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叶绿体基因组微卫星标记(cpSSR)研究进展
被引量：
7
1
作者
李博
刘合霞
《安徽农业科学》
CAS
2012年第13期7638-7639,7649,共3页
随着测序技术的发展,叶绿体基因组微卫星标记(cpSSRs)的开发和应用越来越普遍。该研究介绍了叶绿体基因组分子标记的特点、用途、开发方法以及已开发的cpSSRs所具有的特点。随着cpSSRs开发成本的降低及研究技术的成熟,新的cpSSRs不断开...
随着测序技术的发展,叶绿体基因组微卫星标记(cpSSRs)的开发和应用越来越普遍。该研究介绍了叶绿体基因组分子标记的特点、用途、开发方法以及已开发的cpSSRs所具有的特点。随着cpSSRs开发成本的降低及研究技术的成熟,新的cpSSRs不断开发,将会有越来越多的叶绿体基因组SSR分子标记应用于群体遗传学、生物地理学和杂交育种的研究。其在野生植物进化过程研究中所具备的潜力在不久的将来将被充分认识和利用。
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关键词
叶绿体
基因组
微卫星
标记
叶绿体
基因组
微卫星
标记
cpssrs
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职称材料
白菜胞质雄性不育系叶绿体DNA的SSR分析
2
作者
邱正明
邓晓辉
+1 位作者
聂启军
朱凤娟
《湖北农业科学》
北大核心
2008年第2期134-137,共4页
从烟草的36对叶绿体SSR引物中筛选出10对引物对白菜不育系和保持系的叶绿体基因组进行了SSR分析,发现两系间扩增片段的多态性较小,获得了1条只在不育系稳定出现的微卫星序列。此结果显示,不育系和保持系的叶绿体基因组间确实存在差异,...
从烟草的36对叶绿体SSR引物中筛选出10对引物对白菜不育系和保持系的叶绿体基因组进行了SSR分析,发现两系间扩增片段的多态性较小,获得了1条只在不育系稳定出现的微卫星序列。此结果显示,不育系和保持系的叶绿体基因组间确实存在差异,此差异也许与细胞质雄性不育相关。
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关键词
白菜
胞质雄性不育
叶绿体
微卫星
技术
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职称材料
新疆濒危植物半日花居群的遗传变异及遗传结构分析
被引量：
5
3
作者
苏志豪
李文军
+1 位作者
卓立
姜小龙
《植物资源与环境学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第4期67-73,共7页
利用3个叶绿体微卫星多态性引物(包括mtrn Sf-trn Gr、mtrn L2-trn F和mtrn L5-trn L3)对新疆地区半日花(Helianthemum songaricum Schrenk)9个居群[分别位于伊犁河谷的军马场(JMC)、黑山头(HST)、科克苏(KKS)、种羊场(ZYC)、科博(KB)...
利用3个叶绿体微卫星多态性引物(包括mtrn Sf-trn Gr、mtrn L2-trn F和mtrn L5-trn L3)对新疆地区半日花(Helianthemum songaricum Schrenk)9个居群[分别位于伊犁河谷的军马场(JMC)、黑山头(HST)、科克苏(KKS)、种羊场(ZYC)、科博(KB)、龙口(LK)、喀拉布拉(KLBL)和拜什墩(BSD)以及河谷北部的博乐(BL)]92个单株的叶片总DNA进行了扩增,在此基础上,对各居群的遗传变异、地理分布、遗传多样性和遗传结构进行了分析。结果表明:3个叶绿体微卫星多态性引物共扩增出6个多态性位点;经分析,得到H1、H2、H3和H4 4个单倍型,其中,H1单倍型分布在JMC、HST、KKS、ZYC、KB和KLBL居群,H2单倍型仅分布在JMC居群,H3单倍型分布在LK和BL居群,H4单倍型仅分布在BSD居群。9个半日花居群总的遗传多样性指数较高(0.583),但居群内的遗传多样性指数却很低(0.040),居群间的遗传分化系数为0.932。主坐标分析(PCo A)将9个半日花居群划分成3个群体,其中,BSD居群单独为1个群体,BL和LK居群为1个群体,其余6个居群为1个群体;而亲缘关系树状图将这9个居群分成2支,其中,BL、LK和BSD居群为1支,其余6个居群为1支,说明BL、LK和BSD居群明显有别于其他居群。分子方差分析结果表明:半日花95.61%的遗传变异发生在群体间。Mantel检验结果表明:各居群间遗传距离与地理距离的相关系数为0.324,说明半日花居群间遗传距离与地理距离存在一定程度的正相关。研究结果显示:新疆地区半日花居群间发生了明显的遗传分化,并存在一定程度的地理隔离,这可能与小居群的遗传漂变和近交效应及居群间的地理障碍有关。建议对新疆地区半日花的全部居群、个体和原始生境进行保护,并对其天然居群采取复壮、迁地保护和划分居群管理单元等保护措施。
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关键词
半日花
新疆地区
遗传变异
遗传结构
叶绿体
微卫星
技术
(
cpssrs
)
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职称材料
题名
叶绿体基因组微卫星标记(cpSSR)研究进展
被引量：
7
1
作者
李博
刘合霞
机构
桂林师范高等专科学校
南京林业大学森林资源与环境学院
出处
《安徽农业科学》
CAS
2012年第13期7638-7639,7649,共3页
文摘
