期刊文献+
共找到27篇文章
< 1 2 >
每页显示 20 50 100
基于差值有效值的智能录波器暂态同源比对算法研究 被引量:10
1
作者 刘玮 屠卿瑞 +3 位作者 郭明宇 郑君林 李学等 文明浩 《电力系统保护与控制》 CSCD 北大核心 2021年第16期97-103,共7页
随着智能录波器的推广应用,现有的监测方法无法对继电保护装置采样的暂态数据进行有效监测。为了解决此问题,提高继电保护装置采样回路的在线监视能力,提出了一种基于差值有效值的智能录波器暂态同源比对方法。首先利用突变量查找方法,... 随着智能录波器的推广应用,现有的监测方法无法对继电保护装置采样的暂态数据进行有效监测。为了解决此问题,提高继电保护装置采样回路的在线监视能力,提出了一种基于差值有效值的智能录波器暂态同源比对方法。首先利用突变量查找方法,精确匹配在某一时间段智能录波器和保护装置采集的多个录波文件。然后从录波文件提取暂态数据,运用波形的一致性实现暂态数据对齐。最后根据暂态数据差值有效值的计算,进行数据精确比对,实现采样回路的监测及预警。通过实际电网的验证结果表明,所提出的暂态同源比对技术与实际工程贴合,智能录波器能有效对继电保护装置的采样值进行实时监测及预警,实现采样回路的实时监测,保证了电网的安全稳定运行。 展开更多
关键词 智能录波器 差值有效值 暂态同源比对 实时监测
在线阅读 下载PDF
甘蓝种质资源根肿病抗性鉴定及CRa、Crr1a同源基因分析 被引量:14
2
作者 孙超 马建 +3 位作者 雷蕾 刘洁 颉建明 康俊根 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期1058-1064,共7页
利用来源于湖北长阳、陕西太白、河南新野3个地方的根肿病菌对22份不同甘蓝材料进行抗病性鉴定。采用同源比对的方法,对甘蓝基因组中的大白菜抗根肿病同源基因CRa和Crr1a进行分析;同时对不同抗、感根肿病甘蓝材料中的CRa和Crr1a同源基... 利用来源于湖北长阳、陕西太白、河南新野3个地方的根肿病菌对22份不同甘蓝材料进行抗病性鉴定。采用同源比对的方法,对甘蓝基因组中的大白菜抗根肿病同源基因CRa和Crr1a进行分析;同时对不同抗、感根肿病甘蓝材料中的CRa和Crr1a同源基因序列进行了扩增、测序和比对分析。结果表明:供试22份甘蓝材料对3份根肿病菌存在较大的抗感差异,推测来源于3个地区的菌种可能不是同一个生理小种;筛选出的抗性品种BDH3、Chou hybride Tekila、SW-110、CGL-8、先正达品种、SW-109将来可用作根肿病抗源和抗性基因挖掘;在甘蓝7号染色体上存在3个预测基因为CRa的同源基因,分别是Bo7g107710、Bo7g107730和Bo7g107740,其中,Bo7g107730基因在抗病材料SW-110存在较大的序列变异,推测可能与根肿病抗性相关;在甘蓝3号染色体上存在1个预测基因Bo3g164040为Crr1a的同源基因,所分析的抗、感病材料中Bo3g164040基因序列一致性极高,没有发现与抗根肿病有关的位点,说明甘蓝中Bo3g164040基因可能没有根肿病抗性功能。 展开更多
关键词 甘蓝 根肿病 同源比对 抗性基因
在线阅读 下载PDF
鲫体重和体厚相关的EST-SSRs标记筛选及同源基因分析 被引量:1
3
作者 郭薇 郑先虎 +3 位作者 匡友谊 崔晓亮 曹顶臣 孙效文 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2013年第2期9-15,共7页
