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基于网络药理学的僵蚕主要药效作用研究
被引量：
42
1
作者
权浩浩
张晓凤
+1 位作者
高凯
杜霞
《西部中医药》
2021年第3期92-96,共5页
目的:通过网络药理学方法探讨僵蚕的主要药效作用机制。方法:利用化学专业数据库及文献收集僵蚕的化学成分,借助中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)以及Swiss Target Prediction数据库获得僵蚕化合物潜在作用靶点,结合TTD、DisGeNE...
目的:通过网络药理学方法探讨僵蚕的主要药效作用机制。方法:利用化学专业数据库及文献收集僵蚕的化学成分,借助中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)以及Swiss Target Prediction数据库获得僵蚕化合物潜在作用靶点,结合TTD、DisGeNET等生物信息库及僵蚕现代药理作用将靶标映射在相关疾病上。运用Cytoscape构建药材-成分-靶点-疾病网络模型,并应用DAVID数据库基于KEGG通路分析僵蚕作用机制。结果:僵蚕39个化学成分共作用451个靶点,主要富集在糖尿病、哮喘、肿瘤、疼痛类疾病方面,其中27个化合物和20个靶点是网络中的关键节点。僵蚕以代谢通路、神经活性配体-受体相互作用、PI3KAkt信号通路、钙信号通路、cAMP信号通路、癌症通路等为主要作用通路。结论:僵蚕可通过多成分、多靶点、多通路治疗糖尿病、哮喘、肿瘤、疼痛类疾病。
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关键词
网络药理学
僵蚕
代谢通路
神经活性
配体
-
受体
相互作用
PI3K
-
AKT信号通路
钙信号通路
cAMP信号通路
癌症通路
药效
作用
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职称材料
基于细胞模型的抗HER2单抗耐药通路研究方法的建立及应用
2
作者
王馨
池文杰
《山西医科大学学报》
CAS
2024年第11期1449-1455,共7页
目的 建立基于细胞模型的抗人类表皮生长因子受体2(HER2)单抗耐药通路研究方法。方法 从低剂量开始分别使用原研药曲妥珠(Trastuzumab)或其生物类似药候选物对HER2阳性BT474细胞进行加压筛选至药物浓度60μg/mL。利用流式细胞术检测抗H...
目的 建立基于细胞模型的抗人类表皮生长因子受体2(HER2)单抗耐药通路研究方法。方法 从低剂量开始分别使用原研药曲妥珠(Trastuzumab)或其生物类似药候选物对HER2阳性BT474细胞进行加压筛选至药物浓度60μg/mL。利用流式细胞术检测抗HER2单抗耐药细胞株表面HER2表达量变化。利用细胞增殖抑制生物学活性测定法对加压细胞株进行耐药性验证。对耐药细胞株和敏感细胞株进行高通量转录组测序以挖掘差异表达基因(DEGs)。利用KEGG数据库对得到的DEGs进行通路富集分析,寻找耐药相关通路。结果 经过相同条件的药物加压筛选,原研药及其生物类似药候选物均不改变BT474细胞表面HER2抗原表达量。细胞增殖抑制活性实验表明两种药物的加压细胞株均呈现一定耐药性,且耐药曲线相似。转录组测序结果经过KEGG富集分析表明,与敏感细胞相比,原研药和生物类似药候选物的耐药细胞株的DEGs均在丝裂原活化蛋白激酶通路及神经活性的配体-受体相互作用通路有富集。不同的是,原研药耐药细胞株的DEGs还在黏着斑激酶通路及肌动蛋白细胞骨架调节通路上有富集,而生物类似药候选物耐药细胞株则在细胞因子-细胞因子受体相互作用通路上有富集。结论 建立了基于细胞模型的抗HER2单抗耐药通路研究方法,可用于比较原研药曲妥珠与其生物类似药候选物两者的耐药相关基因通路的异同,为单抗生物类似药的耐药研究提供参考。
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关键词
曲妥珠单抗
生物类似药
耐药细胞
转录组测序
差异表达基因
丝裂原活化蛋白激酶通路
神经活性的
配体
-
受体
相互作用
通路
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职称材料
通过计算方法预测甜菊糖苷的甜味和苦味
被引量：
5
3
作者
李伟
王海军
夏咏梅
《食品与生物技术学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期24-32,共9页
通过计算模拟软件,对一系列甜菊糖苷与人体味觉受体间的相互作用进行了研究。建立了人体甜味受体(hT1R2,hT1R3)和苦味受体(hT2R4)的同源模型,通过Ramachandran图和其他质量参数来验证模型的可靠性。将味觉受体模型与天然甜菊糖苷分子进...
