泛耐药鲍氏不动杆菌获得性耐药相关基因与可移动遗传元件检测指标的聚类分析 被引量：9

1

作者 王春新 耿先龙 +5 位作者 许亚丰 陈国千 赵琪 周丽珍 糜祖煌 金辉 《南京医科大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期115-118,共4页

目的 :调查泛耐药鲍氏不动杆菌(pandrug-resistant Acinetobacter baumannii,PDR-ABA)中获得性耐药相关基因和可移动遗传元件遗传标记的存在状况,以及两者的相关性。方法:收集2010年3月到2010年5月临床标本中分离的PDR-ABA菌20株,采用... 目的 :调查泛耐药鲍氏不动杆菌(pandrug-resistant Acinetobacter baumannii,PDR-ABA)中获得性耐药相关基因和可移动遗传元件遗传标记的存在状况,以及两者的相关性。方法:收集2010年3月到2010年5月临床标本中分离的PDR-ABA菌20株,采用聚合酶链反应(PCR)的方法检测37种β-内酰胺类获得性耐药基因、15种氨基糖苷类获得性耐药基因、5种喹诺酮类获得性耐药基因和8种可移动遗传元件,并用指标聚类分析(SPSS法)分析获得性耐药相关基因和可移动遗传元件遗传标记的相关性。结果:20株PDR-ABA菌共检出5种β-酰胺类获得性耐药基因、4种氨基糖苷类获得性耐药基因、1种喹诺酮类获得性耐药基因、5种可移动遗传元件。指标聚类分析显示获得性耐药基因与多种可移动遗传元件相关联:TEM-1、ADC-like、OXA-23、aac(6′)-Ⅰb、ant(2")-Ⅰ、ant(3")-Ⅰ、aphA1、adeB与tnpU、ISCR1、IS26、ISaba1高度关联,DHA-1、CARB与IS903关联。结论:本组PDR-ABA携带获得性耐药相关基因导致对相关药物耐药,且获得性耐药相关基因和可移动遗传元件密切相关。 展开更多

关键词 鲍氏不动杆菌 获得性耐药基因 可移动遗传元件 指标聚类分析 泛耐药

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携带bla_(KPC-2)基因泛耐药肺炎克雷伯菌可移动遗传元件分析 被引量：2

2

作者 黄支密 夏守慧 +3 位作者 周芸 杨伟平 李洁 糜祖煌 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期139-143,共5页

目的了解临床分离的携带bla_(KPC-2)型碳青霉烯酶基因泛耐药肺炎克雷伯菌中可移动遗传元件(mobile genetic elements,MGEs)存在情况。方法在2008年11月至2009年7月从住院患者中分离19株携带blaKPC-2型碳青霉烯酶基因泛耐药肺炎克雷伯菌... 目的了解临床分离的携带bla_(KPC-2)型碳青霉烯酶基因泛耐药肺炎克雷伯菌中可移动遗传元件(mobile genetic elements,MGEs)存在情况。方法在2008年11月至2009年7月从住院患者中分离19株携带blaKPC-2型碳青霉烯酶基因泛耐药肺炎克雷伯菌,通过分析3种基因gyrA、parC和mdfA序列对菌株进行分子鉴定。采用PCR方法检测4种可移动遗传元件遗传标记基因,分别为:泛宿主性接合性质粒遗传标记trbC、转座子Tn1548遗传标记tnpU、Ⅰ类整合子遗传标记qacE△1‐sul1和插入序列共同区遗传标记ISCR1基因;对扩增阳性的4种遗传标记基因PCR产物采用双向测序,测序结果用Chromas软件直接作BLAST Search比对分析。结果本组19株gyrA、parC和mdf A基因PCR扩增均阳性,其基因序列经Gen Bank中的BLASTn程序进行同源性比较分析,证实19株均为肺炎克雷伯菌。19株中,4种可移动遗传元件遗传标记trbC、tnpU、qacE△1‐sul1和ISCR1基因阳性率均为100.0%,经对该4种遗传标记基因PCR阳性产物进行测序比对,发现与Gen Bank中已发布的4种相对应基因trbC、tnpU、qacE△1‐sul1和ISCR1序列完全相同(同源性均为100.0%),均得到确认。结论可移动遗传元件在携带bla_(KPC-2)型碳青霉烯酶基因泛耐药肺炎克雷伯菌中广泛存在。 展开更多

关键词 肺炎克雷伯菌 blaKPC-2 碳青霉烯酶 可移动遗传元件 插入序列共同区 基因 分子鉴定

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河南某工厂附近农田土壤中抗生素抗性基因与可移动遗传元件的分布 被引量：1

3

作者 刘佳 赵小学 +6 位作者 李红萍 程学敏 巴月 李庆波 丁记者 朱静媛 赵宗生 《郑州大学学报（医学版）》 CAS 北大核心 2016年第3期301-305,共5页