利用300个EST-SSRs标记对普通二倍体鲫(Carassius auratus)自交F2代的181个个体进行基因型检测,并对其体重、体厚两种经济性状进行单标记回归分析。Permutation检验(10 000次)结果显示,38个标记与所检测的经济性状相关,其中26个标记达... 利用300个EST-SSRs标记对普通二倍体鲫(Carassius auratus)自交F2代的181个个体进行基因型检测,并对其体重、体厚两种经济性状进行单标记回归分析。Permutation检验(10 000次)结果显示,38个标记与所检测的经济性状相关,其中26个标记达到显著性相关(P<0.05),12个标记达到极显著性相关(P<0.01)。在38个相关标记中,有27个标记与体重相关,25个标记与体厚相关,14个标记与体重、体厚均相关。对同一标记的不同基因型之间进行多重比较,找到了与两种经济性状相关的基因型。将与性状相关的38个标记与斑马鱼(Da-nio rerio)基因组序列进行BLAST同源性比对,找到10条相似性高且功能已知的EST-SSRs序列(E<e-20)。其中,JE594与斑马鱼膜结合环指蛋白基因march7相似性高达95%,JE3165与斑马鱼肌盲蛋白基因mbnl1的相似性达78%,JE6996与斑马鱼促蛋白激酶的基因mapk10的相似性高达98%,JE4984与斑马鱼蛋白磷酸酶的基因ppp1cab相似性达84%。本研究筛选出了与鲫体重、体厚相关的EST-SSRs标记及基因型并找到了与鲫生长相关的候选功能基因,为鲫的分子标记辅助育种(MAS)及目标性状的遗传改良提供依据。 展开更多
关键词 鲫(Carassius auratus) EST-SSRS 体重 体厚 同源比对
在线阅读 下载PDF
基于FDTW算法的故障录波数据智能比对方法 被引量:10
4
作者 戴志辉 张富泽 +1 位作者 杨鑫 韩笑 《电力系统保护与控制》 EI CSCD 北大核心 2023年第23期82-91,共10页
针对智能变电站保护装置故障录波文件无通道标识信息、难以与同源通道故障录波器录波文件相互对应的问题,提出一种基于快速动态时间规整(fast dynamic time warping,FDTW)算法的故障录波数据智能比对方法。首先,对各厂站提取的故障录波... 针对智能变电站保护装置故障录波文件无通道标识信息、难以与同源通道故障录波器录波文件相互对应的问题,提出一种基于快速动态时间规整(fast dynamic time warping,FDTW)算法的故障录波数据智能比对方法。首先,对各厂站提取的故障录波数据进行异常检测,确保故障录波文件中数据的质量。其次,利用拉格朗日插值法进行采样频率转换,解决保护装置与故障录波器采样频率不一致的问题。然后,利用欧氏距离对同源录波文件数据进行波形一致性对齐,以实现时钟同步。最后,使用FDTW算法对无通道标识信息的故障录波数据进行智能比对。算例分析表明,该方法能够对故障录波数据进行一致性处理,可以快速准确地计算待匹配录波波形的相似度,实现同源通道的录波数据匹配,具备较强的稳定性和实时性。 展开更多
关键词 故障录波 FDTW 同源比对 欧氏距离 智能变电站
在线阅读 下载PDF
基于水稻粒长OsPPKL1基因的玉米同源基因的生物信息学分析
5
作者 田玉焕 张亚玲 +1 位作者 范子洋 陶勇生 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2014年第12期1-6,共6页
为弄清玉米中粒长基因的调控机制,采用生物信息学的方法,对水稻粒长基因OsPPKL1进行同源性分析。结果表明:玉米GRMZM2G070323和GRMZM2G148539基因是OsPPKL1的同源基因,分别位于第1染色体和第5染色体上;这2个基因的基因结构存在一定差异... 为弄清玉米中粒长基因的调控机制,采用生物信息学的方法,对水稻粒长基因OsPPKL1进行同源性分析。结果表明:玉米GRMZM2G070323和GRMZM2G148539基因是OsPPKL1的同源基因,分别位于第1染色体和第5染色体上;这2个基因的基因结构存在一定差异;玉米同源基因与OsPPKL1存在良好的共线性;这2个玉米基因与水稻粒长基因在蛋白质序列、理化性质、高级结构和表达部位等方面均表现出高度的一致性。 展开更多
关键词 玉米 水稻 粒长 同源比对 生物信息学
在线阅读 下载PDF
基于多源信息的故障处理智能综合系统设计 被引量:2
6
作者 曹雄 黄泰山 +2 位作者 童志祥 余松 罗长浩 《中国测试》 北大核心 2024年第S2期184-190,共7页
