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题名鸡爪槭种下分类群的DNA条形码筛选
被引量：9
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作者
高健
孟婉姮
杜芳
李俊清
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机构
北京林业大学林学院
北京林业大学省部共建森林培育与保护教育部重点实验室
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出处
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期734-743,共10页
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基金
北京市科技新星(Z151100000315056)
国家环境保护公益性行业科研专项(201509042)
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文摘
槭属鸡爪槭（Acer palmatum Thunb.）是北温带广泛分布的一类园艺观赏树种,由于频繁的种内杂交渐渗导致其种下分类群的形态性状特征趋同,致使传统的形态学分类难以准确鉴定,新兴的DNA条形码技术为快速、准确的鉴定鸡爪槭种下分类群提供了新的思路。本研究采用5个叶绿体DNA片段（rpl16、psbA-trnH、trnL-trnF、rbcL、matK）和核基因组ITS片段,运用PWG-distance和Tree-Building两种方法对鸡爪槭的8个分类群共32个个体进行DNA条形码分析。结果显示,单个叶绿体基因组片段（分辨率为0%~25%）或核rDNA ITS片段（12.5%）的分辨率较低,不同组合的叶绿体DNA片段（0%~62.5%）、叶绿体片段与核rDNA ITS片段（12.5%~50%）的分辨率则相对较高。其中,rpl16＋psbA-trnH＋trnL-trnF片段组合的分辨率最高（62.5%）,较为符合DNA条形码快速、准确鉴定的要求,因此建议将其作为鸡爪槭种下分类群鉴定的DNA条形码。
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关键词
鸡爪槭
dna条形码
叶绿体dna片段
核基因组ITS片段
物种分辨率
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Keywords
Acer palmatum
dna barcoding
Chloroplast dna fragment
nrdna ITS region
Discrimination rate
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分类号
Q949.755.3
[生物学—植物学]
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题名中国穗状狐尾藻遗传多样性的初步分析
被引量：2
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作者
吕天锋
蒿飞
熊争
刘星
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机构
武汉大学生命科学学院
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出处
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第1期109-116,共8页
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基金
国家自然科学基金面上项目(31170203)~~
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文摘
利用叶绿体DNA三个片段(trnK-matK、trnL-trnF、rpl32-trnL)对中国大陆广布的水生植物穗状狐尾藻(Myriophyllum spicatum L.)的遗传多样性进行了初步分析,以探讨其自然居群的遗传结构及具有广泛分布格局的可能机制。AMOVA分析显示,穗状狐尾藻8个居群间的遗传变异为84.97%,而居群内的遗传变异为15.03%,居群遗传分化系数(Fst)为0.85,表明穗状狐尾藻具有较高的遗传多样性(Hd=0.83)且主要存在于居群间,奠基者效应可能导致了最初的遗传差异,而隔离障碍(Nm=0.09)又进一步导致了居群间的遗传分化。基于17个单倍型构建的系统发育树和网络关系图均显示,单倍型H5和H6在居群中的分布范围最广且出现频率最高,表明H5和H6可能为最古老的祖先单倍型。Mantel检验表明居群间的遗传距离与地理距离之间不存在显著的相关性,失配分布检测结果显示穗状狐尾藻在历史上曾发生过扩张事件,而Tajima’s、Fu&Li’s D*和F*检测发现,该物种不存在明显的谱系地理格局,这可能与穗状狐尾藻种子的长距离扩散有关。
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关键词
穗状狐尾藻
叶绿体dna片段
遗传多样性
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Keywords
Myriophyllum spicatum
Chloroplast dna segments
Genetic diversity
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分类号
Q943
[生物学—植物学]
Q949.762.6
[生物学—植物学]
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