目的：观察河南某工厂附近农田土壤中抗生素抗性基因和可移动遗传元件的分布。方法：分别于不同时间点采集河南某工厂主导风向下风向上距离为700～2 500 m不等的7块农田土壤的土样,提取总DNA,采用PCR法检测15种抗生素抗性基因（包括四... 目的：观察河南某工厂附近农田土壤中抗生素抗性基因和可移动遗传元件的分布。方法：分别于不同时间点采集河南某工厂主导风向下风向上距离为700～2 500 m不等的7块农田土壤的土样,提取总DNA,采用PCR法检测15种抗生素抗性基因（包括四环素类药物抗性基因tet A、tet C、tet E、tet M、tet Q、tet W,磺胺类药物抗性基因sulⅠ、sulⅡ,β内酰胺类药物抗性基因bla-TEM、SHV、CTX-M-1,喹诺酮类药物的抗性基因qnr A、qnr B、qnr S,链霉素类药物抗性基因str A）和4种可移动遗传元件（包括整合酶基因int I1、int I2,插入序列共同区基因orf513、ISCR2）,PCR阳性产物送测序,通过BLAST与Gen Bank数据库进行同源性比对。结果：共检出8种抗生素抗性基因,分别是sulⅡ、tet C、bla-TEM、sulⅠ、tet A、str A、tet M和tet W;3种可移动遗传元件int I1、int I2、ISCR2。各PCR扩增阳性产物经测序比对后,与Gen Bank已有序列识别度为95%～100%。各基因在不同距离土样中的阳性率比较差异均无统计学意义（P〉0.05）,sulⅡ、tet C、bla-TEM和int I1在不同时间点的土样中阳性率比较差异有统计学意义（P〈0.05）。结论：该工厂附近农田土壤中常见抗生素抗性基因及可移动基因元件为sulⅡ、tet C、bla-TEM、sulⅠ和int I1,除sulⅠ外,sulⅡ、tet C、bla-TEM和int I1的分布均具有时间差异,但在不同距离农田土壤中分布稳定。 展开更多

关键词 农田土壤 抗生素抗性基因 可移动遗传元件 河南省 水平基因转移

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产ESBLs肺炎克雷伯菌ESBLs基因与可移动遗传元件相关性分析 被引量：7

4

作者 莫梢梢 刘宝 +2 位作者 胡智成 万珊 费樱 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 2019年第5期580-585,共6页

目的了解产超广谱β-内酰胺酶(extended spectrum beta-lactamases,ESBLs)肺炎克雷伯菌(Klebsiella pnewmoniae,Kpn)ESBLs基因与可移动遗传元件(mobile genetic elements,MGEs)标记基因的携带情况及其相关性。方法收集从住院患者标本中... 目的了解产超广谱β-内酰胺酶(extended spectrum beta-lactamases,ESBLs)肺炎克雷伯菌(Klebsiella pnewmoniae,Kpn)ESBLs基因与可移动遗传元件(mobile genetic elements,MGEs)标记基因的携带情况及其相关性。方法收集从住院患者标本中分离出的产与非产ESBLsKpn非重复菌株各100株,采用PCR检测细菌中4种ESBLs基因与8种MGEs标记基因,并作指标聚类分析。结果产ESBLs Kpm中,ESBLs基因阳性率高达100%;MGEs标记基因以IS26、ISEcpl、trad、trbC和intll基因为主,阳性率高于非产ESBLsKpn(P-0.05);ESBLs基因与MGEs标记基因的同时检出率明显高于非产ESBLs Kpn(P-0.05):基因blaSHV-12、blaOXA-1与MGEs基因tmpU、np513、mer4、intll/相关联,基因blaTEM-1、bldCTX-M-125与MGEs基因ISEcp1、IS26、trad相关联。产与非产ESBLs Kpn均没有只检出MGEs标记基因的菌株。结论产ESBLsKpn ESBLs基因和MGEs标记基因携带率高,两者存在相关性,可能是产ESBLsKpn出现多重耐药的重要原因;MGEs标记基因在Kpn中可能不是单独存在的。 展开更多

关键词 ESBLS 肺炎克雷伯菌 可移动遗传元件(MGEs)

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水产用微生态制剂耐药性评估及耐药相关遗传元件检测 被引量：2

5

作者 陈招弟 李健 +3 位作者 翟倩倩 常志强 王佳佳 葛倩倩 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期132-140,共9页

以市场上购买的9种水产用微生态制剂为研究对象,采用琼脂稀释法筛选其中的耐药菌株,运用微量肉汤稀释法检测分离菌株对庆大霉素、恩诺沙星、诺氟沙星、氟苯尼考、磺胺嘧啶、磺胺甲基嘧啶、四环素、土霉素、万古霉素9种抗生素的耐药性,... 以市场上购买的9种水产用微生态制剂为研究对象,采用琼脂稀释法筛选其中的耐药菌株,运用微量肉汤稀释法检测分离菌株对庆大霉素、恩诺沙星、诺氟沙星、氟苯尼考、磺胺嘧啶、磺胺甲基嘧啶、四环素、土霉素、万古霉素9种抗生素的耐药性,结合聚合酶链式反应分析耐药菌株携带的耐药基因和可移动遗传元件(接合性质粒遗传标记、转座子、整合子和插入序列),为微生态制剂的安全生产与监测提供参考。结果显示,9种微生态制剂中都存在耐药菌株,100株分离菌株对除恩诺沙星以外的8种抗生素都存在不同程度的耐药, 46%的株菌同时携带氟喹诺酮类、酰胺醇类、磺胺类、四环素类、氨基糖苷类和糖肽类耐药基因,且有15株菌同时携带整合子-基因盒、质粒、转座子和插入序列,携带两种及两种以上可移动遗传原件的比例为95%。微生态制剂产品可能存在一定的安全隐患,应加强质量监测和市场监管。 展开更多

关键词 微生态制剂 抗生素 耐药基因 可移动遗传元件

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耐药鲍曼不动杆菌不同年份分离株耐药元件基因比较研究 被引量：10

6

作者 付启云 郑绍同 +2 位作者 连建春 戴京京 张小云 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 2019年第5期595-599,共5页