发电站作为电力系统重要电源的一环,发电站的安全稳定也越来越重要。目前常规发电站均部署有相角测量系统、故障录波系统、保护信息系统等信息系统,可实现发电站一、二次设备信息的在线监视,极大保障了发电站内电力系统的安全稳定运行... 发电站作为电力系统重要电源的一环,发电站的安全稳定也越来越重要。目前常规发电站均部署有相角测量系统、故障录波系统、保护信息系统等信息系统,可实现发电站一、二次设备信息的在线监视,极大保障了发电站内电力系统的安全稳定运行。但是发电站内故障录波系统、保护信息系统和相角测量系统独立组网,缺乏系统间数据综合对比分析,影响了继电保护人员运维和故障处理的效率。同时缺乏对全厂保护装置状态全面监视手段,缺少对设备不正常运行状态和故障状态的自动综合分析功能,不利于发电站内二次设备的运维管理。该文提出基于多源信息的故障处理智能综合系统,可接入保护信息、故障录波数据、相角测量数据等多源数据,实现发电站内多源数据分析处理功能,具体包括PT慢融分析、GCB同期分析、同源比对分析等高级应用功能。该系统极大提升发电站内一二次设备监视和运维管理水平,同时障处理智能综合系统还可以作为发电站工业互联网平台建设基础数据平台,为发电站工业互联网平台提供试实时一二次设备实时运行信息,进一步推进发电站工业互联网平台的建设。 展开更多
关键词 故障处理 智能综合系统 PT慢融 GCB同期 同源比对分析
在线阅读 下载PDF
“湘益”牌茯砖茶真菌的分离及鉴定研究 被引量:9
7
作者 刘石泉 赵运林 +3 位作者 雷存喜 董萌 彭晓赟 周小梅 《湖北农业科学》 北大核心 2011年第9期1765-1769,共5页
采用平板梯度稀释法对金湘益特制礼品茯砖茶中真菌进行了分离纯化和计数,获得2301、2401、3302、4304、5402等5种类型真菌,其中5402为优势菌,每克茶样中含量达4.98×106个,其余为非优势菌,数目相对较少。运用18S rDNA片段序列进行... 采用平板梯度稀释法对金湘益特制礼品茯砖茶中真菌进行了分离纯化和计数,获得2301、2401、3302、4304、5402等5种类型真菌,其中5402为优势菌,每克茶样中含量达4.98×106个,其余为非优势菌,数目相对较少。运用18S rDNA片段序列进行同源比对,结合形态学鉴定方法对其进行鉴定,表明菌株2301为产紫青霉(Penicillium purpurogenum)、2401为产黄青霉(P.chrysogenum)、3302为青霉(Peni-cillium sp.)、4304为酱油曲霉(Aspergillus sojae)、5402为蜡叶散囊菌(Eurotium herbariorum)。 展开更多
关键词 “湘益”牌茯砖茶 真菌分离 18SrDNA同源比对 形态学特征 菌种鉴定
在线阅读 下载PDF
鱼类基因数据库与生物信息学在鱼类基因开发上的应用 被引量:3
8
作者 贝锦新 张勇 +2 位作者 李文笙 刘晓春 林浩然 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期387-392,共6页
关键词 鱼类基因组 同线性分析 同源比对 基因开发
在线阅读 下载PDF
棉花MAPKs家族成员的聚类分析 被引量:1
9
作者 郭慧敏 翟伟卜 +5 位作者 张珊珊 郭安慧 张文蔚 简桂良 段江燕 齐放军 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2016年第5期425-433,共9页
MAP激酶(促分裂原活化蛋白激酶)级联信号通路(MAPKs)由3种级联磷酸化的蛋白激酶MAPKKK、MAPKK和MAPK组成,在调控植物的生长发育、胁迫响应及抗病反应等过程中都起重要作用。为了全面了解棉花MAPK、MAPKK、MAPKKK家族各成员间的关系,进... MAP激酶(促分裂原活化蛋白激酶)级联信号通路(MAPKs)由3种级联磷酸化的蛋白激酶MAPKKK、MAPKK和MAPK组成,在调控植物的生长发育、胁迫响应及抗病反应等过程中都起重要作用。为了全面了解棉花MAPK、MAPKK、MAPKKK家族各成员间的关系,进而研究和揭示MAPKs在棉花抗病、抗逆中的作用,利用已公布的雷蒙德氏棉和亚洲棉基因组数据,并从NCBI数据库中收集陆地棉的MAPKs氨基酸序列,运用生物信息学的方法对棉花(陆地棉、雷蒙德氏棉、亚洲棉)MAPK、MAPKK和MAPKKK家族的氨基酸序列进行了同源比对和聚类分析。