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紫花苜蓿CNGC基因家族全基因组鉴定及干旱胁迫下的调控模式分析
1
作者
邱应德
罗永忠
+3 位作者
齐建伟
周晓彤
马超
于思敏
《干旱地区农业研究》
北大核心
2025年第1期54-68,116,共16页
环核苷酸门控通道蛋白(cyclic nucleotide-gated channel proteins,CNGC)在Ca^(2+)信号转导过程中发挥着重要作用。利用生物信息学和分子生物学的研究方法对四倍体紫花苜蓿(Medicago sativa‘Xinjiangdaye’)CNGC基因家族成员进行全基...
环核苷酸门控通道蛋白(cyclic nucleotide-gated channel proteins,CNGC)在Ca^(2+)信号转导过程中发挥着重要作用。利用生物信息学和分子生物学的研究方法对四倍体紫花苜蓿(Medicago sativa‘Xinjiangdaye’)CNGC基因家族成员进行全基因组鉴定和干旱胁迫下的调控模式分析。结果表明:新疆大叶苜蓿基因组中共包含67个MsCNGC基因,不均匀地分布在30条染色体上,分属5个亚家族,共包含20个Motif,其启动子区域存在多种响应逆境胁迫的作用元件。新疆大叶苜蓿叶片中共表达了28个MsCNGC基因,有26个在干旱胁迫下不均匀上调,其中MsCNGC 59表达量最高且在干旱胁迫下上调倍数最大。MsCNGCs含有29~120个磷酸化位点,能被LRR蛋白激酶磷酸化,MsLRRs与MsCNGCs基因表达之间呈显著的正相关关系。此外,Ca^(2+)信号转导相关基因MsCaM、MsCML和MsCDPK表达量在干旱胁迫下显著上调。综上,四倍体紫花苜蓿MsCNGCs对干旱胁迫的响应包括转录调控和蛋白质的磷酸化调控,在干旱胁迫下能通过参与Ca^(2+)信号转导途径提高紫花苜蓿的抗旱性。
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关键词
同源四倍体紫花苜蓿
CNGC基因家族
蛋白质磷酸化
干旱胁迫
表达模式
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题名
紫花苜蓿CNGC基因家族全基因组鉴定及干旱胁迫下的调控模式分析
1
作者
邱应德
罗永忠
齐建伟
周晓彤
马超
于思敏
机构
甘肃农业大学林学院
出处
《干旱地区农业研究》
北大核心
2025年第1期54-68,116,共16页
基金
国家自然科学基金(32160409)。
文摘
环核苷酸门控通道蛋白(cyclic nucleotide-gated channel proteins,CNGC)在Ca^(2+)信号转导过程中发挥着重要作用。利用生物信息学和分子生物学的研究方法对四倍体紫花苜蓿(Medicago sativa‘Xinjiangdaye’)CNGC基因家族成员进行全基因组鉴定和干旱胁迫下的调控模式分析。结果表明:新疆大叶苜蓿基因组中共包含67个MsCNGC基因,不均匀地分布在30条染色体上,分属5个亚家族,共包含20个Motif,其启动子区域存在多种响应逆境胁迫的作用元件。新疆大叶苜蓿叶片中共表达了28个MsCNGC基因,有26个在干旱胁迫下不均匀上调,其中MsCNGC 59表达量最高且在干旱胁迫下上调倍数最大。MsCNGCs含有29~120个磷酸化位点,能被LRR蛋白激酶磷酸化,MsLRRs与MsCNGCs基因表达之间呈显著的正相关关系。此外,Ca^(2+)信号转导相关基因MsCaM、MsCML和MsCDPK表达量在干旱胁迫下显著上调。综上,四倍体紫花苜蓿MsCNGCs对干旱胁迫的响应包括转录调控和蛋白质的磷酸化调控,在干旱胁迫下能通过参与Ca^(2+)信号转导途径提高紫花苜蓿的抗旱性。
关键词
同源四倍体紫花苜蓿
CNGC基因家族
蛋白质磷酸化
干旱胁迫
表达模式
Keywords
tetraploid alfalfa
CNGC gene family
protein phosphorylation
drought stress
expression mode
分类号
S963.223.3 [农业科学—水产养殖]
Q945.78 [生物学—植物学]
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出处
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1
紫花苜蓿CNGC基因家族全基因组鉴定及干旱胁迫下的调控模式分析
邱应德
罗永忠
齐建伟
周晓彤
马超
于思敏
《干旱地区农业研究》
北大核心
2025
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