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基于叶绿体基因序列rbcL-accD研究莛子藨的分子遗传多样性和谱系地理结构
被引量：
3
1
作者
刘海瑞
高庆波
+3 位作者
张发起
邢睿
迟晓峰
陈世龙
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第2期278-283,共6页
莛子藨是莛子藨属的一种多年生草本植物,主要分布在青藏高原东北部及邻近高山地区和日本,为东亚特有种。本文基于叶绿体DNA基因间隔区rbcL-accD序列,对莛子藨物种水平的序列特征、分子遗传多样性和谱系地理结构进行研究。分析结果发现...
莛子藨是莛子藨属的一种多年生草本植物,主要分布在青藏高原东北部及邻近高山地区和日本,为东亚特有种。本文基于叶绿体DNA基因间隔区rbcL-accD序列,对莛子藨物种水平的序列特征、分子遗传多样性和谱系地理结构进行研究。分析结果发现该区域莛子藨种群的遗传变异主要来自于居群间(72.28%),优势单倍型(H2)广泛分布,特有单倍型分散在多个居群。居群间遗传分化系数N_(ST)<G_(ST),没有检测到显著谱系地理结构,而且居群间基因流较低(N_m=0.096),青藏高原及其邻近地区特殊地形和生态环境造成的地理隔离或者生境异质化可能是现有单倍型分布格局形成的原因。种群动态历史分析显示莛子藨经历过不显著的种群选择或者扩张事件,综合分析推测莛子藨居群应该是在间冰期或者冰期后从不同避难所扩散形成现在的分布格局,具体避难所还需进一步深入研究才能确认。
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关键词
莛子藤
遗传多样性
谱系地理结构
叶绿体基因序列
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职称材料
基于叶绿体基因组全序列分析真叶植物叶绿体基因的适应性进化
被引量：
12
2
作者
王博
高磊
+1 位作者
苏应娟
王艇
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期108-113,146,共7页
真叶植物包括蕨类、裸子植物和被子植物。迄今已积累有较为丰富的真叶植物叶绿体基因组全序列数据。选取了29种真叶植物的叶绿体基因组全序列,采用PAML软件基于位点间可变ω模型,分别分析了蕨类、裸子植物和被子植物叶绿体基因的适应性...
真叶植物包括蕨类、裸子植物和被子植物。迄今已积累有较为丰富的真叶植物叶绿体基因组全序列数据。选取了29种真叶植物的叶绿体基因组全序列,采用PAML软件基于位点间可变ω模型,分别分析了蕨类、裸子植物和被子植物叶绿体基因的适应性进化。结果显示:①蕨类、裸子植物和被子植物各有6.5%、7.5%和19.2%的叶绿体基因受正选择作用;被子植物经历正选择的叶绿体基因明显比蕨类和裸子植物为多;②被正选择作用的叶绿体基因主要是遗传系统和光合系统基因,它们的编码产物涉及叶绿体蛋白质合成、基因转录、能量转化与调节及光合作用等过程。推测叶绿体功能基因可能在真叶植物对陆生生态环境的适应过程中起着重要作用。
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关键词
真叶植物
叶绿体
基因
叶绿体
基因
组全
序列
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职称材料
题名
基于叶绿体基因序列rbcL-accD研究莛子藨的分子遗传多样性和谱系地理结构
被引量：
3
1
作者
刘海瑞
高庆波
张发起
邢睿
迟晓峰
陈世龙
机构
中国科学院高原生物进化与适应重点实验室
中国科学院大学
出处
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第2期278-283,共6页
基金
青海省应用基础研究计划(2016-ZJ-761)
国家自然科学基金(31400322)
文摘
莛子藨是莛子藨属的一种多年生草本植物,主要分布在青藏高原东北部及邻近高山地区和日本,为东亚特有种。本文基于叶绿体DNA基因间隔区rbcL-accD序列,对莛子藨物种水平的序列特征、分子遗传多样性和谱系地理结构进行研究。分析结果发现该区域莛子藨种群的遗传变异主要来自于居群间(72.28%),优势单倍型(H2)广泛分布,特有单倍型分散在多个居群。居群间遗传分化系数N_(ST)<G_(ST),没有检测到显著谱系地理结构,而且居群间基因流较低(N_m=0.096),青藏高原及其邻近地区特殊地形和生态环境造成的地理隔离或者生境异质化可能是现有单倍型分布格局形成的原因。种群动态历史分析显示莛子藨经历过不显著的种群选择或者扩张事件,综合分析推测莛子藨居群应该是在间冰期或者冰期后从不同避难所扩散形成现在的分布格局,具体避难所还需进一步深入研究才能确认。
关键词
莛子藤
遗传多样性
谱系地理结构
叶绿体基因序列
Keywords
Triosteum pinnatifidum
genetic variation
phylogeographic structure
cpDNA sequence
分类号
Q949.781.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
基于叶绿体基因组全序列分析真叶植物叶绿体基因的适应性进化
被引量：
12
2
作者
王博
高磊
苏应娟
王艇
机构
中国科学院武汉植物园//中国科学院植物种质创新与特色农业重点实验室
中国科学院研究生院
中山大学生命科学学院
出处
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期108-113,146,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目(30970290
31070594)
文摘
真叶植物包括蕨类、裸子植物和被子植物。迄今已积累有较为丰富的真叶植物叶绿体基因组全序列数据。选取了29种真叶植物的叶绿体基因组全序列,采用PAML软件基于位点间可变ω模型,分别分析了蕨类、裸子植物和被子植物叶绿体基因的适应性进化。结果显示:①蕨类、裸子植物和被子植物各有6.5%、7.5%和19.2%的叶绿体基因受正选择作用;被子植物经历正选择的叶绿体基因明显比蕨类和裸子植物为多;②被正选择作用的叶绿体基因主要是遗传系统和光合系统基因,它们的编码产物涉及叶绿体蛋白质合成、基因转录、能量转化与调节及光合作用等过程。推测叶绿体功能基因可能在真叶植物对陆生生态环境的适应过程中起着重要作用。
关键词
真叶植物
叶绿体
基因
叶绿体
基因
组全
序列
正选择
Keywords
euphyllophytes； chloroplast genes； complete chloroplast genome sequences； positive selection
分类号
Q349 [生物学—遗传学]
Q949 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于叶绿体基因序列rbcL-accD研究莛子藨的分子遗传多样性和谱系地理结构
刘海瑞
高庆波
张发起
邢睿
迟晓峰
陈世龙
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2018
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于叶绿体基因组全序列分析真叶植物叶绿体基因的适应性进化
王博
高磊
苏应娟
王艇
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2012
12
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职称材料
已选择
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引证文献
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