结果表明:棉花MAPK家族具有特征性结构TEY磷酸化位点或TDY磷酸化位点,依据其氨基酸序列可划分为A、B、C和D族,其中TEY类包含A、B和C族,TDY类只包含D族;棉花MAPKK家族具有特征性保守区域S/T-X5-S/T和活性部位基序D(I/L/V)K,并依据其氨基酸序列也可将其划分为A、B、C和D族;棉花MAPKKK家族具有MEKK特征性保守区域G(T/S)PX(W/Y)MAPEV和Raf特征性保守区域GTXX(W/Y)MAPE(L/V),进而分为MEKK类和Raf类2组亚群。本研究梳理了棉花MAPKs中的MAPK、MAPKK、MAPKKK家族各成员间的关系,为进一步研究棉花MAPKs信号传导途径和揭示其在棉花抗病、抗逆中的作用提供了基础信息。 展开更多
关键词 陆地棉 雷蒙德氏棉 亚洲棉 MAPKS 生物信息学 同源比对 聚类分析
在线阅读 下载PDF
水稻羧酸酯酶基因OsCDAP的克隆及表达分析 被引量:1
10
作者 李臻 潘教文 +1 位作者 王庆国 刘炜 《山东农业科学》 2018年第11期10-15,共6页
羧酸酯酶是一大类水解酶家族,催化短链脂肪酸酯键水解,在植物中参与除草剂代谢、信号分子激活、植物胁迫响应等过程。前期通过感染黑条矮缩病水稻数字表达谱鉴定到一个在病毒侵染后表达明显上调的羧酸酯酶基因。本研究以水稻中花11为材... 羧酸酯酶是一大类水解酶家族,催化短链脂肪酸酯键水解,在植物中参与除草剂代谢、信号分子激活、植物胁迫响应等过程。前期通过感染黑条矮缩病水稻数字表达谱鉴定到一个在病毒侵染后表达明显上调的羧酸酯酶基因。本研究以水稻中花11为材料克隆了该基因,将其命名为OsCDAP。生物信息学分析显示,该基因属于羧酸酯酶家族,与烟草中羧酸酯酶Nthsr203J的相似性最高,可达95%。组织表达模式分析显示,该基因在水稻茎中表达量最高,且为赤霉素诱导表达,并受赤霉素合成抑制剂PAC的抑制。该研究为进一步解析羧酸酯酶基因功能奠定了基础。 展开更多
关键词 水稻 羧酸酯酶基因 OsCDAP 同源比对 组织表达 赤霉素
在线阅读 下载PDF
苦荞粒重基因FtGW8的生物信息学分析 被引量:1
11
作者 石桃雄 汪燕 +1 位作者 黄娟 梁成刚 《安徽农学通报》 2021年第15期29-32,50,共5页
种子大小和重量是荞麦产量构成的关键因素。该研究基于水稻粒重基因GW8,对苦荞粒重基因进行了生物信息学分析,结果表明,苦荞粒重FtGW8基因CDS序列长768bp,编码的蛋白质包含255个氨基酸,分子量为27.97kD,等电点为9.5,属于亲水性蛋白,具... 种子大小和重量是荞麦产量构成的关键因素。该研究基于水稻粒重基因GW8,对苦荞粒重基因进行了生物信息学分析,结果表明,苦荞粒重FtGW8基因CDS序列长768bp,编码的蛋白质包含255个氨基酸,分子量为27.97kD,等电点为9.5,属于亲水性蛋白,具有跨膜结构,与水稻GW8蛋白相似。预测FtGW8蛋白定位于细胞核内,其二级结构主要由α螺旋和无规则卷曲组成,预测的三级结构与二级结构基本一致。蛋白功能分析发现,FtGW8和水稻GW8蛋白均具有SBP功能域,表明其可能具有控制粒重的功能。该研究为苦荞粒重基因的克隆奠定了基础。 展开更多
关键词 苦荞 粒重基因 同源比对分析 蛋白质结构
在线阅读 下载PDF
红曲菌产毒相关基因的克隆及序列分析
12
作者 吴伟 李燕萍 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期1101-1106,共6页
通过分子生物学软件,从产桔霉素相关的红曲菌cDNA消减文库中找出20个与桔霉素合成相关的差异序列,并用BLAST软件对这些序列进行同源比对,分析其功能。将消减文库中P5基因进行5’RACE后电子拼接获得的全长cDNA,再与其基因组DNA进行对比,... 通过分子生物学软件,从产桔霉素相关的红曲菌cDNA消减文库中找出20个与桔霉素合成相关的差异序列,并用BLAST软件对这些序列进行同源比对,分析其功能。将消减文库中P5基因进行5’RACE后电子拼接获得的全长cDNA,再与其基因组DNA进行对比,从而获得完整基因结构并做特性分析,为筛选红曲菌中产桔霉素基因提供理论依据。 展开更多
