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基于TaqMan MGB探针的可可花瘿病菌快速检测方法
被引量：
4
1
作者
吕燕
郭立新
段维军
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期220-226,共7页
可可花瘿病菌是一种我国进境植物检疫性真菌。本文根据可可花瘿病菌EF1α基因的保守序列,设计并合成1对特异性的实时荧光PCR引物和1条TaqMan MGB探针,建立了可可花瘿病菌的实时荧光PCR检测方法。特异性试验结果表明,该检测方法能够特异...
可可花瘿病菌是一种我国进境植物检疫性真菌。本文根据可可花瘿病菌EF1α基因的保守序列,设计并合成1对特异性的实时荧光PCR引物和1条TaqMan MGB探针,建立了可可花瘿病菌的实时荧光PCR检测方法。特异性试验结果表明,该检测方法能够特异性检出可可花瘿病菌;实时荧光PCR优化反应条件为引物终浓度0.2μmol/L,探针终浓度0.6μmol/L;灵敏度试验结果表明,20μL反应体系中可可花瘿病菌DNA含量最低检测限为10 pg;重复性试验结果表明,该检测方法的重复性和稳定性良好;接种试验样品检测结果表明,该方法可用于疑似携带可可花瘿病菌样品的检测与初筛。本文建立的方法具有良好的灵敏性、特异性和应用性,为可可花瘿病菌早期快速检测提供了一种有效手段。
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关键词
可可花瘿病菌
实时荧光PCR
检测
TaqMan
MGB探针
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职称材料
来自台湾地区番荔枝果实上可可花瘿病菌的检疫鉴定
被引量：
3
2
作者
李敏
吕燕
+2 位作者
陈细红
沈建国
段维军
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第4期644-651,共8页
【目的】从台湾进境的番荔枝果实样品上发现带有黑褐色、不规则病斑的病果,对其进行病原菌分离鉴定,以明确其病原种类及分类地位。【方法】采用常规PDA平板分离法获得1株疑似可可花瘿病菌(Albonectria rigidiuscula)菌株2268-2-2-3,通...
【目的】从台湾进境的番荔枝果实样品上发现带有黑褐色、不规则病斑的病果,对其进行病原菌分离鉴定,以明确其病原种类及分类地位。【方法】采用常规PDA平板分离法获得1株疑似可可花瘿病菌(Albonectria rigidiuscula)菌株2268-2-2-3,通过形态学特征观察、序列比对分析及致病性测定的方法对其进行了鉴定。【结果】分离菌株在PDA平板上菌丝生长茂盛,菌落呈粉色,可产生大量大型分生孢子和小型分生孢子,大型分生孢子镰刀形或稍弯的柱形,具5~9个隔,大小为(52.98~76.33)μm×(5.38~8.56)μm,小型分生孢子椭圆形至圆柱形,有0~1个隔,大小(4.95~10.38)μm×(2.61~5.12)μm,培养期间未见有性阶段。经rDNA基因间隔序列(ITS)和翻译延长因子基因序列(EF1A)比对分析,发现该菌株与GenBank中多个可可花瘿病菌(A.rigidiuscula)菌株的ITS和EF1A基因序列同源性超过98%。根据EF1A序列构建的系统进化树表明,该菌株与其他多株可可花瘿病菌(A.rigidiuscula)分离物EF1A序列聚在同一个分枝上。致病性测定结果表明菌株2268-2-2-3可侵染释迦果实,形成黑褐色不规则病斑。以上研究结果表明台湾地区释迦果上分离获得的菌株2268-2-2-3为可可花瘿病菌(A.rigidiuscula)。【结论】采用形态学、序列分析、致病性测定相结合的方法,准确截获鉴定了来自台湾地区释迦果上的可可花瘿病菌。可可花瘿病菌是我国进境检疫性植物病原真菌,研究为口岸检疫以及该病菌的防控工作提供了重要参考。
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关键词
番荔枝
果实
可可花瘿病菌
检测鉴定
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职称材料
题名
基于TaqMan MGB探针的可可花瘿病菌快速检测方法
被引量：
4
1
作者
吕燕
郭立新
段维军
机构
宁波检验检疫科学技术研究院
宁波中盛产品检测有限公司
宁波海关
出处
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期220-226,共7页
基金
国家重点研发计划(2022YFF0608804)
国家自然科学基金(NSFC31770009)