目的调查两组相隔7年的鲍曼不动杆菌菌株可能存在的耐药基因状况及菌株间的亲缘关系。方法分别收集南京医科大学附属淮安第一医院2008年20株鲍曼不动杆菌,2016年20株鲍曼不动杆菌。菌种鉴定为鲍曼不动杆菌种特异mdfA基因与blaoyA基因PC... 目的调查两组相隔7年的鲍曼不动杆菌菌株可能存在的耐药基因状况及菌株间的亲缘关系。方法分别收集南京医科大学附属淮安第一医院2008年20株鲍曼不动杆菌,2016年20株鲍曼不动杆菌。菌种鉴定为鲍曼不动杆菌种特异mdfA基因与blaoyA基因PCR双重检测为阳性方确认为鲍曼不动杆菌。再用PCR方法检测32种β-内酰胺类药物获得性耐药基因、15种氨基糖苷类药物获得性耐药基因、10种可移动遗传元件遗传标记,最后对检测结果作样本聚类分析(UPGMA法)。结果2016年分离株对第三代头孢类药物、碳青霉烯类药物、氨基糖苷类药物、喹诺酮药物均为耐药。2008年分离株仅对第三代头孢类药物均为耐药,而对碳青霉烯类药物均为敏感,对喹诺酮药物、氨基糖苷类药物分别有50.00%和60.00%的敏感性。2008和2016年分离株均检出blaADC和blaOXA-1,但bldOXA2册、blaOXA-23群只有2016年分离株均被检出。2008年分离株对第三代头孢类药物耐药主要与bldspc相关,2016年分离株对第三代头孢类药物、碳青霉烯类药物耐药主要与blaADC、blaOXA-2和blaOXA-23群相关。2016年分离株均测出aac(2)-I b、aph(3)-I、armA等3种氨基糖苷类药物耐药相关基因,而2008年分离株均无检出。可移动遗传元件遗传标记tmpU、tmp513、IS26和ISabal等4种也只有2016年分离株被全部检出。菌株亲缘关系分析可见2008和2016年不同年份分离株分成两个独立的簇群(A簇群和B簇群),2016年分离株聚集性更强相差系数更小。A和B族群均可分为两个亚簇群。A-1亚簇群有两个克隆播散,A-2、B-1和B2亚簇群各有一个克隆播散。其中2016年分离株B-簇群一个有14株菌构成的大克隆播散。分离株耐药元件检测阳性模式显示,2008年分离株仅携带2~7种耐药元件基因;2016年分离株则携带14种~16种耐药元件基因。结论多种β-内酰胺类药物耐药基因、氨基糖苷类药物耐药基因和可移动遗传元件是导致鲍曼不动杆菌对抗菌药物耐药的重要原因。在同一家医院的对相隔7年的鲍曼不动杆菌临床分离株进行耐药元件基因检测与分析是国内首次报道。不同年份分离株的耐药性和耐药元件基因携带状况差异明显:2016年分离株比2008年分离株耐药性更强,携带的耐药元件基因更多。2008年和2016年分离株均有克隆播散,提示有医院感染的存在。 展开更多

关键词 鲍曼不动杆菌 Β-内酰胺类 氨基糖苷类 可移动遗传元件 样本聚类分析 耐药

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我国流域水环境污染对共存抗生素抗性基因赋存与传播的影响

7

作者 潘雄 林莉 杨玉义 《湖泊科学》 北大核心 2026年第2期448-464,I0003,I0004,共19页

抗生素抗性基因(ARGs)作为一种新型环境污染物,其在流域水环境中的传播机制与风险控制是保障水安全的重要科学问题。本文系统综述了我国七大流域(长江、黄河、淮河、珠江、海河、辽河、松花江)水环境中ARGs的赋存特征、污染来源及时空... 抗生素抗性基因(ARGs)作为一种新型环境污染物,其在流域水环境中的传播机制与风险控制是保障水安全的重要科学问题。本文系统综述了我国七大流域(长江、黄河、淮河、珠江、海河、辽河、松花江)水环境中ARGs的赋存特征、污染来源及时空分布规律,并结合富营养化、重金属、新污染物(抗生素、微塑料、内分泌干扰物、持久性有机污染物等)的复合污染效应,解析ARGs的迁移扩散机制。研究表明,我国流域水环境中ARGs以磺胺类、四环素类和氨基糖苷类为主,主要来源于面源污染(农业种植、畜禽养殖等)和点源排放(污水处理厂尾水、医疗废水等)。在赋存水平上,沉积物中ARGs绝对丰度(10^(6)~10^(10) copies/g)普遍高出水体(10^(3)~10^(7) copies/mL)近3个数量级,但二者相对丰度(copies/16S rRNA)相近。在时空分布上,ARGs受微生物群落、环境理化因子、人类活动及可移动遗传元件(MGEs)共同驱动,其中以微生物群落的影响最为显著。在污染效应方面,水体富营养化通过促进硝酸盐还原菌等ARGs宿主菌群增殖,导致ARGs丰度与总氮、总磷负荷呈显著正相关;重金属(如Cu、Zn、Ni等)通过协同选择效应增强ARGs接合转移效率;新污染物中,抗生素通过选择性压力驱动ARGs进化,微塑料表面生物膜可将ARGs转化频率提升至自然底物的1000倍,内分泌干扰物(如双酚A)和持久性有机污染物(如全氟辛酸)则主要通过诱导氧化应激或上调质粒表达促进ARGs水平转移。ARGs传播机制主要包括细菌群落塑造(如厚壁菌门、变形菌门的选择性富集)、接合转移(依赖MGEs和ATP能量代谢)、诱导转化(胞外DNA吸附于悬浮颗粒物)及噬菌体介导(优先包裹ARGs片段)。需特别指出的是,水沙输移动力学过程,如悬浮物输移、沉积物再悬浮等,通过调控污染物相间分配,显著影响ARGs的传播通量。未来需探究“水沙动力学-污染物-ARGs”的耦合过程,解析水环境多相介质中ARGs的跨尺度调控机制,并探索水沙生态调度在ARGs风险管控中的应用潜力。 展开更多