关键词 红曲菌 桔霉素 CDNA消减文库 同源比对
在线阅读 下载PDF
理性设计提高β-葡萄糖醛酸苷酶的热稳定性 被引量:2
13
作者 汤恒 黄申 +1 位作者 冯旭东 李春 《化工学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第6期2205-2211,共7页
采用同源序列比对策略和脯氨酸效应的设计策略,以同源建模的三维结构为基础,结合定点突变技术,对重组产紫青霉β-葡萄糖醛酸苷酶(PGUS-E)进行理性设计,获得了2个热稳定性明显提高的突变体PGUS-E I130V和PGUS-E G280P,再将突变位点进行... 采用同源序列比对策略和脯氨酸效应的设计策略,以同源建模的三维结构为基础,结合定点突变技术,对重组产紫青霉β-葡萄糖醛酸苷酶(PGUS-E)进行理性设计,获得了2个热稳定性明显提高的突变体PGUS-E I130V和PGUS-E G280P,再将突变位点进行组合获得突变体PGUS-E I130V+G280P。相比PGUS-E,PGUS-E I130V、PGUS-E G280P和PGUS-E I130V+G280P在60℃下的半衰期T1/2分别比原始酶的23 min提高3.5倍,5倍和5.5倍,达到82 min,117 min和128min。突变体的动力学参数Kcat/Km值分别为1.534×107 mol-1·L·min-1,1.368×107mol-1·L·min-1和1.283×107 mol-1·L·min-1,与原始酶(1.316×107 mol-1·L·min-1)接近,对底物的亲和力基本不变。结果表明在蛋白质构象不稳定的区段中引入脯氨酸,以及在相应位置引入嗜热菌的氨基酸,均可提高蛋白质热稳定性。 展开更多
关键词 Β-葡萄糖醛酸苷酶 分子模拟 动力学 蛋白质稳定性 理性设计 同源比对 脯氨酸
在线阅读 下载PDF
玫烟色棒束孢几丁质酶基因部分序列的克隆及分析 被引量:2
14
作者 梅利 朱振宇 +2 位作者 刘永翔 朱国胜 刘作易 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2010年第3期19-22,共4页
为了得到玫烟色棒束孢几丁质酶基因的保守区域,根据GenBank中几丁质酶基因的同源性序列设计简并引物,采用DNA和RNA分别作为模板扩增玫烟色棒束孢的几丁质酶保守区域。结果表明,DNA扩增的含有3个内含子,RNA扩增的不含内含子;所得到的氨... 为了得到玫烟色棒束孢几丁质酶基因的保守区域,根据GenBank中几丁质酶基因的同源性序列设计简并引物,采用DNA和RNA分别作为模板扩增玫烟色棒束孢的几丁质酶保守区域。结果表明,DNA扩增的含有3个内含子,RNA扩增的不含内含子;所得到的氨基酸序列具有几丁质酶18族的典型特征,即1个酶作用活性位点和几丁质结合区。 展开更多
关键词 玫烟色棒束孢 几丁质酶 扩增 序列分析 同源比对
在线阅读 下载PDF
全基因组小麦PPR基因家族鉴定及表达分析 被引量:2
15
作者 郭彩娟 公杰 +3 位作者 刘永杰 赵昌平 高世庆 吴华伟 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期1-8,共8页
旨在筛选对二系杂交小麦杂交种具有育性恢复功能的PPR(Pentatricopeptide repeats)基因,以期进一步研究PPR基因的功能及调控机制。通过对小麦全基因组数据进行生物信息学分析,获得了1351个小麦PPR成员,并对该基因家族进行了染色体定位... 旨在筛选对二系杂交小麦杂交种具有育性恢复功能的PPR(Pentatricopeptide repeats)基因,以期进一步研究PPR基因的功能及调控机制。通过对小麦全基因组数据进行生物信息学分析,获得了1351个小麦PPR成员,并对该基因家族进行了染色体定位与分布分析及进化树构建。通过与已报道的水稻育性恢复基因进行同源比对分析,候选了23个育性恢复相关PPR基因。进一步对高、低2种不同类型恢复系、不育系及杂交种减数分裂期幼穗取样,对23个育性恢复相关PPR基因进行实时荧光定量PCR表达模式筛选鉴定。结合结实率等重要农艺性状表型分析发现,4个PPR基因在高恢复系杂交组合中表现出了明显的超亲表达模式,相应地,这4个基因在低恢复系杂交组合中基本呈现低亲的表达模式。初步确认了4个可能参与调控二系杂交小麦杂交种的育性恢复基因。 展开更多