+2 种基金
浙江省公益技术研究项目(LGF20C140001)
海关总署科研项目(2020HK162)
宁波市社会公益科研项目(2022S010)。
文摘
可可花瘿病菌是一种我国进境植物检疫性真菌。本文根据可可花瘿病菌EF1α基因的保守序列,设计并合成1对特异性的实时荧光PCR引物和1条TaqMan MGB探针,建立了可可花瘿病菌的实时荧光PCR检测方法。特异性试验结果表明,该检测方法能够特异性检出可可花瘿病菌;实时荧光PCR优化反应条件为引物终浓度0.2μmol/L,探针终浓度0.6μmol/L;灵敏度试验结果表明,20μL反应体系中可可花瘿病菌DNA含量最低检测限为10 pg;重复性试验结果表明,该检测方法的重复性和稳定性良好;接种试验样品检测结果表明,该方法可用于疑似携带可可花瘿病菌样品的检测与初筛。本文建立的方法具有良好的灵敏性、特异性和应用性,为可可花瘿病菌早期快速检测提供了一种有效手段。
关键词
可可花瘿病菌
实时荧光PCR
检测
TaqMan
MGB探针
Keywords
Albonectria rigidiuscula
real-time fluorescent PCR
detection
TaqMan MGB probe
分类号
S41-32 [农业科学—植物保护]
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职称材料
题名
来自台湾地区番荔枝果实上可可花瘿病菌的检疫鉴定
被引量：
3
2
作者
李敏
吕燕
陈细红
沈建国
段维军
机构
福州海关技术中心
宁波检验检疫科学技术研究院
宁波海关
出处
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第4期644-651,共8页
基金
国家重点研发计划(2016YFF0203201&2016YFF0203203)
国家自然科学基金(NSFC31770009)
+1 种基金
海关总署科研项目(2020HK162)
福州海关科研项目(FK2021-02)。
文摘
【目的】从台湾进境的番荔枝果实样品上发现带有黑褐色、不规则病斑的病果,对其进行病原菌分离鉴定,以明确其病原种类及分类地位。【方法】采用常规PDA平板分离法获得1株疑似可可花瘿病菌(Albonectria rigidiuscula)菌株2268-2-2-3,通过形态学特征观察、序列比对分析及致病性测定的方法对其进行了鉴定。【结果】分离菌株在PDA平板上菌丝生长茂盛,菌落呈粉色,可产生大量大型分生孢子和小型分生孢子,大型分生孢子镰刀形或稍弯的柱形,具5~9个隔,大小为(52.98~76.33)μm×(5.38~8.56)μm,小型分生孢子椭圆形至圆柱形,有0~1个隔,大小(4.95~10.38)μm×(2.61~5.12)μm,培养期间未见有性阶段。经rDNA基因间隔序列(ITS)和翻译延长因子基因序列(EF1A)比对分析,发现该菌株与GenBank中多个可可花瘿病菌(A.rigidiuscula)菌株的ITS和EF1A基因序列同源性超过98%。根据EF1A序列构建的系统进化树表明,该菌株与其他多株可可花瘿病菌(A.rigidiuscula)分离物EF1A序列聚在同一个分枝上。致病性测定结果表明菌株2268-2-2-3可侵染释迦果实,形成黑褐色不规则病斑。以上研究结果表明台湾地区释迦果上分离获得的菌株2268-2-2-3为可可花瘿病菌(A.rigidiuscula)。【结论】采用形态学、序列分析、致病性测定相结合的方法,准确截获鉴定了来自台湾地区释迦果上的可可花瘿病菌。可可花瘿病菌是我国进境检疫性植物病原真菌,研究为口岸检疫以及该病菌的防控工作提供了重要参考。
关键词
番荔枝
果实
可可花瘿病菌
检测鉴定
Keywords
Custard apple
Fruit
Albonectria rigidiuscula
Detection and identification
分类号
S667.9 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于TaqMan MGB探针的可可花瘿病菌快速检测方法
吕燕
郭立新
段维军
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2022
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
来自台湾地区番荔枝果实上可可花瘿病菌的检疫鉴定
李敏
吕燕
陈细红
沈建国
段维军
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
3
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