随着测序技术的发展,叶绿体基因组微卫星标记(cpSSRs)的开发和应用越来越普遍。该研究介绍了叶绿体基因组分子标记的特点、用途、开发方法以及已开发的cpSSRs所具有的特点。随着cpSSRs开发成本的降低及研究技术的成熟,新的cpSSRs不断开发,将会有越来越多的叶绿体基因组SSR分子标记应用于群体遗传学、生物地理学和杂交育种的研究。其在野生植物进化过程研究中所具备的潜力在不久的将来将被充分认识和利用。
关键词
叶绿体
基因组
微卫星
标记
叶绿体
基因组
微卫星
标记
cpssrs
Keywords
Chloroplast genome
Microsatellite
Chloroplast simple sequence repeats （
cpssrs
）
分类号
S188.1 [农业科学—农业基础科学]
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职称材料
题名
白菜胞质雄性不育系叶绿体DNA的SSR分析
2
作者
邱正明
邓晓辉
聂启军
朱凤娟
机构
武汉大学生命科学学院植物发育生物学教育部重点实验室
湖北省农业科学院蔬菜科技中心
出处
《湖北农业科学》
北大核心
2008年第2期134-137,共4页
基金
国家"863"计划项目(2003AA207120)
文摘
从烟草的36对叶绿体SSR引物中筛选出10对引物对白菜不育系和保持系的叶绿体基因组进行了SSR分析,发现两系间扩增片段的多态性较小,获得了1条只在不育系稳定出现的微卫星序列。此结果显示,不育系和保持系的叶绿体基因组间确实存在差异,此差异也许与细胞质雄性不育相关。
关键词
白菜
胞质雄性不育
叶绿体
微卫星
技术
Keywords
Chinese cabbage
CMS
chloroplast
SSR
分类号
S634.3 [农业科学—蔬菜学]
Q343.34 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
新疆濒危植物半日花居群的遗传变异及遗传结构分析
被引量：
5
3
作者
苏志豪
李文军
卓立
姜小龙
机构
中国科学院新疆生态与地理研究所干旱区生物地理与生物资源重点实验室
新疆师范大学图书馆
上海辰山植物园
出处
《植物资源与环境学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第4期67-73,共7页
基金
新疆维吾尔自治区自然科学基金资助项目(2014211A073)
文摘
利用3个叶绿体微卫星多态性引物(包括mtrn Sf-trn Gr、mtrn L2-trn F和mtrn L5-trn L3)对新疆地区半日花(Helianthemum songaricum Schrenk)9个居群[分别位于伊犁河谷的军马场(JMC)、黑山头(HST)、科克苏(KKS)、种羊场(ZYC)、科博(KB)、龙口(LK)、喀拉布拉(KLBL)和拜什墩(BSD)以及河谷北部的博乐(BL)]92个单株的叶片总DNA进行了扩增,在此基础上,对各居群的遗传变异、地理分布、遗传多样性和遗传结构进行了分析。结果表明:3个叶绿体微卫星多态性引物共扩增出6个多态性位点;经分析,得到H1、H2、H3和H4 4个单倍型,其中,H1单倍型分布在JMC、HST、KKS、ZYC、KB和KLBL居群,H2单倍型仅分布在JMC居群,H3单倍型分布在LK和BL居群,H4单倍型仅分布在BSD居群。9个半日花居群总的遗传多样性指数较高(0.583),但居群内的遗传多样性指数却很低(0.040),居群间的遗传分化系数为0.932。主坐标分析(PCo A)将9个半日花居群划分成3个群体,其中,BSD居群单独为1个群体,BL和LK居群为1个群体,其余6个居群为1个群体;而亲缘关系树状图将这9个居群分成2支,其中,BL、LK和BSD居群为1支,其余6个居群为1支,说明BL、LK和BSD居群明显有别于其他居群。分子方差分析结果表明:半日花95.61%的遗传变异发生在群体间。Mantel检验结果表明:各居群间遗传距离与地理距离的相关系数为0.324,说明半日花居群间遗传距离与地理距离存在一定程度的正相关。研究结果显示:新疆地区半日花居群间发生了明显的遗传分化,并存在一定程度的地理隔离,这可能与小居群的遗传漂变和近交效应及居群间的地理障碍有关。建议对新疆地区半日花的全部居群、个体和原始生境进行保护,并对其天然居群采取复壮、迁地保护和划分居群管理单元等保护措施。
关键词
半日花
新疆地区
遗传变异
遗传结构
叶绿体
微卫星
技术
(
cpssrs
)
Keywords
Helianthemum songaricum Schrenk
Xinjiang region
genetic variation
genetic structure
chloroplast microsatellite technology(
cpssrs
)
分类号
Q946-33 [生物学—植物学]
Q949.758.9 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
叶绿体基因组微卫星标记(cpSSR)研究进展
李博
刘合霞
《安徽农业科学》
CAS
2012
7
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
白菜胞质雄性不育系叶绿体DNA的SSR分析
邱正明
邓晓辉
聂启军
朱凤娟
《湖北农业科学》
北大核心
2008
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
新疆濒危植物半日花居群的遗传变异及遗传结构分析
苏志豪
李文军
卓立
姜小龙
《植物资源与环境学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
5
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参考文献
引证文献
统计分析
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