关键词 小麦 PPR基因 同源比对 育性恢复
在线阅读 下载PDF
ITS序列在酵母批量分子鉴定中的适用性 被引量:6
16
作者 陈源源 陈浩 +1 位作者 石贵阳 王正祥 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期11-14,共4页
内部转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列是目前最常用的酵母分子鉴定标识之一。该文利用ITS序列同源性分析法对保藏于中国高校工业微生物资源与信息中心的623株酵母分离物进行了鉴定。实验结果显示:581株酵母分离物(93.3%... 内部转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列是目前最常用的酵母分子鉴定标识之一。该文利用ITS序列同源性分析法对保藏于中国高校工业微生物资源与信息中心的623株酵母分离物进行了鉴定。实验结果显示:581株酵母分离物(93.3%)可通过ITS序列直接鉴定到种一级,40株分离物(6.4%)可鉴定至属一级,仅有2株酵母分离物无法通过ITS序列获得有效鉴定。上述结果表明,ITS序列在大多数酵母种属鉴定中具有很高的敏感性和特异性,可以作为第一分子标识用于大批量酵母分离物的分子鉴定。 展开更多
关键词 酵母 ITS序列 同源比对 分子鉴定
在线阅读 下载PDF
C基因型牛副流感3型病毒的分离鉴定 被引量:6
17
作者 冉旭华 张峣 +6 位作者 曹思 卢元赫 张玲玲 刘阳阳 倪宏波 朱战波 闻晓波 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第5期1368-1373,共6页
为了对宁夏地区患有呼吸系统疾病的舍饲牛进行病原鉴定,试验主要利用RT-PCR方法对样品进行牛副流感3型病毒(BPIV3)M基因序列扩增,将扩增产物连接在pMD18-T载体后转化到大肠杆菌DH5α感受态细胞中进行亚克隆。通过氨苄青霉素平板筛选,将... 为了对宁夏地区患有呼吸系统疾病的舍饲牛进行病原鉴定,试验主要利用RT-PCR方法对样品进行牛副流感3型病毒(BPIV3)M基因序列扩增,将扩增产物连接在pMD18-T载体后转化到大肠杆菌DH5α感受态细胞中进行亚克隆。通过氨苄青霉素平板筛选,将鉴定为阳性的克隆菌进行核苷酸序列测定并利用分子生物学软件与GenBank上参考序列进行同源性比对。测序结果表明,从样品中分离到了1株BPIV3,并命名为NX49,其M基因全长为1 056bp;进化分析表明,NX49隶属于BPIV3C基因型,其M基因与中国山东C型分离株SD0835具有较高同源性,核苷酸同源性为99.4%;理化分析表明,该毒株对温度、酸及有机物均敏感,高温孵育下Mg2+对该病毒无保护力;血凝试验表明,NX49对豚鼠红细胞凝集效价仅为1∶4,且仅在4℃孵育时出现凝集反应。本研究成功分离得到一株BPIV3C型毒株,这将有助于中国BPIV3分子进化规律及病毒流行特点的进一步研究。 展开更多
关键词 牛副流感3型病毒 C基因型 分离 鉴定 同源比对
在线阅读 下载PDF
猪链球菌2型四川人源分离株ZYH18纤连蛋白结合蛋白基因的克隆和序列分析 被引量:3
18
作者 王花茹 王长军 +3 位作者 唐家琪 陆承平 潘秀珍 郭恒彬 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期407-409,432,共4页