关键词 流域水环境 抗生素抗性基因 水质 新污染物 迁移扩散 可移动遗传元件

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气单胞属菌粪便分离株分子鉴定与耐药元件检测 被引量：1

8

作者 翁幸鐾 糜祖煌 周铁丽 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第10期931-937,共7页

目的调查一组14株气单胞属菌的菌种分子鉴定情况,以及β-内酰胺酶类、氨基糖苷类耐药的遗传学背景。方法14株气单胞属菌均分离自2012年1月至12月宁波市第一医院肠道门诊腹泻患者的粪便标本,再作通用引物16SrDNA测序比对判定菌种,然后用... 目的调查一组14株气单胞属菌的菌种分子鉴定情况,以及β-内酰胺酶类、氨基糖苷类耐药的遗传学背景。方法14株气单胞属菌均分离自2012年1月至12月宁波市第一医院肠道门诊腹泻患者的粪便标本,再作通用引物16SrDNA测序比对判定菌种,然后用聚合酶链反应(PCR)的方法分析23种β-内酰胺酶基因、6种氨基糖苷类修饰酶基因和6种16SrRNA甲基化酶基因以及6种可移动遗传元件分子标记。结果本组14株菌经16SrDNA测序比对,10株为嗜水气单胞菌,水簇箱气单胞菌、温和气单胞菌、肠棕气单胞菌、斑点气单胞菌各1株。14株气单胞菌共检出5种β-内酰胺酶基因、4种氨基糖苷类修饰酶基因和3种可移动遗传元件遗传标记基因。其中4号株(嗜水气单胞菌)AQU基因是新的基因亚型,命名为AQU-2,11号株(水簇箱气单胞菌)AQU基因也是新的基因亚型,命名为AQU-3。结论气单胞菌属的菌种鉴定应该以分子鉴定法为准。本组14株气单胞属菌耐药严重,已呈多重耐药。 展开更多

关键词 气单胞属菌 分子鉴定 耐药基因 基因亚型 可移动遗传元件

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多重耐药肺炎克雷伯菌62种耐药基因元件的检测与gyrA基因突变的发现 被引量：5

9

作者 丘江 张洁 +1 位作者 孙杨 糜祖煌 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期539-544,共6页

目的 调查一组临床检出的肺炎克雷伯菌可能存在的耐药基因状况,以及各菌株间可能存在的亲缘关系。方法 25株肺炎克雷伯菌均分离自2016-2017年江汉油田总医院医院住院病人标本。菌种鉴定为gyrA基因测序上网BLASTn比对法,用PCR方法检测35... 目的 调查一组临床检出的肺炎克雷伯菌可能存在的耐药基因状况,以及各菌株间可能存在的亲缘关系。方法 25株肺炎克雷伯菌均分离自2016-2017年江汉油田总医院医院住院病人标本。菌种鉴定为gyrA基因测序上网BLASTn比对法,用PCR方法检测35种β-内酰胺酶基因,15种氨基糖苷类药物耐药基因,1种喹诺酮类药物耐药相关基因和11种可移动遗传元件。再用DNA测序法分析基因突变。最后对62种耐药元件基因的检测结果作样本聚类分析(UPGMA法)。结果 25株耐药肺炎克雷伯菌对碳青霉烯类耐药率低(亚胺培南、美罗培南均只有8%),对其它8种抗菌药物的耐药率较高(40%~96%)。每株均检出β-内酰胺类药物耐药相关基因(总阳性率100.00%);有24株菌检出氨基糖苷类药物耐药相关基因(总阳性率96.00%);有20株菌检出喹诺酮类药物耐药相关基因gyrA突变(即突变率为80.00%);每株均检出可移动遗传元件遗传标记基因(总阳性率100.00%)。共检出5种β-内酰胺酶基因(bla TEM、bla LAP、bla KPC、bla DHA群、bla OXA-1群),6种氨基糖苷类药物耐药基因(aac(3)-Ⅱ、aac(6’)-Ⅰb、ant(3”)-Ⅰ、aph 3’-Ⅰ、aad A5、rmt B),20株存在喹诺酮类药物耐药相关基因gyrA第83位密码子发生了同样的突变,且均无第87位密码子的突变。检出8种可移动遗传元件(intⅠ1、tnp U、tnp 513、ISEcp1、IS26、IS903、ISKpn6、trbC),且检出率较高。样本聚类分析显示本组菌可分A与B 2个簇群,2个簇群中均有克隆传播。A簇群中有2个克隆,分别为2-3-5-16等4株、13-14等2株;B簇群中有1个克隆,为19-20号2株。结论 多种β-内酰胺类药物耐药基因、氨基糖苷类药物耐药基因,gyrA第83位密码子突变和可移动遗传元件共同导致本组肺炎克雷伯菌对10种抗菌药物的耐药。本组肺炎克雷伯菌3个克隆传播提示可能有医院感染的存在。 展开更多

关键词 肺炎克雷伯菌 Β-内酰胺类 氨基糖苷类 GYRA 突变 可移动遗传元件 聚类分析 耐药

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棉隆熏蒸和强还原处理对农田土壤抗生素抗性基因的影响研究 被引量：3

