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六堡茶群体种叶绿体基因组捕获历史与遗传多样性研究
1
作者
姚淑婷
张强
+5 位作者
苏敏
吴雨婷
庞月兰
梁燕妮
蔡爱华
覃信梅
《广西植物》
北大核心
2025年第3期527-541,共15页
六堡茶群体种(Camellia sinensis var.sinensis‘Liupao’)是制作六堡茶的主要原材料植物。为探索六堡茶群体种的遗传背景,特别是其系统发育和演化历史,该文对27份六堡茶群体种和5份突肋茶开展了浅层基因组和转录组测序,并进行了六堡茶...
六堡茶群体种(Camellia sinensis var.sinensis‘Liupao’)是制作六堡茶的主要原材料植物。为探索六堡茶群体种的遗传背景,特别是其系统发育和演化历史,该文对27份六堡茶群体种和5份突肋茶开展了浅层基因组和转录组测序,并进行了六堡茶群体种的系统发育关系、分歧进化时间及遗传多样性分析。结果表明:(1)在叶绿体树上,六堡茶群体种样品被分为距离较远的两组。一组与茶亲缘关系最近,嵌入了主要由茶组成的分支内部,分别与不同栽培茶聚在一起;另一组则形成单系分支,与突肋茶亲缘关系最近且嵌入其内部。然而,在核基因树上,六堡茶群体种样品与栽培茶及山茶属其他几个物种聚为一支,但与突肋茶关系较远。核质基因组系统发育矛盾表明,部分六堡茶群体种的祖先曾与突肋茶发生过杂交事件,捕获了突肋茶的叶绿体基因组。(2)分子钟分析进一步表明,该杂交事件发生在1.55百万年前的第四纪时期,远早于人类栽培和制作茶的历史。(3)基于叶绿体基因组和核基因的遗传多样性分析均发现,六堡茶群体种具有较高的单倍型多样性,有较大的演化潜力。该研究为六堡茶群体种种质资源保护、品种选育及开发利用提供了科学依据和指导。
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关键词
六堡茶群体种
叶绿体
基因组
转录组
叶绿体基因组捕获
杂交
遗传多样性
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题名
六堡茶群体种叶绿体基因组捕获历史与遗传多样性研究
1
作者
姚淑婷
张强
苏敏
吴雨婷
庞月兰
梁燕妮
蔡爱华
覃信梅
机构
广西壮族自治区中国科学院广西植物研究所
广西师范大学生命科学学院
广西壮族自治区茶叶科学研究所
梧州学院
出处
《广西植物》
北大核心
2025年第3期527-541,共15页
基金
广西创新驱动发展专项(桂科AA20302018-1)
广西自然科学基金(2023GXNSFAA026221)
广西喀斯特植物保育与恢复生态学重点实验室项目(22-035-26)。
文摘
六堡茶群体种(Camellia sinensis var.sinensis‘Liupao’)是制作六堡茶的主要原材料植物。为探索六堡茶群体种的遗传背景,特别是其系统发育和演化历史,该文对27份六堡茶群体种和5份突肋茶开展了浅层基因组和转录组测序,并进行了六堡茶群体种的系统发育关系、分歧进化时间及遗传多样性分析。结果表明:(1)在叶绿体树上,六堡茶群体种样品被分为距离较远的两组。一组与茶亲缘关系最近,嵌入了主要由茶组成的分支内部,分别与不同栽培茶聚在一起;另一组则形成单系分支,与突肋茶亲缘关系最近且嵌入其内部。然而,在核基因树上,六堡茶群体种样品与栽培茶及山茶属其他几个物种聚为一支,但与突肋茶关系较远。核质基因组系统发育矛盾表明,部分六堡茶群体种的祖先曾与突肋茶发生过杂交事件,捕获了突肋茶的叶绿体基因组。(2)分子钟分析进一步表明,该杂交事件发生在1.55百万年前的第四纪时期,远早于人类栽培和制作茶的历史。(3)基于叶绿体基因组和核基因的遗传多样性分析均发现,六堡茶群体种具有较高的单倍型多样性,有较大的演化潜力。该研究为六堡茶群体种种质资源保护、品种选育及开发利用提供了科学依据和指导。
关键词
六堡茶群体种
叶绿体
基因组
转录组
叶绿体基因组捕获
杂交
遗传多样性
Keywords
Camellia sinensis var.sinensis‘Liupao’
chloroplast genomes
transcriptomes
chloroplast genome capture
hybridization
genetic diversity
分类号
Q943 [生物学—植物学]
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作者
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1
六堡茶群体种叶绿体基因组捕获历史与遗传多样性研究
姚淑婷
张强
苏敏
吴雨婷
庞月兰
梁燕妮
蔡爱华
覃信梅
《广西植物》
北大核心
2025
0
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