目的对2005年猪链球菌2型(Streptococcus suistype 2,S.suis2)四川资阳人源分离株ZYH18纤连蛋白结合蛋白(FBPS)基因进行克隆和序列分析。方法以ZYH18的基因组DNA为模板,采用PCR方法扩增出纤连蛋白/血纤蛋白原结合蛋白基因片段,克隆于pMD... 目的对2005年猪链球菌2型(Streptococcus suistype 2,S.suis2)四川资阳人源分离株ZYH18纤连蛋白结合蛋白(FBPS)基因进行克隆和序列分析。方法以ZYH18的基因组DNA为模板,采用PCR方法扩增出纤连蛋白/血纤蛋白原结合蛋白基因片段,克隆于pMD-T18载体,构建成载体pMD-T-fbps,转化到宿主菌TG1中,进行序列测定(GenBank登录号为DQ345444)。测序结果与实验室保存的其它7株猪链球菌2型临床分离菌株测序结果及GenBank提交序列AF438158进行编码区基因的同源性比对。结果成功克隆了实验室保存的分离于不同时间和地点的,包括ZYH18在内的8株S.suis2临床分离菌株的fbps基因,并对其编码区基因进行了同源性比对。结论实验室保存的8株菌的FBPS编码区基因同源性高达100%,并不因分离时间和地点的不同而不同;与GenBank提交序列AF438158同源性为99%,存在两个氨基酸的差异。 展开更多
关键词 纤连蛋白结合蛋白基因 猪链球菌 同源比对 序列分析
在线阅读 下载PDF
植物病原丝状真菌寄生性与RGS蛋白的关系研究 被引量:1
19
作者 祝友朋 韩长志 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期23-29,共7页
以49个全基因组序列已经公布的真菌为研究对象,通过OrthoVenn2同源基因簇比对、BLASTp比对和关键词搜索3种方法对G蛋白信号调控因子(regulators of G-protein signaling,RGS)同源基因进行比对分析,并结合SMART进行保守结构域分析,结果发... 以49个全基因组序列已经公布的真菌为研究对象,通过OrthoVenn2同源基因簇比对、BLASTp比对和关键词搜索3种方法对G蛋白信号调控因子(regulators of G-protein signaling,RGS)同源基因进行比对分析,并结合SMART进行保守结构域分析,结果发现,49个真菌中共有229个RGS蛋白,每种真菌中所含有RGS蛋白的数量范围为3~9个,且死体营养型病原菌和半活体营养型病原菌的RGS蛋白数量高于活体营养型病原菌;根据RGS蛋白中保守结构域进行分类,可以划分为DEP-RGS、RGS-TM、PXA-RGS-PX、RGS、RGS-PAS-PAC、TM-RGS等6种,其中,具有RGS-PAS-PAC和TM-RGS这2种特殊保守结构域的RGS蛋白主要集中在半活体营养型病原菌和死体营养型病原菌;进一步对229个RGS蛋白进行遗传关系分析,发现具有同种保守结构域的RGS蛋白亲缘关系较近。上述研究结果表明植物病原丝状真菌的寄生性与RGS蛋白数量和种类之间存在着一定的关联性。 展开更多
关键词 植物病原菌 丝状真菌 调控蛋白 G蛋白信号调控因子(RGS) 同源比对 比较基因组学
在线阅读 下载PDF
杨树EBP1基因的克隆与表达载体构建 被引量:1
20
作者 李慧 李爱 +1 位作者 彭立新 阎国荣 《江苏农业科学》 北大核心 2015年第4期14-17,共4页
器官大小是植物形态的重要表现特征之一,也是决定一些作物或经济植物产量和品质的重要因素。研究证实,草本植物如拟南芥中EBP1类转录因子可从细胞数量和体积2个方面同时调控植物器官大小,但该基因在木本植物杨树中的结构及功能仍未知。... 器官大小是植物形态的重要表现特征之一,也是决定一些作物或经济植物产量和品质的重要因素。研究证实,草本植物如拟南芥中EBP1类转录因子可从细胞数量和体积2个方面同时调控植物器官大小,但该基因在木本植物杨树中的结构及功能仍未知。本研究依托杨树全基因组及EST数据信息,采用生物信息学方法结合基因同源序列克隆,首次对杨树中的EBP1全长c DNA进行克隆及序列分析,同时成功构建了用于遗传转化的过表达载体。 展开更多
关键词 杨树 EBP1基因 克隆 表达载体 构建 基因序列分析 蛋白同源比对
在线阅读 下载PDF
上一页 1 2 下一页 到第
使用帮助 返回顶部