10

作者 于文豪 李舒 +6 位作者 林于蓝 张晶清 徐晨伟 刘亮亮 张金波 蔡祖聪 赵军 《土壤学报》 北大核心 2025年第1期114-126,共13页

化学熏蒸和强还原处理(Reductive soil disinfestation,RSD)是农业生产上广泛应用的土壤灭菌措施,但它们是否同样能够消减土壤中富集的抗生素抗性基因(Antibiotics resistance genes,ARGs),目前还不得而知。以长期鸡粪施用导致ARGs富集... 化学熏蒸和强还原处理(Reductive soil disinfestation,RSD)是农业生产上广泛应用的土壤灭菌措施,但它们是否同样能够消减土壤中富集的抗生素抗性基因(Antibiotics resistance genes,ARGs),目前还不得而知。以长期鸡粪施用导致ARGs富集的农田土壤为研究对象,分别设置0.02%的棉隆熏蒸(DZ)和以1%的乙醇(ET,总有机碳:521.7 g·kg^(-1))、苜蓿粉(AL,总有机碳:454.9 g·kg^(-1),碳氮比:21.2)、糖蜜(MO,总有机碳:270.1 g·kg^(-1),碳氮比:12.6)以及苜蓿粉和糖蜜复合物(AM,m/m=1︰1)为有机物料的RSD处理,同时设置最大持水量(FCK)和不处理对照(CK),利用荧光定量PCR技术研究土壤中主要ARGs和可移动遗传元件(Mobile genetic elements,MGEs)在绝对丰度和相对丰度上的变化,并通过消减率来评估不同处理对土壤ARGs和MGEs的消减效果。研究发现,RSD处理能够消减aadA21、msrE、tetG、tetM、ErmF等基因的相对丰度,其中AL、MO和AM处理对aadA21基因相对丰度的消减率达到50.5%~58.3%,而ET处理对msrE、tetG和tetM基因相对丰度的消减效果显著,其消减率分别高达80.9%、78.3%和66.9%。同时,RSD处理能够显著降低土壤中MGEs(IS6100和IS26)的相对丰度,消减率分别为72.5%~76.2%和38.4%~56.2%。此外,DZ处理对土壤中ARGs和MGEs的相对丰度具有一定的增加作用,其中ARGs和IS26的相对丰度分别提高了21.9%和60.0%。综上,RSD处理能够通过降低ARGs和MGEs的相对丰度,限制ARGs的水平转移能力,实现对土壤ARGs的消减,且其消减效果与所使用的有机物料类型有关。此外,相较于棉隆熏蒸,RSD处理对ARGs和MGEs的消减效果更好,具备快速修复ARGs污染土壤的潜力。 展开更多

关键词 抗生素抗性基因 可移动遗传元件 棉隆熏蒸 强还原处理 相对丰度

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环境中抗生素抗性基因的健康风险分级 被引量：2

11

作者 许梅榕 安新丽 +2 位作者 赵彩霞 姚槐应 苏建强 《化学与生物工程》 北大核心 2025年第1期9-14,共6页

细菌耐药性的快速传播和蔓延是全球公共健康领域的重大挑战。除了医疗和动物养殖业外,抗生素抗性基因可在多种环境介质中传播扩散进而转移到人类病原菌中,影响人类健康。甄别环境中高风险抗性基因是实现抗性基因有效环境监测和风险评估... 细菌耐药性的快速传播和蔓延是全球公共健康领域的重大挑战。除了医疗和动物养殖业外,抗生素抗性基因可在多种环境介质中传播扩散进而转移到人类病原菌中,影响人类健康。甄别环境中高风险抗性基因是实现抗性基因有效环境监测和风险评估的基础。对环境中抗性基因的研究现状进行了总结,聚焦质粒携带的抗性基因,提出了环境中抗性基因风险分级框架,进而对制药厂和养殖厂场地环境样品进行了质粒组分析,形成了风险分级清单。结果表明,按抗性基因的移动性(与可移动遗传元件共存)、质粒类型、在人类病原菌中的流行度、致病潜力(与毒力因子共存)等4个标准,从制药厂和养殖厂场地环境样品中共检测到425个质粒携带的抗性基因,其中最高风险Ⅰ级抗性基因0种,Ⅱ级2种,Ⅲ级33种,Ⅳ级89种,最低风险Ⅴ级301种,形成了制药厂和养殖厂场地环境抗性基因风险分级清单。所检测到的高风险抗性基因,为环境抗性基因污染监测及人群暴露健康风险评估提供了理论和数据支撑。 展开更多

关键词 抗生素抗性基因 风险评估 质粒 可移动遗传元件 病原菌 毒力因子

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好氧堆肥对牛粪中养分含量及抗生素抗性基因丰度的影响

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作者 顾小凤 柳玲玲 +2 位作者 张萌 魏全全 芶久兰 《山东农业科学》 北大核心 2025年第10期123-129,共7页

为探究好氧堆肥对牛粪中养分含量及抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes,ARGs)丰度的影响,本试验将牛粪和高粱秸秆按体积比7∶3混合后,在自然条件下进行好氧堆肥,设置堆肥前样品为CK,堆肥后样品为CP,监测堆积过程中的堆体温度,... 为探究好氧堆肥对牛粪中养分含量及抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes,ARGs)丰度的影响,本试验将牛粪和高粱秸秆按体积比7∶3混合后,在自然条件下进行好氧堆肥,设置堆肥前样品为CK,堆肥后样品为CP,监测堆积过程中的堆体温度,测定堆肥前后物料浸提液处理下不同作物种子的发芽指数,并测定其养分含量,采用高通量qPCR芯片检测堆体中抗生素抗性基因种类和丰度,并分析ARGs丰度与养分含量的相关性。结果表明,好氧堆肥过程中高温期为9 d,最高堆温72℃;CP浸提液的黄瓜和萝卜发芽指数分别为117.91%和97.82%,较CK提升98.23%和73.87%;CP的pH值、全氮、全磷、全钾含量较CK分别提高2.33%、8.04%、20.18%、59.98%,有机质含量显著下降,降幅为10.43%。CK共检测出13个大类的ARGs,分别为氨基糖苷类、四环素类、大环内酯类-林可酰胺类-链阳性菌素B类(MLSB)、林可酰胺类、二氨基嘧啶类、氯霉素类、β-内酰胺类、氟喹诺酮类、糖肽类、插入类、磺胺类抗生素、肽类抗生素、转座酶类和1个大类的可移动遗传元件(mobile genetic elements,MGEs);CP共检测出12个大类的ARGs(肽类抗生素未检出)和1个大类的MGEs。CK检测出102个ARGs,CP检测出80个,检出幅度下降21.57%。CK和CP中基因个数前三的ARGs种类均为氨基糖苷类、四环素类和MLSB,检出数量分别为26个和23个、17个和13个、12个和9个。CP对aadA17基因和IncI1_repI1及ISCR1可移动遗传元件的去除率均为100%。相关性分析结果显示,全氮和全磷对floR、sul2、sul1、qacF_H、tnpA-3、tetX、IS6100、IS1247、ISEcp1、ISCR1绝对定量丰度影响显著,有机质对IncI1_repI1和APH(6)-Id绝对定量丰度影响显著,pH值和全钾对aadA2和aadA17绝对定量丰度影响显著。综上所述,好氧堆肥处理能显著提升牛粪堆肥浸提液的种子发芽指数和牛粪全磷、全钾含量,消减牛粪中的抗生素抗性基因和可移动遗传元件绝对定量丰度,提高牛粪资源化利用的品质,降低其潜在风险。 展开更多

