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链霉菌中一类同源非典型端粒的克隆及分析
1
作者
李鹏
刘兰
+1 位作者
王通
黄筱萍
《湖南农业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期42-50,共9页
采用自连接-PCR的方法克隆和测序了Streptomyces cattleya DSM46488、Streptomyces mobaraensisDSM40847及Streptomyces davawensisJCM4913的端粒,序列比对发现,这3种端粒具有较高的序列相似性,前60个核苷酸的序列相似性达到了80%以上;...
采用自连接-PCR的方法克隆和测序了Streptomyces cattleya DSM46488、Streptomyces mobaraensisDSM40847及Streptomyces davawensisJCM4913的端粒,序列比对发现,这3种端粒具有较高的序列相似性,前60个核苷酸的序列相似性达到了80%以上;在二级结构水平,这些端粒含有多个回文序列,其中,包含相同的回文序列I和II,但并不能通过折返形成超级发夹结构;Streptomyces cattleya DSM46488、StreptomycesmobaraensisDSM40847及Streptomyces davawensis JCM4913的端粒与线性质粒pSHJG1端粒及Streptomyces albus J1074染色体端粒均具有较高的序列相似性;系统发育分析显示它们与典型端粒及其他非典型端粒处于不同的进化分支,S.cattleyaDSM46488、S.mobaraensis DSM40847、S.davawensisJCM4913、S.albus J1074及S.hydroscopicussubsp.Jinggangensis 5008都编码同源的潜在末端蛋白-端粒相关蛋白,暗示了这类同源的非典型端粒系统广泛存在于链霉菌中。
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关键词
链霉菌
线性复制子
同源非典型端粒
端粒
系统
回文序列
末端蛋白-
端粒
相关蛋白
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职称材料
题名
链霉菌中一类同源非典型端粒的克隆及分析
1
作者
李鹏
刘兰
王通
黄筱萍
机构
江西省科学院微生物研究所
出处
《湖南农业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期42-50,共9页
基金
国家自然科学基金项目(31900061)
江西省科学院科研开发专项基金项目(2017-YYB-03)。
文摘
采用自连接-PCR的方法克隆和测序了Streptomyces cattleya DSM46488、Streptomyces mobaraensisDSM40847及Streptomyces davawensisJCM4913的端粒,序列比对发现,这3种端粒具有较高的序列相似性,前60个核苷酸的序列相似性达到了80%以上;在二级结构水平,这些端粒含有多个回文序列,其中,包含相同的回文序列I和II,但并不能通过折返形成超级发夹结构;Streptomyces cattleya DSM46488、StreptomycesmobaraensisDSM40847及Streptomyces davawensis JCM4913的端粒与线性质粒pSHJG1端粒及Streptomyces albus J1074染色体端粒均具有较高的序列相似性;系统发育分析显示它们与典型端粒及其他非典型端粒处于不同的进化分支,S.cattleyaDSM46488、S.mobaraensis DSM40847、S.davawensisJCM4913、S.albus J1074及S.hydroscopicussubsp.Jinggangensis 5008都编码同源的潜在末端蛋白-端粒相关蛋白,暗示了这类同源的非典型端粒系统广泛存在于链霉菌中。
关键词
链霉菌
线性复制子
同源非典型端粒
端粒
系统
回文序列
末端蛋白-
端粒
相关蛋白
Keywords
Streptomyces
linear replicon
homologous atypical telomere
telomere system
palindrome
terminal protein-telomere associated protein
分类号
Q934.3 [生物学—微生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
链霉菌中一类同源非典型端粒的克隆及分析
李鹏
刘兰
王通
黄筱萍
《湖南农业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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