱技术以高敏感性、高通量、高准确率、高分辨率、快速且重复性好等优势在该研究领域具有较大的应用价值。介绍质谱技术在全基因组DNA甲基化和启动子区甲基化分析中的应用。 展开更多

关键词 全基因组DNA甲基化 启动子区甲基化 质谱 液相色谱

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表观遗传修饰介导抑制SOSTDC1表达促进宫颈癌细胞的恶性生物学行为 被引量：2

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作者 林万松 郭爱华 +4 位作者 陈淑萍 汪阳 黄天莹 冯梅 叶韵斌 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期473-481,共9页

目的:探究含硬化蛋白域蛋白1(SOSTDC1)对宫颈癌细胞恶性生物学行为的调控及其分子机制。方法:收集2020年8月至2022年5月间在福建省肿瘤医院活检或手术切除的53例宫颈癌组织和相应的癌旁组织标本,免疫组化法检测SOSTDC1蛋白在宫颈癌组织... 目的:探究含硬化蛋白域蛋白1(SOSTDC1)对宫颈癌细胞恶性生物学行为的调控及其分子机制。方法:收集2020年8月至2022年5月间在福建省肿瘤医院活检或手术切除的53例宫颈癌组织和相应的癌旁组织标本,免疫组化法检测SOSTDC1蛋白在宫颈癌组织及相应癌旁组织中的表达,qPCR法检测正常宫颈细胞、宫颈癌细胞中SOSTDC1 mRNA表达;将SOSTDC1过表达慢病毒(OE-sostdc1)和对照空病毒(NC)感染宫颈癌细胞SiHa及CaSki,将其分为SiHa-OE-sostdc1、SiHa-NC、CaSki-OE-sostdc1、CaSki-NC组,采用WST-1法、细胞集落形成实验、Transwell实验和WB法检测转染各组SiHa及CaSki细胞的增殖、集落形成、迁移和侵袭能力和BMP、Wnt/β-catenin信号途径相关蛋白及上皮-间充质转化(EMT)相关蛋白的表达。用DNA甲基化酶抑制剂5-氮杂2'-脱氧胞苷(5'-Aza-CdR)处理宫颈癌细胞后采用qPCR和WB法检测SOSTDC1 m RNA及蛋白的表达变化,用甲基化特异性PCR(MSP)检测5例配对宫颈癌组织与癌旁组织中SOSTDC1基因启动子区甲基化水平,同时qPCR检测其SOSTDC1 mRNA水平。结果:与癌旁组织比较,SOSTDC1蛋白在宫颈癌组织中呈低表达(P<0.01),且与淋巴结转移与FIGO分期有关联(均P<0.05);与正常宫颈HUCEC细胞比较,SOSTDC1 mRNA在宫颈癌C33A、HeLa、SiHa、CaSki细胞中均呈低表达(均P<0.01)。过表达SOSTDC1显著抑制SiHa及CaSki细胞的增殖、迁移和侵袭能力(均P<0.05)。WB法结果检测显示,过表达SOSTDC1显著抑制SiHa及CaSki细胞中磷酸化Smad、Dvl2/3、β-catenin、VIM、N-cadherin、Snail蛋白的表达(均P<0.05),5'-Aza-CdR处理后的SiHa及CaSki细胞中SOSTDC1 mRNA和蛋白水平均显著增加(均P<0.05),MSP检测结果显示,相较于癌旁组织,宫颈癌组织中SOSTDC1基因启动子区呈高度甲基化,且SOSTDC1 mRNA水平降低(P<0.01)。结论:SOSTDC1在宫颈癌组织中呈低表达且与肿瘤的恶性进展关联,其表达下调与其基因启动子区高度甲基化有关,过表达SOSTDC1可能通过阻断BMP及Wnt/β-catenin信号通路从而抑制SiHa、CaSki细胞的增殖、侵袭和迁移能力。 展开更多

关键词 宫颈癌 SIHA细胞 CASKI细胞 含硬化蛋白域蛋白1 启动子区甲基化 增殖 侵袭 迁移

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