关键词 牛粪 好氧堆肥 抗生素抗性基因 绝对定量丰度 发芽指数 养分含量 可移动遗传元件

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纳米零价铁改性生物炭对鸡粪堆肥中抗生素抗性基因的影响

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作者 邱秀文 冯梦婷 +4 位作者 毛霞 陈瑞旭 郑香容 宋微 万文轩 《农业工程学报》 北大核心 2025年第15期210-217,共8页

抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes,ARGs)的广泛传播对公众健康和生态环境构成了严重威胁。为探索堆肥过程中ARGs的有效去除方法,该研究使用玉米秸秆生物炭(corn straw biochar,CSB)和纳米零价铁改性玉米秸秆生物炭(corn stra... 抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes,ARGs)的广泛传播对公众健康和生态环境构成了严重威胁。为探索堆肥过程中ARGs的有效去除方法,该研究使用玉米秸秆生物炭(corn straw biochar,CSB)和纳米零价铁改性玉米秸秆生物炭(corn straw biochar-nZVI,CSBN)作为添加剂,进行了35 d的鸡粪堆肥试验。结果表明,添加CSB和CSBN提高了堆肥的温度、pH值、硝态氮含量和种子发芽指数,降低了铵态氮含量和碳氮比。堆肥结束后,CSB处理中氨基糖苷类、磺胺类、多重耐药性、四环素类、β-内酰胺酶、氯霉素抗性基因丰度分别比CK处理低35.13%、37.98%、52.45%、34.53%、86.23%和83.56%;CSBN处理中这些ARGs丰度分别比CK处理低52.77%、57.44%、57.94%、65.23%、85.36%和61.26%。CSB处理中大环内酯-林可酰胺-链霉菌素B抗性基因丰度比CK处理高92.93%,而CSBN处理中该抗性基因丰度比CK处理低43.65%。此外,CSB和CSBN处理中ARGs和可移动遗传元件(mobile genetic elements,MGEs)的总丰度较CK处理分别降低了40.42%和57.56%,表明CSBN对ARGs和MGEs的消减效果优于CSB。ARGs主要的潜在宿主菌是芽孢杆菌属、芽孢八叠球菌属、海洋球菌属、极小单胞菌属、棒状杆菌属等。添加CSB和CSBN降低了宿主菌的丰度。结构方程模型显示,MGEs在ARGs的去除过程中发挥了主导作用。以上结果表明,添加CSBN可以降低ARGs宿主菌的丰度和抑制由MGEs介导的水平基因转移,从而有效消减鸡粪堆肥中的ARGs。该结果可为开发安全高效的堆肥技术以控制畜禽粪便中抗生素抗性基因的环境传播提供重要理论依据和实践参考。 展开更多

关键词 抗生素抗性基因 改性生物炭 堆肥 细菌群落 可移动遗传元件

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3种抗生素菌渣经高温造粒技术肥料化后特性及污染物变化

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作者 万瑞琪 荀彦平 +3 位作者 郭大龙 迭庆杞 杨玉飞 孟令易 《环境污染与防治》 北大核心 2025年第7期57-64,I0020,I0021,共10页

抗生素菌渣的无害化处理与资源化利用已成为制药行业面临的紧迫挑战。为有效推动抗生素菌渣的资源化利用,采用高温造粒技术处理青霉素、头孢菌素和阿维菌素3种抗生素菌渣,评估肥料化前后理化性质及特征污染物的变化情况。检测了pH、含... 抗生素菌渣的无害化处理与资源化利用已成为制药行业面临的紧迫挑战。为有效推动抗生素菌渣的资源化利用,采用高温造粒技术处理青霉素、头孢菌素和阿维菌素3种抗生素菌渣,评估肥料化前后理化性质及特征污染物的变化情况。检测了pH、含水率、有机质、总养分(氮、磷、钾)等关键理化指标,以及重金属、多环芳烃(PAHs)和抗生素的浓度变化。此外,使用实时荧光定量聚合酶链式反应(PCR)技术检测抗生素菌渣及其菌渣肥中抗生素抗性基因(ARGs)和可移动遗传元件(MGEs)的丰度。结果表明,3种菌渣肥的pH为5.74~6.63,含水率为0.23%~1.12%,总养分含量高(总养分质量分数介于8.27%~12.36%),有机质质量分数均超过43%,砷、汞、铅、镉、铬等重金属浓度均在限定范围内,符合《有机肥料》(NY/T 525—2021)和《生物有机肥》(NY 884—2012)的标准。肥料化后,PAHs浓度上升,但风险较低。高温造粒技术能显著降低菌渣中的抗生素残留,3种菌渣肥的抗生素去除率均超过94%。高温造粒技术有望使菌渣中ARGs和MGEs丰度降低,使之具有优质有机肥潜力,但仍需开展大田或盆栽实验来进一步探究其长期安全性及对土壤和农作物的影响。 展开更多

