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根肿病菌核糖体基因ITS区段的克隆测序及其在检测中的应用
被引量：
40
1
作者
杨佩文
李家瑞
+2 位作者
杨勤忠
曾莉
王群
《云南农业大学学报》
CAS
CSCD
2003年第3期228-233,共6页
应用真菌核糖体基因ITS区段通用引物ITS1和ITS4,对十字花科蔬菜根肿病菌(Plasmodiophorabrassicae)rDNA进行PCR扩增,并将扩增到的目的片段克隆到pGEM-T载体上。对重组克隆进行测序和碱基编码结构特点分析,结果表明:十字花科蔬菜根肿病菌...
应用真菌核糖体基因ITS区段通用引物ITS1和ITS4,对十字花科蔬菜根肿病菌(Plasmodiophorabrassicae)rDNA进行PCR扩增,并将扩增到的目的片段克隆到pGEM-T载体上。对重组克隆进行测序和碱基编码结构特点分析,结果表明:十字花科蔬菜根肿病菌ITS1区长141bp,5 8S区长160bp,ITS2区长187bp,rDNA总长为488bp.根据此序列设计一对根肿病菌特异性寡聚核苷酸引物(前引物:5'AGGTGAACCTGCGGAAGGAT3'和后引物:5'TTCAGCGGGTAATCCTACCT3'),应用聚合酶链式反应(polymerasechainreaction,PCR)技术,对分离自十字花科蔬菜(白菜、青菜、甘蓝、芥蓝、花椰菜等)根肿病菌全基因组DNA进行特异性扩增试验。试验结果表明,该对引物能从十字花科根肿病菌全基因组DNA中扩增到约500bp长度的分子片段,而对照菌株和健康对照则无扩增产物。该实验结果对有效追踪根肿病菌在田间的发生动态监测和预测预报提供了重要的信息和手段。
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关键词
十字花科蔬菜
根肿病菌
核糖体基因ITS区段
基因克隆
基因测序
基因检测
预测预报
发生动态监测
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职称材料
题名
根肿病菌核糖体基因ITS区段的克隆测序及其在检测中的应用
被引量：
40
1
作者
杨佩文
李家瑞
杨勤忠
曾莉
王群
机构
云南省农业科学院植物保护研究所
出处
《云南农业大学学报》
CAS
CSCD
2003年第3期228-233,共6页
基金
云南省"十五"科技攻关项目(2000A3-02)。
文摘
应用真菌核糖体基因ITS区段通用引物ITS1和ITS4,对十字花科蔬菜根肿病菌(Plasmodiophorabrassicae)rDNA进行PCR扩增,并将扩增到的目的片段克隆到pGEM-T载体上。对重组克隆进行测序和碱基编码结构特点分析,结果表明:十字花科蔬菜根肿病菌ITS1区长141bp,5 8S区长160bp,ITS2区长187bp,rDNA总长为488bp.根据此序列设计一对根肿病菌特异性寡聚核苷酸引物(前引物:5'AGGTGAACCTGCGGAAGGAT3'和后引物:5'TTCAGCGGGTAATCCTACCT3'),应用聚合酶链式反应(polymerasechainreaction,PCR)技术,对分离自十字花科蔬菜(白菜、青菜、甘蓝、芥蓝、花椰菜等)根肿病菌全基因组DNA进行特异性扩增试验。试验结果表明,该对引物能从十字花科根肿病菌全基因组DNA中扩增到约500bp长度的分子片段,而对照菌株和健康对照则无扩增产物。该实验结果对有效追踪根肿病菌在田间的发生动态监测和预测预报提供了重要的信息和手段。
关键词
十字花科蔬菜
根肿病菌
核糖体基因ITS区段
基因克隆
基因测序
基因检测
预测预报
发生动态监测
Keywords
Plasmodiophora brassicae
ITS(Internal transcribed spacer)
cloning and sequencing gene
detection gene
分类号
S436.3 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
S188 [农业科学—农业基础科学]
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作者
出处
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被引量
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1
根肿病菌核糖体基因ITS区段的克隆测序及其在检测中的应用
杨佩文
李家瑞
杨勤忠
曾莉
王群
《云南农业大学学报》
CAS
CSCD
2003
40
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