通过计算模拟软件,对一系列甜菊糖苷与人体味觉受体间的相互作用进行了研究。建立了人体甜味受体(hT1R2,hT1R3)和苦味受体(hT2R4)的同源模型,通过Ramachandran图和其他质量参数来验证模型的可靠性。将味觉受体模型与天然甜菊糖苷分子进行对接,分析了对接过程中的能量变化和相互作用,发现对接结果与甜菊糖苷的甜味与苦味明显相关,可通过该计算方法来预测甜菊糖苷的风味。此外,味觉受体的空间位阻是导致甜菊糖苷C-13和C-19位上的葡萄糖基数量改变对其风味造成不同影响的主要原因。预测了数种改性甜菊糖苷的风味并挑选出可能的优质甜味剂。
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关键词
甜菊糖苷
甜味
受体
苦味
受体
同源建模
受体-配体相互作用
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职称材料
题名
基于网络药理学的僵蚕主要药效作用研究
被引量：
42
1
作者
权浩浩
张晓凤
高凯
杜霞
机构
陕西中医药大学
陕西省中医医院
陕西省中医药研究院
出处
《西部中医药》
2021年第3期92-96,共5页
基金
国家自然科学基金面上项目(81873201)
西安市科技计划项目(201805103YX11SF37)。
文摘
目的:通过网络药理学方法探讨僵蚕的主要药效作用机制。方法:利用化学专业数据库及文献收集僵蚕的化学成分,借助中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)以及Swiss Target Prediction数据库获得僵蚕化合物潜在作用靶点,结合TTD、DisGeNET等生物信息库及僵蚕现代药理作用将靶标映射在相关疾病上。运用Cytoscape构建药材-成分-靶点-疾病网络模型,并应用DAVID数据库基于KEGG通路分析僵蚕作用机制。结果:僵蚕39个化学成分共作用451个靶点,主要富集在糖尿病、哮喘、肿瘤、疼痛类疾病方面,其中27个化合物和20个靶点是网络中的关键节点。僵蚕以代谢通路、神经活性配体-受体相互作用、PI3KAkt信号通路、钙信号通路、cAMP信号通路、癌症通路等为主要作用通路。结论:僵蚕可通过多成分、多靶点、多通路治疗糖尿病、哮喘、肿瘤、疼痛类疾病。
关键词
网络药理学
僵蚕
代谢通路
神经活性
配体
-
受体
相互作用
PI3K
-
AKT信号通路
钙信号通路
cAMP信号通路
癌症通路
药效
作用
Keywords
network pharmacology
bombyx batryticatus
metabolizing pathway
neuroactive ligand receptor interaction
PI3K
-
Akt signaling pathway
calcium signaling pathway
cAMP signaling pathway
cancer pathway
pharmacodynamic effect
分类号
R562 [医药卫生—呼吸系统]
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职称材料
题名
基于细胞模型的抗HER2单抗耐药通路研究方法的建立及应用
2
作者
王馨
池文杰
机构
福建省食品药品质量检验研究院
出处
《山西医科大学学报》
CAS
2024年第11期1449-1455,共7页
文摘
目的 建立基于细胞模型的抗人类表皮生长因子受体2(HER2)单抗耐药通路研究方法。方法 从低剂量开始分别使用原研药曲妥珠(Trastuzumab)或其生物类似药候选物对HER2阳性BT474细胞进行加压筛选至药物浓度60μg/mL。利用流式细胞术检测抗HER2单抗耐药细胞株表面HER2表达量变化。利用细胞增殖抑制生物学活性测定法对加压细胞株进行耐药性验证。对耐药细胞株和敏感细胞株进行高通量转录组测序以挖掘差异表达基因(DEGs)。利用KEGG数据库对得到的DEGs进行通路富集分析,寻找耐药相关通路。