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利用等位基因特异性PCR检测水稻可溶性淀粉合酶基因的单核苷酸多态性
被引量：
3
1
作者
彭小松
朱昌兰
+5 位作者
林华
欧阳林娟
贺晓鹏
陈小荣
傅军如
贺浩华
《江西农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第6期1080-1085,共6页
单核苷酸多态性(SNP)广泛分布于水稻基因组中,SNP分型已成为水稻遗传作图、关联分析、资源鉴定和分子标记辅助选择等研究的重要技术。本文选择水稻可溶性淀粉合酶基因SSIIIa的12个SNP位点,研究了利用等位基因特异性PCR法检测SNP的可行...
单核苷酸多态性(SNP)广泛分布于水稻基因组中,SNP分型已成为水稻遗传作图、关联分析、资源鉴定和分子标记辅助选择等研究的重要技术。本文选择水稻可溶性淀粉合酶基因SSIIIa的12个SNP位点,研究了利用等位基因特异性PCR法检测SNP的可行性。按照等位基因特异性PCR原理设计引物3'末端碱基,并根据每个SNP位点引物3'端的错配类型,在上游引物3'末端第3位引入不同的错配碱基,结果均获得了很好的扩增特异性,PCR检测结果与测序结果吻合。表明,等位基因特异性PCR是一种简便、快捷、可靠和低成本的SNP分型方法,可有效应用于水稻可溶性淀粉合酶基因的种质资源鉴定和分子标记辅助选择育种等相关研究。
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关键词
水稻
可溶性淀粉合酶基因
等位
基因
特异性PCR(AS-PCR)
单核苷酸多态性(SNP)
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职称材料
题名
利用等位基因特异性PCR检测水稻可溶性淀粉合酶基因的单核苷酸多态性
被引量：
3
1
作者
彭小松
朱昌兰
林华
欧阳林娟
贺晓鹏
陈小荣
傅军如
贺浩华
机构
江西农业大学作物生理生态与遗传育种教育部重点实验室/江西省超级稻工程技术研究中心
出处
《江西农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第6期1080-1085,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(30560074
30760118)
+1 种基金
江西省主要学科学术和技术带头人培养计划(2008DD00800)
江西省科技支撑计划
文摘
单核苷酸多态性(SNP)广泛分布于水稻基因组中,SNP分型已成为水稻遗传作图、关联分析、资源鉴定和分子标记辅助选择等研究的重要技术。本文选择水稻可溶性淀粉合酶基因SSIIIa的12个SNP位点,研究了利用等位基因特异性PCR法检测SNP的可行性。按照等位基因特异性PCR原理设计引物3'末端碱基,并根据每个SNP位点引物3'端的错配类型,在上游引物3'末端第3位引入不同的错配碱基,结果均获得了很好的扩增特异性,PCR检测结果与测序结果吻合。表明,等位基因特异性PCR是一种简便、快捷、可靠和低成本的SNP分型方法,可有效应用于水稻可溶性淀粉合酶基因的种质资源鉴定和分子标记辅助选择育种等相关研究。
关键词
水稻
可溶性淀粉合酶基因
等位
基因
特异性PCR(AS-PCR)
单核苷酸多态性(SNP)
Keywords
rice
soluble starch synthase genes
allele specific PCR
single nucleotide polymorphism
分类号
S511.032 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用等位基因特异性PCR检测水稻可溶性淀粉合酶基因的单核苷酸多态性
彭小松
朱昌兰
林华
欧阳林娟
贺晓鹏
陈小荣
傅军如
贺浩华
《江西农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
3
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