关键词 固体废物 抗生素菌渣肥 高温造粒处置技术 抗生素抗性基因 可移动遗传元件

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福建省69株嗜肺军团菌全基因组进化特征分析

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作者 毛郡杰 金瑞 +3 位作者 梁雪晨 邓玉航 高亚东 李曲文 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第7期691-696,共6页

目的通过全面的基因组学分析,了解福建省嗜肺军团菌的遗传多样性、进化特征、潜在的致病力以及可能的耐药机制,为福建省军团菌病防控提供基础数据。方法收集2019—2024年福建省环境来源嗜肺军团菌69株,采用血清凝集的方法检测菌株的血... 目的通过全面的基因组学分析,了解福建省嗜肺军团菌的遗传多样性、进化特征、潜在的致病力以及可能的耐药机制,为福建省军团菌病防控提供基础数据。方法收集2019—2024年福建省环境来源嗜肺军团菌69株,采用血清凝集的方法检测菌株的血清型。对菌株进行全基因组测序和组装;利用VFDB、MEGARes、IslandViewer4、PHASTEST、CRISPRCas‑Finder等开源软件及VRprofile2在线网站预测毒力基因、耐药基因和可移动遗传元件,同时基于单核苷酸多态性(SNP)构建最大似然系统发育树。结果69株菌株血清型以LP1型和LP5型为主,分别检出23株(33.33%)和15株(18.84%)。全基因组测序分析显示,69株嗜肺军团菌基因组大小在3.26~3.81 Mb,GC含量在38.0%~38.3%,ST1880为优势ST型。69株菌均携带mip、iraA、htpB、LPG_RS03055、lspM等与致病力密切相关的毒力基因,多药耐药基因lpeAB的携带率为23.2%(16/69),并且携带多种可移动遗传元件,包括基因组岛、插入序列、噬菌体、CRISPR/Cas等。结论福建省69株环境来源嗜肺军团菌均具有潜在的致病力,并且优势克隆群ST1880的lpeAB携带率较高,显示出其潜在的公共卫生风险,未来的研究和监测工作应重点关注这一克隆群,以便更好地了解和控制其传播。 展开更多

关键词 嗜肺军团菌 全基因组测序 耐药基因 可移动遗传元件

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畜禽粪便厌氧发酵过程抗生素抗性基因归趋及驱动因子分析 被引量：14

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作者 支苏丽 周婧 +2 位作者 赵润 杨凤霞 张克强 《农业工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第1期195-205,共11页

针对畜禽养殖业抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes, ARGs)污染问题,该文选取厌氧发酵技术,对比不同厌氧发酵体系内ARGs消长与潜在宿主菌,挖掘不同因子与ARGs的相互关系。结果表明,厌氧发酵体系内微生物群落变化是ARGs消长的... 针对畜禽养殖业抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes, ARGs)污染问题,该文选取厌氧发酵技术,对比不同厌氧发酵体系内ARGs消长与潜在宿主菌,挖掘不同因子与ARGs的相互关系。结果表明,厌氧发酵体系内微生物群落变化是ARGs消长的主要驱动因子,确定ARGs的潜在宿主菌是目前研究的难点;抗生素和重金属也是ARGs消长的重要驱动因子,控制抗生素污染和重金属污染可有效减缓ARGs污染;可移动遗传元件在ARGs水平传播过程中起着重要作用。综合而言,厌氧发酵体系内各个因子直接或间接影响ARGs消长,其中工艺参数是控制整个厌氧发酵体系的先决因素,在特定工艺参数下,微生物群落与体系物化指标相互影响与制约;微生物通过分子内部可移动遗传元件实现ARGs在不同微生物之间的水平传播。综上所述,通过综合协调各类因子实现厌氧发酵体系内ARGs消控是今后研究重点。 展开更多

关键词 抗生素 粪 厌氧发酵 微生物群落 可移动遗传元件 驱动因子

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一组泛耐药铜绿假单胞菌耐药相关基因的样本聚类分析 被引量：6

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作者 屠涌涛 肖美英 糜祖煌 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2013年第9期1515-1517,共3页

目的:调查一组泛耐药铜绿假单胞菌菌株间的亲缘关系。方法:收集2010年1-12月绍兴第二医院住院患者痰液标本中分离到的泛耐药铜绿假单胞菌共20株,采用聚合酶链反应(PCR)方法分析31种β-内酰胺酶基因以及膜孔蛋白oprD2基因,14种氨基糖苷... 目的:调查一组泛耐药铜绿假单胞菌菌株间的亲缘关系。方法:收集2010年1-12月绍兴第二医院住院患者痰液标本中分离到的泛耐药铜绿假单胞菌共20株,采用聚合酶链反应(PCR)方法分析31种β-内酰胺酶基因以及膜孔蛋白oprD2基因,14种氨基糖苷类修饰酶基因,7种16SrRNA甲基化酶基因和7种可移动遗传元件遗传标志,再对检测结果作样本聚类分析。结果:20株泛耐药铜绿假单胞菌共检出5种β-内酰胺类耐药相关基因(TEM-1、CARB、KPC、OXA-10群、oprD2突变),5种氨基糖苷类耐药相关基因[aac(6′)-Ⅰb、aac(6′)-Ⅱ、ant(2″)-Ⅰ、ant(3″)-Ⅰ、rmtB],4种可移动遗传元件的遗传标志(intⅠ1、tnp513、IS26、merA)。样本聚类分析把本组菌分为4个可操作分类单元。其中2号株簇群包含了16个成员均携带了TEM、CARB、aac(6′)-Ⅰb、aac(6′)-Ⅱ、ant(2″)-Ⅰ、rmtB、intⅠ1、tnp513、IS26、merA基因,并存在oprD2缺失,为克隆传播暴发。结论:尽管本组泛耐药铜绿假单胞菌菌株药敏表型相同,但样本聚类分析仍可分辨出4个可操作分类单元,其中2号株簇群为克隆传播暴发。获得菌株之间的亲缘关系对院内感染实时监测和控制院内感染意义重大。 展开更多