结果 经过相同条件的药物加压筛选,原研药及其生物类似药候选物均不改变BT474细胞表面HER2抗原表达量。细胞增殖抑制活性实验表明两种药物的加压细胞株均呈现一定耐药性,且耐药曲线相似。转录组测序结果经过KEGG富集分析表明,与敏感细胞相比,原研药和生物类似药候选物的耐药细胞株的DEGs均在丝裂原活化蛋白激酶通路及神经活性的配体-受体相互作用通路有富集。不同的是,原研药耐药细胞株的DEGs还在黏着斑激酶通路及肌动蛋白细胞骨架调节通路上有富集,而生物类似药候选物耐药细胞株则在细胞因子-细胞因子受体相互作用通路上有富集。结论 建立了基于细胞模型的抗HER2单抗耐药通路研究方法,可用于比较原研药曲妥珠与其生物类似药候选物两者的耐药相关基因通路的异同,为单抗生物类似药的耐药研究提供参考。
关键词
曲妥珠单抗
生物类似药
耐药细胞
转录组测序
差异表达基因
丝裂原活化蛋白激酶通路
神经活性的
配体
-
受体
相互作用
通路
Keywords
Trastuzumab
biosimilar drug
resistant cell line
transcriptome sequencing
differentially expressed genes
mitogen
-
activated protein kinase
neuroactive ligand
-
receptor interaction
分类号
R92 [医药卫生—药学]
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职称材料
题名
通过计算方法预测甜菊糖苷的甜味和苦味
被引量：
5
3
作者
李伟
王海军
夏咏梅
机构
食品科学与技术国家重点实验室
江南大学化学与材料工程学院
出处
《食品与生物技术学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期24-32,共9页
基金
国家自然科学基金项目(31772017
31371837)
食品科学与技术国家重点实验室自由探索项目(SKLF-ZZB-201808)。
文摘
通过计算模拟软件,对一系列甜菊糖苷与人体味觉受体间的相互作用进行了研究。建立了人体甜味受体(hT1R2,hT1R3)和苦味受体(hT2R4)的同源模型,通过Ramachandran图和其他质量参数来验证模型的可靠性。将味觉受体模型与天然甜菊糖苷分子进行对接,分析了对接过程中的能量变化和相互作用,发现对接结果与甜菊糖苷的甜味与苦味明显相关,可通过该计算方法来预测甜菊糖苷的风味。此外,味觉受体的空间位阻是导致甜菊糖苷C-13和C-19位上的葡萄糖基数量改变对其风味造成不同影响的主要原因。预测了数种改性甜菊糖苷的风味并挑选出可能的优质甜味剂。
关键词
甜菊糖苷
甜味
受体
苦味
受体
同源建模
受体-配体相互作用
Keywords
steviol glycosides
sweet taste receptor
bitter taste receptor
homology modeling
receptor
-
ligand interaction
分类号
TP302.7 [自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学的僵蚕主要药效作用研究
权浩浩
张晓凤
高凯
杜霞
《西部中医药》
2021
42
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下载PDF
职称材料
2
基于细胞模型的抗HER2单抗耐药通路研究方法的建立及应用
王馨
池文杰
《山西医科大学学报》
CAS
2024
0
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下载PDF
职称材料
3
通过计算方法预测甜菊糖苷的甜味和苦味
李伟
王海军
夏咏梅
《食品与生物技术学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
5
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