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最长公共子序列的快速算法及其并行实现
被引量：
6
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作者
刘维
陈崚
《计算机应用》
CSCD
北大核心
2006年第6期1422-1424,1427,共4页
求生物序列的最长公共子串是生物信息学中最重要的问题之一,提出了该问题的一个快速算法,可对所有初始同字符对并行地寻找其后继同字符对,并记录下相应层次值。最后通过最大层次值回溯得到比对结果。此外,该算法采用了剪枝技术,对于明...
求生物序列的最长公共子串是生物信息学中最重要的问题之一,提出了该问题的一个快速算法,可对所有初始同字符对并行地寻找其后继同字符对,并记录下相应层次值。最后通过最大层次值回溯得到比对结果。此外,该算法采用了剪枝技术,对于明显不能得出最优比对的同字符将中止其后继的搜索。实验结果证明,本文算法比其他算法速度快、精确度高。
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关键词
生物信息学
最长公共子串
同字符对
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职称材料
题名
最长公共子序列的快速算法及其并行实现
被引量：
6
1
作者
刘维
陈崚
机构
扬州大学信息工程学院
出处
《计算机应用》
CSCD
北大核心
2006年第6期1422-1424,1427,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目(60473012)
国家科技攻关项目(2003BA614A-14)
江苏省自然科学基金(BK20005047)
文摘
求生物序列的最长公共子串是生物信息学中最重要的问题之一,提出了该问题的一个快速算法,可对所有初始同字符对并行地寻找其后继同字符对,并记录下相应层次值。最后通过最大层次值回溯得到比对结果。此外,该算法采用了剪枝技术,对于明显不能得出最优比对的同字符将中止其后继的搜索。实验结果证明,本文算法比其他算法速度快、精确度高。
关键词
生物信息学
最长公共子串
同字符对
Keywords
bioinformaties
the longest common subsequence
the identical character pair
分类号
TP37 [自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
最长公共子序列的快速算法及其并行实现
刘维
陈崚
《计算机应用》
CSCD
北大核心
2006
6
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