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基于cpDNA和rDNA ITS片段分析西南地区青杨派杨树的系统发育与进化关系
被引量：
5
1
作者
李佳蔓
员涛
+3 位作者
周安佩
纵丹
李旦
何承忠
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期1113-1122,共10页
西南地区青杨派杨树种质资源丰富,可为杨树遗传改良提供珍贵的基因资源,但树种之间形态学差异细微,该研究以山杨作为外类群,测定了西南地区及其他地区杨属青杨派17个种（杂种）共36份样本的3个叶绿体片段（atpF-atpH、trnL-F和matK）和...
西南地区青杨派杨树种质资源丰富,可为杨树遗传改良提供珍贵的基因资源,但树种之间形态学差异细微,该研究以山杨作为外类群,测定了西南地区及其他地区杨属青杨派17个种（杂种）共36份样本的3个叶绿体片段（atpF-atpH、trnL-F和matK）和核糖体ITS片段,并对其进行系统发育分析,以探讨西南地区青杨派树种的系统进化关系。结果表明：（1）在所有样本中,3个叶绿体片段atpF-atpH、trnL-F、matK的长度分别为605~634bp、957~1 010bp、819bp,3个片段拼接后的联合序列包含29个变异位点和15个信息位点;ITS片段对齐后的长度为646bp,变异位点19个,信息位点17个。（2）基于叶绿体联合序列和ITS片段的杨属青杨派树种的平均遗传距离分别为0.001 3和0.003 6。叶绿体联合片段的MP和Bayes系统树树型基本一致,青杨派树种可以划分为2组,第1组由青杨、三脉青杨、大青杨和辽杨构成;第2组中的小叶杨、小青杨、川杨、德钦杨、昌都杨、乡城杨、康定杨、西南杨、滇杨和藏川杨不能有效区分,且均与缘毛杨的遗传关系较近。（3）基于ITS的系统树与叶绿体联合片段构建的系统树差异不大,仅在于第2组中的小青杨与小叶杨、川杨等差异明显,与第1组中的树种紧密聚拢。
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关键词
西南地区
青杨派
叶绿体联合片段
ITS
系统发育
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基于cpDNA和rDNA ITS片段分析西南地区青杨派杨树的系统发育与进化关系
被引量：
5
1
作者
李佳蔓
员涛
周安佩
纵丹
李旦
何承忠
机构
云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室
西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室
云南生物多样性研究院
西南山地森林资源保育与利用省部共建教育部重点实验室
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期1113-1122,共10页
基金
国家林业公益性行业专项(201104076)
国家自然科学基金(31360184,31460205)
+1 种基金
云南省教育厅基金(2014J099)
云南省中青年学术与技术带头人后备人才培养基金(2012HB021)
文摘
西南地区青杨派杨树种质资源丰富,可为杨树遗传改良提供珍贵的基因资源,但树种之间形态学差异细微,该研究以山杨作为外类群,测定了西南地区及其他地区杨属青杨派17个种（杂种）共36份样本的3个叶绿体片段（atpF-atpH、trnL-F和matK）和核糖体ITS片段,并对其进行系统发育分析,以探讨西南地区青杨派树种的系统进化关系。结果表明：（1）在所有样本中,3个叶绿体片段atpF-atpH、trnL-F、matK的长度分别为605~634bp、957~1 010bp、819bp,3个片段拼接后的联合序列包含29个变异位点和15个信息位点;ITS片段对齐后的长度为646bp,变异位点19个,信息位点17个。（2）基于叶绿体联合序列和ITS片段的杨属青杨派树种的平均遗传距离分别为0.001 3和0.003 6。叶绿体联合片段的MP和Bayes系统树树型基本一致,青杨派树种可以划分为2组,第1组由青杨、三脉青杨、大青杨和辽杨构成;第2组中的小叶杨、小青杨、川杨、德钦杨、昌都杨、乡城杨、康定杨、西南杨、滇杨和藏川杨不能有效区分,且均与缘毛杨的遗传关系较近。（3）基于ITS的系统树与叶绿体联合片段构建的系统树差异不大,仅在于第2组中的小青杨与小叶杨、川杨等差异明显,与第1组中的树种紧密聚拢。
关键词
西南地区
青杨派
叶绿体联合片段
ITS
系统发育
Keywords
Southwest China
Tacamahaca
chloroplast combination
ITS
phylogeny
分类号
Q789 [生物学—分子生物学]
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作者
出处
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1
基于cpDNA和rDNA ITS片段分析西南地区青杨派杨树的系统发育与进化关系
李佳蔓
员涛
周安佩
纵丹
李旦
何承忠
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
5
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