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题名软体动物密码子使用偏好规律解析
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作者
唐凌雲
滕铭轩
王浩
叶质
曾启繁
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机构
中国海洋大学三亚海洋研究院
中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室
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出处
《中国海洋大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025年第11期89-98,共10页
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基金
国家自然科学基金面上项目(32373122)
国家自然科学基金青年科学基金项目(32002388)资助。
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文摘
为探究软体动物中无板纲、双壳纲、头足纲和腹足纲四个主要类群在演化历程中的遗传特征和适应策略,进而推断其演化动力,本研究系统地分析了近年来发表的41种软体动物的基因编码序列的密码子使用偏好(Codon usage bias)。结果显示,大部分软体动物的密码子偏好性较弱且呈现出按纲分类阶元分层的密码子使用偏好类型:双壳纲和头足纲动物偏向于使用以腺嘌呤或胸腺嘧啶结尾的密码子;而腹足纲和无板纲动物则偏向于使用以鸟嘌呤或胞嘧啶结尾的密码子。演化动力分析显示,软体动物的密码子使用偏好类型是由中性演化和自然选择共同塑造的,但是这两种因素在四个类群间的影响存在差异,具体而言,腹足动物受到的选择压力显著强于其他三个纲,且该选择压力集中作用于编码精氨酸的三种密码子上。本研究系统绘制了软体动物的密码子选择偏好图谱,为深入理解这一庞大、多样且具有重要进化地位的动物类群的基因组演化研究提供了重要见解。
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关键词
软体动物
密码子使用偏好
有效密码子数量
基因组演化
同义密码子使用频率
中性演化
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Keywords
mollusks
codon usage bias
effective number of codons
genome evolution
relative synonymous codon usage
neutral evolution
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分类号
Q319.1
[生物学—遗传学]
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