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基于单细胞拉曼技术的口腔病原微生物快速鉴别研究
被引量：
1
1
作者
李姗姗
孙雁斐
+1 位作者
郭艺
杨芳
《口腔医学研究》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第9期794-799,共6页
目的:评价单细胞拉曼技术对3种口腔病原微生物的快速分类效能。方法:(1)培养变异链球菌UA159、白色念珠菌ATCC10231和粪肠球菌ATCC29212至稳定期,绘制生长曲线评估生长状态;(2)测量对数和稳定期菌株单细胞拉曼图谱,使用主成分和随机森...
目的:评价单细胞拉曼技术对3种口腔病原微生物的快速分类效能。方法:(1)培养变异链球菌UA159、白色念珠菌ATCC10231和粪肠球菌ATCC29212至稳定期,绘制生长曲线评估生长状态;(2)测量对数和稳定期菌株单细胞拉曼图谱,使用主成分和随机森林分析方法分析光谱。结果:(1)3个菌株的对数期和稳定期均可被拉曼技术快速区分。准确率分别为:99.6%、99.86%、99.60%;(2)单细胞拉曼技术能够快速精确区分稳定期的3种实验菌株,准确率高达99.68%;(3)通过随机森林算法分析得到3种稳定期实验菌株之间的拉曼差异峰分别为:1126~1128 cm^(-1)、736~744 cm^(-1)、1330~1440 cm^(-1)、778~785 cm^(-1)、1001~1003 cm^(-1)和1431~1481 cm^(-1)。其生物学标志分别为:蛋白质、胸腺嘧啶、脂质、胞嘧啶、尿嘧啶、苯丙氨酸、蛋白质。结论:单细胞拉曼光谱可高效区分物种的生长时期和菌株类别。
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关键词
单细胞拉曼
口腔病原微生物
鉴定
随机森林
主成分分析
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职称材料
题名
基于单细胞拉曼技术的口腔病原微生物快速鉴别研究
被引量：
1
1
作者
李姗姗
孙雁斐
郭艺
杨芳
机构
青岛大学口腔医学院
同济大学嵌入式系统与服务计算教育部重点实验室
青岛市市立医院口腔医学中心
出处
《口腔医学研究》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第9期794-799,共6页
文摘
目的:评价单细胞拉曼技术对3种口腔病原微生物的快速分类效能。方法:(1)培养变异链球菌UA159、白色念珠菌ATCC10231和粪肠球菌ATCC29212至稳定期,绘制生长曲线评估生长状态;(2)测量对数和稳定期菌株单细胞拉曼图谱,使用主成分和随机森林分析方法分析光谱。结果:(1)3个菌株的对数期和稳定期均可被拉曼技术快速区分。准确率分别为:99.6%、99.86%、99.60%;(2)单细胞拉曼技术能够快速精确区分稳定期的3种实验菌株,准确率高达99.68%;(3)通过随机森林算法分析得到3种稳定期实验菌株之间的拉曼差异峰分别为:1126~1128 cm^(-1)、736~744 cm^(-1)、1330~1440 cm^(-1)、778~785 cm^(-1)、1001~1003 cm^(-1)和1431~1481 cm^(-1)。其生物学标志分别为:蛋白质、胸腺嘧啶、脂质、胞嘧啶、尿嘧啶、苯丙氨酸、蛋白质。结论:单细胞拉曼光谱可高效区分物种的生长时期和菌株类别。
关键词
单细胞拉曼
口腔病原微生物
鉴定
随机森林
主成分分析
Keywords
single-cell raman spectroscopy
oral pathogens microorganism
identification
random forest
PCA
分类号
O65 [理学—分析化学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于单细胞拉曼技术的口腔病原微生物快速鉴别研究
李姗姗
孙雁斐
郭艺
杨芳
《口腔医学研究》
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
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