关键词 铜绿假单胞菌 Β-内酰胺类 氨基糖苷类 可移动遗传元件 样本聚类分析 泛耐药 可操作分类单元

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海洋环境中抗生素抗性基因的分布、来源、传播和风险研究 被引量：10

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作者 张晓娜 许慧芹 +1 位作者 汝少国 崔鹏飞 《生态毒理学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期174-190,共17页

当前抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes,ARGs)在海洋环境中已普遍存在并广泛传播,具有潜在的生态健康风险。本文综述了国内外近岸海洋环境(河口、沿海地区以及周边海洋)和极地海域中ARGs的分布和归趋特征,总结了医疗废水、陆... 当前抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes,ARGs)在海洋环境中已普遍存在并广泛传播,具有潜在的生态健康风险。本文综述了国内外近岸海洋环境(河口、沿海地区以及周边海洋)和极地海域中ARGs的分布和归趋特征,总结了医疗废水、陆地径流、污水处理厂尾水和养殖废水等近岸海域ARGs的主要来源,分析了近岸海域ARGs的传播扩散途径和影响因素,探讨了近岸海域ARGs传播对人类健康构成的潜在风险以及评估方法。最后,我们从构建海洋环境中ARGs污染的标准化检测方法、深入研究海洋环境中ARGs的传播转移规律等方面对今后的研究进行了展望。本综述为全面了解海洋环境ARGs污染以及健康风险提供支撑。 展开更多

关键词 抗生素抗性基因 抗生素 可移动遗传元件

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多耐药大肠埃希菌NB8株全基因组耐药基因检测 被引量：2

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作者 翁幸鐾 糜祖煌 +1 位作者 王春新 朱健铭 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期741-745,共5页

目的检测1株多耐药大肠埃希菌NB8株的遗传学背景。方法病原分离自2012年4月宁波市第一医院住院患者尿液,作16SrDNA和gyrA基因测序、BLASTn比对确认为大肠埃希菌,采用Illumina HiSeq与Ion Torrent PGM两种大规模并行测序仪进行全基因组分... 目的检测1株多耐药大肠埃希菌NB8株的遗传学背景。方法病原分离自2012年4月宁波市第一医院住院患者尿液,作16SrDNA和gyrA基因测序、BLASTn比对确认为大肠埃希菌,采用Illumina HiSeq与Ion Torrent PGM两种大规模并行测序仪进行全基因组分析,再行人工测序。最后NB8株和9株已完成全基因组测序的大肠埃希菌耐药基因的比较基因组学研究。结果多耐药大肠埃希菌NB8株全基因组测序得到一条推定的染色体序列,长4 550 369bp(内含14个缺口),得到一条推定的质粒序列,长635 377bp(内含33个缺口)。从NB8株全基因组数据中挖掘出了β-内酰胺类、氨基糖苷类、喹诺酮类、大环内酯类、磺胺类、四环素类、多粘菌素的耐药基因,并挖掘出接合性质粒、转座子、插入序列、整合子的遗传标记,以及5大类外排泵基因。结论多耐药大肠埃希菌NB8株遗传学背景明确,主动外排机制增强也会导致或者增强NB8株的耐药性。质粒、转座子和整合子等可移动遗传元件可以使细菌的耐药性得以快速传播,使受体菌表现为多重耐药。 展开更多

关键词 大肠埃希菌 全基因组 多耐药 耐药基因 可移动遗传元件 外排泵基因

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微生物消毒剂抗性机理 被引量：13

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作者 张可玟 胡泓 陈刚 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2022年第1期34-47,共14页

在物体表面和传播介质中,消毒剂能有效抑制或杀死微生物,广泛用于食品、卫生、健康、防疫等领域。在新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情期间,全球消毒剂的使用量激增,对有效防控病毒传播和防止疫情扩散起到重要作用。但消毒剂的不正确使用... 在物体表面和传播介质中,消毒剂能有效抑制或杀死微生物,广泛用于食品、卫生、健康、防疫等领域。在新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情期间,全球消毒剂的使用量激增,对有效防控病毒传播和防止疫情扩散起到重要作用。但消毒剂的不正确使用会降低其有效性,甚至会诱导微生物产生抗性,从而增加传染性疾病的传播风险。微生物的消毒剂抗性基因还会通过繁殖传代增殖或在不同种属间水平转移而加剧其污染和传播风险,严重威胁到公共卫生安全。目前,抗生素抗性基因(ARG)的广泛出现引起了全球对公共卫生的关注,但对消毒剂的抗性认识非常有限。本文综述了近年来微生物对消毒剂抗性的研究,着重就微生物通过形成生物膜、降低细胞膜通透性、过量表达外排泵、产生消除或减弱消毒剂的特异性酶、改变作用靶点等方式产生抗性的机理进行综述。另外针对微生物消毒剂抗性的获得和传播,对染色体和质粒介导的抗性基因、环境中微生物消毒剂抗性与抗生素抗性的关联进行了论述。消毒剂抗性基因能通过质粒、噬菌体等可移动遗传元件,以转化、转导或接合的方式转移传播,对科学消毒提出新要求。 展开更多

关键词 微生物 消毒剂抗性 生物膜 外排泵 获得抗性 基因水平转移 可移动遗传元件

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